上海交大陶生策团队:独家蛋白质组芯片可加速疫苗研发
截止到2020年3月3日,我国累计已有新冠肺炎病例80302例,死亡2947人。我国的疫情防控已渐渐向好,但其它多个国家的疫情则呈快速上升和爆发趋势,引起了强烈关注,世界卫生组织总干事谭德赛28日在日内瓦宣布将新冠肺炎疫情全球风险级别由此前的高上调至非常高。基于流行病学数据,多名国内外专家预计新冠肺炎可能会长期流行。为了实现最终的有效防控,新冠肺炎的基础研究必须要迅速得到加强,其中尤为重要的两个方面是:1.对新冠肺炎康复人员血清中病毒特异性抗体的系统性分析;2.对病原-宿主相互作用的全局性研究。通过这些研究将可提供全面的免疫响应数据及提示病毒蛋白质的功能,为疫苗研发、中和抗体制备以及药物靶点的确定提供重要线索,进而加速新冠肺炎关键研究的进程。系统性的分析需要强力工具,包含新型冠状病毒(SARS-CoV-2)绝大多少甚至所有蛋白质的蛋白质组芯片是一个极佳的选项。 近日,上海交通大学系统生物医学研究院陶生策团队传来好消息。该团......阅读全文
上海交大陶生策团队:独家蛋白质组芯片可加速疫苗研发
截止到2020年3月3日,我国累计已有新冠肺炎病例80302例,死亡2947人。我国的疫情防控已渐渐向好,但其它多个国家的疫情则呈快速上升和爆发趋势,引起了强烈关注,世界卫生组织总干事谭德赛28日在日内瓦宣布将新冠肺炎疫情全球风险级别由此前的高上调至非常高。基于流行病学数据,多名国内外专家预计新
陈竺院士、陶生策教授PNAS发表癌症研究新成果
来自上海交通大学、中科院等处的研究人员,通过系统鉴别砷结合蛋白揭示出砷剂抑制了己糖激酶2(hexokinase-2,HK2)。这项研究发布在11月23日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 上海交通大学系统生物医学协同创新中心的陈竺(Zhu Chen)院士及陶生策(Sheng-ce Tao
上海交大发表MCP:构建首个结核杆菌STPK蛋白互作网络
来自上海交通大学系统生物医学研究院的研究人员发表了题为“The Ser/Thr Protein Kinase Protein-Protein Interaction Map of M. tuberculosis ”的文章,利用独有的肺结核分枝杆菌蛋白组芯片构建了首个肺结核分枝杆菌丝氨酸/苏氨酸蛋
飞行喷墨式生物芯片点样技术在超高通量抗体芯片开发...
飞行喷墨式生物芯片点样技术在超高通量抗体芯片开发的应用上海交通大学系统生物医学研究院3月12日报道,国际知名期刊Science Advances在线发表了上海交大陶生策团队,Abmart孟逊团队和西北大学联合研究的最新研究成果:An Array of 60,000 Antibodies fo
PROTEOMICS:OGalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现
近日,上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos
上海交大MCP最新成果:首个全覆盖登革病毒蛋白质芯片
作为RNA病毒中的一种,登革病毒每年感染数千万人,其遗传信息高度可变,目前缺乏有效的疫苗、药物及研究工具。近期来自上海交通大学系统生物医学研究院,广东省CDC病原微生物研究所的研究人员发表了题为“Rapid production of virus protein microarray using
中科院、上海交大推出新蛋白质组芯片
结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)是引起结核病的病原体,每年全世界有将近两百万人死于这一毁灭性疾病。现有抗生素能够缓解结核病的症状,但治疗往往持续数月并且难以将其根治,结果是这种疾病在治疗数年之后频频复发。 人们已经对结核分支杆菌进行了多年研究,但至今
校企携手,共促胃癌诊断领域新突破
6月21日,成都博奥新景医学科技有限公司(以下简称博奥新景)与上海交通大学在上海交大系统生物医学研究院举行了签约仪式,成都博奥新景医学科技有限公司总裁高云先生和上海交通大学系统生物医学研究院陶生策教授代表双方签署了本次协议,博奥生物集团有限公司高级副总裁兼技术总监邢婉丽教授、博奥新景医学科技有限
-上海交大PNAS发文,揭示砒霜抗肿瘤机制
来自上海交通大学的研究人员证实,砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2: hexokinase-20)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。这一研究成果于11月23日在美国科学院院报(PNAS)上在线发表。 经过几代中国科学家的努力,As
蛋白质组与蛋白质芯片研究现状及应用
摘要: 蛋白质组研究目的在于从蛋白水平阐明基因的功能,这对于探索生命的奥秘具有重要的意义。蛋白质芯片是近年来兴起的一种强有力的高通量研究方法, 能够一次平行分析成千上万的蛋白样品, 具有很高的敏感度与准确性。它将成为蛋白质组学研究中的强有力的研究方法, 并最终架起基因组学与蛋白质组学的桥梁。1 研
研究证实:影响蛋白通路砒霜可抗肿瘤
上海交通大学和山东大学的一项合作研究证实,砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。相关研究成果近日在线发表于美国《国家科学院院刊》。 As2O3在治疗APL(急性早幼粒细胞白血病)上已获成功,现有研究
上海交大医学院瑞金医院找到7项胃癌血清标志物
