一文了解sgRNA（向导RNA）
向导RNA（guide RNA，gRNA），也称为小向导RNA（small guide RNA，sgRNA）。是作用于动质体（kinetoplastid）体内一种称为RNA编辑（RNA editing）的后转录修饰过程中。也是一种小型非编码RNA。可与pre-mRNA配对，并在其中插入一些尿嘧啶（U），产生具有作用的mRNA。向导RNA编辑的RNA分子，长度大约是60～80个核苷酸，是由单独的基因转录的，具有3'寡聚U的尾巴，中间有一段与被编辑mRNA精确互补的序列，5'端是一个锚定序列，它同非编辑的mRNA序列互补。 gRNA介导的RNA编 在编辑时,形成一个编辑体(editosome),以gRNAs内部的序列作为模板进行转录物的校正, 同时产生编辑的mRNA。gRNA3'端的oligo(U)尾可作为被添加的U的供体。 原核生物及植物线粒体中进行RNA编辑所需的RNA序列，是与正确编辑的RNA......阅读全文
什么是sgRNA
shRNA是short hairpin RNA 的缩写。翻译为“短发夹RNA”。shRNA包括两个短反向重复序列，中间由一茎环（loop）序列分隔的，组成发夹结构，几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起。重叠基因中不仅有编码序列也有调控序列，大基因内包含小基因。重叠基因有多种重叠方式，更重要的可能是参与
sgRNA的设计与载体构建
实验概要1. CRISPR的介绍： CRISPR的全称为Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(规律成簇的间隔短回文重复序列)。实际上就是一种基因编辑器，由于细菌自身具有降解入侵的病毒DNA或其他外源DNA的免
基因编辑鼠－sgRNA表达载体构建
继上次发表的Guide RNA设计和筛选的相关知识之后，希望大家还没有忘记相关的操作和技巧，今天，我们就来和大家聊聊后续的实验，在基因编辑鼠的过程中，sgRNA表达载体是如何构建的呢？在靶点筛选结束之后，下一步就要进行sgRNA载体构建。在构建表达载体前，应根据实验目的选取合适的表达质粒。比如进行实
一文了解sgRNA（向导RNA）
向导RNA（guide RNA，gRNA），也称为小向导RNA（small guide RNA，sgRNA）。是作用于动质体（kinetoplastid）体内一种称为RNA编辑（RNA editing）的后转录修饰过程中。也是一种小型非编码RNA。可与pre-mRNA配对，并在其中插入一些尿嘧啶
基于PCR评估sgRNA特异性的方法
CRISPR/Cas9已经成为一种通用的基因组工程工具，依赖于一个单导向RNA（sgRNA）和Cas9酶进行基因组编辑。研究人员可以用简单、快速和经济的方法来产生sgRNAs，因此能够在培养细胞、小鼠、斑马鱼和其他模型系统中进行靶向诱变。为了靶向效率，预先筛选sgRNAs，对于成功诱变和减少动物
清华汪小我等人开发CRISPR－sgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控
CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计
sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有：1、http://crispr.mit.edu/ ；2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/；等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要，但仍然存在很多不足和缺陷。例如：1、数据分析周期长；2、无具体的脱靶数据；
汪阳明组“miRNA与sgRNA联姻”打造基因编辑体系控制新平台
miRNA是一类长度约22个碱基的核糖核酸分子，广泛表达于植物，动物以及病毒中。miRNA通过与Argonaute (AGO)等蛋白形成RNA诱导沉默复合物（RNA Induced Silencing Complex，RISC），在转录后水平抑制基因表达【1，2】。其表达谱呈现细胞特异性【3】，
同济大学刘琦教授Cell子刊探讨CRISPR的insilico－sgRNA设计
CRISPR/Cas9系统是目前进行基因编辑的有效技术。实现CRISPR/Cas9系统的核心问题之一是进行高效以及特异性的sgRNA设计。近日，同济大学生命科学与技术学院刘琦教授课题组受邀在Cell子刊，Trends系列著名杂志《Trends in Biotechnology》（影响因子：12）
借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生...
