差减cDNA文库的建立实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 ［＋］ 和 ［-］cDNA 文库（ATCC 或 Stratagene） 试剂、试剂盒 TE 缓冲液 EcoRI EDTA 蔗糖溶液 琼脂糖凝胶 TBE 缓冲液 乙醇 S1 核酸酶 S1 核酸酶缓冲液 苯酚 氯仿 异丙醇 乙酸钠 AluI ......阅读全文
CDNA文库筛选
CDNA文库筛选（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1．用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2．将过夜培养物以3000×g离心5min。3．分别用2ml λ-dil（10 mmol/L
cDNA/AFLP－Protocol
Preparation of Para-magnetic beads from Promega cat#Z5482:a) suspend magnetic particles in bottle - transfer 200 ul (200 ug) of beads per sampleof RNA
如何获得cDNA
cDNA的获取方法：1.用亲和层析法得到 mRNA 后，根据 mRNA 分子的 3' 端有 poly (A) 尾结构的原理，用 12~20 个核苷酸长的 oligo 与纯化的 mRNA 混合， oligo （ dT ）会与 poly (A) 结合作为反转录酶的引物，随机引物法合成的产物也是
cDNA文库构建
cDNA文库构建 实验方法原理 cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。
cDNA－LIBRARY－SCREENING
PREPARE SOLUTIONS1. 10mM MgSO4, 0.2% Maltose LB (100 mL):Mix 1.0 g of Bacto-Tryptone, 1.0 g of NaCl, 0.5 g of Yeast Extract, and 1.0 mL of 1M MgSO4. A
cDNA文库组标准流程八:pBlueScript－cDNA库扩增
1．试剂及配方：2 x LB （1升）： 20g 氯化钠 20g 蛋白提取物 10g 酵母提取物 加入蒸馏水至1升，用NaOH调pH值至7.0，高压灭菌2 x LB－甘油（12.5%）（200ml）175ml 2 x LB液体2
cDNA文库组标准流程三:cDNA双链合成
1. Superscipt II—RT合成第一链:1. 在一RNase-free的0.2ml PCR管中,加入 xul mRNA(大约500ng) 1ul Xho I Primer(1.4ug/ul) (5’ GAGAGAGAGAGAGAG
cDNA克隆的方法
cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段，而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝，因此，无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序，它可在任何宿主体内得以迅速表达 。
cDNA克隆的概念
cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段，而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝，因此，无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序，它可在任何宿主体内得以迅速表达
cDNA合成技术2
3. 第一链产量测定第一链掺入率(%)= 掺入cpm/总cpm ×100%掺入dNTP(nmol)=2nmol dNTP/μl ×反应体积(μl)×(第一链掺入率)设330为每mol dNTP的平均分子量合成cDNA量(ng)=掺入dNTP (nmol)×330ng/nmolmRNA向cDNA转变率
cDNA能存放多久
不要反复冻融就没有太大影响，可以放在-70度长期保存。
cDNA的筛选2
（三）免疫筛选制备Sepharose偶联细菌裂解液1.各用一个E.coli温度敏感溶源菌株（BTA 282（λgt11amp3）或BNN 97）单菌落接种于2×7.5ml培养基并于32℃生长过夜。2.过夜培养物用LB培养基稀释100倍，于32℃生长至OD600值为0.5。3.于45℃温育15min诱
cDNA的筛选1
（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil（10 mmol/L tris-Cl,
Differential－cDNA－Screening－Procedures
Differential cDNA Screening ProceduresThe protocols listed refer to cDNA library construction and preliminary differential screening procedures. They
cDNA的筛选3
免疫学染色1.为了洗去顶层琼脂上的残余物和细胞碎片，将硝酸纤维素滤膜一次最多5张转移放在摇床上的盘子（10×10cm）内，用25ml TBS室温洗涤10 min 2次。2.然后滤膜用25ml封闭缓冲液（每张90mm直径的滤膜至少15ml）于室温温育 30min，以封闭滤膜上的非特异性结合位点。不断晃
cDNA能存放多久
不要反复冻融就没有太大影响，可以放在-70度长期保存。
cDNA克隆的定义
中文名称cDNA克隆英文名称cDNA cloning定 义从基因的转录产物(如mRNA)开始，逆转录合成互补DNA(cDNA)，然后重组入载体，经过复制，筛选得到单一种cDNA分子的技术。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级学科）
cDNA浓度的测定
理论上讲，等质量是必要的。但是就反转录结果而言，里面的成分太多，测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度，然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录，再取等量反转录体系做PCR。另外，我看你用条带定量？这样很不准确，因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说，组间差8倍，差
cDNA合成技术1
Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶，使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶，cDNA第二链合成采用置换合成法，采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成
cDNA－文库的构建
此经典方案建立在 Gubler-Hoffman 法（Gulber-Hoffman 1983) 之上，分为六个阶段。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）上册，作者：黄培堂。实验材料λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶
cDNA合成技术3
2. 电泳分析(1) 用50mM NaCl， 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳， 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。(2) 取样品液， 用TE调整体积， 使第一链和第二链产率测定液的体积相同，加入等体积的2×样品缓冲液(20mmol/L NaOH， 20%甘油，0.025%溴粉兰）。(3)
cDNA浓度的测定
理论上讲，等质量是必要的。但是就反转录结果而言，里面的成分太多，测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度，然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录，再取等量反转录体系做PCR。另外，我看你用条带定量？这样很不准确，因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说，组间差8倍，差
cDNA－文库的构建
实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂盒 放线菌素 D
cDNA文库组标准流程五:cDNA双链和载体的连接
1.连接：根据载体和cDNA的电泳定量结果，每个样品设置3个比例的连接，即：insert/vector=1/3 incert/vector=1/1 insert/vector=3/1按以下体系依次加入： ddH2O xulT4 ligase
基因表达轮廓（gene－expressed－profile）技术1
基因表达谱或基因表达轮廓（gene expressed profile）技术就是利用mRNA提取、cDNA合成、酶切、连接、PCR及分子杂交等分子生物学基础操作技术，将某一生物材料在某一特定阶段表达的基因全部展示出来，通过测序及与数据库比较或通过目标和对照样品中所表达基因的比较，可以找出特异表达
锚定酶消化cDNA实验
试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀（实验方案 A, 第
cDNA－文库的构建2
阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液（选用)如希望，可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)
Experimental－Protocol－for－cDNA－Library－Construction
Experimental Protocol for cDNA Library ConstructionIdentify appropriate celltype over-expressing corresponding gene.Find out if transcription can be s
cDNA文库的构建1
分为六个阶段：阶段1：反转录酶催化合成cDNA第一链阶段2：cDNA第二链的合成阶段3：cDNA的甲基化阶段4：接头或衔接子的连接阶段5：Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA阶段6：cDNA与λ噬菌体臂的连接 [阶段1：反转录酶催化合成cDNA第一链] 1.在置于冰上的无菌微
cDNA文库的物化方法
基因工程初始阶段所用的方法，已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C，A T配对特性，分离目的基因。 例如：海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%（其稳定性高，溶解温度高），通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA，最后经氯化铯平衡梯度离心，得到相对分子量为1.9X107Dal