定量代谢组学案列:用小分子代谢产物诊断肠癌
近年来,医学领域的基础研究日趋系统化和多学科交叉,系统生物学的迅猛发展翻开了临床实践、药物研发的新篇章。作为国内较早涉足系统生物学研究的贾伟教授研究团队,近年来应用代谢组学技术对各种临床疾病的早期预测、诊断和预后的生物标志物进行了广泛的研究,现以结直肠癌的系列研究为例介绍我们的研究进展。研究团队首先采用气相色谱质谱联用、液相色谱质谱联用分析方法,结合单维统计、多维统计的代谢组学研究技术,对I-IV期的64名肠癌患者和65名健康志愿者分别进行了血清和尿液代谢标志物的筛查,并进一步在扩大的研究对象101名肠癌患者和103名健康人中对所发现的潜在代谢标志物进行了验证。 研究结果显示,肠癌患者与健康人的血清代谢物组成具有显著差异。肠癌患者的糖酵解通路中的两个代谢产物丙酮酸和乳酸在血清中呈显著性升高,三羧酸循环中的琥珀酸、异柠檬酸、柠檬酸中间产物呈下降趋势;油胺在肠癌病人血清中的含量也有显著性降低;尿素循环代谢物精氨酸、鸟氨酸和......阅读全文
质谱分析水杨酸(SA)中葡萄糖醛酸代谢产物定量方法...
质谱分析水杨酸(SA)中葡萄糖醛酸代谢产物定量方法开发的思考前言前几天和一位友人讨论他的毕业课题,其主要目的是定量分析其代谢物在尿液中的暴露量,其它的代谢物均完成了定量分析,但在葡萄糖醛酸代谢产物的定量上遇到了一些困难,现就对其方法开发中需要注意的问题跟大家分享下:药物的葡萄糖醛酸代谢产物有2个SA
定量代谢分析在代谢类疾病治疗与预防中的应用(二)
接下来,我们评估了MILLIPLEX®试剂盒检测生物样品的性能。 正如之前的预期,多种代谢激素水平会随着食物的摄入而发生变化(血清中C-Peptide, GIP, active GLP-1与Insulin水平升高,如图3A所示)。将匹配的人血清和血浆样本进行比较,发现大多数分析物的血清和血浆
定量代谢分析在代谢类疾病治疗与预防中的应用(一)
健 康 肥胖、糖尿病、心血管疾病以及其他代谢综合征范畴内的相关疾病,是关系到我们健康最紧迫的问题,其中代谢相关的激素由内分泌系统的各个器官,包括脂肪细胞、胰腺和胃肠道分泌。在调节能量、食物摄取量和全身代谢方面发挥着重要作用。 近些年,随着II型糖尿病的发病率上升,代谢类疾病甚至已经影响到儿童和青少年
介导局部系统性天然免疫信号传递的代谢小分子
7月23日,Cell Host & Microbe在线发表中国科学院上海巴斯德研究所潘磊研究组题为Sugar Alcohols of Polyol Pathway Serve as Alarmins to Mediate Local-Systemic Innate Immune Communic
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里,代谢(脂质)组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用(LC-HRMS)技术是目前内源性代谢物最常用的手段,然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本,其组分化学性质各异,同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性,导致生物学信
Cell:广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史
继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后,2018年1月11日,《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农
代谢物靶向精准定量与分子机制创新研究专题会暨MExplorer-Ultimate靶向代谢组学质谱数据分析新品发布会
靶向代谢组学研究特定代谢物与物质群组的精准定量创新方法及其分子机制。通过高准确与高精度的方法对生物样本中的代谢物进行准确定量,进而在探索疾病机制、药物作用以及个体对环境因素响应的分子机制等方面,均扮演着至关重要的角色。随着代谢组学研究的不断深入,靶向代谢组学分析为深入理解生命过程复杂性和动态性,以及
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些
代谢组学,妙手何来?|迈理奥,开拓代谢组学新科技的先锋
今天要讲到的代谢组学妙手来自何方? 来自我们优秀的用户——迈理奥(Meliomics)。迈理奥的快速崛起,源自于他们对代谢组学领域的深刻理解和持续创新,而安捷伦出色的仪器和解决方案也为其提供了重要支持。日前,我们有幸采访到了迈理奥首席科学家厉良教授(加拿大皇家科学院院士)和学术总监李佳博士,深入了解
非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?
