使用SoftMaxPro7软件选择最佳的曲线拟合方式(一)
引言当需要定义一个数据的特征时,如变化的比例、曲线上下边的渐近线或者 EC50/IC50值时,选择正确的曲线拟合方式是十分关键的。选择的曲线拟合方式应该是能够最准确的反映两个已知变量 (x,y) 的关系。因此,曲线拟合的目的就是为了寻找最佳的公式和参数来匹配数据。SoftMax Pro 7软件能够提供 21 种曲线拟合方式,包括四参数 (4P) 和五参数 (5P) 非线性回归分析。多种的拟合方式选择,是为了确保能够找到适合数据的最佳拟合方式,并且能够通过调整所选拟合方式的参数来得到最能反映浓度响应变化关系的曲线图。本文将介绍在 SoftMaxPro7 软件中能够运用的线性和非线性回归分析方法。另外,本文还给出了如何利用标准方差和阿凯克信息论准则来评估选择的拟合方式是否最合适。优势- 利用一种高效免洗实验方法来测定细胞活性- 准确定量活细胞或死细胞- 通过预设分析模块快速获得相关统计学结果线性回归线性回归拟合是最常见的数据......阅读全文
使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(一)
引言当需要定义一个数据的特征时,如变化的比例、曲线上下边的渐近线或者 EC50/IC50值时,选择正确的曲线拟合方式是十分关键的。选择的曲线拟合方式应该是能够最准确的反映两个已知变量 (x,y) 的关系。因此,曲线拟合的目的就是为了寻找最佳的公式和参数来匹配数据。SoftMax Pro 7软
使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(二)
SSE 方法使用下面的公式进行分析:SSE= Σ wi (yi - yi)2。假设数据误差是不相关的且符合正态分布,使 SSE 尽可能的最小能够最大近似的估算数据模型的曲线公式参数。换句话说,最佳的曲线拟合方式是其参数能够得到最小的 SSE。如果两种拟合方式都能符合数据,那么哪个残差图给出了最小的
如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(一)
前言选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的绝对误差的差异,如四参数
如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子
前言 选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的
如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(二)
结论利用 SSE 和 AIC 方法开发了检测模板,在SoftMax Pro7 软件中选择的曲线拟合模型测试最常见的加权因子。这些统计测试有助于比较适用于不同加权因子的拟合度优化,可以自信选择最适当的加权方式。然而,必须确保有足够的数据点支撑来解释其变化。参考文献1. Gottschalk, P.,
SoftMax-Pro软件验证方案
对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。验证时间从6个月缩短至三天对于您实验最重要的莫过于结果的重复性,可靠性和完整性,但要做到这些可能需要多达6个月的时间进行充足的实验步骤的认证和记
使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(一)
使用MD SoftMax Pro 7软件进行平行线分析和相对活性评价介绍在生物实验中要经常要使用到的平行线分析(PLA)方法,当无法直接检测一个生物制品的活性而只能通过检测其产生的效果时,PLA方法通常会被用来进行效应曲线的比较来获得此制品的效果(Figure1)。如果对于两种物质其生物响应相似或者
使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(二)
噪声和权重噪声是指检测响应的随机变化,当进行平行线评价时这是需要考虑的重要因素,因为它会影响检测平行性的能力。在高噪声的情况下,平行性计算值由于由于受噪声的影响过大,因此无法再正确的反应非平行性的程度。对于 F- 检验和卡方检验法这两种方法,在计算各自的概率值的过程中对于不同噪声水平的处理能力是不同
利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩
