利用SoftMaxPro软件分析心肌细胞球收缩

前言基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应。这里,我们将介绍一种包括成像和分析的实验方法,此方法可用于监测体外心肌细胞球的跳动及其跳动模式特征。在研究心肌细胞毒性的案例中,实时观察到心肌细胞的跳动行为将使科学家们通过使用透射光、相差和荧光成像方式从单一实验中获得多参数结果。在药物研发的早期阶段筛选化合物毒性,能够大大节约后期药物对心血管副作用导致药物研发失败所产生的成本。这促使了开发生物相关的、高通量、高内涵筛选工具如心肌细胞球。高内涵筛选产生出大量需要快速和自动化分析的数据。SoftMax® Pro 软件的数据导入功能可以让您分析任何科学数据,包括高内涵成像系统 ( 图......阅读全文

利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩

前言基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应

利用SoftMax-Pro软件分析心肌细胞球收缩

  基于细胞的化合物筛选模型已变的越来越复杂,以展示生物系统的复杂性。活细胞成像和三维模型为活细胞的结构和细胞过程提供了有价值的见解。最近在开发代表人类不同种类组织的复杂类器官模型方面有了很大的进展,其中包括肝脏、胰腺、神经和心肌组织。心肌细胞球能够在体外环境下收缩并且可对不同调控因子的影响作出反应

SoftMax-Pro软件验证方案

对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。验证时间从6个月缩短至三天对于您实验最重要的莫过于结果的重复性,可靠性和完整性,但要做到这些可能需要多达6个月的时间进行充足的实验步骤的认证和记

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子

     前言      选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的

SoftMax-Pro-7.1-GxP企业版数据获取和分析软件说明书

  SoftMax Pro 7.1 GxP企业版数据获取和分析软件   在GMP/GLP实验条件下符合FDA指导方针的完整验证工具及手段   优势:   • 通过系统审计追踪功能可以轻松跟踪和记录所有的改变   • Microsoft SQL 数据库能够使软件具有企业级别文档共享能力

使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(二)

噪声和权重噪声是指检测响应的随机变化,当进行平行线评价时这是需要考虑的重要因素,因为它会影响检测平行性的能力。在高噪声的情况下,平行性计算值由于由于受噪声的影响过大,因此无法再正确的反应非平行性的程度。对于 F- 检验和卡方检验法这两种方法,在计算各自的概率值的过程中对于不同噪声水平的处理能力是不同

使用MD-SoftMax-Pro-7软件进行平行线分析和相对活性..(一)

使用MD SoftMax Pro 7软件进行平行线分析和相对活性评价介绍在生物实验中要经常要使用到的平行线分析(PLA)方法,当无法直接检测一个生物制品的活性而只能通过检测其产生的效果时,PLA方法通常会被用来进行效应曲线的比较来获得此制品的效果(Figure1)。如果对于两种物质其生物响应相似或者

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(二)

结论利用 SSE 和 AIC 方法开发了检测模板,在SoftMax Pro7 软件中选择的曲线拟合模型测试最常见的加权因子。这些统计测试有助于比较适用于不同加权因子的拟合度优化,可以自信选择最适当的加权方式。然而,必须确保有足够的数据点支撑来解释其变化。参考文献1. Gottschalk, P.,

如何在SoftMax-Pro-7软件中选择最佳权重因子?(一)

前言选择合适的权重因子对于获得最佳的曲线拟合至关重要, 获得曲线拟合参数值使得曲线拟合模型尽可能接近真实的测量数据点。加权将会影响到每个浓度下数据点的影响程度和发挥的作用,或特定数据点或曲线某一部权重是对数据中误差进行建模的一种方式,并且已经用于处理不同曲线的不同数据点的绝对误差的差异,如四参数

使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(二)

SSE 方法使用下面的公式进行分析:SSE= Σ wi (yi - yi)2。假设数据误差是不相关的且符合正态分布,使 SSE 尽可能的最小能够最大近似的估算数据模型的曲线公式参数。换句话说,最佳的曲线拟合方式是其参数能够得到最小的 SSE。如果两种拟合方式都能符合数据,那么哪个残差图给出了最小的

