使用MDSoftMaxPro7软件进行平行线分析和相对活性..(二)

噪声和权重噪声是指检测响应的随机变化,当进行平行线评价时这是需要考虑的重要因素,因为它会影响检测平行性的能力。在高噪声的情况下,平行性计算值由于由于受噪声的影响过大,因此无法再正确的反应非平行性的程度。对于 F- 检验和卡方检验法这两种方法,在计算各自的概率值的过程中对于不同噪声水平的处理能力是不同的。F- 检验的概率值不受此因素影响,但是卡芳检验概率计算值则高度依赖于噪声水平并要求对于数据方差进行准确的估算。因此,对于卡方检验法需要进行反方差权重设置。如在“Selecting the best weightingfactor in SoftMax Pro 7”此篇应用资料里讨论的,生物实验一般在在曲线的上半部分会有较大的方差。在无权重的回归分析中,平行性的结果会主要受曲线的上半部分的数据点影响,而曲线的下半部分的数据点在对于平行性结果的影响不大。在软件的模板中,权重因子的设置使用方差的倒数,但是根据情况可以调整为更合适的权......阅读全文

使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(二)

噪声和权重噪声是指检测响应的随机变化,当进行平行线评价时这是需要考虑的重要因素,因为它会影响检测平行性的能力。在高噪声的情况下,平行性计算值由于由于受噪声的影响过大,因此无法再正确的反应非平行性的程度。对于 F- 检验和卡方检验法这两种方法,在计算各自的概率值的过程中对于不同噪声水平的处理能力是不同

使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(一)

使用MD SoftMax Pro 7软件进行平行线分析和相对活性评价介绍在生物实验中要经常要使用到的平行线分析(PLA)方法,当无法直接检测一个生物制品的活性而只能通过检测其产生的效果时,PLA方法通常会被用来进行效应曲线的比较来获得此制品的效果(Figure1)。如果对于两种物质其生物响应相似或者

使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(二)

SSE 方法使用下面的公式进行分析:SSE= Σ wi (yi - yi)2。假设数据误差是不相关的且符合正态分布,使 SSE 尽可能的最小能够最大近似的估算数据模型的曲线公式参数。换句话说,最佳的曲线拟合方式是其参数能够得到最小的 SSE。如果两种拟合方式都能符合数据,那么哪个残差图给出了最小的

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(二)

结论利用 SSE 和 AIC 方法开发了检测模板,在SoftMax Pro7 软件中选择的曲线拟合模型测试最常见的加权因子。这些统计测试有助于比较适用于不同加权因子的拟合度优化,可以自信选择最适当的加权方式。然而,必须确保有足够的数据点支撑来解释其变化。参考文献1. Gottschalk, P.,

SoftMax-Pro软件验证方案

对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。验证时间从6个月缩短至三天对于您实验最重要的莫过于结果的重复性,可靠性和完整性,但要做到这些可能需要多达6个月的时间进行充足的实验步骤的认证和记

使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(一)

引言当需要定义一个数据的特征时,如变化的比例、曲线上下边的渐近线或者 EC50/IC50值时,选择正确的曲线拟合方式是十分关键的。选择的曲线拟合方式应该是能够最准确的反映两个已知变量 (x,y) 的关系。因此,曲线拟合的目的就是为了寻找最佳的公式和参数来匹配数据。SoftMax Pro 7软

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子

     前言      选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(一)

前言选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的绝对误差的差异,如四参数

利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩

前言基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应

利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩

  基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应

SoftMax-Pro-7.1-GxP企业版数据获取和分析软件说明书

  SoftMax Pro 7.1 GxP企业版数据获取和分析软件   在GMP/GLP实验条件下符合FDA指导方针的完整验证工具及手段   优势:   • 通过系统审计追踪功能可以轻松跟踪和记录所有的改变   • Microsoft SQL 数据库能够使软件具有企业级别文档共享能力

微孔读板机符合-GMP/GLP-实验的合规之路

  符合 GMP/GLP 实验的合规之路   SoftMax® Pro 7.1 GxP 是 Molecular Devices 最新、最安全的一款软件,符合全新的 FDA   21 CFR Part 11 的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的   是简化分析流程和报

在MD两款酶标仪上应用Promega-CellTiterGlo化学发光法检测...

在MD两款酶标仪上应用Promega CellTiter-Glo化学发光法检测细胞活性介绍Molecular Devices公司的SpectraMax® L及SpectraMax®M5型号酶标仪结合Promega公司的CellTiter-Glo化学发光细胞活性检测试剂盒能进行快速灵敏的活细胞数量

用新型自动细胞成像系统和细胞分析软件进行基...(二)

评价化合物对心机细胞毒性的作用评价心肌细胞毒性影响,使用各种不同的心肌细胞毒性化合物处理 24 小时,然后活细胞通过 Hoechst 核染料分子标记后,MitoTracker Orange 染料标记和 AF-488 连接的鬼笔环肽染料来检测细胞骨架的完整性。利用 ImageXpress Pi

SoftMax®Pro7.1.1GxP应用于更全地获得并分析数据

SoftMax®Pro7.1.1GxP是MolecularDevices最近更新、最安全的一款软件,符合全新的FDA21CFRPart11的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的是简化分析流程和报告生成时间,以便于支持我们的微孔读板机更快获得完整、可靠的数据。为了确保您的微孔

使用SpectraMax微孔板读板机检测QuantiT-PicoGreen-dsDNA实验-二

- 高浓度范围标曲可以浓度从1 ng/mL制备到1 μg/mL,低浓度范围标曲可以从25 pg/mL制备到25 ng/mL。对于高浓度范围标曲,按Table 2中稀释方案稀释;对于低浓度范围标曲,40倍稀释2μg/mL溶液制备50 ng/mL溶液,参考Table 3中的稀释方案。 注意:此篇

