PLoSGenet：何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日，北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA methylation loci”的论文，该论文报道了模式植物拟南芥中的两个组蛋白甲基化酶的同源蛋白SUVH2和SUVH9参与招募RNA聚合酶V并调控RNA介导DNA甲基化的机制。 植物中RNA介导DNA甲基化引起的转录沉默参与维持转座元件和DNA重复序列的稳定。在RNA介导DNA甲基化过程中，植物特异存在的依赖DNA 的RNA聚合酶IV和V产生的非编码RNA具有关键作用，可以通过顺式作用介导DNA甲基化。因此，研究这两个聚合酶在染色质上的定位机制，有助于理解 RNA介导DNA甲基化作用的位置特异性。何新建实验室以前的研......阅读全文
内含肽介导的蛋白连接
通过改变裂解条件以及对内含肽进行适当修饰，可以生物合成c端带有硫酯键或N端带有半光氨酸的蛋白质分子。两种蛋白质混合以后，硫酯键和半光氨酸利用“自然化学连接”(native chemical ligation)的原理进行自发的连接反应，在硫酯和半光氨酸之间形成肽键，从而将两种蛋白质连接起来。自然化学连
载体蛋白介导的易化扩散
运输过程是通过载体蛋白发生可逆的构象变化实现的。载体蛋白是膜上与物质运输有关的穿膜蛋白，对所运输的物质具有高度选择性，当载体蛋白一端表面的特异结合部位与专一的溶质分子结合，引发载体蛋白空间构象改变，将运送的溶质分子从结合的一侧转运到膜的另一侧；变构的载体蛋白对被转运物质的亲和力同时发生改变，于是被转
通道蛋白介导的易化扩散
运输过程借助于穿越脂双分子层的通道蛋白完成。通道蛋白中心是亲水性小孔，不同种类的通道蛋白可分别运输离子，水等小分子。主要运输离子的通道蛋白也称为离子通道，对离子具有高度亲和力和高度选择性。离子通道运输速率高，每秒运输离子数量多达几百万个，载体蛋白每秒运载的分子数目则不足一千个。某些离子通道蛋白星关闭
通道蛋白介导的易化扩散
运输过程借助于穿越脂双分子层的通道蛋白完成。通道蛋白中心是亲水性小孔，不同种类的通道蛋白可分别运输离子，水等小分子。主要运输离子的通道蛋白也称为离子通道，对离子具有高度亲和力和高度选择性。离子通道运输速率高，每秒运输离子数量多达几百万个，载体蛋白每秒运载的分子数目则不足一千个。某些离子通道蛋白星关闭
锌指蛋白ZFP217通过介导m6A－mRNA甲基化导致肥胖的原理
过去三十年来，全球肥胖和2型糖尿病的发病率有所上升，而脂肪组织是肥胖相关疾病的重要因素，因此，控制脂肪细胞分化和成熟可能是治疗肥胖相关疾病的一个有希望的策略（1）。为了阐明转录和表观遗传调控在脂肪形成中的作用，并确定一个主要的关键调控因子和途径（1，2），人们做了大量的努力，然而，转录后调控在脂肪形
载体蛋白介导的易化扩散介绍
运输过程是通过载体蛋白发生可逆的构象变化实现的。载体蛋白是膜上与物质运输有关的穿膜蛋白，对所运输的物质具有高度选择性，当载体蛋白一端表面的特异结合部位与专一的溶质分子结合，引发载体蛋白空间构象改变，将运送的溶质分子从结合的一侧转运到膜的另一侧；变构的载体蛋白对被转运物质的亲和力同时发生改变，于是被转
G蛋白介导的信号转导途径
G蛋白可与鸟嘌呤核苷酸可逆性结合。由γ亚基组成的异三聚体在膜受体与效应器之间起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白亚基的功能，参与细胞内信号转导。信息分子与受体结合后，激活不同G蛋白，有以下几种途经：（1）腺苷酸环化酶途径 通过激活G蛋白不同亚型，增加或抑制腺苷酸环化酶（AC）活性，调节细胞内cAMP浓
G蛋白介导的信号转导途径
G蛋白可与鸟嘌呤核苷酸可逆性结合。由γ亚基组成的异三聚体在膜受体与效应器之间起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白亚基的功能，参与细胞内信号转导。信息分子与受体结合后，激活不同G蛋白，有以下几种途经：（1）腺苷酸环化酶途径 通过激活G蛋白不同亚型，增加或抑制腺苷酸环化酶（AC）活性，调节细胞内cAMP浓
泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径
为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫，全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中，研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用，影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解，叶绿体降解进而会引发植物早衰，最终影响作物产量。叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器。植物叶绿体内部
