科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 2019年11月21日,Paul Mischel教授团队再次在Nature杂志上发表了题为“Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression”的文章,该研究首次解析了ecDNA的结构与功能。研究团队利用超微结构电子显微镜、远程光学作图、全基因组测序、计算机分析等技术阐述了ecDNA的四大特点。一是环状结构。研究团队首先结合二代全基因组测序和光学匹配(optical mapping),从序列的角度发现,扩增出来的ecDNA形成了环状结构。进一步使......阅读全文

染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁

北京时间11月21日,发表在《Nature》上的一篇新研究发现,在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA),改变了与癌症相关基因的表达方式,从而促进了癌细胞的侵袭性,并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力(如化疗、放疗和其他治疗)中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  ​1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?   2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生

染色体双微体的概念

双微体是染色体外成对出现的无着丝粒的环状DNA分子,大小从几百kb到几百Mb不等。这种染色体外遗传单位为小的Mb级别的环状结构、无着丝粒、无端粒、可自主复制,经常携带癌基因和耐药基因扩增,与基因组不稳定、肿瘤恶性程度及耐药等密切相关。

研究人员绘制出首张儿童癌症环状DNA图谱

  随着时间推移,癌症的发生往往与DNA缺陷的逐渐积累有关,因此,癌症通常会被认为是一种年龄相关的疾病,那么为何儿童也会患癌呢?近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自德国夏洛蒂—洪堡大学和柏林自由大学附属医学中心等机构的科学家们通过研究发现,染色体外环状DNA或会

分子遗传学词汇共价闭合环状DNA

中文名称:共价闭合环状DNA外文名称:cccDNA定义:共价闭合环状DNA(cccDNA)是乙型肝炎病毒的原始复制模板,对乙型肝炎病毒的复制具有重要的意义,药物难以清除。

关于共价闭合环状DNA(cccDNA)的展望介绍

  我们对HBVcccDNA的认识有待提高。在检测技术上有许多问题需要解决,比如,如何进一步提高灵敏度,如何避免rcDNA同时被扩增(国内有些文献报告的结果可能忽视了这一问题),如何简化操作步骤,从而能够被广泛应用等。检测或监测cccDNA的临床意义也有待挖掘,比如,可以通过细胞和动物模型,来评判新

简述共价闭合环状DNA(cccDNA)的检测意义

  乙肝病毒不仅仅是一种嗜肝病毒,一些肝外组织中也可检测到乙肝病毒DNA,如肾脏、胰腺以及外周血单个核细胞(peripheralblood mononuclearcell,PBMC)等。早就有人发现乙肝病毒可以感染白细胞,而这种免疫细胞的感染似乎有利于病毒逃避免疫反应,从而导致机体清除乙肝病毒的能力

Y染色体的染色体结构

Y染色体(Y chromosome)是决定生物个体性别的性染色体的一种。男性的一对性染色体是一条x染色体和一条较小的y染色体。在雄性是异质型的性决定的生物中,雄性所具有的而雌性所没有的那条性染色体叫Y染色体。由于Y染色体传男不传女的特性,因此在Y染色体上留下了基因的族谱,Y-DNA分析现在已应用于家

x染色体的染色体结构

研究确认了X染色体上有1098个蛋白质编码基因,有趣的是,这1098个基因中只有54个在对应的Y染色体上有相应功能的等位基因,而且Y染色体比X染色体小得多。在2003年6月完成的详细分析研究报告中指出Y染色体上仅有大约78个基因,Y染色体甚至被戏称为X染色体的“错误版本”。X染色体中大约有10%的基

Nature发表山中伸弥新成果,iPS校正环状染色体

  科学家们通过细胞重编程技术(iPS),使正常染色体成功替代环状染色体,校正了大规模的染色体缺陷。这样的新技术有望用来治疗,因染色体异常引起的先天畸形、智力障碍和生长迟缓。   这项研究于一月十二日发表在Nature杂志的网站上,文章的通讯作者包括iPS技术的创始人山中伸弥(Shinya Y

