绘制D7152441与PB2cap的结合模式图（二）
设置关键残基对象：关键残基包括：A链的K339、H357、E361、K376和F404。由于该蛋白只有一条链，在使用命令选择残基时，可以不用指定链名。按照下图顺序，将关键残基设置为res对象。2.3. 显示所需，隐藏多余在PyMOL中输入以下命令：然后，进行鼠标操作：2.4. 绘制相互作用力前面说过，命令行和鼠标的配合是很重要的。这里再简单讲讲鼠标的几个操作用法：A） 拖动鼠标左键：按住右键，任意方向拖动鼠标，使视图转动；B） 上下拖动鼠标右键：按住右键，上下拖动鼠标，使视图缩放；C） 拖动鼠标中间滚轮：按住滚轮，任意方向拖动鼠标，使视图移动；D）滚动鼠标中间滚轮：拉进或拉远镜头，使近处原子逐渐显示或隐藏。我们参照平台给出的结合模式图（本文第二张图），通过下面的键鼠操作来绘制相互作用力。绘制π-π堆积与盐桥作用首先，确保鼠标模式（Mouse Mode）为Viewing状态，选择（Selecting）模式为Atoms状态（位置在P......阅读全文
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图（二）
设置关键残基对象：关键残基包括：A链的K339、H357、E361、K376和F404。由于该蛋白只有一条链，在使用命令选择残基时，可以不用指定链名。按照下图顺序，将关键残基设置为res对象。2.3. 显示所需，隐藏多余在PyMOL中输入以下命令：然后，进行鼠标操作：2.4. 绘制相互作用力前面说过
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图（一）
前言本期，我将带大家使用PyMOL软件（搭配Photoshop、MS Powerpoint）绘制D715-2441与PB2cap的结合模式图。我们先来看一张成品图： 研究背景根据上期的分析结果，我们获得以下相互作用：1、化合物D715-2441的芳环夹在氨基酸残基H357和F404之间并形成π-π堆
绘制D7152441与PB2cap的结合模式图（三）
必要时，可先将cartoo隐藏起来，等调整好label后，再显示出来），让视图更清晰。经过上述一系列操作，得到下图：2.6. 生成图片上面的图已经可以发表文章了，但为了更好看，还需要进行一步：光线追踪（Ray tracing）。继续使用命令：至此，我们拿到3张图片：focus.png、label.p
高质量PyMOL软件作图教程绘制D7152441与PB2cap的结合模式图
上一期，小编教大家使用殷赋云计算平台（http://cloud.yinfotek.com）重现了一篇2018年文献《【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究》的分子对接计算结果。然而，要发表高质量SCI文章，还需要制作高质量的Figure。本期，我将带大家使用PyMOL软
分子对接技术研究D7152441－抑制剂与PB2蛋白的结合模式－二
4、 准备受体分子与配体不同，受体分子通常是生物大分子，无法通过手绘准备。平台提供了其他输入方式。点击上传文件，选择刚才下载的4cb4.pdb文件，然后按提示进行下去。通常来说，从PDB库下载的晶体结构文件里边包含了很多组分，不仅有（单条或多条）肽链，通常还有有机小分子和溶剂分子（水分子、金属离子）
分子对接技术研究D7152441－抑制剂与PB2蛋白的结合模式－二
6、 提交计算任务Dock6方案为我们提供了多种对接计算模式，这里稍微解释一下。在各种模式中，蛋白受体都是刚性不动的。因为Dock6的Grid算法实际上并非直接采用蛋白结构进行对接，而是采用其模型（正是前面生成的格点）。根据配体运动的方式，分为下面几种情况：1） 柔性配体对接，即配体在对接过程中是柔
分子对接技术研究D7152441－抑制剂与PB2蛋白的结合模式－－一
【前言】从本期起，小编将带领大家使用殷赋云计算平台（http://cloud.yinfotek.com/）来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果，看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6，是典型的“实验+计算”模式，比较接近大多数
分子对接技术研究D7152441－抑制剂与PB2蛋白的结合模式
