ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)
案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materials 影响因子:39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成,通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况,发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库,建立了疾病预测分析模型,结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关(P<0.001)。与此同时,作者还构建了诊断结果预测模型,该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物(P<0.001)。......阅读全文
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包
不卑不亢看待二代测序
人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面: 1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表
九大测序平台对比(二)
2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)样品要求: 5 μg of DNA,浓度≥300 ng/μL测序原理:焦磷酸测序在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它
九大测序平台对比(二)
Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打
车用流量计故障分析案例(二)
毛病二:奥迪A6,1.8T发起机怠速不稳,行驶无力并冒黑烟。做一次根本设定,毛病扫除,但几天后又呈现重复。 检测进程:电脑显示空气流量计暂时性毛病,改换空气流量计毛病照旧,改换电脑毛病照旧,再检测全车数据块正常。但详细检测空气流量计电路,发现空气流量计进气端信号线电阻值偏大,正常值为0.5欧姆
航天器用低频电缆网设计案例(二)
二、 导线/电缆线的选择选用航天用导线的一般要求如下:① 导线抗辐射指标应满足航天器对应轨道的轨抗辐射要求。② 导线护套材料在真空环境下应具有低挥发性,防止挥发物污染航天器光学镜头。③ 不得使用聚氯乙烯绝缘的电缆线。④ 导线根数一般都不少于19股,具有良好的柔软性和成束后的可弯曲性。此外,导
重结晶的原理和经典问题案例(二)
操作时要注意以下几个问题: 1.在溶解预纯化的化学试剂时要严格遵守实验室安全操作规程,加热易燃、易爆溶剂时,应在没有明火的环境中操作,并应避免直接加热。因为在通常的情况下,溶解度曲线在接近溶剂沸点时陡峭地升高,故在结晶和重结晶时应将溶剂加热到沸点。为使结晶和重结晶地收率高,溶剂的量尽可能少,故在
ATS声波移液原理及应用案例(二)
2.高通量定量PCR: 自动化,微体系,极低的CV 定量PCR(qPCR)被广泛应用于基因表达分析,基因分型,SNP分析等应用。目前定量PCR常用的反应体系为10ul-20ul,采用ATS声波移液技术可进行1ul 甚至更小反应体系定量PCR。ATS进行cDNA, Mix buffer,引物,
LED灯具谐波抗扰度测试案例(二)
高性能可编程交流电源典型应用1、典型应用功能电压与频率调节输出相位角调节输出谐波合成输出符合IEC标准测试输出交直流混合输出List编程仿真输出Step编程仿真输出线路仿真输出2、典型应用领域家电系统集成信息与通信技术(ICT)储能与光伏逆变器汽车无线充电检测认证测试电气元件验证电子设备研发高性能可
时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例
时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例:肿瘤研究在肺癌研究中,通过时空分辨单细胞测序技术,发现了肿瘤组织中不同区域的癌细胞具有独特的基因表达模式和免疫细胞浸润情况。这有助于深入了解肿瘤的异质性,为制定更精准的治疗策略提供依据,例如针对特定区域的癌细胞选择更有效的靶向药物。神经系统疾病对于脑胶质
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例:乳腺癌研究通过时空分辨单细胞测序,研究人员发现了肿瘤细胞在不同部位的异质性,以及与肿瘤微环境中免疫细胞和基质细胞的动态相互作用。这有助于理解肿瘤的进展和转移机制,并为治疗策略的制定提供依据。黑色素瘤研究该技术揭示了黑色素瘤细胞在原发灶和转移灶中的基因表达
生物实验室实战经验分享(二)
注:不能用Gu-HCl代替。 13. 我也推荐几个偷懒的方法 1. 做SDS-PAGE跑胶通常都是现配现用,但配胶要>1h,所以如果想第二天睡个懒觉而又不耽误跑胶可以于前一天晚上做好浓缩胶和分离胶,待凝聚后不要拔下梳子,把含胶玻璃板从制胶槽取下,用保鲜膜包上,注意玻璃板上下两
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de
一代测序和二代测序的区别
