SMAD2／3与TGFβ通路协同影响转录因子发生m6ARNA甲基化调...
SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读：胚胎干细胞作为一种全能性细胞，通过增殖和分化，产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明，胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化，大多与细胞增殖[1-2]，免疫应答[4]关系密切。然而，对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天，分享一篇英国剑桥大学研究团队于2018年8月发表在Nature（影响因子：40.14）文章，聊一聊RNA甲基化在调控胚胎干细胞分化过程中的作用机制。这篇文章的开头很直接，首先通过阅读文献确定了感兴趣的基因SMAD2/3，对其进行Co-IP和质谱后，结果显示其能够与甲基化转移酶METTL3，METTL14和WTAP直接互作。他们是明星，和他们结合的分子也是明星分子，这不，在胚胎干细胞当中有研究者就发现SMAD2/3就和METTL3，METTL14结合，不出所料，这一结......阅读全文
何川、贾桂芳Nature子刊发布表观遗传学新成果
来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中，揭示出了拟南芥m6A甲基化组（methylome）的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 芝加哥大学的何川（Chuan He）教授、Joy Bergelson教授以及北京大学
2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总
感恩有你，一路同行！2019年末，云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候！光阴如梭，一年转瞬又将成为历史，新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战，决心再接再厉，更上一层楼。回首即将过去的2019，云序生物不断创新，硕果累累；展望2020，任重道远却信心倍
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3
总结： 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式，越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用，而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP（云序生物提供此服务）等多种技术联合分析，揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
m6A修饰的YTHDF1与介导EIF3C对卵巢癌进展的影响（二）
为了全面探索YTHDF1及其靶基因之间的直接相互作用，作者对过表YTHDF1的A2780细胞，进行了eCLIP-seq，并鉴定了2,343个目标转录物，这些转录物大多数是mRNA。将eCLIP seq的结果2,343个基因和上面三组数据交集确定的647个基因取交集，产生175个基因，将其确定
Nucleic－Acids－Research：脂肪生成的表观调控机制
肥胖和2型糖尿病的全球发病率在过去的30年中显著增加，已严重危害人们的生命健康。脂肪组织被认为与该类疾病相关，因此操纵脂肪细胞的分化和成熟有望用于临床治疗。大量研究已阐明转录和表观遗传（DNA和组蛋白修饰）在脂肪发生过程中的重要作用，但是对于转录后调控如何影响脂肪生成，尚不清楚。 近日，华中农业大
Nucleic－Acids－Research：脂肪生成的表观调控机制
肥胖和2型糖尿病的全球发病率在过去的30年中显著增加，已严重危害人们的生命健康。脂肪组织被认为与该类疾病相关，因此操纵脂肪细胞的分化和成熟有望用于临床治疗。大量研究已阐明转录和表观遗传（DNA和组蛋白修饰）在脂肪发生过程中的重要作用，但是对于转录后调控如何影响脂肪生成，尚不清楚。 近日，华
与－TGFβ信号通路相关因子介绍CDKN2B
该基因与肿瘤抑制基因CDKN2A相邻，位于一个在多种肿瘤中经常突变和缺失的区域。该基因编码一种与CDK4或CDK6形成复合物的细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂，并阻止CDK激酶的激活，因此编码蛋白作为控制细胞周期G1进展的细胞生长调节剂发挥作用。该基因的表达被发现是由TGF-β显著诱导的，提示其在TGF-
与－TGFβ信号通路相关因子介绍ACR1B
这个基因编码激活素A型IB受体。激活素是二聚体生长和分化因子，属于结构相关信号蛋白转化生长因子β（tgfβ）超家族。激活素通过受体丝氨酸激酶的异聚复合物发出信号，该异聚复合物至少包括两个I型和两个II型受体。这种蛋白质是一种I型受体，对信号传导至关重要。这个基因的突变与垂体瘤有关。交替剪接导致多个转
陈建军/杨建华/何川/黄刚－揭示RNA－m6A由组蛋白修饰决定
近年来，RNA表观遗传学的研究发现RNA甲基化修饰，特别是m6A甲基化修饰，在哺乳动物的转录组中广泛存在，并且在多种生理和病理过程中发挥着重要的生物学功能，引领了RNA以及表观遗传学领域的又一个热潮。高通量测序揭示在人和小鼠的转录组中有1/3-1/2的mRNA转录本具有m6A修饰【1，2】。理论
RNA甲基化研究深度剖析（一）
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。 图：RNA甲基化近期高
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用
最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMe
基因组所肥胖调控机制合作研究获重要进展
肥胖相关基因FTO主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤 近日，中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员杨运桂与美国芝加哥大学何川教授合作，发现了肥胖相关基因FTO(Fat mass and obesity-associated protein）主要作用底物是RNA中的6甲基
m5C－RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文
文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热，关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表，至今已觉不新鲜；5-甲基胞嘧啶RNA甲基化（m5C）是一类新的修饰方式，参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面，目前m5C研究正处 方兴未艾之际，大量的科学研究工作也亟待开展，非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这
云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用1
m6A甲基化是近年来一大热门研究方向，种种研究表明m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在，并对多种生物学功能、疾病肿瘤的发生发展具有极大影响。m6A甲基化位点的检测依赖于MeRIP-seq，其中的抗体免疫共沉淀（IP）环节要求样品RNA起始量相较普通转录组测序要高，曾经令许多难以大量获取的
Hepatology：m6A－RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展，近期Hepat
Hepatology：m6A－RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
导读 近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展，近
m6A－RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机
导读近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展，近期Hepat
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nature，Cell
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nat
一文了解RNA甲基化机制
1. 什么是RNA甲基化修饰？ 我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶（C）上的，而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）和尿苷化修饰（uridylation，U-tail）。 m6A修饰在70年代就发现了，是可以发生在mRNA、lncR
RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication（IF=11.878）的文章，作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量，对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用，而BAT的出生后发育，正是它们获得这些功能的关
与－干细胞标和分化信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad，一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’（mad）和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子（tgf）-β的信号，从而调节多种细胞过程，如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
与干细胞标和分化信号通路相关因子介绍SMAD2
由该基因编码的蛋白质属于smad，一个类似于果蝇基因‘母亲抗十五瘫’（mad）和秀丽隐杆线虫基因sma的基因产物的蛋白质家族。smad蛋白是介导多种信号通路的信号转导和转录调节因子。这种蛋白介导转化生长因子（tgf）-β的信号，从而调节多种细胞过程，如细胞增殖、凋亡和分化。该蛋白通过与受体激活的SM
揭示多梳蛋白PCGF5调控胚胎干细胞向神经前体细胞分化的.
5月15日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员姚红杰课题组在《自然-通讯》（Nature Communications）中在线发表了题为PCGF5 is required for neural differentiation of embryonic stem cells 的研究成果。该研
多梳蛋白PCGF5调控胚胎干细胞向神经前体细胞分化
5月15日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员姚红杰课题组在《自然-通讯》（Nature Communications）中在线发表了题为PCGF5 is required for neural differentiation of embryonic stem cells 的研究成果。该
北京基因组所等揭示肥胖相关基因FTO调控能量代谢新机制
肥胖相关基因（FTO）是第一个被发现在肥胖中发挥重要作用的基因，在调节体重和脂肪含量方面具有重要作用，但具体的分子机制以及是否能够利用小分子化合物抑制FTO活性来治疗肥胖相关的代谢类疾病一直以来并不清楚。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队与北京生命科学研究所黄牛和张二荃团队合作发现，恩他卡