质谱界重磅:继Nature子刊后董梦秋团队又发Nature
交联质谱技术(英文全称Chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry, 简称CXMS或XL-MS);CXMS利用化学交联剂将蛋白质或蛋白质复合体中空间距离足够接近的两个氨基酸通过共价键连接起来,酶切成肽段后用质谱鉴定出交联位点,从而获取低分辨度结构信息,帮助推断蛋白质在三维空间的折叠状态以及蛋白-蛋白相互作用的大致区域。相比于晶体和冷冻电镜技术, CXMS对样品量和样品纯度要求低,可捕获蛋白质在溶液中的动态,并且具有简单、快速等优点。因此,CXMS在过去十年中得到了广泛应用,常常助力解析大型蛋白质复合体的精细结构,以及寻找蛋白与蛋白之间直接相互作用的区域。 交联质谱技术有三个支撑点(交联剂、质谱仪器和方法、鉴定软件)和一个原动力(解决实际生物学问题)。当前交联质谱技术的一个明显局限是过分依赖氨基特异性的NHS酯交联剂。此类交联剂主要靶向赖氨......阅读全文
常用交联剂与交联剂选择
什么是交联剂 交联剂是一类小分子化合物,分子量一般在200-600之间,具有2个或者更多的针对特殊基团(氨基、巯基等)的反应性末端,可以和2个或者更多的分子分别偶联从而使这些分子结合在一起。在生命科学研究中,巧妙地运用交联剂可以使很多工作取得突破。交联剂的应用 交联剂已经被广泛地应用于:
质谱界重磅:继Nature子刊后董梦秋团队又发Nature
交联质谱技术(英文全称Chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry, 简称CXMS或XL-MS);CXMS利用化学交联剂将蛋白质或蛋白质复合体中空间距离足够接近的两个氨基酸通过共价键连接起来,酶切成肽段后用质谱
雷晓光课题组在发展化学交联质谱技术领域取得最新进展
化学交联结合质谱技术 (chemical cross-linking coupled with mass spectrometry, CXMS) 是近年来迅猛发展的一种检测蛋白质结构和蛋白质相互作用的方法。随着质谱仪器以及交联数据搜索软件的发展,CXMS技术已经获得了长足的进步,但在该技术中能够
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通过相
NHS与胺反应的交联剂化学特性
NHS 酯反应化学NHS 酯是通过羧酸盐分子的碳二亚胺活化形成的反应基团(参阅碳二亚胺交联剂化学)。NHS 酯活化的交联剂和标记化合物在生理至弱碱性条件下(pH 7.2 至 9)与伯胺反应,形成稳定的酰胺键。反应释放出 N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)。化学偶联伯胺的 NHS 酯反应方案。R 代表具有
氨基树脂交联剂在涂料中的应用
一、氨基树脂交联剂应用氨基树脂(三聚氰胺-甲醛、苯代三聚氰胺甲醛和尿素甲醛(尿醛)树脂)在热固性涂料中的主要作用是,将主要的成膜材料分子,通过化学反应交联成一个三维(立体)网状结构。这种网状结构是通过氨基树脂分子与成膜材料分子上的官能团的反应,并和其他氨基树脂分子同时发生缩聚反应而得到的。氨基树脂很
氨基树脂交联剂在涂料中的应用
一、氨基树脂交联剂应用氨基树脂(三聚氰胺-甲醛、苯代三聚氰胺甲醛和尿素甲醛(尿醛)树脂)在热固性涂料中的主要作用是,将主要的成膜材料分子,通过化学反应交联成一个三维(立体)网状结构。这种网状结构是通过氨基树脂分子与成膜材料分子上的官能团的反应,并和其他氨基树脂分子同时发生缩聚反应而得到的。氨基树脂很
董梦秋、雷晓光eLife发表重要成果
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为“Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and
学者开发出基于氟磺酸的可富集化学交联剂
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员唐士兵与浙江大学研究员杨兵、北京航空航天大学副教授刘超团队合作,在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持下,开发出一种新型氟磺酸类可富集化学交联的非天然氨基酸并在活细胞中研究蛋白质直接相互作用。相关成果发表于《自然-通讯》。蛋白质-蛋白质相互作用
学者开发出基于氟磺酸的可富集化学交联剂
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员唐士兵与浙江大学研究员杨兵、北京航空航天大学副教授刘超团队合作,在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的支持下,开发出一种新型氟磺酸类可富集化学交联的非天然氨基酸并在活细胞中研究蛋白质直接相互作用。相关成果发表于《自然-通讯》。 蛋白质-蛋白质
蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an
董梦秋:Observing-Protein-Unfolding-Using-Crosslinker-by-LCMS/MS
分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医
科学家开发蛋白质复合物原位解析新技术
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500192.shtm作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显
德国应用化学:蛋白质复合物原位解析新技术
作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和
中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术
近日,中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通
