一文了解蛋白质组学分析技术

蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。 蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。 可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖......阅读全文

国人佳作惊艳时代风口!蛋白质组学2021科研成果汇编

蛋白质组学(proteomics)是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质,包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列,蛋白质的丰度,蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。蛋白质组(proteome)的概念最早在1994年由澳大利亚 Maquaire大学的一个学生 Marc wilkins 提出,蛋白质组被

2010-“蛋白质组学与疾病”专题研讨会隆重开幕

  2010年9月15日上午,慕尼黑上海生化展览会召开期间,2010“蛋白质组学与疾病”专题同期研讨会在W2馆M9会议室隆重开幕。本次研讨会是由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委会(CNHUPO)主办,蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心和德国慕尼黑国际博览基团(MMI)联合承办举

蛋白质组学团队揭示蜂王浆如何提高人体免疫力

  近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蛋白质组学团队发现,蜂王浆中的特有不饱和脂肪酸10-羟基-2-癸烯酸(10-HDA),具有保护免疫器官的功能和促进免疫潜力。相关研究成果发表在《靶向治疗专家观点( Expert Opinionon Therapeutic Targets )》上。   据李建科

磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研究获突破

近日,广东省农业科学院农业生物基因研究中心晏石娟团队联合加拿大约克大学、德国马普分子植物生理研究所等研究人员在磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研发方面取得重大突破,首次搭建全自动在线磷酸化蛋白质组学分析技术平台,解决了磷酸化蛋白质组学研究的一大瓶颈。相关研究以农业生物基因研究中心为第一完成单位在线发

蛋白质组学应用于诱导毛发重生的关键细胞分泌蛋白鉴定

  脱发是目前非常难于有效治愈的一种流行病,近期研究结果证实真皮乳头细胞早期分泌蛋白可以诱导毛发的产生。小编今天来给大家分享一篇通过蛋白质组学研究的手段寻找诱导毛发重生的关键细胞分泌蛋白的文章。   iTRAQ-Based Quantitative Proteomic Comparisonof E

蛋白质组学技术对营养胁迫中泛素化修饰变化情况分析与

  吃货们,为了健康,少吃点吧!   小编知道一名资深的吃货,无论什么都阻挡不了美食的诱惑。但我忍不住要阻止:“吃货们!为了健康,少吃点吧!”   为什么要让热爱美食的你们做出如此痛苦的选择呢?看看下面这篇文献解读你就知道了。   Cell Death and Disease IF=5.96

刚刚!2022-HUPO-发布了蛋白质组学的四大奖项名单

HUPO及其奖项委员会荣幸地宣布2022年各奖项获奖者,让我们祝贺这些在蛋白质组学上取得突出成就的杰出人士!HUPO and the Awards Committee are very pleased to announce the 2022 HUPO Award winners. Please j

国内外蛋白质组学大腕云集-聚焦生物质谱前沿技术

  2014年7月3日,全国生物质谱学术报告会--生物质谱前沿技术邀请报告会在上海复旦大学隆重召开。此次活动旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作,特邀瑞士苏黎世联邦技术学院分子系统生物学

关于举办蛋白质组学技术与应用专题研讨班的通知

  蛋白质组学技术的发展已经成为现代生物技术快速发展的重要支撑,并将引领生物技术取得关键性的突破。为帮助生命科学领域的工作者全面掌握蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点,中国生物工程杂志社(中国生物工程学会、中国生物技术发展中心、中国科学院文献情报中心主办)与北京蛋白质组研究中心

中国医学科学院蛋白质组学大会报告集锦

PTTG——促进食管鳞癌转移的癌基因   中国医学科学院肿瘤研究所徐宁志研究员作了题为《PTTG——促进食管鳞癌转移的癌基因》的报告,介绍了我国食管鳞癌患者的分布情况,PTTG过度表达对肿瘤转移的机理和促进作用,以及医学分析所面临的挑战。   中国医学科学院肿瘤研究所 徐宁志 研究员

第十届CNHUPO开幕:凤凰涅槃——蛋白质组学的新时代

  分析测试百科网讯 2018年11月15日,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办,军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、暨南大学生命科学技术学院、国家蛋白质科学中心∙北京、蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心共同承办的第十届中国蛋白质组学大会在广州白云国

基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定(一)

摘要 随着“一小时酵母蛋白质组”的实现, 短梯度下实现蛋白质组深度覆盖成为可能。本文利用全新Q-OT-qIT三合一质谱系统进行“一小时蛋白质组”分析与优化。50 min有效梯度, 单次实验分别从1 μg和50 ng HeLa全蛋白中鉴定到20860和14100条肽段, 对应到3865和287

Orbitrap-Exploris™-480的鉴定性能、软件特性和蛋白质组学应用2

3.前所未有的TMT定量体验 困扰:对于10标以及11标的TMT定量来说我们一直受到两个问题的困扰。 1第一个问题 10标TMT的相邻报告离子基团仅存在质量亏损级的质量差异,因此我们需要采用50,000的分辨率进行采集,从而使得扫描速度变慢,降低了对样品的测序深度。 2第二个问题 共流出肽段的干扰,

