有关UCSFDOCK6、AUTODOCK与AUTODOCKVINA对接准确率的探讨

1A:有没有关于主流对接软件的横评的综述啊,我看很多CNS级别的文章也在引用autodock还有vina,对接的准确与否一般是怎么定义的呢?答:这样的文章(文献)有很多,到pubmed搜一下就有了。之前群里有人发了一篇文章,说到vina的准确率比dock6高。我对此持怀疑态度。我只凭经验判断,没有重现过人家的结果,也没有去仔细研究人家的研究过程。有两个方面,我认为dock6更好:1、做过不少体系,dock6的结果更接近晶体构象或者能够解释实验现象,而vina则不太行。比如,我以前在做教程的时候,同一个PDB蛋白用dock6只产出少量(经常是一两个)pose结果,且第一个(也就是打分最好的)结果与实验晶体结构非常一致,而用vina则产生很多结果,没有一个好的。当然,并不是说vina对所有体系都没有好结果,只是我自己做的多了,渐渐发现dock6明显更可靠。这个比那些测评更实际。2、dock6的打分与实验活性的相关性能够达到0.9,v......阅读全文

水和废水中总氮测定有关问题探讨

  总氮是水中无机氮(含氨氮、硝酸盐氮、亚硝酸盐氮)和有机氮的总称,是判断饮用水、水源水、地表水污染程度的重要指标之一。目前测定的标准分析方法是碱性过硫酸钾消解、紫外分光光度法。该法虽然步骤较为简单,但实验所用实验用水、器皿、试剂纯度、保存时间要求苛刻,任何一处环节出现偏差,都会对测定结果产生影响。

有关自动顶空进样器空白出峰的相关探讨

 有关自动顶空进样器空白出峰的相关探讨  顶空进样是对液体样品或固体试样中的可挥发性成分进行分析的有效方法。如塑料包装食品包装袋中挥发性VOC成分的分析,人在有毒环境中工作后,体液中有毒组分含量的分析等。  自动顶空进样器从目前来看,可以分为手动型,半自动型,全自动型三种。  自动顶空进样器选型时要

有关自动顶空进样器空白出峰的相关探讨

有关自动顶空进样器空白出峰的相关探讨  顶空进样是对液体样品或固体试样中的可挥发性成分进行分析的有效方法。如塑料包装食品包装袋中挥发性VOC成分的分析,人在有毒环境中工作后,体液中有毒组分含量的分析等。  自动顶空进样器从目前来看,可以分为手动型,半自动型,全自动型三种。  自动顶空进样器选型时要注

早产与失眠有关

  尽管如今在孕产妇药物方面已经有了长足进步,但早产对全世界的产科医生来说仍然是个棘手的问题。如今一项对美国加利福尼亚州近300万名孕妇的医疗记录进行的分析表明,一个出人意料的简单干预措施——更好的睡眠——可能有助于解决这个问题。  研究人员之前发现,与那些没有睡眠障碍的女性相比,被诊断出患有失眠症

这个基因与嗜睡症有关,也与心力衰竭有关

  斯坦福大学等机构的研究人员通过全基因组关联研究(GWAS),发现一个之前与睡眠相关的基因也与心力衰竭存在关联。他们将研究成果发表在《美国心脏病学会杂志》(JACC)上。  斯坦福大学的Marco Perez及其同事发现,有些心力衰竭的患者对治疗的反应很好。心脏功能在药物治疗后明显改善。而其他患者

前沿金融科技与场景需求在京对接

2024中关村论坛系列活动——“向新而行”2024场景赋能新质生产力系列活动“金融科技”领域供需对接会近日在西城区举办,为企业找市场、找合作、找资金、找场景,推动前沿科技赋能金融发展。我国企业数量庞大,融资与贷款需求也巨大。金融机构针对科技企业的贷前尽职调查需要大量的工作投入,不但需要专业的金融领域

沈阳分院与鞍钢集团开展技术对接

  8月1日,在辽宁省科技厅组织下,中国科学院沈阳分院、金属研究所、沈阳自动化研究所等单位院士、专家团队赴鞍钢集团公司开展定向科技成果发布和专题对接。中国工程院院士柯伟、沈阳分院副院长马越红、金属所副所长谭若兵等14位沈阳分院系统院士、专家参加了对接活动。来自鞍钢集团公司、鞍山钢铁公司、鞍钢矿业公司

