ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（二）
案例解析案例1：ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊：Nature Materials 影响因子：39本篇文章由美国加州大学圣地亚哥分校教授张康与广州中山大学附属肿瘤医院院长徐瑞华团队一同合作完成，通过对比肝癌患者血浆、组织及健康人白细胞中ctDNA甲基化分布情况，发现肝癌患者体内血浆和组织一致性很高。通过1,098位肝癌患者和835位健康者的ctDNA甲基化情况及病理信息为资源库，建立了疾病预测分析模型，结果显示该模型基因的特异性、敏感性与肿瘤状态、诊断反应和时期显著相关（P＜0.001）。与此同时，作者还构建了诊断结果预测模型，该模型的基因可用于预测疾病诊断和生存时期的分子标志物（P＜0.001）。......阅读全文
靶向捕获让ctDNA无处遁形
循环肿瘤DNA（ctDNA）是一类具备广泛应用前景的肿瘤标志物，可用于肿瘤发展及预后状态的无创测定。现有的ctDNA检测方法要根据每位癌症患者的情况来制定繁琐的检测步骤，且敏感度低，难以适用于广泛的临床应用。近期在Nature Medicine上发表的一篇文章中1，研究人员介绍了一种全新的ctDNA
应用案例分享－|－安捷伦－8700－LDIR－红外成像快速检测婴儿配方奶粉微塑料
微塑料是指粒径低于 5mm 的塑料颗粒。科研人员已经在海鲜、饮用水、水果、蔬菜、日常调味品、以及饮料和婴儿配方奶粉中都检测到微塑料的身影。在 2022 年发表的一项研究中表明每克婴儿配方奶粉中检出约 17.3 个微塑料，其中聚氨酯和聚酰胺占检出微塑料总数的 67%。日前，安捷伦公司利用 8700 L
VACV2型包装透氧仪器检测改性淀粉膜案例分享
Labthink兰光VAC-V2型包装透氧仪器，执行GB/T 1038-2000（塑料薄膜和薄片气体透过性试验方法 压差法）、ASTM D1434（测定塑料薄膜和薄片透气性能的测试方法）、ISO 2556、ISO 15105-2、YBB 00082003等标准，适用于塑料薄膜、复合膜、高阻隔材料、片
VACV2型包装透氧仪器检测改性淀粉膜案例分享
VAC-V2型包装透氧仪器，执行GB/T 1038-2000（塑料薄膜和薄片气体透过性试验方法 压差法）、ASTM D1434（测定塑料薄膜和薄片透气性能的测试方法）、ISO 2556、ISO 15105-2、YBB 00082003等标准，适用于塑料薄膜、复合膜、高阻隔材料、片材、金属箔片、橡胶、
分享一些具体的苔藓植物监测大气污染的案例
以下是一些苔藓植物监测大气污染的案例：案例一：城市大气污染监测地点：某工业城市。监测过程：研究人员在城市的不同区域，包括工业区、商业区、居民区和公园等地设置了多个监测点。每个监测点放置了不同种类的苔藓样本，如大灰藓、白发藓等。定期采集苔藓样本，分析苔藓体内的重金属含量（如铅、镉、汞等）、硫含量以及氮
二羟丙茶碱的含量测定方法
取本品约0.2g,精密称定,加无水甲酸2ml使溶解,缓缓加醋酐50ml,振摇3分钟,加苏丹Ⅳ指示液4~5滴,用高氯酸滴定液(0.1mol/L)滴定至溶液显紫色,并将滴定的结果用空白试验校正。每1ml高氯酸滴定液(0.1mol/L)相当于25.42mg的CoH14N4O4
关于二羟丙茶碱的检查介绍
1、二羟丙茶碱的酸碱度 取本品0.50g，加水10mL使溶解，加溴麝香草酚蓝指示液5滴，应显黄色或绿色，再加氢氧化钠滴定液（0.02mol/L）0.20mL，应显蓝色。 2、二羟丙茶碱的溶液的澄清度与颜色 取本品1.0g，加水10mL，振摇使溶解，溶液应澄清无色，如显色，与黄色或黄绿色1号
二羟丙茶碱相关物质的检查
酸碱度 取本品0.50g，加水10ml使溶解，加溴麝香草酚蓝指示液5滴，应显黄色或绿色；再加氢氧化钠滴定液（0.02mol/L）0.20ml，应显蓝色。溶液的澄清度与颜色 取本品1.0g，加水10ml，振摇使溶解，溶液应澄清无色；如显色，与黄色或黄绿色1号标准比色液比较，不得更深。氯化物 取本品
关于二羟丙茶碱的基本介绍
二羟丙茶碱（dyphylline）化学名为 1,3-二甲基-7-（2，3-二羟丙基）-3,7-二氢-1H-嘌呤-2,6-二酮，白色粉末或颗粒；无臭，味苦。在水中易溶，在乙醇中微溶，在三氯甲烷或乙醚中极微溶解 ，熔点为160～164℃。常温常压稳定，存放在密闭容器中。储存在阴凉，干燥，通风良好的区
关于二羟丙茶碱的基本介绍
二羟丙茶碱，是一种有机化合物，化学式为C10H14N4O4，为白色结晶性粉末，易溶于水，主要用作平滑肌松弛药，有扩张支气管和冠状动脉的作用，并有利尿作用，在胃液中稳定，平喘作用与氨茶碱相似，尤适用于伴有心动过速。 1、二羟丙茶碱的基本信息： 化学式：C10H14N4O4 分子量：254.2
二羟丙茶碱的用途是什么？
二羟丙茶碱（Diprophylline）是一种茶碱类药物，主要用于治疗哮喘、慢性阻塞性肺病（COPD）等呼吸系统疾病。它的作用机制与茶碱相似，主要通过抑制磷酸二酯酶，增加细胞内环磷酸腺苷（cAMP）的水平，从而使支气管平滑肌松弛，扩张支气管，改善气道通畅。 二羟丙茶碱还具有抗炎、抗氧化和免疫调
二羟丙茶碱的基本性状
本品为白色粉末或颗粒;无臭本品在水中易溶,在乙醇中微溶,在三氯甲烷或乙醚中极微溶解。熔点本品的熔点(通则0612)为160~164℃吸收系数取本品,精密称定,加水溶解并定量稀释制成每lml中约含10g的溶液,照紫外可见分光光度法(通则0401),在273nm的波长处测定吸光度,吸收系数(E)为354
二羟丙茶碱的鉴别方法
(1)取本品约0.g,加盐酸1ml与氯酸钾0.1g置水浴上蒸干,残渣遇氨气即显紫色,再加氢氧化钠试液数滴,紫色即消失(2)本品的红外光吸收图谱应与对照的图谱(光谱集12图)一致
二羟丙茶碱的含量测定方法
取本品约0.2g,精密称定,加无水甲酸2ml使溶解,缓缓加醋酐50ml,振摇3分钟,加苏丹Ⅳ指示液4~5滴,用高氯酸滴定液(0.1mol/L)滴定至溶液显紫色,并将滴定的结果用空白试验校正。每1ml高氯酸滴定液(0.1mol/L)相当于25.42mg的CoH14N4O4
循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA，存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中，其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成，以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸；30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
