SSCP检测SNP原理,步骤及常见问题总结整理

SSCP原理:sscp称为单链构象多态性,它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法,因其检测敏感,快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响,如:PCR产物,温度,电压,PAGE胶的浓度和交联度等,因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各种条件的一致性。如果有酶切位点的话最好用RFLP方法检测DNA 多态,或是用SSCP与RFLP两种方法相结合,试验结果要更加可靠些。SSCP的主要试验步骤:1. PCR扩增目的基因片段。2. 制备PAGE(聚丙烯酰胺)胶。不同长度的基因片段用不同浓度和交联度的胶,常用 的有19:1,29:1,39:1(丙烯酰胺:甲叉),浓度有8%,10%,12%的。3. PAGE胶的灌制。将配好的PAGE胶混匀,立即灌至干净的玻璃板中,插上梳子于室温聚合1-2小时。4. PCR产物的变性及电泳。取1-2 ul PCR产物加5ul变性缓冲液,95度水浴......阅读全文

SSCP检测SNP原理,步骤及常见问题总结整理

SSCP原理:sscp称为单链构象多态性,它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法,因其检测敏感,快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响,如:PCR产物,温度,电压,PAGE胶的浓度和交联度等,因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各

SSCP检测SNP原理,步骤及常见问题总结整理

SSCP原理:sscp称为单链构象多态性,它是基于DNA构象来检测PCR产物单链碱基微小差异的方法,因其检测敏感,快速和所需装置简便而在分子生物学各个领域广泛应用。但该方法的试验结果受多种因素的影响,如:PCR产物,温度,电压,PAGE胶的浓度和交联度等,因而重复性比较差。因此在做SSCP时要注意各

SNP的检测方法(直接测序法与PCRSSCP)

人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人类基因组的

PCRSSCP实验原理和操作步骤

【实验目的】1.了解PCR-SSCP技术的原理。2.了解并熟悉PCR-SSCP技术的步骤。 【实验原理】 PCR-SSCP是1989年日本Orita等创建的筛查突变的新技术。它是一种简单、快速、经济的点突变筛查手段。PCR-SSCP技术的基本原理是PCR扩增后的DNA片段经变性成单链DNA,

SSCP原理

SSCP原理及特点 日本Orita等研究发现,单链DNA片段呈复杂的空间折叠构象,这种立体结构主要是由其内部碱基配对等分子内相互作用力来维持的,当有一个碱基发生改变时,会或多或 少地影响其空间构象,使构象发生改变,空间构象有差异的单链DNA分子在聚丙烯酰 胺凝胶中受排阻大小不同.因此,通过非变性聚丙

PCRSSCP原理及应用

随着分子生物学技术的发展,检测基因结构和突变的方法不断涌现.尤其是PCR技术问 世以后,各种与PCR相结合的基因检测技术进一步推动了基因研究的发展.如不对称 PCR产物的直接测序、核糖核酸酶酶切法(Ribonuclease cleavage,RNAase)、限制性 片段长度多态性分析(Restric

冷热冲击测试机常见问题整理

 整理与介绍目前环境试验当中,使用者在使用环境试验设备,以及对于规范的要求常遇见的问题与迷失,若您有下述相关问题欢迎您与业务部,我们将竭诚为您服务。 温度冲击试验温变率是否是越快越好?说明:温度冲击试验中的温变率是否是越快越好,温变率到底对于试验结果有没有影响,怎么样的温变率才是好的冲击温变率?温度

环刀法测量土壤密度原理步骤及常见问题

在农业科研中,测量土壤的密度是一个非常重要的步骤。对土壤密度的测量,不仅仅可以准确判断出土壤的基本信息,更为以后施肥、灌溉、种植等提供重要的决 策。对土壤密度测量的方法有很多,主要包括环刀法、灌水法、灌砂法等。其中环刀法测量简便、所需仪器较少、结果较为精准,所以常常被运用到实际操作中。本 文就针对环

SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)

snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼

SNP检测技术对比

1.  SNP检测方法分类1.1.  根据检测原理分类根据检测原理进行分类,目前来说,基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。1.2. 根据检测通量分类根据检测通量进行分类,可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法(包括beadschip)应用更为广泛。除此之外,基于Ta

SNP-的检测方法

SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)、寡核苷酸连接分析(OLA)、等位基因特异聚合酶链反应分析(AS2PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、变性梯度凝胶电泳分析(DGGE),虽然这些技术与高通量时代的

冷热冲击试验机常见问题整理

温度冲击试验温变率是否是越快越好?说明:温度冲击试验中的温变率是否是越快越好,温变率到底对于试验结果有没有影响,怎么样的温变率才是好的冲击温变率?温度冲击与温度循环如何分辨?说明:温度冲击与温度循环两者的差异性在哪里,还是都一样只是称呼不一样而已?温度冲击试验驻留时间如何决定?说明:在冲击过程当中有

