蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and comparing protein conformational states”。在这项研究中,研究人员开发了一种赖氨酸靶向交联剂,以改进创新性的技术——蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术(chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry analysis,CXMS)。 NIBS的董梦秋和雷晓光两位研 究员是本文共同通讯作者。董梦秋研究员早年毕业于四川大学,1995年硕士毕业于中科院上海生化所,2001年博士毕业于耶鲁大学,曾经在美国加州大学圣 地亚哥......阅读全文
董梦秋:破译衰老密码
办公桌上、窗台上,摆满了绿植,还有一个精致的小鱼缸,四平方米左右的办公室干净温馨。在见识前几位PI简陋的办公室后,这里的风景让人眼前一亮。“哈哈,肯定是黄牛说的,他老说我这是闺房。”董梦秋的一串爽朗笑声瞬间让我轻松许多。 受“女生不太擅长理科”这种根深蒂固观点的影响,我向来对很牛的女科研人
董梦秋:化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼
在蛋白质组学分析方法中,质谱获得的是多肽序列结构的信息;那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息?近几年来,董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作,主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下,很多研究者都把样品一分为二,一份做冷冻电镜,一份做交联质谱。那么交联
质谱界重磅:继Nature子刊后董梦秋团队又发Nature
交联质谱技术(英文全称Chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry, 简称CXMS或XL-MS);CXMS利用化学交联剂将蛋白质或蛋白质复合体中空间距离足够接近的两个氨基酸通过共价键连接起来,酶切成肽段后用质谱
-NIBS董梦秋研究组-解析衰老机制
北京生命科学研究所董梦秋研究组致力于衰老过程及其调控机制等方面的研究(专访董梦秋:学科交融,思想交融的结晶),近期其研究组与其他研究组合作接连发表文章,分别解析了秀丽线虫衰老有关的两个蛋白:PUD-1 和 PUD-2的生物学功能,以及钙离子/钙调素依赖性蛋白激酶II(CAMKII)和蛋白磷酸
NIBS董梦秋组发表Nature子刊文章
2012年7月8日,北京生命科学研究所董梦秋实验室与中科院计算技术研究所贺思敏教授领导的pFind研究团队合作在《Nautre Methods》在线发表题为“Identification of Cross-linked Peptides from Complex Samples”的文章。
董梦秋、雷晓光eLife发表重要成果
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为“Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and
董梦秋、贺思敏Nature-Methods发表重要成果
蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。 二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直
董梦秋:Observing-Protein-Unfolding-Using-Crosslinker-by-LCMS/MS
分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医
董梦秋发现线粒体的“超氧炫”频率可以预测线虫的寿命
2014年2月12日,北京生命科学研究所董梦秋实验室与北大分子医学研究所程和平实验室在《自然》杂志在线发表题为“Mitoflash frequency in early adulthood predicts lifespan in Caenorhabditis elegans”的文章,报
蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展
3月8日,国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所(NIBS)、北京大学和清华大学等处的一项最新成果,题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an
享受“慢科研”——访北京生命科学研究所杜立林、董梦秋夫妇
城市西北角,北京生命科学研究所(NIBS)。在这里,一对科研伉俪共同工作,他们是妻子董梦秋和丈夫杜立林。2007年,他们双双从海外归来,在这里分别建立起自己的实验室,既是同事,又是夫妻。他们如何相识、相恋、相伴,携手从事生命科学研究?从研究生到独立研究员,一路走来,又有多少故事?他们又有怎样的独
董梦秋等钙离子/钙调素依赖性蛋白激酶II调控机制获进展
2013年6月25日,北京生命科学研究董梦秋实验室在《eLIFE》杂志发表题为“CAMKII and Calcineurin regulate the lifespan of Caenorhabditis elegans through the FOXO transcription fact
蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题
蛋白质(Protein)是生物体中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物细胞,作为生命的物质基础之一,蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用,因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。现代研究结果发现越来越多的多肽同蛋白质一样
雷晓光课题组在发展化学交联质谱技术领域取得最新进展
化学交联结合质谱技术 (chemical cross-linking coupled with mass spectrometry, CXMS) 是近年来迅猛发展的一种检测蛋白质结构和蛋白质相互作用的方法。随着质谱仪器以及交联数据搜索软件的发展,CXMS技术已经获得了长足的进步,但在该技术中能够
蛋白质凝胶电泳后或者质谱后怎么鉴定
看你的目的.如果你只是检测目标蛋白大小的话,加上蛋白质marker,考染观察条带大小即可.你要是想知道蛋白质的氨基酸序列的话就去打质谱.话说蛋白质的质谱就是序列分析.
