章海兵团队发现调控细胞生死转换的重要分子机制
9月13日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院营养与健康研究所章海兵研究组的最新研究成果“Ubiquitination of RIPK1 suppresses programmed cell death by regulating RIPK1 kinase activation during embryogenesis”。该研究揭示了重要激酶蛋白RIPK1通过K376位点的泛素化修饰，调控细胞生存与死亡命运转换的关键分子机制，为相关疾病的治疗提供了新的思路。细胞死亡是多细胞生物体维持自身稳态与正常发育的基本生命活动，人类多数疾病从根本上说归因于细胞死亡异常（过多或过少）。RIPK1蛋白是调控细胞凋亡、细胞程序性坏死以及炎症信号通路中的关键分子，参与胚胎发育、造血系统发育以及免疫稳态维持等多种重要生物学过程，最近有报道发现RIPK1基因突变的病人同时表现自身免疫缺陷及自......阅读全文
中科院上海药物所等单位确证肾癌治疗新靶点
中科院上海药物所蒋华良课题组、杨财广课题组及北京基因组所刘江课题组在一项合作研究中确证了肾癌治疗新靶点SPOP。9月12日，相关成果在线发表于《癌症细胞》杂志。 以索拉非尼和舒尼替尼为代表的靶向抗肿瘤药物是晚期肾癌的一线治疗药物，但对转移性肾癌的疗效十分有限，并且容易产生耐药。因此，当前亟待发
生物物理所等在神经细胞凋亡领域取得新进展
3月9日，中科院生物物理研究所袁增强研究组等在分子生物学杂志EMBO reports在线发表了题为Lysine methylation of FOXO3 regulates oxidative stress-induced neuronal cell death的论文，报道了转录因
经典NFKB－p52信号通路简介
最基本的NF-κB信号通路，包括受体和受体近端信号衔接蛋白， IκB激酶复合物， IκB蛋白和NF-κB二聚体。 当细胞受到各种胞内外刺激后，IκB激酶被激活，从而导致IκB蛋白磷酸化，泛素化，然后IκB蛋白被降解， NF-κB二聚体得到释放。然后NF-κB二聚体通过各种翻译后的修饰作用而被进
细胞凋亡，细胞凋亡通路和细胞凋亡检测的几种检测方法
一、形态学观察方法 1、HE染色、光镜观察：细胞凋亡后呈圆形，胞核深染，胞质浓缩，染色质成团块状，细胞表面有“出芽”现象。 2、丫啶橙(AO)染色，荧光显微镜观察：活细胞核呈黄绿色荧光，胞质呈红色荧光。细胞凋亡|后（细胞凋亡,细胞凋亡通路，细胞凋亡检测）核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧
sumo化与磷酸化修饰联合分析
随着质谱技术的不断进步，大规模修饰组学的方法也越来越成熟，PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定，找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发
流式细胞光度数分析肿瘤细胞凋亡——修饰性核苷酸标记法
实验材料肿瘤细胞悬浮液试剂、试剂盒福尔马林HBSS乙醇TdT反应缓冲液TdT贮存液抗生素蛋白液仪器、耗材离心机制冰机烧杯载玻片盖玻片荧光显微镜离心管FCM仪流式细胞术（Flow Cytometry, FCM）是一种可以对细胞或亚细胞结构进行快速测量的新型分析技术和分选技术。其特点是：①测量速度快，最
营养所发现TRAF6促进癌症发展的新机制
近日，《美国癌症研究》杂志 (Cancer Research) 发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的题为TRAF6 Upregulates Expression of HIF-1αand Promotes Tumor Angiogenesis的研究论文，该研究揭示了TRAF6癌
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
关于分泌蛋白的修饰加工糖基化的介绍
这些修饰包括糖基化、羟基化、酰基化（酰化）、二硫键形成等，其中最主要的是糖基化，几乎所有内质网上合成的蛋白质最终被糖基化。糖基化的作用是： ①使蛋白质能够抵抗消化酶的作用； ②赋予蛋白质传导信号的功能； ③某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。 糖基化有两种类型： （1）糖蛋白是由寡糖
