NCBI使用方法之一:Mapviewer查找基因序列,RNA,启动子
下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面,网址为 在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。 二、点击“GO”: 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框里打勾,然后点击Filter: 说明一下:1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。2、下面参考序列给出了三个,是不同的部门做出来的,经我验证,序列有微小的差异,但总体来说基本相同。尽管你分别点击后,序列代码、序列代码等有所差异,但碱基基本一致,不影响大家研究分析序列。现在普遍采用的是最上面的那个序列,这一条是世界范围的生物科学家用计算机合成的一个序列。我也推荐大家使用这个序列。 四、点击上述三条序列第一条序列(即reference)对应的"Genes seq",出现新的页面, 五、点击上图出现......阅读全文
信使RNA的启动子和转录因子
一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。 二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。 三真核
如何确定非编码rna的启动子?
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,成为遗传学
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
基本方案 备选方案 备选方案2 实验材料 载体 试剂、
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验1
在适宜的条件下,T7 RNA聚合酶/启动子系统表达的基因产物可占细胞总蛋白的25%以上,但多数情况下产量比这个比例要低得多。实验材料载体试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材培养箱分光光度计离心机实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验3
实验材料噬菌体试剂、试剂盒PEGIPTG仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 制备从M13噬菌体mGP1-2原种,加PEG溶液沉淀浓缩噬菌体。重悬噬菌体于M9培养基,滴定其滴度。 2. 将由“基本方案”步骤1所得的含T7 启动子表达质粒转化M13许可性大肠杆菌细胞,转化物涂布于氨苄青霉素平皿上,3
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验2
实验材料蛋白质试剂、试剂盒氨基酸混合物M9培养基甲硫氨酸甲醇仪器、耗材荧光显微镜离心机分光光度计实验步骤1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养过
NCBI使用方法之一:Map-viewer查找基因序列,RNA,启动子
下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤一、打开Map viewer页面,网址为在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。二、点击“GO”:三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框里打勾,然后点
NCBI使用方法之一:Map-viewer查找基因序列,RNA,启动子
下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤 一、打开Map viewer页面,网址为 在search的下拉菜单里选择物种,for后面填写你的目的基因。 二、点击“GO”: 三、在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框,在Gene前面的小方框
启动子是什么?
启动子 (promoter),是位于基因5'端上游紧靠转录起点的一段非编码序列,其功能是引导RNA 聚合酶与基因相应部位的正确结合,启动基因的转录。一般来说, 原核基因的启动子比较简单,只有数十个碱基组成,而真核基因的启动子较大,可能涉及数千个碱基。启动子有方向性, 位于结构基因转录起始点的
启动子分类介绍
①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,
启动子分类介绍
①组成型启动子(constitutive promoter)是指在该类启动子控制下,结构基因的表达大体恒定在一定水平上,在不同组织、部位表达水平没有明显差异。使用最广泛的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV)35S 启动子、来自根癌农杆菌Ti 质粒T-DNA 区域的胭脂碱合成酶基因nos 启动子,
启动子封堵的定义
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子清除的概念
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
翻滚启动子的定义
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
启动子封堵的概念
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子来说
双向启动子的定义
双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。
启动子清除的定义
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子的功能介绍
一个启动子是一组DNA序列能使一个基因进行转录。启动子是由RNA聚合酶所确认,并且引发转录。在RNA的合成中,启动子是一种方法区分哪一个基因用作制造mRNA,及进而控制细胞制造哪一种蛋白质。
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
杂合启动子的定义
中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定 义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子,兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻
基因内启动子的定义
中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定 义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)