借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生成非嵌合体突变体胚胎基因编辑解析：借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生成非嵌合体突变体基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”，实现对特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技术自问世以来，就有着
多个sgrna作用于同一个基因相互之间会不会有影响
但因为结构得到了简化更方便研究者使用，进而对目的DNA双链进行切割。 由于PAM序列结构简单（5’-NGG-3’）。 通过基因工程手段对crRNA和tracrRNA进行改造CRISPR (clustered，作用是时间也比较长、鱼类及哺乳动物细胞, regularly interspaced，且长期
强大的基因组编辑工具Crisp/cas9（二）
三、 产品推荐 针对sgRNA和cas9，我们有如下产品可供选择哦： 1.sgRNA系列。 （1）sgRNA载体类型 货号 载体 启动子 sgRNA 是否含有Cas9核酸酶基因 筛选标记/报告基因 SG001
CRISPR/Cas9设计工具，让基因编辑不再高冷！
CRISPR/Cas9已经成为最常用的基因编辑系统。CRISPR/Cas9包括2部分：Cas9核酸内切酶和sgRNA(single guide RNA)，sgRNA由天然的tracrRNA (transactivating crRNA)和crRNA (CRISPR RNA)融合而来。 使用
中科院王艳丽课题组在Crispr/Cas系统获得新的研究成果
2016年12月15日，Molecular Cell 杂志在线发表了中科院生物物理研究所王艳丽课题组关于CRISPR-Cas系统的最新研究成果，文章标题为“C2c1-sgRNA Complex Structure Reveals RNA-Guided DNA Cleavage Mechanism
设计cas9条件性基因敲除小鼠
其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠，即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步：第一步，选择外显子。第二步，设计sgRNA。第三步，设计SSODN。听起来蛮简单的哈？下面我们详细讲讲。第一步，选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。
如何正确选择的CRISPR文库？
确认基因型和表型之间的关系是功能基因组学的最终目标。如今，功能基因组学有了一种强大的新工具，那就是CRISPR-Cas9文库。这种方法利用慢病毒载体大规模导入全基因组sgRNA文库，能够同时靶向数千个基因，实现高通量的功能基因筛选。 大家最常用的Cas9靶定5’-NGG PAM位点，这种位点在
浙江大学最新文章利用CRISPR/Cas9技术敲除基因
基因组编辑技术(Genome editing)是通过基因工程表达的序列特异的核酸酶对基因组进行切割，实现基因定点敲除、敲入等修饰，在基础生物学领域的反向遗传学研究、农业领域的种质改良和医学领域的基因治疗等方面有重要的应用价值。 来自浙江大学生科院的研究人员在 Golden-gate 克隆技术的
纳米马达让CRISPRCas9钻进癌细胞心窝进行基因编辑
在癌症研究领域，“Cas-9–sgRNA”复合物是一种有效的基因编辑工具，但是其穿过细胞膜接触肿瘤细胞基因组的能力非常低。来自美国和丹麦的科学家们现在开发了一种可以运动的纳米马达，可以有效输送并释放这种基因魔剪系统。在这篇发表于《Angewandte Chemie》的文章中，研究人员详细描述了他
华南植物园猕猴桃多重高效基因组编辑系统研究取得进展
猕猴桃因其丰富的营养价值和独特的风味而成为重要的全球性新兴水果。随着我国及世界猕猴桃产业的发展，如何快速高效地创制优异特色新种质并培育新品种，成为制约产业发展的关键。目前，基于成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列关联蛋白（clustered regularly interspa
－Cell子刊突破：无需克隆的CRISPR新技术
