蛋白酶解的首选变性剂——RapiGestSF

在生物药肽图分析、蛋白质修饰分析、蛋白质组学研究等诸多工作中,蛋白质的变性与酶解是样品处理的必经之路。RapiGestTM SF正是在这个实验步骤中,用以辅助蛋白酶解的变性试剂[1,2,3]。RapiGest SF有以下优点:■ 综合水相、有机相溶液条件下,最高效的辅助酶解变性剂。■ 作用过程中,不对蛋白造成副反应化学修饰。■ 操作简单、全面适应液质分析方法。■ 常规操作浓度对胰蛋白酶活性无抑制。■ 可大大缩短酶解反应时间。■ 对各种蛋白酶、肽-N糖苷酶等多种酶解过程都适用。 在蛋白质质谱分析的大部分工作中,常常需要将蛋白质酶解为多肽进行分析。但蛋白质结构是以三维结构的形式存在的,为了将蛋白高级结构内部的酶切位点暴露于蛋白酶的作用下,首先需要对蛋白进行变性,使蛋白舒展开。John R. Yates教授领导的团队对各种变性剂中的辅助酶切效果进行了充分比较,其中RapiGest SF的表现最为(图1)[4]。......阅读全文

CBS变性梯度凝胶电泳DGGE-实验

【实验目的】掌握变性梯度凝胶电泳检测新的突变,以及测定高度多态基因的基因型的技术方法。 【实验原理】在现代遗传学中DNA 序列突变的分析占有十分重要的地位。由于在较大DNA 序列中检测一个细微的突变非常困难,因而现在人们建立了几种方法来解决这一难题。变性梯度凝胶电泳(DGGE)能把长度相同而核苷酸顺

二硫键的功能特点

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键的基本功能

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键的功能介绍

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

简述二硫键的功能

  二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成

细胞化学基础​二硫键的功能

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

变性凝胶电泳的作用方式介绍

  不同的双链DNA片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA片段最低的解链区域解链,此时DNA片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而一旦DNA片段迁移到一特定位置,其变性剂浓度刚好能使双链D

变性梯度凝胶电泳不同的双链DNA-片段

  不同的双链DNA 片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA 片段最低的解链区域解链,此时DNA 片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而,一旦变性剂浓度达到DNA 片段最高的解链区域温度时

变性凝胶电泳的作用方式

不同的双链DNA片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA片段最低的解链区域解链,此时DNA片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而一旦DNA片段迁移到一特定位置,其变性剂浓度刚好能使双链DNA

关于变性凝胶电泳的作用方式介绍

不同的双链DNA片段因为其序列组成不一样,所以其解链区域及各解链区域的解链浓度也是不一样的。当它们进行DGGE时,一开始变性剂浓度比较小,不能使双链DNA片段最低的解链区域解链,此时DNA片段的迁移行为和在一般的聚丙烯酰胺凝胶中一样。然而一旦DNA片段迁移到一特定位置,其变性剂浓度刚好能使双链DNA

简述蛋白质复性的初期成果

  80年代后期,人们开展了广泛的蛋白质复性研究。例如,Carlson等发现,单克隆抗体具有协助蛋白质复性的作用[4];Cleland等发现,向稀释的变性蛋白质溶液中加入适当浓度的聚乙二醇,可抑制蛋白质复性过程中的凝聚沉淀,使蛋白质复性收率提高两倍[5];Hagen等利用反胶团萃取人工变性的蛋白质后

关于生物学术语—包涵体的特性介绍

  1、包涵体的简介:  与一般微生物细胞相比,基因工程菌的细胞破碎要复杂得多。基因工程菌新合成的重组蛋白,是没有活性的、折叠构型有误的蛋白质,叫包涵体。细胞破碎后先分离出包涵体,将包涵体溶解在变性剂中。再加入还原剂,还原蛋白质中的半胱氨酸,使二硫键断裂,得到单体肽链再复性重新折叠。  2、包涵体的

