定量代谢组学案列：用小分子代谢产物诊断肠癌
近年来，医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉，系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队，近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究，现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。研究团队首先采用气相色谱质谱联用、液相色谱质谱联用分析方法，结合单维统计、多维统计的代谢组学研究技术，对I-IV期的64名肠癌患者和65名健康志愿者分别进行了血清和尿液代谢标志物的筛查，并进一步在扩大的研究对象101名肠癌患者和103名健康人中对所发现的潜在代谢标志物进行了验证。 研究结果显示，肠癌患者与健康人的血清代谢物组成具有显著差异。肠癌患者的糖酵解通路中的两个代谢产物丙酮酸和乳酸在血清中呈显著性升高，三羧酸循环中的琥珀酸、异柠檬酸、柠檬酸中间产物呈下降趋势；油胺在肠癌病人血清中的含量也有显著性降低；尿素循环代谢物精氨酸、鸟氨酸和......阅读全文
代谢组学在疾病诊断中的应用
代谢组学 （metabolomics）的出现是生命科学研究的必然。在20世纪90年代中期发展起来的代谢组学，是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有广泛的应用前景。 代谢产物是基因表达的最终
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展，单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物，如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题，同时加速了无标准谱图化合物的解析过程，在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样，根据其工作原理，现分为化学结构数据库基础上的
发根农杆菌用于生产次生代谢产物
利用植物细胞培养技术生产次生代谢物真正实现商品化生产的还为数甚少，其主要原因在于植物细胞生长缓慢，有些还需要激素维持，次生代谢物含量太低，以及生产能力不稳定等，因而工业化生产的成本太高。发根能合成植物特征的次生代谢产物，而且其含量往往比植物的含量还高，尤其是它的稳定性和生长迅速的特点是工业化生产
细菌的分解代谢产物有哪些
细菌除能分解糖和蛋白质外，对一些有机物和无机物也可分解利用。各种细菌产生的酶不同，其代谢的基质不同，代谢的产物也不一样。（1）对其他有机物的分解：如变形杆菌具有尿素酶，可以水解尿素，产生氨。乙型副伤寒沙门菌和变形杆菌都具有脱硫氢基作用，使含硫氨基酸（胱氨酸）分解成氨和H2S。（2）对其他无机物的分解
藻类及其代谢产物对水质的影响
受城市污水排放和农田径流的影响，大量氮、磷等营养成分排入水体，致使水体富营养化，藻类过量繁殖。特别是我国南方地区的一些湖泊和水库水，由于阳光充足、温度较高，藻类成为主要问题。 水中藻类严重影响给水处理效果，主要表现在以下几方面：藻类一般带负电，具有较高的稳定性，难于混凝；藻类比重小，沉
代谢组学－|－肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢
能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下，肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解，将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ～ 30倍，为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此，靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研
中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案
中药组成成分复杂、作用环节多样，中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明，已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息，减轻繁重的数据处理工作量，成为广大中医药研究工作者的心声。 赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇1
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇
微生物发酵代谢产物途径中间产物的测定方法
先经分离纯化得到你测纯物质（≥95%），再进行质谱、核磁、同位素等的检测，打出图谱，然后再进行解谱，空间结构的话还需要一些的反应！很复杂！
代谢组学科学哲学思路
代谢组学突出的是一种整体性的研究思路。它通过现代超高效液相色谱/高分辨质谱联用仪等技术分析体液中的代谢物组成谱，并利用多变量统计分析技术，把所有代谢物的组成信息都整合到一起，为在系统和整体的层面上比较和分析生物的代谢特性。 众所周知，西方医学的哲学基础是从分析开始的，如魏尔啸的细胞论。随着分析
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
代谢物组的定义
中文名称代谢物组英文名称metabolome定 义细胞内在某一特定生理和发育阶段的所有小分子量的代谢物质。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），总论（二级学科）