未正确折叠蛋白介导的细胞凋亡
在真核生物体内，为正确折叠蛋白反应(unfolded protein response，UPR)是细胞对抗内质网应激的一种重要的自我保护机制。当细胞中出现长时间或高强度的UPR时，三种内质网上的跨膜蛋白PERK、IREI、ATF6在发挥修复作用的同时，也可以同时启动由ERS介导的三种细胞凋亡途径。P
关于内含肽介导的蛋白连接的介绍
通过改变裂解条件以及对内含肽进行适当修饰，可以生物合成c端带有硫酯键或N端带有半光氨酸的蛋白质分子。两种蛋白质混合以后，硫酯键和半光氨酸利用“自然化学连接”(native chemical ligation)的原理进行自发的连接反应，在硫酯和半光氨酸之间形成肽键，从而将两种蛋白质连接起来。自然化
揭秘Piezo蛋白介导机体触觉的分子机制
我们的身体能够感知多种机械刺激，我们的触觉能够有效区分微风吹过皮肤的感觉和疼痛的按压感，而其它系统则能够检测到肌肉的伸展，甚至血压；我们感知这些东西的能力需要一种外力，其能够在遍布机体不同组织的感觉神经元细胞的微小末梢转化为电信号，其中两个相关蛋白：Piezo1和Piezo2离子通道就能够通过允
染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能
5月31日，《基因组生物学》（Genome Biology）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前，复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展，相关成果发布在《分子细胞》上，该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰，参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
谷氧还蛋白介导活性氧平衡调控木薯抗旱
木薯是一种重要的热带作物，是非洲等热带地区的主要粮食作物之一。其块根碳水化合物含量高达38%，且含有多种维生素，是全球10亿多人口的主要食物来源。木薯在种植过程中，其苗期和块根形成期与热带地区的旱季重叠，干旱对木薯的产量和品质有非常大的影响。因此，鉴定木薯重要的抗旱基因、提高栽培木薯对干旱的适应性，
ApoE4显著恶化tau蛋白介导的神经退化
2017年9月23日/生物谷BIOON/---在将近25年之前，人们鉴定出一种ApoE4基因变异体是阿尔茨海默病的一种主要风险因子，这种变异体让一个人患上这种神经退行性疾病的几率增加了高达12倍。然而，人们并不清楚为何这种变异体是如此危险。当ApoE4蛋白存在时，β-淀粉样蛋白（Aβ）团块在大脑
发现介导癌细胞关键生命活动的蛋白质
蛋白质是生命的组成部分——在细胞内，蛋白质结合成大型的大分子复合物，即蛋白质的联合体，它们相互协作以完成特定的功能。大量的癌症研究集中在寻找这些蛋白质复合物的抑制剂。像mTOR和ATR这样的激酶，以及像端粒酶这样在肿瘤中过度表达的酶，都属于这类复合物。 有一些蛋白质(称为伴侣蛋白和共同伴侣蛋白
植物所发现蛋白构象改变介导开花新机制
开花是高等植物进入生殖发育的重要标志，受关键基因以及组蛋白修饰的精确调控，甾醇类激素(BRs)和赤霉素(GAs)参与其中，但激素信号分子与蛋白质构象的瞬时改变如何联动调控开花尚不清楚。 中科院植物研究所种康研究组及其合作者发现，BRs信号途径中核心转录因子BZR1通过直接抑制组蛋白去甲基化
断裂型内合肽介导的蛋白质环化
环化蛋白质具有3个明显的特性：①提高稳定性和活性，这是由于环化的蛋白质可以减少非折叠状态的构象熵值；②折叠速度快，这是因为其减少了折叠途径的数目的缘故；③对N端和C端特异性的蛋白酶具有抗性，因此能改善在体内的稳定性。由于以上特性，环化蛋白质在蛋白质工程和医药工业中备受重视。以IMPACT～TWIN(
关于G蛋白介导的信号转导途径的介绍
G蛋白可与鸟嘌呤核苷酸可逆性结合。由γ亚基组成的异三聚体在膜受体与效应器之间起中介作用。小G蛋白只具有G蛋白亚基的功能，参与细胞内信号转导。信息分子与受体结合后，激活不同G蛋白，有以下几种途经： （1）腺苷酸环化酶途径 通过激活G蛋白不同亚型，增加或抑制腺苷酸环化酶（AC）活性，调节细胞内c
水生所揭示Smad蛋白介导BMP信号的调控机制