超声波检测原理及步骤

  一、 超声波检测原理  超声波探伤是利用材料及其缺陷的声学性能差异对超声波传播波形反射情况和穿透时间的能量变化来检验材料内部缺陷的无损检测方法。 脉冲反射法在垂直探伤时用纵波,在斜射探伤时用横波。脉冲反射法有纵波探伤和横波探伤。在超声波仪器示波屏上,以横坐标代表声波的传播时间,以纵坐标表示回波信

PCRSSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCRSSCP技术检测细菌

长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物,由于临床病原菌往往不明,需用多种不同引物和扩增程序进行PCR扩增,亦难实现快速诊断。PCR-SSCP技术主要用于基因突变的检测,利用该技术鉴定细菌虽有报道[1,2,

PCRSSCP技术检测细菌

16SrRNA基因以快速鉴定细菌陶洪群1 李向阳1 杨雷2 杨锦江11.温州医学院附属第二医院检验科? 3250272.温州医学院分子生物实验中心? 325027  长期以来,临床上主要用细菌培养和血清学方法检测病原菌,但均不能达到快速诊断细菌感染的目的。常规PCR技术采用针对特定病原菌的特异性引物

法医--SNP--复合检测体系的构建及应用

【摘要】目的 构建48-SNP 位点复合检测体系,用于个体识别、性别鉴定、ABO 基因分型。方法 采集225 份无关个 体样本( 血斑及口腔拭子) , 18 份案例样本( 不同组织及体液斑) ,选择43 个常染色体位点、 4 个 ABO 基因位点和1 个性别 鉴定位点,根据单碱基延伸技术通过 Gen

SNP的检测知识

SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人

冷热冲击试验箱常见问题整理介绍

温度冲击试验温变率是否是越快越好?说明:温度冲击试验中的温变率是否是越快越好,温变率到底对于试验结果有没有影响,怎么样的温变率才是好的冲击温变率? 温度冲击与温度循环如何分辨?说明:温度冲击与温度循环两者的差异性在哪里,还是都一样只是称呼不一样而已? 温度冲击试验驻留时间如何决定?说明:在冲击过程当

SNP检测——HRM技术应用

  HRM技术服务之SNP检测(snp检测的最佳方案)   单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一

SNP检测——HRM技术应用

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP。SNP在人类

PCRSSCP、-RTPCRSSCP-区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

PCRSSCP、-RTPCRSSCP-区别

仅仅是扩增的方法不同而已,一个是普通的PCR,一个是RTPCR.如果需要鉴定染色体的DNA序列有无差别或基因突变,可以用PCR-SSCP,我曾做过这方面的实验,检测病人有无基因的点突变,同时扩增病人和正常人的基因片段,然后做sscp,只要有一个核苷酸的区别,变性SDS-PAGE后,条带就会有很大的区

超声波检测的原理及步骤

  原理  超声波探伤是利用材料及其缺陷的声学性能差异对超声波传播波形反射情况和穿透时间的能量变化来检验材料内部缺陷的无损检测方法。  脉冲反射法在垂直探伤时用纵波,在斜射探伤时用横波。脉冲反射法有纵波探伤和横波探伤。在超声波仪器示波屏上,以横坐标代表声波的传播时间,以纵坐标表示回波信号幅度。对于同

Western-Blot常见问题总结

  Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与或标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电

蛋白纯化常见问题总结

蛋白纯化过程中常遇见一些问题,这里整理了以下几个蛋白纯化实验中遇见的问题及其解决方案。1)我现在手头有个融合蛋白,纯化的时候用助溶剂溶解后做了GST亲和层析,之后用蛋白酶切割后却发现目的蛋白没有活性。请问有哪些可能会出现这种原因?怎么解决?测过基因序列,没有问题。细胞破碎后,融合蛋白在沉淀里,我用助

蛋白纯化常见问题总结

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总磷检测仪的检测原理及步骤

  总磷检测仪检测原理:   用过硫酸钾(或硝酸-高氯酸)消解试样,将所含磷全部氧化为正磷酸盐。在酸性介质中,正磷酸盐与钼酸铵反应,在锑盐存在下生成磷钼杂多酸后,立即被抗坏血酸还原,生成蓝色的络合物。通过样品吸光度的检测,确定总磷的含量。   检测步骤   1.标准曲线绘制   (1)消

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移液器使用常见问题及解决方法总结

   移液器,对于实验室人员而言,几乎是都要在实验室中用到的,并且在使用的过程中,也会遇到一些列问题。     一、移液器使用常见问题:     A.活塞/吸头 泄漏     B.吸头不适合移液器     C.二次使用吸头     D.移液器吸头没有碰到容器壁     E.湿度差异     F.没有