细胞的形态与什么有关

与细胞的遗传物质有关,细胞内外渗透压大小,细胞活性等有关

有关量热仪测定煤发热量准确性的探讨

目前,就现有各类量热仪而言,假设仪器合格,而且操作正确,则只要在正式测试前注意好以下事项就能获得准确性较高的测试结果。首先就设备本身来说各部件的质量对所得出的数据有直接影响。仪器的性能越精密,自动化程序越高就能尽量减少人为操作引起的误差。具体为:氧弹不受燃烧过程中出现的高温和腐蚀性产物的影响而产生热

有关量热仪测定煤发热量准确性的探讨

目前,就现有各类量热仪而言,假设仪器合格,而且操作正确,则只要在正式测试前注意好以下事项就能获得准确性较高的测试结果。首先就设备本身来说各部件的质量对所得出的数据有直接影响。仪器的性能越精密,自动化程序越高就能尽量减少人为操作引起的误差。具体为:氧弹不受燃烧过程中出现的高温和腐蚀性产物的影响而产生热

新研究探讨听觉与行动的关联

大脑将声音刺激转化为运动(艺术想象图)。图片来源:葡萄牙尚帕利默未知科学研究中心科技日报北京5月14日电 (记者张佳欣)为什么人们会根据声音做出判断,这时大脑究竟发生了什么?据最新一期《当代生物学》杂志报道,来自葡萄牙尚帕利默未知科学研究中心的研究人员阐明了大脑在那一时刻可能发生的行为。他们的发现加

中草药与癌症有关

  你知道你的草药补充剂中都有什么吗?两项新的研究揭示马兜铃酸——这是在许多中草药中存在的一种天然的化合物——会在人体中触发大量的基因突变,而这些突变可能会导致癌症。文章的作者发现的“分子特征”可被证明是一种有用的方法,以发现未受怀疑的马兜铃酸摄取。马兜铃酸来自马兜铃属植物,它多个世纪以来一直在全世

鼻炎是否与遗传有关

  鼻炎是一种常见的疾病,其发病原因比较复杂,遗传因素是其中之一。研究表明,鼻炎患者的家族中,有鼻炎患者的比例明显高于普通人群。因此,可以认为鼻炎与遗传有一定的关系。  具体来说,鼻炎的遗传方式可能是多基因遗传或复杂遗传。多基因遗传是指多个基因共同作用导致疾病的发生,而复杂遗传则是指疾病的发生受到多

性格竟然与疾病有关!

  研究个性和炎症之间的关系,有助于人们了解健康和患病两种状态切换的原因。因为不同的个性因素会带来不同的个体行为,从而间接影响炎症。五大性格特质(英语:Big Five personality traits),又称大五性格模型或五因素模型(The Five Factor Model,简称FFM),是

哪些疾病与输血有关?

输血或血液制品都有传播疾病的危险。常见的有:乙型肝炎和丙型肝炎、艾滋病、巨细胞病毒感染、梅毒、疟疾;EB病毒感染、黑热病、回归热、丝虫病和弓形体病等也可通过输血传播。另外,还有因血液被细菌污染的败血症。 

凝胶柱柱压与填料有关还是柱子有关

都有关系凝胶填料它能作为有机溶剂去分离嗜脂性分子,而且分离的效果很不错,能保持十几年不变,所以对于进行凝胶层析分离样品时,有很重要的作用,所以对于它的选择也是不可忽视的。分析一下在选择凝胶填料时候的注意点,如下: 1、凝胶的颗粒粗细与分离效果有一定的直接关系。一般来说,细颗粒分离效果好,但流速慢;而

分子对接技术研究D7152441-抑制剂与PB2蛋白的结合模式

  从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果,看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6,是典型的“实验+计算”模式,比较接近大多数科研

美载人绕月任务飞船完成与火箭对接

  美国航天局代理局长肖恩·达菲24日表示,执行“阿耳忒弥斯2号”载人绕月飞行任务的“猎户座”飞船已与美国新一代登月火箭“太空发射系统”完成对接,为执行载人任务做好准备。  达菲当天在社交媒体平台X上发文称,代号为“诚信号”(Integrity)的“猎户座”飞船与“太空发射系统”完成对接,标志着“阿

中青报:高校志愿服务亟需与公益项目对接

  “我们学校不缺有公益心的志愿者,但是特别缺乏好的公益项目。”在11月16日举办的北京高校志愿服务社团联谊活动上,来自北京科技大学青年志愿者协会的陈伟杰说。   北京高校志愿服务社团联谊活动由中国青年报社主办,中青公益、海巢HOT社区青年汇承办。北京航空航天大学、北京科技大学、中国传媒大学、北京