代谢组学新工具：METLIN
METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库，将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。 超过上万个代谢物 目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细，高分辨率串联质谱信息的六万化合物，
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子，按质荷比m/e大小分
代谢组学前沿与热点——定性代谢流解决方案
作为代谢组学领域先进解决方案的一贯领导者，安捷伦近期隆重推出了全新的定性代谢流解决方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程，旨在关注代谢组学的前沿和热点，提供更快、更准、更完整的高效工作流程，助力科研工作者拓展组学研究的精度与深度。 下面将从五个方面助您了解定性代谢流及安捷
GCMS－HRAM－代谢组学数据库－探索代谢组学的奥秘
盐城4公分厚外墙岩棉板报价 岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后，采用的四辊离心制棉工序，将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维，再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂，经过沉降、固化、切割等工艺，根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。
科研人员发布新型代谢产物鉴定工具
近日，中国科学院上海药物研究所与中国科学技术大学杭州高等研究院合作，发布代谢产物鉴定工具DMetFinder。药物及先导化合物在体内外的代谢过程往往十分复杂。传统解析依赖人工经验，耗时费力，还可能遗漏低丰度或非经典代谢物。DMetFinder为这些难题提供了新的解决方案。该工具融合余弦相似度算法、同
细菌代谢产物的观察实验——色素产生试验
实验方法原理有些细菌能产生色素，可作为鉴别某些细菌的根据。实验步骤将金黄色葡萄球菌及绿脓杆菌分别划线接种于琼脂平板上，置37 ℃温箱培养24 小时后，取出观察两菌所产生的色素。金黄色葡萄球菌的色素仅使菌落呈金黄色，属脂溶性色素；绿脓杆菌的色素则弥散至培养基中，使整个培养物呈现绿色，属水溶性色素。
细菌合成代谢产物及其意义有哪些？
细菌合成代谢产物及其意义有哪些？（1）热原质：大多数为革兰阴性菌合成的菌体脂多糖。（2）毒素：◇内毒素：G-菌的脂多糖。◇外毒素：G+菌产生的蛋白质，毒性强且有高度的选择性。（3）侵袭性酶：有些细菌还能产生具有侵袭性的酶，如卵磷脂酶、透明质酸酶等。注：毒素和侵袭性酶在细菌致病性中甚为重要。（4）色素
Immunity：石榴的代谢产物可增强抗癌能力
结直肠癌（Colorectal Cancer，CRC）是全世界范围内发病率第三的癌症，每年新增发病人数近200万（仅次于乳腺癌和肺癌），每年导致的死亡人数接近100万（仅次于肺癌）。大约每25个人就有1人会在其一生中患上结直肠癌。 而在我国，结直肠癌年发病人数仅次于肝癌，2020年新增56万结
细菌代谢产物的观察实验_糖发酵试验
细菌的代谢产物大致可分为三类：一为可供鉴别细菌的产物；二为与细菌致病性有关的产物；三为可供治疗用的代谢产物。实验方法原理由于各种细菌具有不同的酶，故分解糖类的能力不同，分解糖类后的终末产物亦不一致，例如肠道非致病菌一般均有乳糖酶，能分解乳糖产酸(乳酸，甲酸，乙酸等)，尚有甲酸脱氢酶。能将甲酸进一步分
嘌呤代谢异常诊断说明
血清尿酸增高，常为357～595μmol/L（6～10mg/dl）。尿中排出的尿酸过多，大于25mg/kg/24小时。尿酸/肌酐的比值增高，正常时小于1，病儿可达2～4比1。确诊要靠酶活性测定，患儿红细胞或皮肤成纤维细胞中HPRT活性减低或消失。腺嘌呤磷酸核糖转移酶的活性为正常或增高。杂合子的检出和
钠代谢紊乱诊断要点
1.低钠血症(1.5～2.5mmol/L) 2.高尿钠(>20mmol/L) 3.代谢性碱中毒(血浆HCO3->30mmol/L)。 4.高肾素血症 5.高醛固酮血症 6.对外源性加压素不敏感 7.肾小球旁器增生 8.低氯血症(尿氯>20mmol/L) 9.血压正常。
嘌呤代谢异常诊断说明
血清尿酸增高，常为357～595μmol/L（6～10mg/dl）。尿中排出的尿酸过多，大于25mg/kg/24小时。尿酸/肌酐的比值增高，正常时小于1，病儿可达2～4比1。确诊要靠酶活性测定，患儿红细胞或皮肤成纤维细胞中HPRT活性减低或消失。腺嘌呤磷酸核糖转移酶的活性为正常或增高。杂合子的检出和
研究揭示直肠癌辅助放化疗毒性血清代谢组学特征
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/1/492737.shtm
什么是两用代谢？
两用代谢途径（amphibolic pathway）亦称无定向代谢途径，即指把合成作用和分解作用合在一起的代谢途径。
什么是两用代谢？
两用代谢途径（amphibolic pathway）亦称无定向代谢途径，即指把合成作用和分解作用合在一起的代谢途径。
用代谢疗法向癌症宣战
今年，我市首批引进的两个顶尖人才团队相继落地，其中之一就是美国MD安德森癌症中心肿瘤代谢中心主任吕志民领衔的肿瘤精准医学团队。前不久，由青岛大学、青岛大学附属医院、市科技局、崂山区政府四方共建的青岛肿瘤研究院正式揭牌成立，吕志民受聘担任青岛肿瘤研究院院长。吕志民用八个字与团队成员共勉：不忘初心