高通量表型分析平台可视化评估大麦病害程度
背景表型是新植物栽培品种发展的瓶颈，该研究引入了一种新的高光谱表型分析系统，此系统将冠层测量的高通量与高空间分辨率和可控测量环境的优势相结合。此外，测量的大麦生长在大容器（称为Mini-Plots）中，这使得植物能够在温室实验中形成田间表型，从而不受容器尺寸的影响。结果在接种白粉病后30天，通过Specim V10E高光谱成像研究了6个大麦品种。凭借高空间分辨率和稳定的测量条件，可以通过Simplex Volume Maximization和Support Vector Machines机械组合自动量化白粉病症状。在手动评级期间，一旦肉眼可见第一症状，就可以立即进行检测。实现了在实验过程中每个测量日对所有栽培品种的疾病严重程度的准确评估。此外，还检测到一个基于坏死症的抗白粉病品种。结论高光谱表型分析系统是结合了基于现场的冠层水平测量系统（高通量、自动化、低手动工作量）和基于实验室的叶片水平两者优势的测量系统（高......阅读全文
高通量元素定量方法揭示健康人群元素表型
元素是生命体的基本组成成分，具有重要的生物学功能。元素组学通常关注元素组及其对外源性或内源性刺激的动态响应，以此来探究元素的功能。基于大型人群队列的多元素研究可以有效地揭示元素稳态失衡和人体病理状态间的密切关系，但生物样品数量大、可用体积小的特点对多元素定量方法提出了更高的要求。复旦大学人类表型组研
软硬件集成平台RhizoVision－Crown在根冠表型分析的应用
2020年2月，Plant Phenomics刊发了美国诺贝尔研究所（Noble Research Institute）Larry M. York课题组题为RhizoVision Crown: An Integrated Hardware and Software Platform for
FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——植物病害表型研究
1. 植物病害早期快速无损检测由于次生代谢产物如多酚等与植物的病害胁迫应答机制紧密相关。因此最初，FluorCam多光谱荧光成像技术主要用于植物病害早期快速无损检测，希望能在病害产生严重影响前就能发现感染（图4）。 图1. UV-MCF多光谱荧光成像早期研究，左：烟草
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空
种质资源研究技术方案
《史记》有云：“王者以民人为天，而民人以食为天。”粮食问题在中国历朝历代都占据着极其重要的位置。新中国成立后，解决粮食问题、保证14亿中国人民的粮食安全更是政府工作的重中之重。中共中央、国务院2004年至2020年已连续十七年发布以“三农”（农业、农村、农民）为主题的中央一号文件，强调了“三农”问题
藻类表型研究全面解决方案
藻类是蓝藻门、眼虫藻门、金藻门、甲藻门、绿藻门、褐藻门、红藻门等一系列水生生物的总称。其形态种类众多，小至微米级的单细胞微藻，大至长达几米乃至几十米的大型褐藻。藻类作为水体中最重要的初级生产者，对整个生态系统乃至地球圈的稳定都起着极为重要的作用。莱茵衣藻、蓝藻等模式藻类为功能基因、生物进化、光合作用
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
高通量小型植物光合表型测量系统的技术原理
叶绿素a荧光作为光合作用研究的探针，是研究各种逆境胁迫（干旱、高温、低温、营养缺失、污染、病害等）对植物影响的强大工具，亦被广泛用于筛选同一植物品种的不同基因型。叶绿素a荧光不仅能反映光能吸收、激发能传递和光化学反应等光合作用的原初反应过程，而且与电子传递、质子梯度的建立及ATP合成和CO2固定
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（一）
Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo
llumina高通量测序平台的应用（一）
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
llumina高通量测序平台的应用（二）
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理，加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”，因为3’羟基末端带有可化学切割的部分，每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后，用激光扫描
首个海洋信息三维可视化平台建成
“数字海洋”信息基础框架通过验收 在“数字海洋”模拟屏前，触摸海洋的任意一点，那里的水温、盐度、流速等信息即可显示。这就是我国第一个集成海洋信息的三维可视化球体平台。 该平台是国家海洋局908专项(近海海洋综合调查与评价专项)“数字海洋”信息基础框架构建项目的成果之一。 记者从12
植物表型组学研究平台建设及技术应用
在生物学和遗传育种领域,表型是指构成生物体的全部特征，包括外观、基本维度、形态和颜色,是基因型和环境因素互相作用的结果。表型采集分析是指以定性和定量的方式测量这些特征。表型组(phenome)则是指某一生物的全部性状特征，不仅局限于农艺性状，还包括植株所表现出来的生理状态及生化组分。随着许多重要作物
高通量小型植物光合表型测量系统的技术参数
成像面积：24 cm x 24 cm 光照面积：30 cm x 30 cm 相机传感器类型：CCD 相机分辨率：600万像素，即2440 x 2440像素 光谱范围：350-950 nm 镜头类型：高质量百万像素镜头 光纤滤光片轮：6种高质量光学干涉滤光片，步进电机驱动 直角坐标机