一、含义不同:第一代测序:指双脱氧末端终止法,扩增后通过毛细管电泳读取序列,每次获取数据量少。第二代测序:为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二、作用不同:San
兰光TQDG1透气度仪检测婴幼儿纸尿裤案例分享
Labthink兰光TQD-G1透气度仪,适用于汽车内饰物材料,例如: 聚氨酯发泡、PVC、皮革、纺织品、非织造布等材料的空气透过率与空气阻力的测试。通过测量,达到控制材料物理特性的要求,以满足产品实际应用的需要。另外还可以用于分离膜、海绵、地毯、无纺布、纸张、皮革的透气度测试。该设备具备两种测试方
分享一些基于植物指示生物的定量监测模型构建的实际案例
基于植物指示生物的定量监测模型构建的实际案例:案例一:利用紫花苜蓿监测土壤中的重金属研究人员选取了紫花苜蓿作为指示植物,在多个已知重金属污染程度不同的土壤区域进行种植。他们测量了紫花苜蓿的生物量、叶片中的重金属含量以及一些生理生化指标,如叶绿素含量、抗氧化酶活性等。通过多元线性回归分析,建立了以紫花
专家分享有机固废处理成果案例-助力污染防治攻坚战
近日,2019年全国有机固废处理与资源化利用研讨会在安徽合肥召开。 中国环境科学学会秘书长助理姜艳萍在开幕致辞中表示,有机固废的资源化和无害化是今后几年污染防治攻坚战的重点和难点,希望与会专家和产业界代表分享前沿技术,提升我国有机固废处理和利用能力,加速科研成果转化,助力打好污染防治攻坚战。
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别介绍如下:一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低,使得de novo测序、转录组测序等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别介绍如下:一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低,使得de novo测序、转录组测序等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面
肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA
肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领
肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA
肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领
临床质谱检测:诊断领域中的-另一个“基因测序”
今天小编与您从临床治疗领域中分享质谱更多的应用。3年前,70多岁的老人李华(化名)进行了食道癌手术切除肿瘤,并一直进行肿瘤复发监测。去年4月,虽然CEA、AFP等肿瘤标志物检测结果正常,影像复查却在他肺部发现两处阴影。疑似是肿瘤复发,是否需要再次治疗呢?恰巧,飞行时间临床质谱系统基因检测不仅给出了答
临床质谱检测:诊断领域中的-另一个“基因测序”
今天小编与您从临床治疗领域中分享质谱更多的应用。3年前,70多岁的老人李华(化名)进行了食道癌手术切除肿瘤,并一直进行肿瘤复发监测。去年4月,虽然CEA、AFP等肿瘤标志物检测结果正常,影像复查却在他肺部发现两处阴影。疑似是肿瘤复发,是否需要再次治疗呢?恰巧,飞行时间临床质谱系统基因检测不仅给出了答
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
云序生物独家首发m5C-RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项,可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势:特别是从2015年的5项到2017年的25项,项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇,可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段,多篇文章荣登CNS级别期刊
甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)
甲基化是目前的研究热点,就我所做的一点工作并其中一点心得,与大家分享。希望能够对大家有所帮助。 第一部分 基因组DNA的提取。 这一步没有悬念,完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒,如果实验室条件成熟,自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因组DNA应
二羟丙茶碱的类别和制剂类型
类别平滑肌松弛药。贮藏密封,在干燥处保存。制剂(1)二羟丙茶碱片(2)二羟丙茶碱注射液
使用二羟丙茶碱的注意事项
1、本品可通过胎盘屏障,也可随乳汁排出,孕妇和哺乳期妇女慎用。 2、心脏、肝、肾功能不全、甲状腺功能亢进、活动性消化道溃疡、糖尿病、前列腺增生而导致排尿困难者慎用。 3、对本品过敏者禁用,过敏体质者慎用。 4、本品性状发生改变时禁止使用。 5、请将本品放在儿童不能接触的地方。 6、儿童
二羟丙茶碱注射液的成分
化学名称:1,3-二甲基-7-(2,3-二羟丙基)-3,7-二氢-1H-嘌呤-2,6-二酮。 分子式:C10H14N4O4 分子量:254.25 辅料名称:注射用水。
二羟丙茶碱片的基本性状
本品为白色片。