据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借
新陈代谢追踪器:用显微镜直接观察脂质代谢
脂类组学原本属于代谢组学的一个分支,如今已经演变成了一门独立科学,它有属于自己的研究目标:识别代谢调控中的关键脂类生物标志物,揭示脂类在细胞和组织内的生命活动的作用机制。常见的脂类研究方法主要依靠高分辨率的质谱技术。Thermo Fisher脂类研究解决方案 昂贵的大型质谱仪是很多脂类研究机构
如何看待代谢组学的前景
是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
代谢组学:未来新方向
加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转
做好代谢组学研究的关键
首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次
代谢组鉴定质控标准正式建立
蛋白质组和代谢组技术都基于质谱,但相比于蓬勃发展的蛋白质组学技术,代谢组虽然技术流程更简单,但其应用却一直十分缓慢。究其原因,是因为蛋白质组学却很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR(假发现率)质控策略,可以保证鉴定结果的可靠性;而代谢组全谱鉴定一直缺乏有效的质控手段对鉴定结果进行
进入前景光明的代谢组学
内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作
油菜代谢组研究方面取得进展
华中农大油菜团队联合小麦团队在Genome Biology发表了题为“Characterization of novel loci controlling seed oil content in Brassica napus by marker metabolite-based multi-om
如何看待代谢组学的前景
是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
代谢组学——肿瘤研究的利器
细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么? 1、肿瘤与代谢组学 肿瘤
代谢组学样本收集答疑解惑
样本收集是代谢组学研究的第一步,是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本?不同种类的生物样本的规范收集流程是什么?有哪些注意事项(抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节)?如何保存生物样本?可保存多久等等?这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题,本文将针对
花生四烯酸代谢产物的相关介绍
包括前列腺素(PG)和白细胞三烯(leukotriene,LT),均为花生四烯酸(arachidonic acid,AA)的代谢产物。AA是二十碳不饱和脂肪酸,是在炎症刺激和炎症介质(如C5a)的作用下激活磷脂酶产生的,在炎症中,中性粒细胞的溶酶体是磷脂酶的重要来源。AA经环加氧酶和脂质加氧酶途
霉菌次生代谢产物的自动化高效检测
检测食物或饲料中的霉菌毒素,已成为常规检测之一,但整个分析过程自动化似乎并不常见。下面的这篇报道展示了自动化可以达到怎样的效率和程度。 图1.玉米、水稻、谷物这样的植物容易产生霉菌。 霉菌毒素是由霉菌或真菌产生的有毒有害物质,是霉菌的次生代谢产物。在植物上
Nature:脂肪燃烧新途径-代谢产物琥珀酸
本报讯 《自然》近日在线发表的一篇论文称,代谢产物琥珀酸可以通过此前未发现的体温调节途径对小鼠的体温、能量消耗以及重量产生影响。图片来源:theconversation 能量摄入大于消耗往往会导致肥胖。一般来说,减肥方式主要有两种:一是减少食物的摄入,降低需要代谢的热量;二是通过运动等途径燃烧
LCMS应用药物代谢产物质谱解析
LC-MS应用-药物代谢产物质谱解析 1. 药物代谢的介绍 药物代谢指药物在体内多种药物代谢酶(肝药酶和肠道菌群酶)的作用下,化学结构发生改变的过程,又称生物转化或药物代谢。药物在体内生物转化后的结果有两种: 一是失活,成为无药理活性药物; 二是活化,由无药理活性成为有药理活性的代谢物或产生
诊断钙代谢紊乱的简介
1. 高钙血症 正常成人血清总钙参考范围为2.25~2.75mmo1/L,如血清钙>2.75mmo1/L,结合病史、临床表现即可诊断。 2. 低钙血症 血清钙
钠代谢紊乱的鉴别诊断
1.钠代谢紊乱应与假性鉴别所谓假性为多种因素引起常见的原因有利尿药的滥用、缓泻剂的应 用反复呕吐长期低氯饮食、肾性失镁家族性氯化物性腹泻尿氯测定有助于鉴别假性者尿氯多低于10mmol/L,真性者多大于 10mmol/L 2.其他需与原发性醛固酮增多肾小管性酸中毒、LiddleFanconi伴失
代谢性酸中毒的诊断
1、引起代谢性酸中毒的原因众多。糖尿病和肾衰竭等疾病合并代谢性酸中毒,标志疾病己发展到严重阶段;严重腹泻或肠瘘导致大量消化液丢失显而易见;摄入酸或成酸物质过多,无氧酵解过程增强,分解代谢增强合成代谢减弱等因素亦应予以注意。 2、代谢性酸中毒即酸血症的症状表现初期很不明显,往往被其原发病所掩盖。
如何诊断脂质代谢异常?
脂质代谢异常可以引起酮血症、酮尿症、脂肪肝、高脂血症、动脉粥样硬化等疾病,根据各种疾病的临床表现、生化检查及其他辅助检查基本可明确脂质代谢异常的情况。