Molecular-Devices在细胞成像系统上检测细胞活性或毒性

EarlyTox™细胞完整性试剂盒由一系列易于识别活细胞和死细胞的优化试剂组成。可用于检测不同处理对细胞活性的影响,也可评估不同机制产生的细胞毒性,包括凋亡和坏死。该试剂盒设计工作于多种细胞类型,贴壁和悬浮均可。简单的操作流程和优异的试剂表现使其能应用到高通量扫描上。试剂盒中使用了两种结合DNA的荧

细胞周期的四种检测方法详解(二)

2 数据分析MiniMax 细胞计数仪的透射光模块可以从自动聚焦得到更好的图像效果。SoftMax Pro 软件中的“Field Analysis”能进行自定义分析从而鉴别细胞重叠的部分。我们应用一种特殊的鉴别方法来区分目标球体和其余物体,如残渣和个体细胞,从而在后续的分析中予以去除 (

MD酶标仪应用:细胞活力和毒性分析的原理和方法(二)

上述的代谢法均属于酶标仪光吸收应用,虽然相对经济,但还是会受到光吸收本身的多种限制,尤其是动态范围窄,容易受到具有光吸收特性的试剂和药物干扰等。同时,光吸收法受限于比尔定律中的光径因素,不适用于384或1536孔板等更高通量检测等。因此,基于荧光检测的代谢法也成为了主要的细胞活力检测方法之一,其中常

独特无标记细胞分析技术无需荧光染料标记细胞也可对...

独特无标记细胞分析技术无需荧光染料标记细胞也可对其进行成像分析简介基于细胞成像的分析技术一般需要使用荧光染料进行标记,一些荧光标记可能对活细胞具有毒性或者只能用于固定过的细胞进行染色。无标记细胞分析技术使得研究者既无需耗时耗力的染色流程也无需担心染料对正常细胞活力的影响,就可以计算出细胞数目和细胞汇

利用MD微孔板读板机对细胞内氧化自由基吸收能力ORAC

  活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由细胞内正常代谢反应,环境压力 以及紫外辐射产生的一类物质,包括过氧 自由基、羟基自由基、超氧离子和单线态 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC) 分析是

利用MD微孔板读板机对细胞内氧化自由基吸收能力(ORAC)...

引言活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由细胞内正常代谢反应,环境压力 以及紫外辐射产生的一类物质,包括过氧 自由基、羟基自由基、超氧离子和单线态 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC)

应用MD微孔板读板机和双报告系统检测NFκB活性(二)

方法细胞接种和转染HEK293细胞(80%融合度)用胰酶消化后分到96孔白板中,每孔15,000细胞。当细胞超过50% 融合度时,用NF- κB-RE 萤火虫荧光素酶和海肾对照组质粒对细胞进行共转染,其中使用三种不同比例FuGENE和DNA组合方式,转然后,细胞置于37°C培养箱中培养24h。

利用细胞计数仪检测细胞周期

前言球体是小型的3D细胞培养微环境,可以用于诸如低吸附微孔板等特殊的方法进行细胞培养。这种体外3D细胞培养模型具有高度的临床及生物可靠性,并且已经被广泛应用于高通量筛选(HTS)和高级细胞培养,从而方便对诸如化合物毒性和癌症等重大疾病进行研究。Multicellular tumor sphe

利用SpectraMax-i3x多功能微孔板读板机检测功能对...(二)

ATP标准曲线既可以验证试验条件也可以用来计算细胞内ATP的含量。因此ATP标准品浓度范围从1nM至10uM产生的化学发光信号范围可覆盖整个不同细胞数目孔中产生的信号值(图二),检测的线性范围大于四个数量级。  经十字孢碱(staurosporine)和茴香霉素 (anisomycin)等化合物

SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(一)

引领微孔板检测系统的行业标准历经13年发展,SpectraMax® M系列多功能微孔板读板机由于其优异的检测表现、可靠的性能、深受广大科研工作者的信赖,已然成为行业标准的引领者。可以根据应用需求轻松升级满足您的检测。仪器设置和数据处理都可借助于专业的SoftMax® Pro软件完成,所有

如何使用M5-多功能微孔板读板机和IMAP®-荧光偏振...(二)

结合反应步骤1.将75%的结合缓冲液A与25%的结合缓冲液B混合,制备结合缓冲液;步骤2.将结合试剂以1:600倍稀释成结合缓冲液,得到结合反应液;步骤3.移出60ul结合反应液到每个检测孔和校正标准孔中(包括背景孔样本)步骤4.室温避光孵育1小时 在SoftMax Pro软件上设置模板,并在Spe

SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(二)

软件验证对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。- 验证时间从6个月降低到3天支持平行线分析,4-P和5-P曲线拟合验证- 全面复杂的针对常规实验计算的检测- 即时可用于OQ验证检测的

Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析(二)

 图3 肽段SNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEK的脱酰胺鉴定及定量  图4 在PepFinder2.0中对所有肽段进行De Novo Sequencing  图5 对一张MS/MS谱图进行De Novo Sequencing   图6 在PepFinder软件中计算单克隆抗体各种常用分

诱导多能干细胞毒性实验(一)

优势:1.  简易、快速的通过检测细胞贴壁面积进行96或384孔板细胞毒性筛选2.  按照一般微孔读板机的简单流程3.  具有细胞影像数据,增加数据可信性药物引起的组织毒性是候选药物未能进入市场的一个重要原因,因此,安全性和有效性试验的高度预测分析是提高药物开发和降低候选药物抗药性的关键。人源诱导多