Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型

人类细胞内的DNA,即我们熟知的基因型,为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的,但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成,这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色,身高,体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些特征中都可以被我们周围的环境所调节,例如,暴露在压力、阳光或微生物下,可以导致一系列结果。 近日,《科学》杂志发布了《从基因型到表型》(Genotype to Phenotype)特刊,扩展了我们对基因型和表型的认知,并探索了在理解人类表型发展的影响因素方面的最新进展。在本期特刊的四篇综述文章中,十余位全球顶尖研究人员展示包括单细胞基因组学分析、GWAS在内的多种方法。这些方法将共同增进了我们对基因型和表现型之间复杂关系的理解,并有助于推动人类健康。 解析人类基因型与表现型关联来源 Deconstructing the sour......阅读全文

植物病理表型测量系统概述

  植物病理表型测量系统PathoScreenProBlu集可见光成像、多光谱成像、叶绿素荧光成像和GFP荧光成像功能于一身,是目前国际上功能最全、成像面积最大(最大成像面积53cm x 53cm)的病理表型测量系统。该系统配备600万像素高清相机,全自动滤光轮和功能强大的分析软件,操作简单、功能强

人单核/-巨噬细胞的表型检测

实验步骤基本方案材料待 测 单 个 核 细 胞(肝素抗凝血或肝素抗凝骨髓)或 外 周 血 单 个 核 细 胞(单 元 8.1)或者单核/巨 噬 细 胞(单 元 8. 5 , 推荐采用阴性分选)PBSPBS/肝素:含 0.1% (V/V ) 肝 素 的 PBS阻 断 IgG,浓 度 3 mg/ml (

植物表型成像分析图片展

 FluorCam和PlantScreen分别是国内外广泛使用的叶绿素荧光成像系统和植物大型表型成像分析平台。 全球顶尖的研究机构充分发挥了它们的功能,取得了顶尖的研究成果。我们将陆续摘选代表性研究论文中的成像图分享给大家。这些成像图“华而又实”——画面优美、结论直观、真实可信,从中可以获得视觉和思

论链球菌表型耐药分析

关键词:链球菌;抗生素;药敏试验;耐药性摘要:链球菌病是主要的人兽共患传染病之一,发病率较高,给养殖业和公共安全带来极大危害,其防治一直是人们关注的焦点,近年来,已产生大量耐药性菌株。以省市为序,总结了自2000年以来链球茵表型耐药的情况,以期对链球菌耐药性的研究以及临床用药有所帮助。  猪链球菌病

新的肌病表型病例分析

37岁男性,因头晕、心悸来诊。心电图显示单形性室速(图A),血流动力学不稳定,同步心脏复律成功终止室速发作。基础心电图可见心前导联深Q波、ST段抬高(图B)提示既往有前壁心肌梗死。该患者既往有肌管性肌病(MTM)史,MTM1携带基因突变(p.Tyr192Cys),此前曾有严重的呼吸衰竭和肌无力;17

B细胞淋巴瘤免疫表型

B细胞淋巴瘤表型多变,我们按照CD5和CD10的表达将其分为CD5+CD10-、CD5-CD10+、CD5+CD10+、CD5-CD10-四大类,并对各大类进行细述。本篇为连载1:CD5+CD10-。CD5+CD10-的B细胞淋巴瘤包括:大部CLL/SLL;大部分MCL;一部分幼稚B淋巴细胞白血病(

人单核/-巨噬细胞的表型检测

基本方案材料待 测 单 个 核 细 胞(肝素抗凝血或肝素抗凝骨髓)或 外 周 血 单 个 核 细 胞(单 元 8.1)或者单核/巨 噬 细 胞(单 元 8. 5 , 推荐采用阴性分选)PBSPBS/肝素:含 0.1% (V/V ) 肝 素 的 PBS阻 断 IgG,浓 度 3 mg/ml (如正常小

关于NK细胞的细胞表型介绍

  与T细胞、B细胞相比,NK细胞表面标志的特异性是相对的。人NK细胞mIg-,部分NK细胞CD2、CD3和CD8阳性,表达IL-2受体β链 (P75,CD122),CD11b/CD18阳性。常用检测NK细胞的标记有CD16、CD56、CD57、CD59、CD11b、CD94和LAK-1。  一种稳

应用多重PCR方法鉴定RHD基因型的研究(2)

  2结果  2.1多重PCR方法的反应结果应用多重PCR方法可以鉴定不同的RHD基因型(图2)。根据扩增条带判断结果,D/d型:目标条带为3条,分别为208bp、263bp和1920bp;d/d型:目标条带为2条,分别为208bp和1920bp;D/D型:目标条带为2条,分别为208bp和263b

大肠杆菌基因型及遗传符号说明系列一

实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因,每条基因的长度约为950bp,基因间的平均间隔为118bp(基因Ⅷ)。E.coli基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。利用大肠杆菌基因组

分子生态学词汇基因型与环境互作

中文名称:基因型与环境互作英文名称:genotype-environment interaction定  义:可供选择的遗传因子(等位基因)的相对表达依赖于环境的变化。应用学科:生态学(一级学科),分子生态学(二级学科)