关于包涵体的形成和蛋白质在等电点或者高盐情况下的沉淀介绍

  包涵体的形成和蛋白质在等电点或者高盐情况下的沉淀是不同的。在沉淀过程中,分子是通过分子表面的相互作用而形成的分子的聚集,无论在聚集的沉淀状态还是在天然状态,没有明显的构象的变化。因此,当溶液中的pH重新改变,或者沉淀重新溶解的时候,蛋白质的结构和活性会重新获得。蛋白质的包涵体形式的聚集则不同于蛋

聚丙烯酰氨凝胶电泳的作用原理

在蛋白质的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中,蛋白质能够保持完整状态,并依据蛋白质的分子量大小、蛋白质的形状及其所附带的电荷量而逐渐呈梯度分开;在DNA的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中,DNA呈双链状态泳动,其迁移率会受碱基组成和序列的影响。在变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中,由于加入了变性剂——蛋白质变性剂常为SDS

影响凝胶聚合的因素

  1) Acr及Bis的纯度:应选用分析纯的Acr及Bis,如试剂不纯,含有杂质或丙烯酸时,则凝胶聚合不均一,或聚合时间延长甚至不聚合, 因而需进一步纯化。 Acr和Bis贮液的pH值为4.9-5.2,当pH值的改变大于0.4pH单位则不能使用,因在偏酸或偏碱的环境中,它们可不断水解放出丙烯酸和N

影响凝胶聚合的因素

  1) Acr及Bis的纯度:应选用分析纯的Acr及Bis,如试剂不纯,含有杂质或丙烯酸时,则凝胶聚合不均一,或聚合时间延长甚至不聚合, 因而需进一步纯化。 Acr和Bis贮液的pH值为4.9-5.2,当pH值的改变大于0.4pH单位则不能使用,因在偏酸或偏碱的环境中,它们可不断水解放出丙烯酸和N

RapiGest-SF-试剂:促进溶液中蛋白酶解的有利工具(二)

胰蛋白酶消解的兼容性 胰蛋白酶是最常见的蛋白水解酶,可用于肽图分析和蛋白组学的应用。我们研究了在添加 RapiGest SF 的情况下胰蛋白酶的活性作用,并与文献中最常见的变性剂的作用做了对比。本检测基于胰蛋白酶诱导 N-α- 苯甲酰 -L- 精氨酸乙基乙酯( BAEE )在 50 mM 重

唾液淀粉酶的激活剂是什么

很少量的激活剂或抑制剂就会影响酶的活性,而且常具有特异性(值得注意的是激活剂和抑制剂不是绝对的,有些物质在低浓度时为某种酶的激活剂,而在高浓度时则成为该酶的抑制剂,例如NaCl是唾液淀粉酶的激活剂,但NaCl浓度到1/3饱和度时就可抑制唾液淀粉酶的活性)。Cl-就是淀粉酶的激活剂,其实所谓的激活剂就

包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性

蛋白的复性是一个世界性的难题,没有通用的方法,甚至没有靠得住的规律,只能试。可以参考以下文章。该文出处已经忘了,如果有人知道原创作者或网上出处,请补充。包涵体表达的蛋白的复性包涵体表达的蛋白的复性包涵体:包涵体是指细菌表达的蛋白在细胞内凝集,形成无活性的固体颗粒。包涵体的组成与特性:一般含有50%以

二硫键作用

二硫键二硫键(S-S) 是连接不同肽链或同一肽链的不同部分的化学键。它由含硫氨基酸形成,半胱氨酸被氧化成胱氨酸时即形成二硫键,二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。二硫键disulfide bond反应:2SH

目标蛋白(target-proteins)粗提方法2

4)去垢剂去垢剂(表面活性剂)是一类即具有亲水基又具有疏水基的物质,一般具有乳化、分散、和增溶作用,可分阴离子、阳离子和中性去垢剂等多种类型,中性去垢剂在蛋白提取钟应用的较多。A.中性去垢剂 又称非离子表面活性剂,对蛋白质的变性作用影响较少,宜于蛋白质或酶提取之用。一般市售中性去垢剂有聚乙二醇类

