SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略

大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(或已知BAC序列)进行系统分析,设计标记开发方案,后期根据前期的方案,构建SLAF-seq文库,筛选特异性长度片段进行高通量测序,将获得测序深度和质量满足要求的SLAF片段来代表目标物种的全基因组信息。它具有以下优势: 1. 高深度测序保证分型准确; 2. 简化的策略降低测序成本; 3. 前期简化方案预测保障标记数量最优; 4. 采用double index技术能适用于大群体。 在文章中,我们用水稻和大豆数据验证了SLAF-seq技术的有效性,2个结果都显示预测的和实际的结果一致性非......阅读全文

高通量筛选神经毒性实验

优点:完全自动化的图像获取与分析 快速得到每个细胞的多表型参数 实时监测活细胞的毒性,可持续几分钟至几天 神经系统对许多毒性化合物以及自然环境中生成的有害物质非常敏感。在疾病发生过程中,神经毒性可以对大脑或者外周神经系统造成短暂或持续性的损伤,例如脊髓损伤,中风,创伤性脑损伤等。同时这种神经毒性

高通量筛选技术简要综述

  药物高通量筛选(HTS)技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。  发展中的高通量筛选技术  高通量筛选的组合模式近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

高通量细胞分析设备简介

  仪器主要用途:可用于细胞的定性和定量分析(包括检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等,定量分析细胞内pH值,蛋白总含量、DNA及RNA含量、免疫表现、细胞周期动力学、细胞特殊配体、细胞生物活性鉴定、细胞凋亡研究、细胞功能分析、钙流等),并将具有将特定形状或功能的细胞从混合

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量组织研磨仪介绍

中药材质量最主要的体现在农药残留的问题上,不仅影响民众的健康,也是阻碍进出 口贸易发展的最大问题。开发快速高效,高灵敏度的中药材农残检测方法,同时对中药材质量进行评价显得尤为重要。金银花为忍冬科多年生藤本植物忍冬的花蕾。别名忍冬花、银花、二花、双花、鹭鸶花、苏花、双苞花、金藤花。花(金银花)、茎藤(

高通量药物筛选的简介

1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

高通量测序技术及原理

高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成

高通量筛选的特点简介

  高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测,工作枯燥,步骤单一,操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势,它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程,编程过程简洁明了。

什么是高通量筛选技术

以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系。高通量筛选技术具有微量、快速、灵敏和准确等特点。简言之就是可以通过一次

高通量筛选有哪些种类?

该技术使用较低剂量,在短时间内完成对大量化合物的生物活性筛选,由于具有微量化,快速,高效等特点,被国内外多数医药研究机构广泛采用。国外许多大型农药公司亦将这种技术用于新农药的筛选。高通量筛选和组合化学(combinatorialchemistry)、自动化操作系统等技术的有机结合,可以缩短新农药创制

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

高通量组织研磨仪种子高通量前处理理想的解决方案

我们知道,在种子真实性和纯度检测中,种子高通量前处理是一项十分基础也是十分重要的工作,而且在这项工作中,每个品种需要做一定数量的重复,尤其是纯度检测时,至少需要100粒种子。这么一项繁重的手工劳动如果是采用人工操作,那么不仅效果差,而且需要的时间还长,但是如果将高通量组织研磨仪加入劳动的话,那么工作

高通量检测的优化网络讲座

IDEX Health & Science 很高兴为您带来网络讲座有关: (时间:2010年7月1日 北京时间凌晨02:00 时长:60分钟 演讲语言:英语) 高通量检测的优化 主题:花费更少、效率更高的分析检测技术 名额有限! 该网络讲座将讨论: • 在改善和优化检测方法时

waters高通量药物开发_英文

用Quattro Micro做,OpenAccess QuanOptimise allows rapid and easy optimisation and method development.  From the initial stages of tuning solutions to the

高通量细胞分析产品推荐

  生化药物筛选虽然十多年前就已经规范化了,但药物疗效并不是总能实现预期效果的。在试管中看起来效果不错的靶标,在动物或者人类试验中却结果不佳,这一部分是由于毒性的问题,另外一部分则是由于药物在体内被处理的过程,与在单纯化学相互作用环境中的不同。科学家们希望能通过以细胞为基础的分析方法,来进行药物研发

高通量检测:痕量毒品瞬间毕露

  小型化SPRi原型机   新闻背景   当前,我国已由毒品过境为主转变为过境与国内消费并存,2008年我国在册吸毒人数累计已达112.67万人。近年来,设计型毒品也在不断出现,对毒品检测鉴定提出了更高要求。然而国内对毒品及代谢物的快速分析,主要利用进口的免疫试剂盒,此方法干扰因素多,经常出现

-新技术助力高通量光学捕获

   光学捕获是一种功能强大的新型测量方法,它使得单分子生物物理测量成为可能。然而,现阶段以激光为基础的工具,在特定时间内完成对于单个分子的操纵仍然局限重重。  美国康奈尔大学物理学院原子与固体物理实验室Soltani等研究人员,正在尝试构建一个基于纳米光子驻波阵列的全新技术平台,使其能够通过芯片实

现代高通量筛选,更快……更小?更弱?

  Citius  -Altius – Fortius!  更快、更高、更强,这是现代奥林匹克运动的追求和理想 ,而现代高通量筛选(High Throughput Screening,简称HTS)所追求的是:更快、但却更小、甚至更弱。  先前我讲到,1990年代末的组合化学没能给新药研发带来足够的多

高通量快速验证miRNA靶基因

尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译

简述高通量筛选的特色效用

  高通量筛选的特色效用高通量筛选技术是将多种技术方法有机结合而形成的一种新技术体系,它以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行实验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验数据,以计算机对数以千计的样品数据进行分析处理,从而得出科学准确的实验结果和特色效用。英国学者AlanD研究提示,一个实验室采

高通量测序技术总结与展望

  第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率,适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补,但是成本昂贵,而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中,454序列片段最长,比较适合对未知基因组从头测序,搭建主体结构,但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

高通量核酸提取组合方案(二)

标准组件已经可以完成核酸分离纯化过程,可进行全血,血清的核酸提取以及PCR产物纯化。各种选用组件主要用于各种不同来源材料的前处理过程。以全血DNA提取为例,介绍提取过程以及过程中每个组件的功能: 1.       血样从采血管手动转移到96孔盘:这步操作最为复杂,一方面采血管的规格不同于96孔盘,另

llumina高通量测序平台的应用

  Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收

关于高通量测序的基本介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),或大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)。区别于传统Sanger(双脱氧法)测

高通量测序数据分析

  1. 是不是一定要用大型计算机?  除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。  2. 是不是一定要用Linux系统?  也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。

高通量表面张力仪

Delta-8高通量表面张力仪    芬兰Kibron公司生产的Delta-8全自动高通量表面张力测量系统提供Kaw、TSA、临界胶束浓度(CMC)和表观pKa等化合物的物理化学性能的关键参数,主要用于生物物理、表面化学和物理化学领域试样的筛选及表征(新药筛选研究、组合化学研究、表面活性剂CMC研究

简述高通量筛选的技术进展

  我国进行药物高通量筛选的优势首先是化合物来源广泛,且多为天然;其次是对化合物生物活性的筛选目的较明确,无目的合成的化合物较少;第三,我国传统药物为筛选研究提供了一个巨大的资源库,可从中药中提取分离筛选新的化合物。这些优势为药物的高通量筛选打下了坚实基础。  我国药物高通量筛选初现规模:药物高通量