染色体的结构

  每条染色体由两条染色单体通过着丝粒相连,从着丝粒到染色体两端之间的部分称为染色体臂。由于着丝粒的位置不同,分为长臂和短臂,在臂的末端还有端粒,臂上还有次缢痕。Telomere端粒、Centromere着丝粒、Region区、Band带、p短臂、q长臂。

染色体的结构

染色体的超微结构显示染色体是由直径仅100埃(1埃=0.1纳米)的DNA-组蛋白高度螺旋化的纤维所组成。每一条染色单体可看作一条双螺旋的DNA分子。有丝分裂间期时,DNA解螺旋而形成无限伸展的细丝,此时不易为染料所着色,光镜下呈无定形物质,称之为染色质。有丝分裂时DNA高度螺旋化而呈现特定的形态,此

染色体的结构

  染色体的超微结构显示染色体是由直径仅100埃(Å,1埃=0.1纳米)的DNA-组蛋白高度螺旋化的纤维所组成。每一条染色单体可看作一条双螺旋的DNA分子。有丝分裂间期时,DNA解螺旋而形成无限伸展的细丝,此时不易为染料所着色,光镜下呈无定形物质,称之为染色质。有丝分裂时DNA高度螺旋化而呈现特定的

肿瘤的染色体异常(二)

  (1)Ph染色体(费城1号染色体):Nowell及Hungerford于1960年发现慢性粒细胞性白血病(CML)血中有一个小于G组的染色体,由于首先在美国费城(Philadelphia)发现,故命名为Ph染色体。最初认为是22号染色体的长臂缺失所致,后经显带证明是9号和22号染色体长臂易位的结

肿瘤的染色体异常(一)

   很久以前已注意到,几乎所有肿瘤细胞都有染色体异常,且被认为是癌细胞的特征。自1960年在慢性粒细胞白血病(CML)患者发现了Ph染色体后,对肿瘤染色体异常的研究已发展为遗传学的一个分支,即肿瘤细胞遗传学。它的任务是阐明染色体畸变与肿瘤之间的关系,同时把获得的知识用于临床,如通过染色体检查来协助

细胞化学词汇染色体外DNA

中文名称:线粒体DNA外文名称:Mitochondrial DNA,mtDNA定       义:线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。

细胞化学词汇染色体外DNA

中文名称:染色体外DNA英文名称:extrachromosomal DNA定  义:存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

染色体DNA的片段化

实验概要琼脂糖(agarose)或聚丙烯酰胺(PAGE)电泳是分离、鉴定和纯化DNA的标准方法。琼脂糖凝胶的分辨率比聚丙烯酰胺电泳低,但分离范围广,可以分离200 bp一50 kb的DNA。细胞凋亡时染色体从核小体间断裂形成大小为180-200bp整数倍的片段,在琼脂糖凝胶中电泳后可呈现出规

儿童的年轻细胞如何转化为癌细胞

  一般认为,多数癌症的发展与DNA缺陷随时间逐渐积累有关。但是为什么孩子也会发展为癌症呢?科学家们绘制了第一张环状DNA的详细地图,对癌症遗传学领域长期存在的问题提出了新的意料之外的见解。这项工作已经发表在《 Nature Genetics》杂志上。  由Charité Universitätsm

葡萄糖的环状结构和变旋现象

结晶葡萄糖有两种,一种是从乙醇中结晶出来的,熔点146℃。它的新配溶液的[α]D为+112°,此溶液在放置过程中,比旋光度逐渐下降,达到+52.17°以后维持不变;另一种是从吡啶中结晶出来的,熔点150℃,新配溶液的[α]D为+18.7°,此溶液在放置过程中,比旋光度逐渐上升,也达到+52.7°以后