基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应
利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩
前言基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应
使用SpectraMax微孔板读板机检测QuantiT-PicoGreen-dsDNA实验-二
- 高浓度范围标曲可以浓度从1 ng/mL制备到1 μg/mL,低浓度范围标曲可以从25 pg/mL制备到25 ng/mL。对于高浓度范围标曲,按Table 2中稀释方案稀释;对于低浓度范围标曲,40倍稀释2μg/mL溶液制备50 ng/mL溶液,参考Table 3中的稀释方案。 注意:此篇
使用酶标仪的细胞成像系统检测标签蛋白的表达
优势: 带细胞成像系统的功能模块扩展了微孔读板机的检测应用2. 方便检测每个细胞或每孔的标签蛋白的表达水平3. 按照一般微孔读板机的简单流程4. 细胞可视化数据输出,增加了数据可信性某些细胞蛋白存在或不存在,可代表着细胞对某些刺激的反应、某种分化的状态或特定细胞类型的独特特征或者基因
SoftMax-Pro-7.1-GxP企业版数据获取和分析软件说明书
SoftMax Pro 7.1 GxP企业版数据获取和分析软件 在GMP/GLP实验条件下符合FDA指导方针的完整验证工具及手段 优势: • 通过系统审计追踪功能可以轻松跟踪和记录所有的改变 • Microsoft SQL 数据库能够使软件具有企业级别文档共享能力
诱导多能干细胞毒性实验(二)
Figure 3. 化合物IC50值由曲线拟合给出采用SoftMax Pro软件的曲线拟合功能,确定四种不同的化合物的IC50值。神经元神经元的毒性体现在数量减少或神经突触的长度减少上(甚至存在于不影响细胞的数量或存活力的情况下)。通过成像实验不仅可以检测神经元细胞的主体,同时还可以检测神经元细胞的
用SpectraMax多功能微孔板读板机进行cAMP-HiRange检测(二)
Z’ 因子由阴性(无cAMP,无cAMP-d2)和阳性质控(无cAMP)计算得到2。利用SoftMax® Pro软件生成和分析数据,包含一些预设的HTRF实验模板以简化检测和分析。结果使用SoftMax Pro软件的4-参数曲线拟合如上所述进行数据分析和做图。依据表2的读板机参数设置获得最佳结果
诱导多能干细胞毒性实验(一)
优势:1. 简易、快速的通过检测细胞贴壁面积进行96或384孔板细胞毒性筛选2. 按照一般微孔读板机的简单流程3. 具有细胞影像数据,增加数据可信性药物引起的组织毒性是候选药物未能进入市场的一个重要原因,因此,安全性和有效性试验的高度预测分析是提高药物开发和降低候选药物抗药性的关键。人源诱导多
如何利用微孔读板机进行微量DNA和蛋白的高通量检测?
介绍在遗传学和分子生物学中,对核酸和蛋白进行定量是许多复杂实验必要的上游检测。虽然已有多种检测方法,但是最常用的仍然是紫外分光光度法。紫外分光光度法的原理是利用分子在固定波长范围吸收光和散射光,在朗伯比尔定律(方程式1)的基础上计算待测物质的浓度。这种方法还需要提前知道样品的摩尔消光系数和通路长度。
Molecular-Devices在细胞成像系统上检测细胞活性或毒性
EarlyTox™细胞完整性试剂盒由一系列易于识别活细胞和死细胞的优化试剂组成。可用于检测不同处理对细胞活性的影响,也可评估不同机制产生的细胞毒性,包括凋亡和坏死。该试剂盒设计工作于多种细胞类型,贴壁和悬浮均可。简单的操作流程和优异的试剂表现使其能应用到高通量扫描上。试剂盒中使用了两种结合DNA的荧
检测不同样品中三聚氰胺的含量实验
简介:SPECTRAMAX APPLICATION NOTE #13使用 Molecular Devices公司的SpectraMax光吸收型读板机及罗默实验室AgraQuant三聚氰胺检测试剂盒可快速检测不同样品中三聚氰胺的含量有机碱三聚氰胺可用于生产很多产品,如塑料、阻燃材料、颜料和肥料等。
SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(一)
引领微孔板检测系统的行业标准历经13年发展,SpectraMax® M系列多功能微孔板读板机由于其优异的检测表现、可靠的性能、深受广大科研工作者的信赖,已然成为行业标准的引领者。可以根据应用需求轻松升级满足您的检测。仪器设置和数据处理都可借助于专业的SoftMax® Pro软件完成,所有