如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异
1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末,或经过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽,离子化的多肽进入质谱,母离子检
如何判定蛋白质的质谱鉴定结果的差异
1 单个蛋白鉴定1. 用于鉴定纯化的单个蛋白的溶液或粉末,或经过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的单个条带或二维电泳的单个点。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分离多肽,离子化的多肽进入质谱,母离子检
质谱鉴定,常见疑问解答
问题1、一级质谱和二级质谱有什么区别?什么时候做一级,什么时候做二级?答:一级质谱鉴定的方式主要为胎指纹图谱(PMF),即利用质谱仪精确测量酶解片段的分子量并搜库比较实现蛋白质的鉴定;二级质谱是在一级质谱的基础上再选择部分肽段做进一步的破碎并对碎片进行深入分析和比较,鉴定出该肽段的序列并结合PMF的
暨大研发另类质谱鉴定算法,大幅提高蛋白质组鉴定能力
暨南大学的研究人员利用翻译组测序(RNC-seq)数据作为稳态细胞内蛋白质的“标准答案”,并另辟蹊径,提出了蛋白水平上的一种简单有效的多算法结果整合策略,不用做额外的实验,零成本轻松提高蛋白质组鉴定数量,同时有效降低假阳性率。 鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是
CASMS分论坛:相互作用组学和结构蛋白质组学前沿
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月11日的“Frontiers in Interactomics and Structural Proteomics” (相互作用组学和结构蛋白质组学
暨大另类质谱鉴定算法策略大幅提高蛋白质组鉴定能力
鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是蛋白质组研究的标准研究方法。从质谱谱图中鉴定蛋白质需要依赖搜库算法,现有许多算法被开发出来,常见的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料:修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒:消化缓冲液 萃取液
利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝 G-250
利用纳升级液相色谱--串联质谱进行蛋白质鉴定实验
实验材料 修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒 消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材 多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤 3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝
2014年度北京质谱年会大会报告
2014年度北京质谱年会于2014年3月21~22日在北京拉斐特城堡酒店隆重开幕。本次质谱年会由北京理化分析测试技术学会北京质谱分会主办,国家大型科学仪器中心北京质谱中心协办。来自各大科研机构、院校、厂商的科研工作者们近400人参加并聆听了年会开
2020CMSS精彩继续,质谱揭开生命组学与药代的神秘面纱
分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医
蛋白鉴定方法之质谱相关技术
质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞
质谱鉴定微生物的原理
在应用MALDI-TOF MS时,通常将微生物样本与一种饱和的低分子量无机化合物溶液(称为基质)进行混合加在靶板上,待干后样本与基质共结晶后形成了以基质包裹构架的样本固体沉淀。样本基质结晶体经激光辐射,基质从激光中吸收能量使样品吸附,基质与样品之间发生电荷转移使得样品分子电离,离子在加速电场下获
田志新:位点和结构特异性定量N糖蛋白组学研究进展
分析测试百科网讯 2020年9月15日,2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020CMSS)进行到第二天,由北京生命科学研究所董梦秋研究员、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究员、同济大学田志新教授、中国医学科学院药物研究所张金兰研究员;吉林大学药物代谢研究中心顾景凯教授、军事医学科学院放射