胰岛β细胞线粒体稳态调控的分子机制被阐明
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517459.shtm中国科学院上海药物研究所李静雅课题组和谭敏佳课题组合作，联合浙江大学基础医学院孟卓贤课题组、上海交通大学附属仁济医院吴琳石课题组，共同解析了糖尿病患者胰岛β细胞线粒体稳态失衡的新分子机
精准检测去泛素化酶活性新型双泛素底物的使用
泛素-蛋白酶体（ubiquitin-proteasome system，UPS）途径介导的蛋白降解是机体调节细胞内蛋白水平与功能的一个重要机制。负责执行这个调控过程的组成成分包括泛素及其启动酶系统和蛋白酶体系统。泛素启动酶系统负责活化泛素，并将其结合到待降解的蛋白上，形成靶蛋白多聚泛
细胞内蛋白质降解的主要途径有哪些
真核细胞内蛋白质的降解途径主要有三种，溶酶体途径、泛素化途径和胱天蛋白酶(caspase)途径。1、溶酶体途径：蛋白质在同酶体的酸性环境中被相应的酶降解，然后通过溶酶体膜的载体蛋白运送至细胞液，补充胞液代谢库。胞内蛋白：胞液中有些蛋白质的N端含有KFERQ信号，可以被HSC70识别结合，HSC70帮
关于泛素化反应过程的介绍
具体过程：泛素化修饰涉及泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的一系列反应：首先在ATP(红色所示)供能的情况下酶E1(蛋白质编号1r4n)粘附在泛素分子尾部(淡黄色所示)的Cys残基上（绿色所示，注意在这个结构中，Cys突变为Ala）激活泛素，接着，E1将激活的泛素分子转移到E2酶上（
去泛素化酶（DUBs）家族介绍
去泛素化酶（DUBs）,是一类数量很大的蛋白酶类家族。它主要通过水解泛素羧基末端的酯键、肽键或异肽键，将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来。人类基因组编码近100种去泛素酶，使得它们成为泛素系统酶中最大家族。在人类中的去泛素化酶基因，可分为两大类：半胱氨酸蛋白酶家族和金属蛋白酶
如何诱导细胞凋亡，对抗致命的纤维化？
正常情况下，肌成纤维细胞（myofibroblasts）负责创伤愈合、纤维化形成。当它们完成修复损伤组织的工作之后，会启动凋亡程序“自我毁灭”（self-destruct）。但是，一旦它们不响应凋亡信号，反而过度活跃下去，最终会导致瘢痕的形成（由坚硬的结缔组织累积而成），进而阻碍器官正常运作。如
武汉大学李红良团队在肝病研究领域取得连续突破
细胞凋亡信号调节激酶1（ASK1）的激活是非酒精性脂肪性肝炎（NASH）进展的关键驱动力，并且代表了NASH治疗的有吸引力的治疗靶标。然而，在NASH发病机制中ASK1激活的分子和细胞机制仍未完全了解。2019年6月20日，武汉大学李红良团队在Hepatology上在线发表了题为“Hepatoc
线性泛素化在调控IFN抗病毒信号的新机制的应用
近年来，蛋白质泛素化成为基因表达调控研究的热点，泛素化在各类细胞信号通路中发挥重要的调节作用。泛素分子通常含有7种内部赖氨酸残基，通过这些残基可与其他泛素分子的甘氨酸C端相连产生分支，形成多聚泛素化修饰。 近年来又鉴定了一种新的多聚泛素链——线性泛素链，由两个泛素N、C端首尾相接而成。已有研究鉴定线
靶向干预m6A通路抑制癌细胞新策略被发现
近日，国际期刊美国《公共科学图书馆—生物学》（PLOS Biology）在线发表了最新研究成果。该成果揭示了RNA甲基化m6A阅读器YTHDF2在细胞周期中的作用，并阐明细胞周期通过影响YTHDF2蛋白稳定性形成前馈调控回路的分子机制，为通过靶向干预m6A通路抑制癌细胞增殖提供新的策略。 论文
昆明动物所阐明多能干细胞基因组稳态维持新机理
多能干细胞（Pluripotent stem cells，PSCs）因在体外具无限增殖和分化为不同类型细胞的潜能，在再生医学领域中颇具应用前景，也成为目前临床上最具潜能的成药细胞。PSCs制备过程中的标准化、规模化及细胞质量稳定性是走向临床应用的先决条件，但人PSCs在体外扩增培养过程中，易出现遗传
双剑合璧－|－sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步，大规模修饰组学的方法也越来越成熟，PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定，找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