三氯乙酸丙酮法提取植物全蛋白实验

实验材料植物试剂、试剂盒三氯乙酸β-巯基乙醇丙酮R2D2 蛋白质溶解缓冲液UKS 蛋白质溶解缓冲液IPG 胶条水化液仪器、耗材研钵和研槌实验步骤1. 蛋白质沉淀与变性( 1 ) 用研钵和研槌在液氮中将植物材料研磨成细小的粉末( 见注释 4) 。( 2 ) 将约 200 μl 粉末转移到 2 ml 的

三氯乙酸丙酮法提取植物全蛋白实验

实验材料 植物试剂、试剂盒 三氯乙酸β-巯基乙醇丙酮R2D2 蛋白质溶解缓冲液UKS 蛋白质溶解缓冲液IPG 胶条水化液仪器、耗材 研钵和研槌实验步骤 1. 蛋白质沉淀与变性( 1 ) 用研钵和研槌在液氮中将植物材料研磨成细小的粉末( 见注释 4) 。( 2 ) 将约 200 μl 粉末转移到 2

三氯乙酸丙酮法提取植物全蛋白实验

实验材料植物                                                          试剂、试剂盒三氯乙酸                                                                  β-巯基乙醇    

磁珠法核酸提取裂解液的作用原理

磁珠法核酸提取是以纳米生物磁珠为载体的一种新型核酸提取技术,核酸分子可与磁珠表面的硅羟基发生特异性识别与结合,在外部磁场的作用下发生聚集或分散,彻底摆脱传统核酸提取过程中离心、抽取上清液等手工操作流程,从而实现核酸的自动化提取。广泛应用于临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检

磁珠法核酸提取裂解液常用试剂及作用原理介绍

磁珠法核酸提取是以纳米生物磁珠为载体的一种新型核酸提取技术,核酸分子可与磁珠表面的硅羟基发生特异性识别与结合,在外部磁场的作用下发生聚集或分散,彻底摆脱传统核酸提取过程中离心、抽取上清液等手工操作流程,从而实现核酸的自动化提取。广泛应用于临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检

磁珠法核酸提取裂解液的作用原理

磁珠法核酸提取是以纳米生物磁珠为载体的一种新型核酸提取技术,核酸分子可与磁珠表面的硅羟基发生特异性识别与结合,在外部磁场的作用下发生聚集或分散,彻底摆脱传统核酸提取过程中离心、抽取上清液等手工操作流程,从而实现核酸的自动化提取。广泛应用于临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检

磁珠法核酸获取裂解液常见实验试剂及功效基本原理

  磁珠法核酸获取要以纳米技术微生物磁珠为质粒载体的这种新式核酸获取技术性,核酸分子结构可与磁珠表层的硅羟基产生非特异鉴别与融合,在外界电磁场的功效下产生集聚或分散化,完全解决传统式核酸获取全过程中抽滤、提取上清液等手工制作步骤,逐步实现核酸的自动化技术获取。运用于临床医学疾患诊断、静脉注射安全性、

多肽的溶解和保存

建议先用少量肽来试验最适溶解方法,只有当多肽完全溶解后,才能加入溶液并将之稀释至最终浓度。即先溶解,后加入缓冲液。注意:总是将多肽加入到适当溶剂中搅拌,而不能采用其它方式。            冻干多肽的溶解              多肽溶解中的主要问题是二级结构的形成。虽然疏水肽链二级结构的形

多肽的溶解和保存

    建议先用少量肽来试验zui适溶解方法,只有当多肽完全溶解后,才能加入溶液并将之稀释至zui终浓度。即先溶解,后加入缓冲液。注意:总是将多肽加入到适当溶剂中搅拌,而不能采用其它方式。        冻干多肽的溶解           多肽溶解中的主要问题是二级结构的形成。虽然疏水肽链二级结构的