分子遗传学词汇环状结构域

中文名称:环状结构域英文名称:loop domain定  义:核苷酸序列盘绕成不规则环形的二级结构,可以由序列两端的碱基配对而产生,也可由与蛋白质结合而产生。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Molecular-Cancer:环状RNA通过经典信号通路抑制肿瘤进展

  环状RNA(circRNAs)以单链和共价闭环结构为特征,通常由preRNAs的外显子反向剪接而成。以前,circRNA被认为是低丰度剪接错误的副产品。然而,通过深入的RNA测序和生物信息学,circRNAs已被证明广泛存在于转录本中。大量证据表明,环状RNA(circRNAs)在肿瘤的发生发展

关于共价闭合环状DNA(cccDNA)的检测方法介绍

  共价闭合环状DNA(cccDNA)和rcDNA在结构和理化特性上有三点不同:  ①rcDNA在正链与负链上均有缺口或缺刻,只是部分区域互补故能形成环状结构,但非超螺旋结构;而cccDNA两条链均是完整的,二者共价互补,形成超螺旋结构。  ②rcDNA能与蛋白质共价结合,cccDNA则不能。  ③

关于共价闭合环状DNA(cccDNA)的定量检测介绍

  在定性检测的基础上,可以进一步对共价闭合环状DNA(cccDNA)进行定量检测。仍以PCR定量分析技术中,尤其是竞争PCR技术的敏感性和精确度高。方法是在PCR反应管中加入一种已知量的、能与野生模板等效扩增的内参照,内参照是经过突变处理的,其两端尤其是引物退火区的序列与野生模板相同。PCR扩增后

概述逆转录病毒的感染相关

  反转录病毒的感染能否实现,取决于细胞的特性,细胞的分裂时相以及与病毒有关的受体是否存在。而病毒的感受性则由细胞基因所决定。只有在许多条件都具备时,肿瘤因子才能感染细胞。首先,病毒吸附在细胞表面。在这一过程中,细胞受体及膜蛋白起主导作用,细胞没有相应的受体就不会被病毒感染。在敏感的细胞里,吸附的病

关于逆转录病毒感染的内容介绍

  反转录病毒的感染能否实现,取决于细胞的特性,细胞的分裂时相以及与病毒有关的受体是否存在。而病毒的感受性则由细胞基因所决定。只有在许多条件都具备时,肿瘤因子才能感染细胞。首先,病毒吸附在细胞表面。在这一过程中,细胞受体及膜蛋白起主导作用,细胞没有相应的受体就不会被病毒感染。在敏感的细胞里,吸附的病

逆转录病毒的感染途径分析

反转录病毒的感染能否实现,取决于细胞的特性,细胞的分裂时相以及与病毒有关的受体是否存在。而病毒的感受性则由细胞基因所决定。只有在许多条件都具备时,肿瘤因子才能感染细胞。首先,病毒吸附在细胞表面。在这一过程中,细胞受体及膜蛋白起主导作用,细胞没有相应的受体就不会被病毒感染。在敏感的细胞里,吸附的病毒经

反转录病毒感染的介绍

  反转录病毒的感染能否实现,取决于细胞的特性,细胞的分裂时相以及与病毒有关的受体是否存在。而病毒的感受性则由细胞基因所决定。只有在许多条件都具备时,肿瘤因子才能感染细胞。首先,病毒吸附在细胞表面。在这一过程中,细胞受体及膜蛋白起主导作用,细胞没有相应的受体就不会被病毒感染。在敏感的细胞里,吸附的病

全球首例端粒融合型环状染色体单体型构建成功

  近日,中山大学附属第六医院生殖医学中心教授梁晓燕团队召开新闻发布会,宣布全球首次应用第三代试管婴儿技术,成功阻断端粒融合型环状染色体向子代传递,现健康宝宝已满百天。这是国际上首次通过改进后的基于链读测序的长片段二代测序技术,成功实现了端粒融合型环状染色体的单体型构建。  小雪(化名)夫妻女方染色

全球首例端粒融合型环状染色体单体型构建成功

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