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甲基化研究新思路

组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士课题组以高分化恶性卵巢癌(HG-SOC)对顺铂耐药为研究对象,为组蛋白甲基化和表观调控提供了新的研究典范,相关研究成果近期发表在国际顶级学术期刊《Nature Communications》上。文献解读1、组蛋白甲基化,发现关键基因C/EBPβ在HG-SOC组织中,研究人员应用ChIP-seq技术对H3K4、H3K36、H3K79(转录激活相关)和H3K9、H3K27、H4K20(转录抑制相关)六个甲基化位点进行基因层面的分析,结果显示HG-SOC中许多基......阅读全文

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(四)

3. 多组学联合运用找靶点:转录组测序甲基化测序,双剑合璧 多个表达谱数据取交集找到靶基因(DOI: 10.1002/hep.29683) 甲基化数据同表达谱数据取交集(http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.02.01)1)云序生物推荐Me

陈建群团队在DNA甲基化作为肿瘤预后标志物研究取得突破

  癌症是世界性的威胁人类健康和安全的头号杀手,2018年全球新增癌症病例达1810万人,死亡病例达960万人。恶性黑色素瘤是由皮肤和其他器官黑素细胞产生的侵袭性恶性肿瘤,在全球各地的发病率呈逐年递增趋势,是最为致命的一种皮肤肿瘤。黑色素瘤通常预后效果很差,晚期患者致死率仅次于各大癌症中的白血病。而

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能

  RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。   近三个月高分文章部分列表:   2月28日

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制

  RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:RNA甲基化研究深度剖析)。   近三个月高分文章部分列表:   2月28日

揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移

  前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln

2012年世界各国生物技术发展回顾

  美国   遗传学研究精彩纷呈;细胞学研究成果丰硕;药理学研究取得新成果;艾滋病研究与治疗获得突破性进展;肿瘤学研究取得成效。   南加利福尼亚大学开发出一种绘制DNA之间接触位点的新方法,并利用计算机模型绘制出一个细胞中完整DNA链——基因组的精确三维图像;亚利桑那州立大学制造出一个能折叠成

PLOS Genet:单分子测序技术助力原核生物DNA甲基化研究

  近日,刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一项研究论文中,来自美国能源部联合基因组研究院的研究人员对230种古细菌和细菌基因组进行了测序,旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的关键角色。  细胞的表观基因组是基因组DNA特殊剪辑发生改变的一个特殊集合,这些表观基因组的改变会影响基因组的

昆明理工大学谭韬、季维智在Cell Research发表研究文章

  2月24日, 国际知名期刊Cell Research(细胞研究,影响因子14.8)以 昆明理工大学灵长类转化医学研究院为第一及通讯作者单位在线发表了灵长类转化医学研究院谭韬和季维智课题组、中国农科院深圳农业基因组研究所高飞课题组,以及同济大学孙毅课题组合作完成的研究论文“De novo DNA

化学生物学助力新药研究模式转变

   专家们认为,这些研究不仅为肿瘤、炎症等生物学基础研究提供了小分子化合物工具,也将推动疾病治疗领域创新药物的发现。  “基于化学小分子探针的信号转导过程研究”重大研究计划(以下简称“重大计划”)是国家自然科学基金委员会在“十一五”期间启动的第一个重大计划,也是化学生物学领域第一个重大计划。  在

植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

  DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作,揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析

  随着人类基因组计划(human genome project )在2003年顺利完成,基因组测序技术取得了长足的进步,这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊,这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以

高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析 6

应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用,研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说,2012年,Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂(aromatase inhibitor)治疗法之间的关联。他们指出突变,后果与诊断之间的关联,同样还有

线虫基因组中存在DNA甲基化现象

  2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN

吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象

2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...

SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域,近3个月以来,该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析,感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号(2018国自然热点二:R

20分文章中的RNA甲基化,热度与实力并存

近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:23.3

为植物表观遗传研究打开一扇门

  DNA测序技术发明之后,科学家们认为自己可以通过DNA全基因组测序解析生命的全部密码。渐渐的,他们发现有些重要信息并不编码于DNA序列里面,即便基因序列没有发生变化,生物体的表型也可以改变。这种研究被称为“表观遗传学”,继传统遗传学之后,表观遗传学如火如荼地发展起来了。  中科院院士、中科院遗传

遗传发育所曹晓风团队开辟水稻表观遗传研究新方向

  DNA测序技术发明之后,科学家们认为自己可以通过DNA全基因组测序解析生命的全部密码。渐渐的,他们发现有些重要信息并不编码于DNA序列里面,即便基因序列没有发生变化,生物体的表型也可以改变。这种研究被称为“表观遗传学”,继传统遗传学之后,表观遗传学如火如荼地发展起来了。曹晓风供图  中科院院士、

Nature杂志12月不得不看的亮点研究

  不知不觉,再过天2016年就离我们远去了,迎接我们的将是崭新的2017年,那么即将过去的12月里Nature杂志又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位一起学习。  【1】Nature:首次揭示RNA剪接与衰老存在因果关联  doi:10.1038/nature20789  衰老是

Nature:“液体活检”新突破,有望改进癌症早筛和分类

  在尽可能早的阶段检测出体内癌变,能够显著提高患者的治愈率和长期存活率。然而,常规的癌症筛查手段(例如血清学肿瘤标志物、影像检查等)面临着难以发现早期癌变或者误诊率较高的难题。  如何打破僵局?科学家们将目光投注于“液体活检”——以非侵入性的方式,将患者的血液作为肿瘤活检的样本,捕捉和检测与肿瘤相

20分文章中的RNA甲基化,热度与实力并存

  近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:23

研究人员首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化图谱

  结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc

北京基因组所等首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化

  结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc

RNA甲基化研究

近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:

第34届中国质谱学会学术年会报告 探讨质谱技术新进展

  分析测试百科网讯 2016年9月10日,由中国质谱学会主办,中国科学院青海盐湖研究所和安特百科(北京)技术发展有限公司联合承办的“第34届中国质谱学会学术年会暨全国会员代表大会”在西宁召开(相关报道:第34届中国质谱学会学术会在西宁开幕 共享质谱顶尖技术)。会议首日,15位报告人分别作了精彩的大

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  物理与材料学领域  【1】2019年12月11日,中科院物理所张余洋、丁洪及高鸿钧共同通讯在Science 在线发表题为“Nearly quantized conductance plateau of vortex zero mode in an iron-based superconducto

Science大型低成本,外显子测序成果

  来自华盛顿大学医学院,霍德华休斯医学院等处的研究人员利用一种新型技术,完成了多达2446个样品外显子测序分析,找到了自闭症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的多个频发突变,不仅为治疗ASD疾病提供了新思路,而且也提出了一种低成本,多基因测序新方法。相关成

染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙

  表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。  众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异

综述:代谢组学在疾病中的应用

   代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起,实现一次性检测坚定上千种物质,同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测,为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。   应用代谢组学的定义事件的预测生