单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系

2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcriptional Regulators and Lineage Relationships”,利用最前沿的单细胞染色质可接近性图谱揭示了正常乳腺发育过程中细胞状态特异性转录因子结合位点的变化动态和细胞谱系的关系。该团队希望通过了解乳腺正常发育过程中细胞状态转换的分子机理,在未来进一步理解乳腺癌细胞可塑性和异质性的分子机理。 在该研究中,作者们首次在染色质可接近性方面,观察到胚胎乳腺原基在胚胎发育晚期已经开始获得成年鼠分化乳腺细胞特异的染色质可接近性特征。进一步通过转录因子结合位点在染色质可接近区域的富集程度,推测了转录因子在不同细胞......阅读全文

转录因子KLF5参与小鼠乳腺干细胞维持及乳腺发育

  乳腺癌是女性中发病率最高的癌症。近年来的研究表明,转录因子KLF5在乳腺癌的发生发展过程中发挥重要作用;前期的研究表明,KLF5在乳腺癌干细胞的自我更新和维持过程中发挥关键的促进作用(Theranostics, 2016; 6(4): 533-544);另外也有研究显示KLF5在胚胎干细胞的维持

乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子和细胞谱系关系

  乳腺癌是全世界妇女中最常见的癌症,大约每年两百多万女性受其困扰。根据WHO 估计,在所有的女性癌症者中,约15%的死亡与乳腺癌相关。乳腺癌中某些类型至今仍然没有有效治疗方案。乳腺癌中癌细胞的可塑性和组织的异质性是治疗失败的一大原因。不论是乳腺发育过程中的正常乳腺细胞,还是乳腺癌发展过程中的癌细胞

日找到控制细胞分化转录因子

  日本理化研究所4月20日发表新闻公报说,该所研究人员与文部科学省项目小组通过大规模数据分析,找到一群控制细胞分化状态的转录因子,并解开了其中的具体机制。   公报说,研究人员以白血病患者的人体免疫细胞株THP—1为研究对象,借助先进的基因测序技术,按细胞分化过程中不同时间段收集它们从原单核细胞

测量任一细胞因子转录因子的其他技术

虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较

角朊细胞的其他转录因子介绍

  K17基因的上游启动子中有γ干扰素激活的STAT因子的结合位点,被称为γ干扰素活化序列(GAS),在皮肤发生迟发型接触性过敏时,STAT-91可转位至角朊细胞核内与启动子中的GAS元件结合而激活K17的表达[8]。兔K3基因的5’上游序列中则有NFκB的结合位点(5’GGGCTTTCC-3’),

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

Nature:T细胞功能调控的关键转录因子

  T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。  来自清华大学医学院,陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“

转录因子活性ELISA

转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活

Cell子刊:转录因子SLUG有助于决定乳腺癌的类型

  最近,塔夫斯大学医学院、塔夫斯医学中心、德克萨斯大学、北卡大学和麻省理工学院等处的研究人员在Cell期刊旗下《Stem Cell Reports》杂志发表论文表明,在乳腺组织的发育过程中,转录因子SLUG在调节干细胞功能的过程中发挥作用,并能够决定乳腺细胞将会长成管腔细胞还是基底细胞。  他们所

转录因子和转录因子之间可以有相互作用吗

可以转录因子真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡ

转录因子的转录调控区的介绍

  同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。  转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10

通用转录因子的定义

通用转录因子(general transcription factors, GTFs)   。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。

依赖ρ因子的转录终止

ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质,以六聚体为活性形式。

通用转录因子的定义

通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子

简述转录因子的作用

  是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。  目前,人工转录因子(Artificial Transcription Factor,ATF)的构建已用于转录因子的生物学功能研究中起到重要作用。ATF是指将不同的DNA结合结

转录终止因子的定义

中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定  义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

概述转录因子的组成

  真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:  1、亚基  RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。  2、复合物  某些转录因子能

关于转录因子的转录抑制区的介绍

  也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。  转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核

胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现

  在胚胎干细胞的自我更新中,转录因子Nanog 具有关键性的作用,这一因子也一直是近年来研究的热点。最近,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的科学家们发现,NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂,分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分,或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯

转录组测序揭示乳腺癌重排

即将在本周《美国科学院院刊》(PNAS)的网络版上发表的一篇论文中,一个国际研究小组介绍了一项利用高通量的转录组测序来发现乳腺癌细胞系中的基因组重排的原理论证研究。美国克莱格凡特研究院(J.Craig Venter Institute)、Lugwig癌症研究所的三个分所、以及纽约斯隆-凯特琳癌症

转录起始因子的定义

中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定  义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

PNAS:“打了就跑”的转录因子

  细胞核中的调控蛋白,在活化基因时采取了一种“打了就跑”(hit-and-run)的策略。美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项最新研究,深入解析了这种高效的转录模式。  “就像马克吐温笔下闯了祸就跑的汤姆·索亚一样,转录因子结合启动子并激活转录之后就会立即离开,让小伙伴们去继续自己未完成的工

转录终止因子的概念介绍

中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定  义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

通用转录因子的相关介绍

  在真核生物中有效的和启动子特异性的起始需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。通用转录因子共同执行

转录激活因子的定义

定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)

转录激活因子的定义

定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)

基因转录因子的相关介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系

  2019年10月8日,美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr