植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布
9月8日，The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台，论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrieving Upstream Regulators from Plant Multi‐omics Data。该工作系统分析并整合了64个植物物种上万套组学数据，以此推测用户输入基因（或列表）及基因组位点（或列表）的上下游调控因子，这一大数据驱动的平台为进行准确深入的功能及调控网络研究提供了重要线索。 随着高通量测序技术的发展，大量非模式植物特别是各种作物的全基因组序列被公布，对所研究基因及位点或由高通量数据获得的基因列表及位点列表进行功能挖掘并推测上下游调控因子的需求极为迫切。但是除少数几个通路研究相对深入的模式植物，如拟南芥、水稻外，大......阅读全文
植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布
9月8日，The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台，论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi
植物多组学比较和进化研究平台发布
近日，西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台，相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础，而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用，在
新发现：植物生物钟调控因子
为了适应地球自转引起的环境周期性变化，地球上几乎所有的真核生物都进化出了内源计时器——生物钟，它可以维持细胞内近24小时的基因表达节律性以适应环境中光温因子的昼夜动态变化。生物钟参与调控植物体内几乎所有的生长发育和代谢过程，如光周期依赖的开花时间、发育、叶片衰老，以及植物对生物与非生物胁迫的响应
我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络
近日，中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者，通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》（Plant Cell）。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状，其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来，穗发育过程中基因表达动态、代谢变
植物所揭示新的植物生物钟周期精细调控因子
生物钟作为植物细胞内在计时机制，通过协调基因表达的节律性和代谢稳态等，使植物更好地适应地球自转和公转引起的昼夜性和季节性环境变化。当植物内源生物钟系统和外界光-暗周期相一致时，植物会获得最佳生长，因此，维持较为稳定的生物钟周期对植物生长发育至关重要。 近期，中国科学院植物研究所王雷团队发现一类
新研究发现植物特有囊泡运输调控因子
12月28日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表华南师范大学生命科学学院高彩吉团队和张盛春团队合作的最新成果。他们研究发现了植物特有囊泡运输调控因子BLISTER（BLI），并揭示其调控Retromer核心复合体组装和内体定位，进而调控内体介导的细胞膜和液泡蛋白分选的分子机制。 在植物细
空间多组学技术对阐明药用植物合成途径起推进作用
陕西省西安植物园资源植物功能基因挖掘与应用团队探讨了空间多组学技术的应用对进一步阐明红豆杉、长春花等药用植物天然产物合成途径的推进作用，并系统阐明了细胞水平合成通路的解析作为合成生物学的蓝图扮演的重要角色以及未来工业化进程中面临的挑战，近日相关研究内容受邀发表在Trends in Plant Sci
新模型为作物育种与环境适宜性评价提供新思路
作物育种与环境评价的代谢调控网络模型 中国农科院供图近日，中国农业科学院都市农业研究所植物光生物学团队与四川大学合作，系统阐述了复杂环境因子对植物重要次级代谢产物合成与调控机制，并提出了一种基于多组学、田间试验以及植物工厂技术的植物代谢调控网络新模型，为作物育种与环境适宜性评价提供了新思路
分子植物卓越中心揭示抗铝毒转录因子调控机制
10月21日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zin
我所基于空间多组学技术揭示MASLD中GPR35的脂代谢调控机制
近日，我所本草物质科学研究室（2800组群）梁鑫淼研究员和朴海龙研究员团队运用前沿空间代谢组学和空间转录组学技术，深入剖析了肝脏的区带化特性（Liver Zonation）。该团队结合肝脏区带化特性，揭示了G蛋白偶联受体——GPR35在调节代谢功能障碍相关脂肪肝病（MASLD）中的关键机制，有望为脂
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源，其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期，中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景，相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上，引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源，其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期，中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景，相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上，引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
首个菊科多组学数据平台AMIR发布
10月8日，华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、药用植物资源可持续利用团队梅之南教授和杨庆勇教授课题组，发布了首个专门面向菊科植物的多组学数据库平台——Asteraceae Multi-omics Information Resource（AMIR）。该平台涵盖了74种菊科植物的多
水稻多器官单细胞多组学图谱问世
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉，该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构，构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱，系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用，有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。 单细胞组学是近年来生命科学
单细胞多组学高通量测序平台（一）
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息，如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程，而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息（如DNA层面的基因序列），从而解读生物体运行机制，应用于疾病的诊断和治
CASMS分论坛：多组学整合与大数据
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中，哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所（国家生物信息中心）了解到，该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作，建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory，旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
单细胞多组学高通量测序平台（二）
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出，但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞，早期的技术代表F
细胞分泌因子的调控
干细胞的细胞膜表面存在多种细胞因子受体，当细胞因子与其受体结合后，使受体结构发生改变，引起一系列变化，从而调控皮肤干细胞的增殖和分化。角质细胞生长因子，表皮生长因子，转化生长因子和抑制性信号物质(如肾上腺素)等都参与皮肤增殖调控。例如，角质细胞生长因子与其受体结合后可促进其受体的二聚体化以及自身的磷
上海生科院揭示新RNA剪接因子调控植物脱落酸信号途径
9月25日，国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为An Arabidopsis PWI and RRM motif-containing protein is critical for pre-mR
版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展
通过比较基因组学，在基因组层次上研究特定基因家族的进化，进而揭示其变化的原因和机制，已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析（GWAS）是通过推断
单细胞多组学整合技术有了新突破
近日，军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术，能够检测单个细
空间多组学质谱技术研讨会（2023）
空间多组学技术结合了组学技术（如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等）和组织学技术，有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。 质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一，可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子（如
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘
苦荞 董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高，即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁，包括种子
单细胞多组学整合技术有了新突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日，军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能
P4－China－2016多组学与系统生物学论坛
自从精准医学概念提出以来，它一直都是全球最热的研究领域，政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言，基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛，从系统生物学出发，对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨，并分享了科研成果应用于