医科院基础所选择TripTOF-5600开展蛋白质组学研究工作

      中国医科院基础研究所是我国国内较早开展临床蛋白质组学研究的科研单位之一,从2002年起致力于蛋白质组学研究方法的开发和临床蛋白质组学研究工作,先后开发了质谱数据分析软件AMASS、快速微波辅助样品处理技术和细胞分泌蛋白分析技术,

赛默飞世尔科技推出新的蛋白质组学解决方案

        2008年8月18日,服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技在2008年人类蛋白质组大会(HUPO 2008)上,推出新的蛋白质组学工作流程解决方案,以及两个Thermo Scientific软件升级包。不久前推出的Proteome Discoverer 软件平台是一个综合性的、可拓展软

Nature子刊实验室洞察:高通量蛋白质组学方法学综述

    在后基因组时代,蛋白质组学在生物医学研究中发挥着重要作用。2022年8月,Nature子刊《Laboratory Investigation》发表了一篇高通量蛋白组的mini-review,概述了高通量蛋白质组学技术、统计和算法的进展。    蛋白质组学作为蛋白质组实验和数据分析的结合,从整

南京大学研究团队实现纳米孔蛋白质组学重大突破

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509528.shtm蛋白质是生命活动的执行者,由20种天然存在的蛋白质氨基酸构成。与高歌猛进的DNA测序技术相比,高灵敏、高通量的蛋白质测序技术的发展严重滞后,目前仅Edman降解法和质谱法能做到蛋白质测

赛默飞世尔科技“蛋白质组学解决方案”网络视频讲座

  3月30日下午,赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳向大家作了题为《蛋白质组学研究方法和Thermo蛋白质组学解决方案》的报告

不同标记与非标记蛋白质组学定量准确性分析研究

  通过质谱法进行定量蛋白质组分析为生物医学探索研究提供非常重要的途径。 然而,了解生物样品中的定量限制对于准确判断结果非常重要。通过使用加入已知浓度的蛋白质标准品的复杂样本,科学家们研究了无标记(label free)和基于标记(TMT和iTRAQ)的肽定量的定量限制,包括前体混合的评估及其对同重

ASMS-2023丨布鲁克质谱新品继续引领单细胞蛋白质组学

  MS/MS扫描速度提升至300Hz的timsTOF Ultra,进一步推进空间蛋白质组学和单细胞多组学;新型离子源和微升流喷雾针、采集方法和软件带来更稳定、更灵敏、更快速的4D-蛋白质组学  01.timsTOF Ultra 质谱仪  timsTOF Ultra PASEF扫描速度提高至300

基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定(二)

表1 有效梯度内的采集数据分析  表2 HeLa和酵母样本全蛋白鉴定结果  2.2 HeLa和酵母蛋白质组快速鉴定结果 数据经SEQUEST HT搜库和Percolator卡值, 从1 μg和50 ng HeLa样本中分别鉴定到20860和14100条肽段(q值0.01), 分别对应3865和287

SCIEX发布ZenoTOF-7600+新品!ZT-Scan-DIA实现精准蛋白质组学发现

  2024年10月22日,在2024年第23届国际人类蛋白质组(HUPO)大会上,全球生命科学分析技术创新者SCIEX通过推出高分辨质谱ZenoTOF 7600+系统,进一步拓展了其高分辨率精确质量质谱系列产品,并宣布了三项新的合作以提升蛋白质组学能力。  作为ZenoTOF高分辨质谱系列的最新系

Orbitrap-Exploris™-480的鉴定性能、软件特性和蛋白质组学应用1

在这期中我们一起来领略一下Exploris 480的强悍性能,以及新的软件特性如何将蛋白质组学推向一个新的高度。1.Orbitrap Exploris™ 480的鉴定性能  Exploris 480是在Q Exactive HF-X的基础上改进而来,因此其绝对性能指标也是达到了新的高度。其最高扫

基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定(三)

表3 不同的最大注入时间与AGC下HeLa样本的鉴定结果 图3 HeLa样本ATAGDTHLGGEDFDNR肽段二级谱图和匹配信息 A: 1 μg样本量, CID碎裂; B: 1 μg样本量, HCD碎裂; C: 50 ng样本量, HCD碎裂 图4 HeLa样本肽段鉴定结果比较 A: HCD和CI

Bruker新型IMPACT-HD质谱仪引起轰动的蛋白质组学研究新成果

  布鲁克IMPACT HD树立了蛋白质组鉴别的新基准,实现超过8000个全蛋白分析,具备破纪录的复杂生物样品中痕量物质鉴定的分析能力  2013年6月10日——在Minneapolis会议中心召开的第61届ASMS会议上,布鲁克推出蛋白质组学和生物标志物研究中令人振奋的全新高精度质谱仪。ZL低噪声

转录组和蛋白质组有何异同之处

转录组是RNA转录后的全部产物,而转录后的产物经过加工修饰(例如甲基化、拼接、加尾等)后才变成蛋白质.相同之处就是他们的大部分结构相同.不同之处就是一个有加工过程,一个没有.

蛋白质组的基本介绍

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是

蛋白质组的鉴定方法

如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库;

蛋白质组的研究内容

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。② 以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学。③

蛋白质组鉴定技术简述

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定。在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达。并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不