使用SoftMax-Pro-7软件选择最佳的曲线拟合方式(一)

引言当需要定义一个数据的特征时,如变化的比例、曲线上下边的渐近线或者 EC50/IC50值时,选择正确的曲线拟合方式是十分关键的。选择的曲线拟合方式应该是能够最准确的反映两个已知变量 (x,y) 的关系。因此,曲线拟合的目的就是为了寻找最佳的公式和参数来匹配数据。SoftMax Pro 7软

SoftMax®Pro7.1.1GxP应用于更全地获得并分析数据

SoftMax®Pro7.1.1GxP是MolecularDevices最近更新、最安全的一款软件,符合全新的FDA21CFRPart11的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的是简化分析流程和报告生成时间,以便于支持我们的微孔读板机更快获得完整、可靠的数据。为了确保您的微孔

利用细胞计数仪检测细胞周期

前言球体是小型的3D细胞培养微环境,可以用于诸如低吸附微孔板等特殊的方法进行细胞培养。这种体外3D细胞培养模型具有高度的临床及生物可靠性,并且已经被广泛应用于高通量筛选(HTS)和高级细胞培养,从而方便对诸如化合物毒性和癌症等重大疾病进行研究。Multicellular tumor sphe

独特无标记细胞分析技术无需荧光染料标记细胞也可对...

独特无标记细胞分析技术无需荧光染料标记细胞也可对其进行成像分析简介基于细胞成像的分析技术一般需要使用荧光染料进行标记,一些荧光标记可能对活细胞具有毒性或者只能用于固定过的细胞进行染色。无标记细胞分析技术使得研究者既无需耗时耗力的染色流程也无需担心染料对正常细胞活力的影响,就可以计算出细胞数目和细胞汇

利用-SpectraMax-iD3-微孔板读板机检测内源色氨酸荧光

介绍蛋白质的内源荧光主要来源于芳香族氨基酸如色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸。在水中,色氨酸的最大激发光波长在270-280nm左右而其发射光波长峰值接近350nm。蛋白的发射光谱对溶剂的极性和外界环境十分敏感。当蛋白质变性时,色氨酸残基会暴露在水中而其发射波长会变长。这种发射波长峰值的改变可以用来检测蛋白

如何利用微孔读板机进行微量DNA和蛋白的高通量检测?

介绍在遗传学和分子生物学中,对核酸和蛋白进行定量是许多复杂实验必要的上游检测。虽然已有多种检测方法,但是最常用的仍然是紫外分光光度法。紫外分光光度法的原理是利用分子在固定波长范围吸收光和散射光,在朗伯比尔定律(方程式1)的基础上计算待测物质的浓度。这种方法还需要提前知道样品的摩尔消光系数和通路长度。

微孔读板机符合-GMP/GLP-实验的合规之路

  符合 GMP/GLP 实验的合规之路   SoftMax® Pro 7.1 GxP 是 Molecular Devices 最新、最安全的一款软件,符合全新的 FDA   21 CFR Part 11 的工作流程,以确保您获得数据的完整性。每个步骤都经过优化,其目的   是简化分析流程和报

如何利用GraphPad-Prism软件分析QPCR数据

第一步:在电脑上安装好GraphPad Prism软件,安装此软件在百度上可以下载,一般下载GraphPad Prism5中文版的。第二步:完成第一步后在电脑上打开GraphPad Prism软件,会弹出对话框welcome to GraphPadPrism,点击左边的Column,选择右边的cho

如何利用GraphPad-Prism软件分析QPCR数据

第一步:在电脑上安装好GraphPad Prism软件,安装此软件在百度上可以下载,一般下载GraphPad Prism5中文版的。第二步:完成第一步后在电脑上打开GraphPad Prism软件,会弹出对话框welcome to GraphPadPrism,点击左边的Column,选择右边的cho

使用SpectraMax微孔板读板机检测QuantiT-PicoGreen-dsDNA实验-二

- 高浓度范围标曲可以浓度从1 ng/mL制备到1 μg/mL,低浓度范围标曲可以从25 pg/mL制备到25 ng/mL。对于高浓度范围标曲,按Table 2中稀释方案稀释;对于低浓度范围标曲,40倍稀释2μg/mL溶液制备50 ng/mL溶液,参考Table 3中的稀释方案。 注意:此篇

SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(四)

使用NanoOrange蛋白试剂盒传统的比色方法,如280吸光,BCA,Bradford或Lowry法,当使用微孔板格式时灵敏度不佳。来自Life Technologies公司的NanoOrange® 蛋白定量试剂盒在多孔板格式的动态区间可达 10 ng/mL到10 μg/mL。此应用文章展

如何使用M5-多功能微孔板读板机和IMAP®-荧光偏振...(二)

结合反应步骤1.将75%的结合缓冲液A与25%的结合缓冲液B混合,制备结合缓冲液;步骤2.将结合试剂以1:600倍稀释成结合缓冲液,得到结合反应液;步骤3.移出60ul结合反应液到每个检测孔和校正标准孔中(包括背景孔样本)步骤4.室温避光孵育1小时 在SoftMax Pro软件上设置模板,并在Spe

细胞周期的四种检测方法详解(二)

2 数据分析MiniMax 细胞计数仪的透射光模块可以从自动聚焦得到更好的图像效果。SoftMax Pro 软件中的“Field Analysis”能进行自定义分析从而鉴别细胞重叠的部分。我们应用一种特殊的鉴别方法来区分目标球体和其余物体,如残渣和个体细胞,从而在后续的分析中予以去除 (

SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(一)

引领微孔板检测系统的行业标准历经13年发展,SpectraMax® M系列多功能微孔板读板机由于其优异的检测表现、可靠的性能、深受广大科研工作者的信赖,已然成为行业标准的引领者。可以根据应用需求轻松升级满足您的检测。仪器设置和数据处理都可借助于专业的SoftMax® Pro软件完成,所有

SpectraMax-M系列微孔板读板机应用集锦(二)

软件验证对于在GLP或GMP实验室工作的科研人员,SoftMax Pro软件验证方案提供了最为全面的记录文档和可用于验证GxP管理员功能,软件运行和分析能力的工具。- 验证时间从6个月降低到3天支持平行线分析,4-P和5-P曲线拟合验证- 全面复杂的针对常规实验计算的检测- 即时可用于OQ验证检测的

如何利用CisGenome和Galaxy软件做Motif分析

基因组数据显示软件   CisGenome功能强大,是个免费的分析数据库。最近要做预测调控元件相关的毕业设计,需要做个Motif分析,选择了CisGenome,但是CisGenome挖掘Motif又只接受Sequence输入,于是又利用了Galaxy,在此记录下我是如何利用Galaxy和C

利用MD微孔板读板机对细胞内氧化自由基吸收能力(ORAC)...

引言活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由细胞内正常代谢反应,环境压力 以及紫外辐射产生的一类物质,包括过氧 自由基、羟基自由基、超氧离子和单线态 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC)

利用MD微孔板读板机对细胞内氧化自由基吸收能力ORAC

  活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由细胞内正常代谢反应,环境压力 以及紫外辐射产生的一类物质,包括过氧 自由基、羟基自由基、超氧离子和单线态 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC) 分析是

用SpectraMax多功能微孔板读板机进行cAMP-HiRange检测(二)

Z’ 因子由阴性(无cAMP,无cAMP-d2)和阳性质控(无cAMP)计算得到2。利用SoftMax® Pro软件生成和分析数据,包含一些预设的HTRF实验模板以简化检测和分析。结果使用SoftMax Pro软件的4-参数曲线拟合如上所述进行数据分析和做图。依据表2的读板机参数设置获得最佳结果

微孔板读板机和SimpleStep-ELISA试剂盒定量白细胞介素8

前言THP-1 是人外周血的单核细胞系,最初来源于急性单核细胞性白血病患者,常被用来体外研究巨噬细胞功能。 它通常属于悬浮细胞,当用 PMA 处理后可分化为贴壁生长的巨噬细胞。THP-1 能释放许多细胞因子,其中包括白细胞介素 -8(IL-8),一种能被许多类型细胞分泌的、在调节急性炎症反应