从本期起，小编将带领大家使用殷赋云计算平台（http://cloud.yinfotek.com/）来做一系列计算“文章”。这一期咱们来重现一篇2018年文献[1]的计算结果，看看作者是如何运用分子对接技术来阐明机理、升华文章的。该文献影响因子4.6，是典型的“实验+计算”模式，比较接近大多数科研
电气原理图的绘制原则与识别方法（二）
电气原理图绘制的基本步骤和注意事项 电气原理图绘制的基本步骤是：首先进行认真构思，对所要绘制的步骤及表达的内容和布局做的心中有数；然后对整个图面进行布局，把所要表达的全部内容（不能遗漏），按其正确位置、主次及繁简划定实际所占画面大小；第三，确定基准线，包括水平基准线和垂直基准线；第四，
XS质控图的绘制与使用
X-S图法由于它只需要单一浓度的未定值血清，绘图方法简单易懂，有较为成熟的理论和实际经验。因此，成为国内外目前采用最广泛的一种常规室内质量控制方法。一般步骤和具体做法如下： ⒈最佳条件和常规条件下的变异的测定及计算 选择含量均匀、稳定性良好的未定值质控血清，在“最佳条件”，对该批血清反复测
嫦娥二号有望绘制世界最清晰“全月图”
国家国防科技工业局首次发布嫦娥二号月面虹湾局部影像图 继传回月球虹湾区域局部影像图之后，嫦娥二号今后还将有望完成约7米分辨率的全月影像图，这将是全世界最清晰、分辨率最高的一幅“全月图”。 据中国科学院国家天文台月球与深空探测科学应用中心主任、嫦娥工程地面应用系统总设计师李春来在2
解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示（二）
plt．figure（1）：表示取第一块画板，通俗地讲，一个画板就是一张图，如果你有多个画板，那么最后就会弹出多张图。plt．subplot（221）：221表示将画板划分为2行2列，然后取第1个区域。那么第几个区域是怎么界定的呢？这个规则遵循行优先数数规则！比如说4个区域：优先从行开始数，
电气原理图的绘制原则与识别方法（一）
为了表达生产机械电气控制系统的结构、原理等设计意图，便于电气系统的安装、调试、使用和维修，将电气控制系统中各电器元件及其连接线路用一定的图形表达出来，这就是电气控制系统图。用导线将电机、电器、仪表等元器件按一定的要求连接起来，并实现某种特定控制要求的电路。 画电气原理图的一般规律如下：
graphpad－prism怎么绘制紫外图
1、Graphpad中创建Newtable&graph，打开Graphpad，选择XY，点击Create。2、输入，导入数据，建立DataTables：Data1。3、分析点击左边的Results里的NewAnalysis，然后选择Transform里的TransposeXandY，点击OK。4、绘
BET图用哪些数据绘制
dV/dD----pore size这个图，因为我们获得的数据中没有dV/dD----pore size这组数据，所以应该可以用dA/dW----pore size数据作图，但是最好是要表明是dA/dW。这个可以用BJH中的adsorption dA/dW pore area中的pore width
BET图用哪些数据绘制
一、dV/dD----pore size这个图，因为我们获得的数据中没有dV/dD----pore size这组数据，所以应该可以用dA/dW----pore size数据作图，但是最好是要表明是dA/dW。这个可以用BJH中的adsorption dA/dW pore area中的pore wid
Nature发文：绘制植物科学的分子图
任何生物体的每个细胞都包含完整的遗传信息，或者说是一个生物的“蓝图”，编码所谓的DNA核苷酸构建块序列。但是植物是如何创造出各种各样的组织的呢？比如将光能转化成化学能并产生氧气的叶子，或者从土壤中吸收养分的根？答案就在各自组织细胞的蛋白质模式。 蛋白质是每个细胞的主要分子。它们是生物催化剂，在
《GigaScience》—实现文章与数据结合的创新学术发表模式
2012年7月12日，华大基因和生物医学中心(BioMed Central)宣布其共同创办的生物学期刊《GigaScience》首刊正式发行。该期刊采用标准全文文献、数据库信息以及信息分析工具相结合的崭新模式，来发表大规模的生物学研究成果，为广大科研工作者提供免费公开的有效数据以及生物学发现
绘制夏威夷岛“鱼流图”