－循环肿瘤DNA“液体活检”或将颠覆癌症治疗
循环DNA是一种无细胞状态的胞外DNA，存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中，其主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成，以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。早在1947年Mandel和Metais就发现了循环核酸；30年后Leon等人的研究表明肿瘤患者外周血清DNA水平
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
Nature子刊：突破性测序技术绘制甲基化图谱
通过一种新的DNA测序技术，研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式，他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。 布莱根妇女医院(Brigham and Women"s Hospital)、霍华德休斯医学研究所研究员Matthew K
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验材料 DNA试剂、试剂盒 NaOH苯二酚（氢醌）亚硫酸氢钠石蜡油仪器、耗材 离心管恒温水浴锅铝箔纸实验步骤 1.将约2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀释至50ul； 2.加5.5ul新鲜配制的3M NaOH； 3. 42℃水浴30min； 水浴期间配制： 4.10mM对苯二酚（氢醌）
甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性
近日，一篇刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自澳大利亚悉尼加文医学研究所（Garvan Institute of Medical Research）的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱，其可以帮助
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以免受甲基化因素的影响）所需片段，则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序，并且与未经处理的序列比较，判断是否CpG位点的甲基化状态。实验材料DNA
亚硫酸氢盐修饰后测序法甲基化检测
第一部分 基因组DNA的提取这一步没有悬念，完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒，如果实验室条件成熟，自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度，即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白
亚硫酸氢盐测序法检测甲基化的介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序，可以提高测序成功率，
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化
DNA甲基化 实验方法原理 重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以
亚硫酸氢盐测序法检测DNA的甲基化
亚硫酸氢盐测序法（Bisulfite sequencing PCR，BSP）用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BS
关于甲基化的亚硫酸氢盐测序法介绍
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA，则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR，在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶，最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化称为BSP-直接测序方法。将PCR产物克隆至载体后进行测序，可以提高测序成功率，
二代测序的焦磷酸测序，合成法测序，连接法测序和离子半导体测序原理
不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上，这些差别可以分为4类： 焦磷酸测序，合成法测序，连接法测序和离子半导体测序。焦磷酸测序 在焦磷酸测序中，测序反应通过每个核苷酸结合过程中释放的焦磷酸来调控。释放的焦磷酸参与了一系列化学反应从而导致链光的产生。发出的光由记录基因蔟相应序列的相
液体活检在CTCs检测的应用
2015年，液体活检被《麻省理工大学科技评论》评选为年度十大突破技术，据Piper Jaffray预测，2026年广义液体活检全球市场总容量约326亿美元，包括癌症领域286亿美元、无创产前诊断（NIPT）20亿美元、器官移植20亿美元。在众多应用场景中，液体活检在癌症领域的应用占据超过85%的
基因检测行业调研（包含企业梳理、行业监管）
一、基因检测公司梳理 目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家，按照业务范围划分，这些公司可以分为：①最上游的基因检测仪器开发企业（测序仪、芯片扫描仪、PCR设备），②提供样本处理试剂和耗材的中上游企业（建库试剂盒、检测试剂盒、工具酶、基因芯片），③提供第三方基因检测服务的中游企业
二代测序及其应用
二代测序为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。二代测序应用如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454：油包