来自荷兰Hubrecht研究所和乌特勒支医学中心（UMC Utrecht）、麻省理工学院的研究人员称，他们开发出了一种自身克隆CRISPR/Cas9(scCRISPR)技术，可以绕开基因编辑过程中所有的克隆步骤，在数小时内完成CRISPR/Cas9介导基因突变及位点特异性转基因敲入。他们的研究成
刘小乐、张锋CRISPR最新论文
最近，来自哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究院、哈佛大学统计系和麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所的研究人员，在国际基因组研究权威期刊《Genome Research》发表题为“Sequence determinants of improved CRISPR sgRNA design”
清华大学Cell子刊发表CRISPR新文章
来自清华大学、哈佛医学院和斯坦福大学等机构的研究人员，通过优化sgRNA的参数提高了CRISPR/Cas9系统在果蝇中的特异性和效率。研究结果发布在10月23日的《Cell Reports》杂志上。 清华大学医学院的倪建泉（Jian-Quan Ni）博士和斯坦福大学的Jin Billy Li教
详解CRISPR基因编辑技术的利与弊
说到基因编辑，大家都会想起CRISPR技术。这个当年名声大噪的技术，现今依旧热度不减，尤其是我们的CRISPR大神张锋，近期发表的文章频频亮相于知名杂志，又引起一片热议。时过境迁，CRISPR技术并没有销声匿迹，一直在线。但任何事物包括技术有利就有弊，CRISPR技术当然也毫不例外。 CR
强大的基因组编辑工具Crisp/cas9（三）
人类 sgRNA 文库相关产品 货号 文库 sgRNA 数目 基因数目 管数 载体 L01-LS03 Innate kinases & ubiquitin ligases 475 239
Detectseq技术为碱基编辑领域内提供了CBE脱靶位点
2021年6月8日，北大-清华生命科学联合中心、北京大学生命科学学院伊成器教授课题组在Nature Methods杂志发表了题为“Detect-seq reveals out-of-protospacer editing and target-strand editing by cytosine
生物物理所等揭示Cas9切割DNA及其被AcrIIC3抑制的分子机理
CRISPR/Cas系统是广泛存在于细菌和古菌中抵抗病毒、质粒等外源核酸的获得性免疫系统。II型的Cas9在RNA的介导下可以特异性识别、切割dsDNA，具有可编辑性，因此被广泛用作基因编辑工具。由于其重要性，Cas9被系统地研究，大量的文献报道了Cas9的原子分辨率结构、单分子测量结果、分子动
PNAS：首次利用CRISPR实现特殊干细胞成体基因修复
北京生命科学研究所的研究人员首次利用体外成熟的Cas9/sgRNA核糖蛋白复合物在病人特异性的隐性营养不良性大疱性表皮松解症（Recessive dystrophic epidermolysis bullosa, RDEB）小鼠表皮干细胞实现了成体基因修复，从而为RDEB疾病以及其它遗传性皮肤疾
基因编辑那么热，可是你都会用了吗？
基因编辑是一种遗传工程技术，针对某个序列已知但功能未知的序列，通过改变生物的遗传基因，使其特定的基因功能丧失作用，通过研究对生物体造成的影响，进而推测出该基因的生物学功能。本文为你科普基因编辑三大技术： 基因敲除 进行DNA水平编辑。一般用于构建基因敲除鼠模型。 CRISPR/Cas9：C
基因编辑鼠的构建－Guide－RNA设计和筛选
众所周知，CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”，它可以高效地实现靶基因的编辑，自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成，Cas9核酸酶会在向导RNA（Guide RNA, gRNA）的指引下，在完整基因组上的特定位点完成切割反应，同
Nature－Biotechnology：CRISPR再获重要改良
Broad研究所的研究团队日前开发了一个独特的CRISPR-Cas9基因控制系统。该系统只需要催化活性的Cas9，就能在同一个细胞中敲除和激活不同基因。这一重要成果发表在十月五日的Nature Biotechnology杂志上，文章的通讯作者是Broad研究所Silvana Konermann，