珊瑚礁中的鱼 图片来源：Shawn Heinrichs/Conservation International近日，美国夏威夷大学马诺阿分校的研究人员在《生态学与环境前沿》上发表了一篇论文。海洋学、遗传学、生态学、渔业生物学和社会科学等领域的专家，对鱼类的自然和商业流动进行了深入研究，绘制出“
怎么利用origin绘制紫外谱图
1、打开Origin8，新建文件，选择porject类型；2、在弹出的数据框中导入要生成曲线的数据，然后将设置好横坐标和纵坐标，同时在每列表格上面三栏填写好单位、标题等3、选择所有数据，选择导出图表（左下角曲线的下拉菜单里面选择line+symbol）4、其他要更改的地方都可以通过单击形成对话框进行
怎么利用origin绘制紫外谱图
1、下载并打开origin软件。2、首先我们打开origin这个软件同时打开我们的实验数据。3、从仪器上直接导出的数据不是这样的，需要分裂一下。4、选择并复制exxcel表格上的数据，再打开origin粘贴在表格里，如图所示。5、添加完数据以后，点击上方的“绘图”会出现下图中的界面，选择你需要的图形
用RNAseq快速绘制大脑图
在过去的十年中，DNA和RNA测序技术已迅猛发展并且更加便宜，现在它们被运用到各种新的领域中。最近在《Neuron》发表的一项新研究中，研究人员使用RNA测序技术，在单个神经元水平上绘制小鼠的大脑图。这种新技术被称为Multiplexed Analysis of Projections by S
如何用电脑绘制HPLC色谱图
方法如下：精密取相应对照品，加适当的溶剂溶解，分别精密量取1、2、3、4、5ml（或相应成梯度的量），稀释成各个梯度的溶液，注入液相色谱仪，记录色谱图，以峰面积为纵坐标，以浓度C为横坐标进行线性回归。在Excel中就直接可以绘制高效液相色谱法标准曲线。有的色谱工作软件能直接绘制标准曲线。色谱法也叫层
什么是核型模式图？
中文名称核型模式图英文名称karyogram;idiogram定 义根据一个细胞中全部染色体的形态特征所描绘并排列而成的模式图。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
卫星绘制热能分布图阐明云层与气候变化关系
北京时间6月17日消息，据美国宇航局官网报道，2010年5月30日，美国地球同步轨道环境卫星绘制了西半球的热能分布图，图片阐明全球气候变化与云层变化之间的关系。 云相当于能量的媒介。通过气候系统，云层将太阳能从温暖的热带地区传送到全球其他地区。同时，云层也在地球与太空之间充当了
科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”
任何生物体的每个细胞都包含完整的遗传信息，或者说是一个生物的“蓝图”，编码所谓的DNA核苷酸构建块序列。但是植物是如何创造出各种各样的组织的呢？比如将光能转化成化学能并产生氧气的叶子，或者从土壤中吸收养分的根？答案就在各自组织细胞的蛋白质模式。科学家为模式植物拟南芥绘制“蓝图”。图片来源：Cha
关于细胞质膜的模式图介绍
１、细胞质膜的模式图— 紧密连接 紧密连接的焊接线由跨膜细胞粘附分子构成，主要的跨膜蛋白为claudin和occludin，另外还有膜的外周蛋白ZO. 紧密连接的主要作用是封闭相邻细胞间的接缝，防止溶液中的分子沿细胞间隙渗入体内，从而保证了机体内环境的相对稳定；消化道上皮，膀胱上皮，脑毛细血
二倍体棉花雷蒙德氏棉全基因组图绘制完成
记者从9月7日召开的“二倍体棉花-雷蒙德氏棉全基因组图绘制完成”新闻发布会上获悉，由该中国农业科学院棉花研究所主持，深圳华大基因研究院、北京大学、美国农部南方平原研究中心、荷兰瓦赫宁根大学等单位共同合作完成了二倍体棉花-雷蒙德氏棉的全基因组草图，研究成果以“二倍体棉花-雷蒙德氏棉的基因组草图”为
中国绘制世界首张南极土地覆盖图
在国家863项目支持下，中国科研人员成功绘制1：10万全南极洲土地覆盖图，这是世界首张南极土地覆盖图，也是中国自主掌握的首批关于南极洲的重要科学数据。 北京师范大学全球变化与地球系统科学研究院副院长程晓教授在2010中国极地科学学术年会上介绍说，相关课题组通过收集1999—2003期
先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作，通过计算药学与生物化学相结合的方法，发现G蛋白偶联受体蛋白（GPCR）全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 GPCR参与着人类体内包括细