lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能，这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能轻松的变废为宝，竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章，你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作为最新的国自然热点受到了越来越多的关注，更多的研究开始着重RNA甲基化方向的讨论与研究，仅仅在刚刚过去的两个月当中，10+的RNA甲基化文章就多达16篇。2018年国自然立项情况来看RNA甲基化中标数目是2017年的4倍之多，其中不少项目开始从mRNA转为关注非编码RNA的甲基化对于疾病发生发展过程重要作用的研究，例如m6A甲基化lncRNAs在套细胞淋巴瘤中的作用与机制研究（北京大学），RNA去甲基化酶FTO介导的lncRNA-m6A修饰对肝癌细胞重编程的调控作用及机制研究（同济大学）等等。云序生物以同济大学康九红团队于2018年2月发表在Nucleic......阅读全文
eLife：lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现，一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上，为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了，关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后，今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量数据，发表5分影响因子的文章，还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础，让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上发表。研究背
lncRNA的概念及形成过程
lncRNA，即Long non-coding RNA，你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如，它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外，仅从核苷酸水平上来看，可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
长链非编码－RNA（lncRNA）研究策略
长链非编码 RNA（long noncoding RNA，lncRNA）指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子，它们不编码蛋白，位于细胞核或胞质内，具有保守的二级结构。研究显示，lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能，它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
m5C－RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文
文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热，关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表，至今已觉不新鲜；5-甲基胞嘧啶RNA甲基化（m5C）是一类新的修饰方式，参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面，目前m5C研究正处 方兴未艾之际，大量的科学研究工作也亟待开展，非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这
甲基化的甲基化的功能
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰，调节基因的表达和关闭，与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关，是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、D
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制！
文章导读： 外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一：非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制
外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功能机制是如何研究的。
上海交大LncRNA研究刊登国际期刊
长非编码RNA（lncRNA）不编码蛋白质，最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近，有研究表明，lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用，并能影响基因的表达。然而，是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用，尚不明确。延伸阅读：中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表文章最多的RNA甲基化测
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期，该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况，筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1，并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内，每年因肝癌死亡的病例超过50万人，是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中，随着影像学的进步以及健康体检的普及，越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺，外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
Nature重要发现：调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》（Nature）
国际知名学者综述：LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家，长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究，其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA，在概念层次上重新定义了“基因”，这一发现被Science选为最
Cell重要发现：调控免疫的lncRNA
由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实，一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》（Cell）杂志上。 细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这
m6A－RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究（二）
接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序，对三个样本分别进行motif分析后，发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks（图5 c）。将peak分别于转录本和基因组比对后，发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d，e)。对两次CLIP实验的peaks
孙树汉：长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究
10月31日，2014（第二届）非编码RNA学术研讨会继续在上海好望角大饭店（中科院上海学术活动中心）如火如荼地进行。 来自第二军医大学遗传学教研室的孙树汉教授介绍了长链非编码RNA在肝癌转移过程中的功能研究。在研究非编码RNA肝炎病毒致癌过程的作用中，该课题组发现在HCV中，miR-155表
中科院Nature子刊发重要成果：帮助癌症干细胞的lncRNA
癌症干细胞（CSC）能够通过自我更新和分化，启动并维持癌症的发生和发展。人们已经在越来越多的肿瘤中分离和鉴定到了癌症干细胞，比如结肠癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。 肝癌是一种预后很差的常见恶性肿瘤。我国是肝癌高发国家，每年约有11万人死于这种疾病。肝细胞癌（HCC）是原发性肝癌的主要类型，也是恶性
dna甲基化与rna甲基化的区别
DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点：都有包含甲基化修饰；不同点：修饰对象不同，一个是对DNA修饰，一个是对蛋白：组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解，与前两者差异较大。
首次以通讯单位在Nature－Metabolism发文－揭示lncRNA的调控机制
lncRNA属于一类没有编码蛋白能力的RNA，在过去几年中受到了相当多的关注，并已成为生物调节的重要参与者。许多lncRNA越来越多地涉及控制重要基因的功能和调节细胞的命运。此外，lncRNA正在成为细胞增殖和细胞凋亡的关键调节因子，这与癌症的发生有关。 越来越多地使用高通量研究表明，lncR
暨南大学报道－造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱
来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院（现为解放军总医院第五医学中心）刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
文章导读 2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3
总结： 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式，越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用，而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP（云序生物提供此服务）等多种技术联合分析，揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC
新机制：lncRNA可调控小麦开花
冬小麦开花需要长时间低温环境的诱导，该过程称之为春化作用。这一过程受到外部环境因子和植物内在发育状态的双重复杂精准的调控。冬小麦不同品种的春化特性与其产量直接相关。在六倍体小麦中，TaVRN1是受低温诱导、可加速开花转换的关键调控因子。然而，目前对于在春化过程中TaVRN1逐步激活的分子机制尚不
华裔学者Cell发表lncRNA研究的利器
长非编码RNA（lncRNA）是长达两百个核苷酸以上的转录本，绝大多数位于细胞核内。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质，但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，这说明lncRNA具有重要的生物学意义。在测序技术的帮助下，人们已经发现了数千种lncRNA，但这些lncRNA的生物学功能依然
lncRNA逆转录的引物如何设计
目前发现的大多数lncRNA都带有poly(A)，可以通过Oligo(dT)、随机引物进行反转录扩增合成cDNA
lncRNA在农业领域的研究成果
miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错！不是标题党。说到miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar，想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题