BMP蛋白是一类形态发生素(morphogen)，对胚胎早期发育的背腹轴向决定起着关键作用，其功能丧失将导致腹侧发育的严重缺陷。BMP信号由3类受体型Smad——Smad1、Smad5、Smad8 (Smad9)来介导。然而，这些受体型Smad是如何在胚胎发育早期进行精细调控，在整体水平上调
PLoS－Genet：何新建等模式植物拟南芥研究获进展
2014年1月22日，北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
Nature研究首次证明自噬可介导核内蛋白降解
"自噬"这个词从字面意思来看就是自己吃自己，对于细胞来说就是不需要的细胞内成分被细胞自身降解的过程，关于自噬的研究已经有很多，但是最近一项发表在国际学术期刊Nature上的最新研究首次发现自噬可以介导细胞核内物质的降解，并且细胞核内发生的自噬在对抗癌症发生方面发挥一定作用，该项工作由
Science－|－抗逆突破！泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径
为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫，全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中，研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用，影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解，叶绿体降解进而会引发植物早衰，最终影响作物产量。 叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器。
Science－|－抗逆突破！泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径
为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫，全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中，研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用，影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解，叶绿体降解进而会引发植物早衰，最终影响作物产量。 叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器
研究揭示喹诺酮抗性蛋白介导的细菌耐药机制
细菌抗生素耐药性是预防传染病的重大威胁，通常是由质粒转移或基因突变引起的。当细菌暴露于抗生素环境中会通过提高细菌的突变率筛选出适应抗生素环境的基因突变，结果导致临床环境中耐药菌株的出现。质粒驱动抗生素抗性基因的水平转移，引发细菌耐药性的产生。此外，质粒和细菌染色体之间的相互作用会影响抗生素抗性的
Science－|－抗逆突破！泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径
为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫，全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中，研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用，影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解，叶绿体降解进而会引发植物早衰，最终影响作物产量。 叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器
蛋白质DNA相互作用的甲基化和尿嘧啶干扰分析法—甲基化
实验方法原理在甲基化干扰实验中，探针通过将鸟嘌呤N-7及腺嘌呤N-3位用硫酸二甲酯 (DMS)进行甲基化而产生。这些甲基化的碱基可被哌啶特异性切割。实验材料含有蛋白质结合位点的DNA片段试剂、试剂盒TE 缓冲液 pH 7.5 〜8.0硫酸二甲酯（DMS)DMS反应缓冲液DMS终止缓冲液10 mg m
两篇PNAS：蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序，成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息，包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中，动态的DNA甲基化模式，是基因表达的重要调控者，与细胞分化、胚胎发育和癌症