我国学者在蛋白质酪氨酸泛素化方面取得进展
图 FUSEP化学生物学技术用于系统研究赖氨酸和非赖氨酸泛素化的位点信息 在国家自然科学基金项目（22137004、22307062）资助下，清华大学药学院尹航教授团队在蛋白质泛素化研究领域取得新进展，开发了FUSEP（Fusion E2-Ub-R74G Profiling）化学生物学技术，揭示了
双剑合璧－|－sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步，大规模修饰组学的方法也越来越成熟，PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定，找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（二）
由此可见，泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近，甚至从重点项目数看，18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明，泛素化研究资助项目在医学部中一共98项，总资助金额高达4700万元。由此可见，泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”，基金申请的一大热点。图2.国自然基金项
西兰花中的吲哚3甲醇（I3C）竟然可以有效恢复PTEN活性
近日，Beth Israel Deaconess医学中心的研究人员指出了肿瘤细胞中PTEN活化降低的元凶之一——E3泛素连接酶（WWP1），同时他们发现，西兰花中的吲哚-3-甲醇（I3C）竟然可以有效恢复PTEN活性，进而遏制癌症发生发展！肿瘤本质上是基因病。多种环境和遗传致癌因素引发DNA损害
细胞因子和BRAF之间的信号通路或会促进肿瘤的生长
BRAF蛋白在很多类型癌症发生中都扮演着非常关键的角色，包括黑色素瘤，如今研究人员发现，BRAF能被生长因子所激活，随后刺激下游蛋白表达，进而促进癌细胞生长、侵袭和生存；然而目前研究人员并不是非常清楚BRAF如何参与到与促炎性因子释放的信号的交流过程中去，这些促炎性因子能被肿瘤周围环境的免疫细胞
ITCH有望作为黑色素瘤潜在治疗靶点
BRAF蛋白在很多类型癌症发生中都扮演着非常关键的角色，包括黑色素瘤，如今研究人员发现，BRAF能被生长因子所激活，随后刺激下游蛋白表达，进而促进癌细胞生长、侵袭和生存；然而目前研究人员并不是非常清楚BRAF如何参与到与促炎性因子释放的信号的交流过程中去，这些促炎性因子能被肿瘤周围环境的免疫细胞
NSMB：科学家发现调节基因组复制的代码信号
三年前，来自西班牙国家癌症研究中心的研究者首次对干预细胞重要过程的特殊蛋白进行了描述，该细胞过程即细胞分裂期间遗传物质的复制过程，当时研究者发现，DNA复制的关键基因组区域充满着特殊蛋白的修饰，即为小分子泛素样修饰蛋白（Small ubiquitin-like modifier， SU
Science－Translational－Medicine：下调A20促进肺腺癌免疫逃逸
炎症是众所周知的肺部肿瘤发生的驱动因素。肿瘤细胞逃避严格的体内平衡控制的一种策略是通过减少强大的抗炎蛋白肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)的表达，也就是众所周知的A20。在肺癌患者和小鼠模型中，作者观察到肿瘤细胞A20的固有缺失显著促进了肺癌的发生，并与CD8+T细胞介导的免疫监视减少有
关于染色质免疫沉淀法的基本介绍
染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecipitation，ChIP）是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。 核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛
NFKB信号通路研究背景
在该途径中，NF-κB/Rel蛋白被IκB蛋白结合和抑制。生长因子、促炎细胞因子、化疗、放疗和抗原受体激活IKK复合物，该复合物磷酸化IκB蛋白。IκB的磷酸化导致其泛素化和蛋白酶体降解，释放NFκB/Rel复合物。转录因子NF-κB由此释放并促进细胞因子、细胞粘附分子和抗凋亡蛋白的表达。免疫系统发