基因型、表现型和环境条件的关系

表现型是一定环境条件下,特定基因型生物个体所表现出的性状特征,所以表现型=基因型+环境条件。因此,基因型控制着生物个体的表现型,是表现型的决定性因素,但不是唯一的决定性因素,它与生物个体所处的特定的环境条件同时发挥作用,使得表现型呈现出多样性。正是因为这样,在基因型相同的情况下,表现型可以不同。例如

载脂蛋白E的多态性分析介绍

  Utermann等于1975年首先观察到ApoE多态性,利用等电聚焦电泳和SDS-PAGE可以确认ApoE的多态性,其后又被直接检测的cDNA序列所证实。ApoE有三种构体(isoform)即E2、E3和E4。有的人只含有一种主要异构体,即为纯合子;有人可含两种主要异构体,即为杂合子。由此可见,

iPSCs建立多发性内分泌瘤疾病模型获进展

 MEN1病人来源的iPSCs建立MEN1疾病模型及其相关机制示意图。研究团队 供图中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员李尹雄课题组等利用患者来源的诱导性多能干细胞(iPSCs)建立多发性内分泌瘤疾病模型取得进展。相关研究近日发表于Cells。博士研究生程子淇为该论文第一作者,李尹雄为通讯作者。

单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法对比

随着监管机构对细胞株开发的要求愈加严格,研究人员被要求开展单细胞克隆并提供细胞株源于单个细胞的证据( 即单克隆性的证据 )。 有限稀释是一个普遍接受的建立单克隆性的方法,它基于统计概率因此只有很少一部分( 10-30% )的微孔能被接种单个细胞。流式细胞分选是另一种传统的克隆方法,它可以高效地接种单

单细胞分离对单细胞测序领域的作用

单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。  它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至

CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法

CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基

如何使用植物表型成像系统完成十字花科表型研究的论文

最近,来自比利时根特大学的专家利用WIWAM XY植物表型系统发表了题为Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae的文章,发表在植物学著名期刊New Phytol

质量与数量性状

质量性状指属性性状,即能观察而不能量测的性状,是指同一种性状的不同表现型之间不存在连续性的数量变化,而呈现质的中断性变化的那些性状。它由少数起决定作用的遗传基因所支配,在表面上这类性状显示的差别,如角的有无、毛色、血型、遗传缺陷、花药、籽粒、颖壳等器官的颜色、芒的有无、绒毛的有无等称为质量性状。质量

自动化拉曼病原药敏快检新系统研发问世

 自动化CAST-R系统服务临床精准抗感染治疗   单细胞中心供图多重耐药菌(MDR)和其耐药性的传播已成为全球公共卫生问题,MDR引起的血流感染往往病情较重,快速完成药敏检测并采取有针对性的治疗措施,对于降低患者的死亡率至关重要。但是,目前病原药敏试验耗时很长,导致临床医生主要依赖经验进行治疗。开

中科院青岛能源所开发微型液滴微流控平台

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498099.shtm微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤,精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日,中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了一种低成

全球每年约1500万人死于感染!微生物耐药有多可怕?

  2015年11月,世界卫生组织(WHO)开展了第一届的世界提高抗生素认识周(World Antibiotics Awareness Week)。此后,每年11月,世卫组织皆举办了该项活动。2020年,该活动更名为世界提高抗微生物药物认识周(World Antimicrobial Awarenes

全球每年约1500万人死于感染!微生物耐药有多可怕?

  2015年11月,世界卫生组织(WHO)开展了第一届的世界提高抗生素认识周(World Antibiotics Awareness Week)。此后,每年11月,世卫组织皆举办了该项活动。2020年,该活动更名为世界提高抗微生物药物认识周(World Antimicrobial Awarenes

青岛能源所发布首台单细胞拉曼分选及测序耦合系统

  10月20日,在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会上,中国科学院青岛生物能源与过程研究所发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合系统(RACS-SEQ)。该系统无需标记即可获知细胞种系发生、生理状态及所处的微环境变化等关键表型,并在单细胞水平精度对接表型组与基因组。  RACS-

中科院青岛生物能源所发布单细胞拉曼分选测序耦合系统

  2018年10月20日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会,发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合(RACS-SEQ)系统。  RACS-SEQ系统通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液

基因多态性的临床医学应用

人类基因多态性在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性,疾病临床表现的多样性(clinical phenotype diversity),以及对药物治疗的反应性上都起着重要的作用。早期临床上有关基因多态性的研究是从HLA基因开始的,分析基因型在疾病发生易感性方面的作用,如HLA-B27等位基因与强直性

​依据非等位基因相互作用的性质分类

依据非等位基因相互作用的性质可以将它们归纳为:互补基因:若干非等位基因只有同时存在时才出现某一性状,其中任何一个发生突变时都会导致同一突变型性状,这些基因称为互补基因。异位显性基因:影响同一性状的两个非等位基因在一起时,得以表现性状的基因称为异位显性基因或称上位基因。累加基因:对于同一性状的表型来讲

青岛能源所开发新技术助力工业菌株快速筛选

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498816.shtm近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所(以下简称“青岛能源所”)单细胞中心开发一种低成本、非标记的微型液滴微流控平台,可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤

植物表型成像系统在完成十字花科表型研究的论文的应用

最近,来自比利时根特大学的专家利用WIWAM XY植物表型系统发表了题为Drought resistance is mediated by divergent strategies in closely related Brassicaceae的文章,发表在植物学先进期刊New Phytol

单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤

单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用