海交通大学医学院附属瑞金医院刘炳亚课题组与上海交通大学系统生物医学研究院陶生策课题组进行合作,利用蛋白质芯片平台,筛选出7个新的胃癌血清标志物,相比于传统的标志物及其联合,新发现的胃癌血清标志物无论是敏感性、特异性、准确性方面均有大幅度提高,对于胃癌的筛查和早期诊断具有较高的临床价值。这一研究成
孙士生:用糖蛋白质组学破译癌症的密码
作为一名生长在齐鲁大地、深受儒家文化熏陶的青年学者,即便在海外求学多年,孙士生始终心系国家、情牵母校。伴随着时代的召唤,入选国家“千人计划”青年项目的孙士生毅然回到母校西北大学,希冀将他在美国掌握与研发的先进技术应用到西北这片广袤的大地上,以期为母校、为西北地区乃至为整个中国的科研水平真正实现
安捷伦举办芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会
疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室第二届学术委员会研讨会 暨安捷伦第一届芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会成功举办 2007年秋,为了开发建立一套全新理念的,与临床研究紧密联结的整体化蛋白质组学研究平台,以实现科研及早期临床诊断、新药开发及个体化医疗的需求,安捷伦科技和西南
蛋白质组和蛋白质组学分析
随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基
Arrayjet飞行喷墨式生物芯片点样技在开发新冠病毒蛋白...
Arrayjet飞行喷墨式生物芯片点样技在开发新冠病毒蛋白组芯片的应用上海交通大学系统生物医学研究院陶生策教授团队联合中科院武汉病毒研究所,佛山第四人民医院,中科院生物物理研究所等单位在著名期刊nature communications上在线发表新冠研究重要研究成果“SARS-CoV-2 pro
蛋白质芯片技术固体芯片的构建方法
常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。
蛋白质芯片技术特点
⒈ 直接用粗生物样品(血清、尿、体液)进行分析⒉ 同时快速发现多个生物标记物⒊ 小量样品⒋ 高通量的验证能力⒌ 发现低丰度蛋白质⒍ 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比,除了有相似功能外,并可增加测定疏水蛋白质⒎ 在同一系统中集发现和检测为一体 特异性高 利用单克隆抗体芯片,可鉴定未知抗原
蛋白质芯片技术简介
由于利用了DNA与互补的DNA或RNA结合的典型性质, DNA 芯片在短时间内就取得了成功. 然而, 已经有关于mRNA 和蛋白质之间数量关系上的争论, 而且实际上在细胞中参与各种不同反应的都是蛋白质. 因此, 如果能制造出蛋白质芯片而不是DNA芯片, 而且如果蛋白质表达强度和键合物能被发现, 就有
蛋白质芯片的特点
⒈ 直接用粗生物样品(血清、尿、体液)进行分析⒉ 同时快速发现多个生物标记物⒊ 小量样品⒋ 高通量的验证能力⒌ 发现低丰度蛋白质⒍ 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比,除了有相似功能外,并可增加测定疏水蛋白质⒎ 在同一系统中集发现和检测为一体 特异性高 利用单克隆抗体芯片,可鉴定未知抗原
蛋白质芯片的种类
蛋白芯片主要有三类:蛋白质微阵列、微孔板蛋白质芯片、三维凝胶块芯片等。
什么是蛋白质芯片?
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。
蛋白质芯片的制备
固体芯片的构建常用的材质有玻片、硅、云母及各种膜片等。理想的载体表面是渗透滤膜(如硝酸纤维素膜)或包被了不同试剂(如多聚赖氨酸)的载玻片。外形可制成各种不同的形状。Lin,SR等人引采用APTS-BS3技术增强芯片与蛋白质的结合。探针的制备低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物
蛋白质芯片的原理
蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
CDI-HuProt人类蛋白质组芯片对砒霜抗肿瘤机制的研究
通过HuProtTM人类蛋白质组芯片(由博翀生物提供),上海交通大学的科研团队发现砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2: hexokinase-20)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。这一研究成果于11月23日在美国科学院院报(PNA
CDI-HuProt人类蛋白质组芯片对砒霜抗肿瘤机制的研究
通过HuProtTM人类蛋白质组芯片(由博翀生物提供),上海交通大学的科研团队发现砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2: hexokinase-20)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。这一研究成果于11月23日在美国科学院院报(PNAS)
糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片(一)
糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密切相关
蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类