研究开发出可一步富集和定量分析的新型交联剂
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群团队研制了基于二甲基哌啶基的可一步富集和定量分析的新型交联剂,通过降低样品损失,实现了少量细胞(1×104个)中蛋白质复合物的原位交联质谱(XL-MS)分析。相关成果发表在《德国应用化学》。新型交联剂特征。大连化物所供图细胞内的蛋白质通过构象
董梦秋:化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼
在蛋白质组学分析方法中,质谱获得的是多肽序列结构的信息;那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息?近几年来,董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作,主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下,很多研究者都把样品一分为二,一份做冷冻电镜,一份做交联质谱。那么交联
生物打印墨水及组织修复功能支架构建领域获进展
近日,中国科学院深圳先进技术研究院医药所人体组织与器官退行性研究中心副研究员阮长顺课题组、研究员潘浩波课题组与北京积水潭医院教授陈大福合作在生物打印墨水及组织修复功能支架构建领域获得新进展。该研究基于海藻酸盐/聚赖氨酸基新型聚电解质生物墨水开展,成功突破了传统海藻酸盐基-钙离子打印墨水体系的不稳
质谱及质谱的目的
质谱,是一种分析方法,原理就是让带电原子、分子或分子碎片按质荷比的大小顺序排列,打出相应的谱线。待分析的样品分子在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子,进入由电场和磁场组成的分析器中;其中离子束中速度较慢的离子通过电场后编转大,
气体分析质谱质谱原理
质谱仪配备QuaderaTM 分析软件, 操作简单, 功能强大, 有128 个检测通道,可生成用户特殊应用软件界面. 在参数设置, 多种实测方式, 谱库, 数据统计, 谱图放大, 光标, 输入输出模块等性能的支持下, 可以更方便地进行定性定量分析以及在线离线分析. Omnistar/
质谱
不同质荷比的离子经质量分析器分离,而后被检测并记录下来的谱图叫作质谱图。简称质谱。质谱图的横坐标是质荷比(m/z) ,纵坐标是离子强度;质谱法(Mass Spectrometry) 即质谱分析法, 一般亦简称为质谱;质谱计(Mass Spectrometer): 采用顺次记录各种质荷比离子的强度的方
什么是质谱及质谱图
质谱(又叫质谱法)是一种与光谱并列的谱学方法,通常意义上是指广泛应用于各个学科领域中通过制备、分离、检测气相离子来鉴定化合物的一种专门技术。质谱法在一次分析中可提供丰富的结构信息,将分离技术与质谱法相结合是分离科学方法中的一项突破性进展。在众多的分析测试方法中,质谱学方法被认为是一种同时具备高特异性
CASMS分论坛:相互作用组学和结构蛋白质组学前沿
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” (相互作用组学和结构蛋白质组学
打质谱打质谱!你知道质谱究竟为何物吗?
随着质谱技术的日新月异的进步,作为研究科研的有利工具,也越来越受到大家的亲睐和欢迎,其中在各类组学中的广泛应用也会各类质谱仪器的选择密不可分,那对于组学中常用的仪器你了解多少,对于其区别和优势有是否清楚,今天我们就主要讲一讲质谱哪些事儿。 那我们先吊一下书袋子, 什么叫质谱?质谱(又叫质谱法)
打质谱打质谱!你知道质谱究竟为何物吗?
随着质谱技术的日新月异的进步,作为研究科研的有利工具,也越来越受到大家的亲睐和欢迎,其中在各类组学中的广泛应用也会各类质谱仪器的选择密不可分,那对于组学中常用的仪器你了解多少,对于其区别和优势有是否清楚,今天我们就主要讲一讲质谱哪些事儿。 那我们先吊一下书袋子, 什么叫质谱
质谱介绍及质谱图的解析
质谱法是将被测物质离子化,按离子的质荷比分离,测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。质量是物质的固有特征之一,不同的物质有不同的质量谱——质谱,利用这一性质,可以进行定性分析(包括分子质量和相关结构信息);谱峰强度也与它代表的化合物含量有关,可以用于定量分析。 质谱仪一般由四部分组成:
促进质谱新技术,传承质谱文化
——第六届中国仪器仪表学会分析仪器分会质谱专业委员会诞生2022年8月26日,由中国仪器仪表学会分析仪器分会质谱仪器专家组和分析测试百科网主办的《第五届质谱仪器研发论坛》在北京市怀柔区举办。本次大会旨在进一步加强我国质谱新技术研发、应用、产业化及投资等方面的交流、促进我国质谱行业健康快速发展。质谱研
质谱介绍及质谱图的解析
质谱法是将被测物质离子化,按离子的质荷比分离,测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。质量是物质的固有特征之一,不同的物质有不同的质量谱——质谱,利用这一性质,可以进行定性分析(包括分子质量和相关结构信息);谱峰强度也与它代表的化合物含量有关,可以用于定量分析。质谱仪一般由四部分组成:进
质谱介绍及质谱图的解析
质谱法是将被测物质离子化,按离子的质荷比分离,测量各种离子谱峰的强度而实现分析目的的一种分析方法。质量是物质的固有特征之一,不同的物质有不同的质量谱——质谱,利用这一性质,可以进行定性分析(包括分子质量和相关结构信息);谱峰强度也与它代表的化合物含量有关,可以用于定量分析。 质谱仪一般由四部分
dart质谱和maldi质谱的区别
这个叫做secondary ion mass spectrometry。用在固体分析的多一些。通常直接用粒子束轰击固体表面,然后固体表面会被“离子化”,采集然后分析这些离子称为二次离子质谱法。举个例子,你用DART离子源发射离子到表面,然后生成离子,之后再分析就是二次离子质谱分析。但是如果你用MAL