简介高通量小型植物光合表型测量系统的功能特性
利用直角坐标机器人实现X-Y-Z轴自动移动 测量范围4.5m x 2m或6m x 3m 带两套潮汐式灌溉水培系统 能够进行叶绿素荧光成像、叶绿素指数成像、花青素指数成像和可见光成像 配备控制电脑和分析电脑 配备控制软件和分析软件 配备NAS（网络附属存储）系统
植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例
植物源蛋白水解物（PHs）是一类重要的生长刺激素，影响植物表型组及代谢组特征，进而促进植物生长和作物产量，尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下，这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等，利用PlantScreen高通量表型分析平台，就一种PH对
自动细胞成像系统进行细胞表型的多参数评估
简介自动细胞成像是一种分析化合物对包括细胞形态，活力和标志物表达在内的细胞表型的影响的有效方法。这里，我们将展示ImageXpress® Pico自动细胞成像系统和CellReporterXpress 自动成像分析软件如何应用于化合物影响的表型分析。成像和分析方法可提供工具来鉴定细胞活力，细
我国首个海洋信息三维可视化平台建成
本报北京12月14日讯（记者陆琦）在“数字海洋”模拟屏前，触摸海洋的任意一点，那里的水温、盐度、流速等信息即可显示。这就是我国第一个集成海洋信息的三维可视化球体平台。 该平台是国家海洋局908专项（近海海洋综合调查与评价专项）“数字海洋”信息基础框架构建项目的成果之一。 记者从今天召开
单细胞多组学高通量测序平台（一）
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息，如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程，而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息（如DNA层面的基因序列），从而解读生物体运行机制，应用于疾病的诊断和治
单细胞多组学高通量测序平台（二）
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出，但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞，早期的技术代表F
绿豆虫害快速检测与抗性品种筛选
在高通量、规模化的植物/作物表型平台中，各种无损的表型成像分析技术是必不可少的。叶绿素荧光、多光谱荧光、红外热成像、高光谱成像等成像分析技术已经是目前最先进也最重要的无损植物表型检测与分析技术，尤其适用于植物各种生物与非生物胁迫的检测、预报与响应机理研究。同时，这些技术也可以直接用于种子本身的病虫害
利用台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析
近日，中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展，研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。 近年来，单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究，然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以
台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析
近日，中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展，研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。 近年来，单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究，然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以
高通量小型植物光合表型测量系统的应用领域介绍
拟南芥和其它小型植株的光合作用和表型研究 光合作用机理研究，全叶片和整株植物的光合作用测量 环境胁迫对植物的影响 基因型筛选、突变株筛选 植物功能基因组学研究 胁迫损伤的早期检测 植物病理学、毒理学、环境科学研究
植物表型研究文章TOP10（四）
TOP 2● 田间表型：作物育种新方向（Trends Plant Sci,2014）田间表型分析受限因素太多，因此限制了大家研究数量性状遗传学的能力，特别是哪些与产量和胁迫耐受性相关的性状。发展有效的基于田间高通量表型分析平台（HTPPs）仍然是未来育种进展的瓶颈。然而，传感器、高性能计算技术的发展
移动式激光雷达LiDAR植物表型成像平台
植物表型受基因和环境因素决定和影响，反映植物结构及组成、植物生长发育过程及结果的全部物理、生理、生化特征和性状。植物表型分析的精确实现有助于农作物基因型与育种工作。植物表型分析对高效且低成本的表型获取技术需求强烈。作物表型测量技术发展的滞后已成为当前育种领域的发展瓶颈,高通量的精确表型测量有助于加速
生物物理所开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空
免疫表型的分析程序
细胞表面抗原检测的染色方案 细胞胞质内及细胞核内抗原检测的染色方案 实验材料 单克隆抗体 抗凝血