科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 2019年11月21日,Paul Mischel教授团队再次在Nature杂志上发表了题为“Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression”的文章,该研究首次解析了ecDNA的结构与功能。研究团队利用超微结构电子显微镜、远程光学作图、全基因组测序、计算机分析等技术阐述了ecDNA的四大特点。一是环状结构。研究团队首先结合二代全基因组测序和光学匹配(optical mapping),从序列的角度发现,扩增出来的ecDNA形成了环状结构。进一步使......阅读全文

科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

  早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。  201

染色体外环状DNA(eccDNA)

1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富,同一个基因有可能会产生非常多的环状,同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb,而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA,是

环状DNA的结构特点

超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

带切口环状DNA的结构特点

中文名称带切口环状DNA英文名称nicked circular DNA定  义双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)

实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且

研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA

  人血浆中细胞游离的DNA(cfDNA)的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间,观察到胎儿血浆DNA(主要是胎盘来源)是线性DNA片段,比母体来源(主要是造血来源)DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA(eccDNA)。但是,尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。 

共价闭和环状DNA的结构特点

中文名称共价闭和环状DNA英文名称covalently closed circular DNA;cccDNA定  义两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力,所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA,质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这种结构

细胞化学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分       类:环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。定       义:超螺旋,D

环状染色体的概念和特点

若断裂发生于染色体的二个末端,那么断裂下来的两个断片彼此可以粘合成无着丝粒碎片,而带着丝粒的部分可通过两断端的粘合形成环状染色体。不带着丝粒的碎片往往消失,而带着丝粒的部分能继续进行有丝分裂。如慢性粒细胞白血病患者向急性方向转化时,常可见到环状染色体。(1)真核类生物中的一种异常染色体,为没有末端的

研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构

  近日,纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章,发现染色体外环状DNA驱动神

开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)

  近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D

开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA(eccDNA)

  近期,Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA(eccDNA),这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央,云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采(点击链接:颠覆性发现:癌基因竟不在染色体上---环状D

环状DNA的类型和分布

环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。

Science:首次实时观察到凝缩蛋白挤压DNA形成环状结构

  引人注目的是,活的细胞当准备分裂时,能够将一堆杂乱的长达两米的DNA包装成整齐的微小染色体。然而,科学家们几十年来一直对这个过程是如何发生的感到困惑。如今,在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学卡夫利研究所和位于德国海德堡的欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员分离出这个过程,拍摄它的影

环状结构域的结构特点

中文名称环状结构域英文名称loop domain定  义核苷酸序列盘绕成不规则环形的二级结构,可以由序列两端的碱基配对而产生,也可由与蛋白质结合而产生。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

单糖的环状结构介绍

在溶液中,含有4个以上碳原子的单糖主要以环状结构存在。单糖分子中的羟基能与醛基或酮基可逆缩合成环状的半缩醛(emiacetal)。环化后,羰基C就成为一个手性C原子称为端异构性碳原子(anomeric carbon atom),环化后形成的两种非对映异构体称为端基异构体,或头异构体(anomer),

细胞化学词汇带切口环状DNA

中文名称:带切口环状DNA英文名称:nicked circular DNA定  义:双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

分子遗传学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分    类:环状单链DNA和环状双链定义:超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

国自然研究热点——eccDNA的前世今生(一)

1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学

Nature-Nanotechnology:DNA环状分子的自主复制

  生物系统中存在很多的自主复制的例子。然而,人工制造这样的生物系统的自主复制系统却是相当困难,这是因为生物系统很复杂。在其他领域,人类可以创造某些自我复制系统,比如磁场系统以及模块化机器人等等。我们很少将这些人造的自我复制系统和生物系统中的自我复制系统进行比较。因而,如果能从理论上将人工的自主复制

环状核苷酸的的结构

“鸟苷-3',5'-环化一磷酸”的简称,亦称:环鸟一磷,环磷酸鸟苷,英文名:guanosine 3',5'-cyclic phosphate,简写为:cGMP,是一种环状核苷酸。

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界,一时之间,将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠

DNA十字架结构导致染色体易位

  日本藤田保健卫生大学的一个研究小组报告说,他们发现DNA一种特殊的十字架结构会导致染色体易位。这一发现有助于弄清染色体易位导致的白血病、不孕症等疾病的发病过程。   染色体易位是指两条非同源染色体同时发生断裂,一条染色体的片段移至另一条染色体的断端后,连接形成新的染色体。如果染色体易位发生在体

DNA十字架结构导致染色体易位

  日本藤田保健卫生大学的一个研究小组报告说,他们发现DNA一种特殊的十字架结构会导致染色体易位。这一发现有助于弄清染色体易位导致的白血病、不孕症等疾病的发病过程。   染色体易位是指两条非同源染色体同时发生断裂,一条染色体的片段移至另一条染色体的断端后,连接形成新的染色体。如果染色体易位发生在体

细胞化学词汇共价闭和环状DNA

中文名称:共价闭和环状DNA英文名称:covalently closed circular DNA;cccDNA定  义:两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力,所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA,质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这

Nat-Nanotechnol:DNA纳米结构可直接送药进肿瘤

          加拿大研究人员发现一种金纳米粒子组装方法,可作为运输工具直接将癌症治疗药物或识别标记传送入肿瘤中。此项研究成果发表在最新一期《自然—纳米技术》杂志上。   研究报告第一作者、多伦多大学生物材料和生物医学工程研究所(IBBME)博士研究生周佑廷在接受科技日报采访时说,要让药物进入

染色体外DNA——导至癌症恶变的罪魁

北京时间11月21日,发表在《Nature》上的一篇新研究发现,在人类肿瘤细胞中发现大量如“甜甜圈”般的环状染色体外DNA(EcDNA),改变了与癌症相关基因的表达方式,从而促进了癌细胞的侵袭性,并在肿瘤快速进化和抵御威胁的能力(如化疗、放疗和其他治疗)中发挥了关键作用。该研究由美国加州大学圣地亚哥

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  ​1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?   2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生

染色体双微体的概念

双微体是染色体外成对出现的无着丝粒的环状DNA分子,大小从几百kb到几百Mb不等。这种染色体外遗传单位为小的Mb级别的环状结构、无着丝粒、无端粒、可自主复制,经常携带癌基因和耐药基因扩增,与基因组不稳定、肿瘤恶性程度及耐药等密切相关。

染色体外DNA的定义

中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定  义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)