RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行RNA-BisSeq。经过生信分析,发现在HEK293细胞有12442个m5C位点,在NSUN2-/-HEK293细胞中有3270个m5C位点,在注释mRNA中分别有1142个和376个m5C甲基化位点(A)。且NSUN2下调能够降低m5C甲基化程度(B)和部分染色体上m5C位点数目(C)。但是,NSUN2下调并不改变m5C位点的motif偏好性,HEK293细胞中,CG含有22%,CHG含有33%,CHH含有45%;NSUN2-/-HEK293细胞中,CG含有24%,CHG含有33%,CHH含有43%(C、D)。这些数据显示,NSU......阅读全文
RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
m5C-RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:
科研人员研发RNA甲基化7甲基鸟嘌呤测序技术
7-甲基鸟嘌呤(m7G)修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一,广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区,对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰,然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。 中国科
检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
占领C位!云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平 RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云
dna甲基化与rna甲基化的区别
DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。
双RNA测序技术
在发表于《自然》(Nature)杂志上的一篇研究论文中, 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现,采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术,可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制,以及在研究中获得的重要发现
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
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解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
RNA甲基化促进草莓成熟
果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素
RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。
DNA-甲基化测序常用方法
随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向
环状-RNA-测序案例分析
案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨 circular RNAs 的富集与增殖的相关性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是构成生物体 RNA 网络的一部分,而且研究者们推测 circular RNAs 与 miRNAs 一样具有生物学功能。 目的
核糖核酸(RNA)测序
RNA在细胞中的稳定性较差,在实验中也更容易受到核酸酶的攻击。因为RNA是由DNA转录产生的,所以信息已经存在于细胞的DNA中。然而,有时也需要对RNA分子进行测序。虽然DNA测序给出了生物体的遗传图谱,但RNA测序却反映了细胞中活跃表达的序列。为了给RNA测序,通常的方法是首先对从样品中提取的
RNA甲基化研究深度剖析(一)
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高
“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析
技术优势:● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接● 可视化数据展示,提供paper级结果图表● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍: 人类基因组中仅有约2%的DNA序列最
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
“RNA测序”通用模板新突破
通过检测血液或尿液中少量的RNA来诊断或治疗疾病是一个新兴领域。随着技术的进步,研究人员可以对RNA片段进行测序,但不同的人使用不同的方法来测序RNA,有时会得到不同的结果,这是影响成功的一个重大障碍,使得此领域很难取得进展。近来,密歇根大学Tewari教授的实验室领导了美国和荷兰的9个实验室组
一文了解RNA甲基化机制
1. 什么是RNA甲基化修饰? 我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶(C)上的,而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修饰(uridylation,U-tail)。 m6A修饰在70年代就发现了,是可以发生在mRNA、lncR
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述
技术优势: ● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程 ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接 ● 可视化数据展示,提供paper级结果图表 ● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍: 人类基因组中仅有
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合