高通量测序技术系统研究大豆连作障碍发生的微生物机制
黑龙江省是我国大豆的主产区，大豆种植面积占全国种植面积40%左右，随着国家作物种植结构的调整和大豆产业振兴计划的实施，黑龙江省大豆种植面积逐步增加。长期的定位试验和多点的田间调查证实，大豆连作1年、2年和3年产量分别下降10-15%、15-20%和20-30%。因此，东北区大豆连作障碍的发生是一个不可回避的现实问题。 大量研究结果表明，大豆连作障碍的发生因素十分复杂，如土壤性状恶化、土壤酶活性降低、土壤病原微生物的富集和化感自毒作用等，这些因素既单独起作用也可能多个因素交织在一起，互相交联在一起共同起作用。而以往基于连作土壤灭菌实验证实，生物因素是导致连作障碍发生的主要制约因素。因此，开展大豆连作下微生物群落组成、多样性分布及群落演替规律及对策研究对阐明大豆连作障碍发生机制及推进现代农业可持续发展具有重要理论意义和实际应用价值。 中国科学院东北地理与农业生态研究所农田分子生态学科组基于大豆短期连作（3年和5年）、长期连作......阅读全文
“护航”新疆棉田－助力绿色生产
棉花作为一种兼具农业与工业价值的重要作物，在种植及后续加工过程中不可避免地产生资源浪费、土壤污染、大气污染等问题，产业升级转型迫在眉睫。新疆棉田 中国农业科学院西部农业研究中心供图面对全球气候变化和资源环境压力，以及气候变化对新疆棉花产业的影响日益显著等问题，中国农业科学院西部农业研究中心（以下简
国际空间站微生物在太空“就地测序”
据美国太空网2日报道，美国国家航空航天局（NASA）的宇航员第一次在国际空间站上对在此发现的微生物进行了DNA测序，这标志着未知微生物首次在太空被“验明正身”。 NASA官员在一份声明中说，以前，微生物必须送回地球进行分析，而新测序工作的实施，标志着科学家朝着为宇航员诊断疾病，甚至未来某一天对
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
直击精准医疗四大挑战：测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日，奥巴马提出了癌症“登月计划”，将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上，精准医疗是一个美好的愿景：即能详细读取肿瘤患者的缺陷，并开发出靶向缺陷的新一代药物，医生给患者最有效的治疗方案。 使用新型靶向药物如厄洛替尼（erlotinib）和西妥昔单抗（cetux
揭示了连作导致病原菌周围定殖细菌的抑病功能衰退
近日，中国农业科学院植物保护研究所土壤有害生物防控创新团队与荷兰生态研究所合作，发现连作会导致病原菌菌丝周围定殖细菌的抑病功能衰退，为连作条件下黄瓜枯萎病加重成因提供了新的解释，为枯萎病的治理提供了新的思路。相关结果在线发表在《应用土壤生态学（Applied Soil Ecology）》上。
球毛壳菌对新疆连作棉田土壤微生态的影响
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497187.shtm 近日，中国农业科学院棉花研究所棉花病害防控与风险评估创新团队阐释了球毛壳菌优化棉花连作土壤的作用机制，发现球毛壳菌可以增加连作棉田土壤细菌群落物种丰度和多样性、提高土壤酶活性、调
华大智造DNBSEQE5基因测序仪－－4.5小时完成病原微生物测序
7月15-16日，第二届感染性疾病诊断技术创新论坛（IDD）在武汉召开，华大智造携病原微生物高通量测序平台亮相。在论坛上，华大智造官方首次发布了DNBSEQ-E5基因测序仪在科研和实战场景下的一系列使用数据。据悉，DNBSEQ-E5基因测序仪体积小、重量轻、测序速度快、操作简单，大大降低了基因测
转基因大豆与非转基因大豆并非“实质等同”
在开始这篇博文前，让我们先来解释一个名词——实质等同原则。如果对转基因食品各种主要营养成分、主要抗营养物质、毒性物质及过敏性成分等物质的种类与含量进行分析测定，与同类传统食品无差异，则认为两者具有实质等同性，不存在安全性问题；如果无实质等同性，需逐条进行安全性评价。支持转基因食品上市者，一直宣称
退化土壤中微生物类群和功能基因的研究
研究背景土壤退化是一个及其严重的全球问题，长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内，每年约有40%的农业土壤发生严重退化，24%的土壤仍在持续恶化。在中国，农业化肥的滥用导致土壤退化，造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生态系统功能的反
退化土壤中微生物类群和功能基因的研究
研究背景 土壤退化是一个及其严重的全球问题，长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内，每年约有40%的农业土壤发生严重退化，24%的土壤仍在持续恶化。在中国，农业化肥的滥用导致土壤退化，造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生
退化土壤中微生物类群和功能基因的研究
研究背景 土壤退化是一个及其严重的全球问题，长期连作和滥用化肥会造成土质变差。全球范围内，每年约有40%的农业土壤发生严重退化，24%的土壤仍在持续恶化。在中国，农业化肥的滥用导致土壤退化，造成土壤养分失衡、土壤酸化、污染物积累和生物多样性下降等现象。但是关于土壤微生物群落对土壤退化及生
新模式种菜既抑制病虫害又增加土壤营养
“这就是我们种的空心菜，从这里可以看到根系露出了土面，这是充分湿润的标志。原来的土面是姜黄色的，土壤可溶性盐浓度高；现在土壤表面就比较正常，土壤的可溶性盐浓度已经恢复到了正常土壤的标准。”近日，在江苏南京市溧水华成蔬菜专业合作社示范基地的田埂上，扬州大学园艺与植保学院江解增教授说。 据了解，江
军科院：小RNA测序鉴定微生物病原体
最近，研究人员利用小RNA（small RNA，sRNA）深度测序鉴定miRNA在植物和动物基因表达过程中转录和后转录的调控功能，该技术也是植物和无脊椎动物中发现病毒的有效策略。由于小RNA片段中可能含有来自所有RNA分子的RNA代谢物，如rRNAs，tRNAs，mRNA，snRNA，snoRN