探讨船舶氢能应用与发展

9月25日,由大连海事大学和大连市氢能发展促进协会共同主办,中科院大连化学物理研究所、信德海事协办,大连市新能源船舶技术创新中心、大连海事大学轮机工程学院承办的第二届大连船舶氢能国际研讨会顺利举办。会议采取线上和线下相结合的形式举行,并全程进行网络直播。 此前,中国海事局发布了《氢燃料电池动力船

与饮水念头有关的大脑区域

  对20个人在饮水时候的进行的大脑成像研究揭示出了可能参与到渴的时候驱使人饮水或者解渴后停止饮水的大脑区域。人通常把渴的时候饮水的行为描述为一种愉悦的体验,但是他们把解渴之后持续饮水的行为描述为不愉悦的。Derek A. Denton及其同事使用了功能磁共振成像探索了触发此类感觉的机制。当

与癌症有关的因素有哪些?

恶性肿瘤的病因尚未完全了解。目前较为明确的与癌症有关的因素可分为外源性和内源性两大类:1.外源性因素(1)生活习惯 如吸烟等不良生活习惯,与癌症发生密切相关。约1/3因癌症而死亡的患者与吸烟有关,吸烟是肺癌的主要危险因素。摄入大量烈性酒可导致口腔、咽喉、食管恶性肿瘤的发生。高能量高脂肪食品可增加乳腺

甲醇的保留时间与什么有关

你需要明白两件事情。 第一,气相色谱和液相色谱,同一个物质,保留时间应该相同(也就是说同一个物质在同一个时间出峰) 第二,同一个物质峰面积和浓度成正比。也就是说,同样是甲醇,浓度越高,峰面积越大。 首先,这里面应该有一个对照品。其...

与抗酸染色有关的细菌成分

与抗酸染色有关的细菌成分是脂质。抗酸染色阳性的细菌主要是分枝杆菌属细菌,包括结核分枝杆菌的人型、牛型,麻风分枝杆菌和非结核分枝杆菌。

与抗酸染色有关的细菌成分

与抗酸染色有关的细菌成分是脂质。抗酸染色阳性的细菌主要是分枝杆菌属细菌,包括结核分枝杆菌的人型、牛型,麻风分枝杆菌和非结核分枝杆菌。

液体的流动速度与什么有关

体流动时只是液体内部压强变小,大气压依然是大气压,没有关系,而液体的蒸发速度跟气压也没有直接关系,跟空气中水蒸气含量有直接关系,而往往空气中水蒸气含量是影响大气压的最主要的因素,所以在其他条件相同的情况下,大气压低时空气中水蒸气含量高,液体蒸发慢,否则反之。对于你这个问题,液体流速会影响蒸发速度,因

与药物研发有关的电影

  涉及到真实存在的药物,并且对剧情有共享的电影。  不涉及科幻、恐怖之类的影片,如吃了药变超人:《超体》,吃了药变聪明:《永无止境(逆天潜能、药命效应 )》等等。  1、《埃尔利希医生的魔弹》(Dr. Ehrlich's Magic Bullet)  埃尔利希是德国著名的血液学家、免疫学说的奠基人

PCR退火的时间与什么有关

PCR退火时间是与引物的长度有关的,一般在30s-1min.所以如果说退火时间过长,酶会在低效率的情况下,长时间工作,对酶的活力有较大的影响,即使在72度最佳延伸温度延伸的时候也未必能得到最好的结果,所以一般延伸温度一般比退火温度时间长,就是这点原因,让酶可以激活,让酶可以保持高效率扩增效率

血小板的多少与什么有关?

  血小板的正常值为100×109~300×109/L。低于100为血小板减少,见于再生障碍性贫血、放射性损伤、急性白血病、恶性淋巴瘤等等恶性病,以及上呼吸道感染、风疹、先天性血小板减少症、脾肿大、血液被稀释等等原因。血小板增多常见于一些骨髓增殖性疾病,如:原发性血小板增多,真性红细胞增多症,骨髓纤

模温机的配置与什么有关呢?

  在使用模温机的时候,模温机的配置与什么有关呢?一般的模温机配置应根据加工的材料,模具的重量,要求的预热时间和生产率kg/h来综合判定。详细内容请看以下的分析。  高温油温机当使用导热油时,操作者不要把模温机放在靠近热源的地方。接头使用有锥度的防漏和具有耐温耐压的软管或硬管。  要定期检查温度控制