利用-SpectraMax-iD3-微孔板读板机检测内源色氨酸荧光
介绍蛋白质的内源荧光主要来源于芳香族氨基酸如色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸。在水中,色氨酸的最大激发光波长在270-280nm左右而其发射光波长峰值接近350nm。蛋白的发射光谱对溶剂的极性和外界环境十分敏感。当蛋白质变性时,色氨酸残基会暴露在水中而其发射波长会变长。这种发射波长峰值的改变可以用来检测蛋白
SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(四)
使用NanoOrange蛋白试剂盒传统的比色方法,如280吸光,BCA,Bradford或Lowry法,当使用微孔板格式时灵敏度不佳。来自Life Technologies公司的NanoOrange® 蛋白定量试剂盒在多孔板格式的动态区间可达 10 ng/mL到10 μg/mL。此应用文章展
使用SpectraMax微孔板读板机检测QuantiT-PicoGreen-dsDNA实验--一
简介双链DNA通常使用微孔板读板机通过测量DNA溶液的260nm吸收光进行定量。然而,这种方法通常在微孔板读板机上只能检测到最低250ng/mL的浓度。对于生物学应用涉及到小体积样品,如新一代测序和扩增产物定量时,更灵敏的方法才能满足需求。Life Technologies公司的Quant-iT
微孔读板机符合-GMP/GLP-实验的合规之路
符合 GMP/GLP 实验的合规之路 SoftMax® Pro 7.1 GxP 是 Molecular Devices 最新、最安全的一款软件,符合全新的 FDA 21 CFR Part 11 的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的 是简化分析流程和报
如何使用M5-多功能微孔板读板机和IMAP®-荧光偏振...(二)
结合反应步骤1.将75%的结合缓冲液A与25%的结合缓冲液B混合,制备结合缓冲液;步骤2.将结合试剂以1:600倍稀释成结合缓冲液,得到结合反应液;步骤3.移出60ul结合反应液到每个检测孔和校正标准孔中(包括背景孔样本)步骤4.室温避光孵育1小时 在SoftMax Pro软件上设置模板,并在Spe
利用细胞计数仪检测细胞周期
前言球体是小型的3D细胞培养微环境,可以用于诸如低吸附微孔板等特殊的方法进行细胞培养。这种体外3D细胞培养模型具有高度的临床及生物可靠性,并且已经被广泛应用于高通量筛选(HTS)和高级细胞培养,从而方便对诸如化合物毒性和癌症等重大疾病进行研究。Multicellular tumor sphe
SoftMax®Pro7.1.1GxP应用于更全地获得并分析数据
SoftMax®Pro7.1.1GxP是MolecularDevices最近更新、最安全的一款软件,符合全新的FDA21CFRPart11的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的是简化分析流程和报告生成时间,以便于支持我们的微孔读板机更快获得完整、可靠的数据。为了确保您的微孔
利用SpectraMax-i3x多功能微孔板读板机检测功能对...(二)
ATP标准曲线既可以验证试验条件也可以用来计算细胞内ATP的含量。因此ATP标准品浓度范围从1nM至10uM产生的化学发光信号范围可覆盖整个不同细胞数目孔中产生的信号值(图二),检测的线性范围大于四个数量级。 经十字孢碱(staurosporine)和茴香霉素 (anisomycin)等化合物
酶标仪在植物领域的三种应用总结(三)
3.3 ROS 分析与氧化应激密切相关的活性氧簇 (Reactive Oxygen Species,ROS) 在植物免疫信号通路中发挥着关键的作用,也是常规检 测的信号事件之一。与哺乳动物细胞的 ROS 水平检测不同,植物 ROS 信号通常用基于化学发光的鲁米诺 (Luminol) 法。Lumi
细胞周期的四种检测方法详解(二)
2 数据分析MiniMax 细胞计数仪的透射光模块可以从自动聚焦得到更好的图像效果。SoftMax Pro 软件中的“Field Analysis”能进行自定义分析从而鉴别细胞重叠的部分。我们应用一种特殊的鉴别方法来区分目标球体和其余物体,如残渣和个体细胞,从而在后续的分析中予以去除 (