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环的
Nature：测序人类皮肤微生物组－解析真菌多样性
历史上，人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了，然而我们对居住在自己身体上的真菌却并十分不了解。 现在，美国国立卫生研究院(NIH)的研究人员，首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌 DNA 进行了测序，明确了皮肤上正常真菌群落的构成，为研究真菌类皮肤病打下了
nanoporetech－使用纳米孔测序技术的微生物学
完整的细菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因组，可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法（无论是在实验室还是在野外），从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要，还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序，以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。 通过长
微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环？
微生物（细菌和古细等）是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而，越来越多的研究表明，由于微生物群落固有的功能冗余性，微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦
454高通量测序研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环
国产大豆为何重要？
大豆是我国重要口粮作物，目前年产1300万吨左右。我国大豆油用量最高，以大豆为主要原料的酱油为居民佐餐必备，面包等烘焙品，火腿肠等肉制品要用大豆蛋白做添加剂…… 大豆不仅能够提供优质蛋白和植物油，还富含人体必需多种营养。大豆油所含亚麻酸、亚油酸等必需脂肪酸和脂溶性维生素对脂质蛋白代谢、血液流变
东北地理所：CO2浓度升高对大豆固氮微生物结构的影响
CO2浓度升高会促进豆科植物的根瘤形成和氮素固定，从而影响土壤氮循环过程，而这些过程均与固氮细菌的群落结构密切相关。明确土壤固氮细菌群落结构组成对于提高豆科植物的固氮能力、提高氮素匮乏的土壤中固氮细菌的数量以及增加土壤氮素含量有着重要意义。 大豆是我国重要的农作物，对保障粮食生产安全有着重要
红壤耕地次生障碍修复技术研究与集成示范项目验收
4月18日，科技部组织有关专家在南昌对国家科技支撑计划“红壤耕地次生障碍修复技术研究与集成示范”项目进行验收，验收专家组听取了项目组汇报，审阅了相关材料，经咨询和讨论，一致同意该项目通过验收。 项目由江西省科技厅组织实施，主要针对红壤耕地的酸化、贫瘠化、连作障碍等次生障碍因子，开展了红壤水
大豆玉米补贴终于来了－这次大豆补贴竟然高于玉米？
关于东北三省和内蒙古自治区的2017年的玉米和大豆补贴方案我们已经盼望已久，今天，我们终于等到了黑龙江、辽宁的方案发出。相信其他省份也会相继公布的，请及时关注。 5月12日，从黑龙江省农业委员会获悉，为深入推进玉米“市场定价、价补分离”改革，调整完善大豆补贴政策，该省出台了《黑龙江省玉米和大豆
全息解读进口转基因大豆－国产天然大豆受冲击
细心的消费者会发现转基因食品在我们的生活中已随处可见，超市中在售大豆油难觅非转基因的踪影。在调查中，几乎所有品牌的大豆油都注明使用了转基因原料，而配料中有大豆油和菜籽油的调和油基本使用的是转基因大豆和菜籽。 根据国际农业生物技术应用服务组织(ISAAA)的年度报告，2012年全球转基因作物
百人团队证实CO2浓度对东北大豆根际细菌群落结构的影响
以CO2浓度升高为主要特征的全球气候变化已经对农田生态系统产生重大影响，成为全球农业可持续发展的严峻挑战。CO2浓度升高影响植物生理代谢过程，导致植物根系分泌物的总量和化学组成发生改变，进而可能影响土壤微生物群落结构和生态功能。由于土壤微生物驱动碳氮循环，参与土壤养分转化，揭示CO2浓度升高条件
土传病害发生的本质
根本原因在于土壤微生物。新开发土壤中的微生物是丰富多样的，既有真菌、细菌、放线菌，也有原生动物，既有能够帮助分解根系分泌物、分解有机质、分解有害物质、释放土壤肥力、分泌蛋白酶、分泌抗生素等的有益微生物存在，同时也存在着喜欢在逆境情况下（厌氧、高温、高湿、干旱等）生长，以作物为营养和食物来源的有害微生
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（三）
注：已用454焦磷酸测序法发表的文章总结1、Archaea predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in soils—— (2006) Nature 442: 806-809——if 36.1012、454 Pyrosequencing ana
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（一）
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物
高通量测序在微生物多样性研究中的应用
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结构提供了新的技术平台，并
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（二）
二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性，或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group)，通过某一功能群中物种的分类