代谢组学新工具:METLIN
METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。 超过上万个代谢物 目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,到目前为止这是世界上最大的数据库。不过Siuzdak研究组的工作并不只这些,“在我们说话的这份上,METLIN也仍在增长,”文章第一作者,资深研究员Ralf Tautenhahn说,“这是一个我们所有项目都用到的关键工具”。一旦代谢物被确定,研究人员就可以开始分析它在身体和疾病中如何发挥作用。 这个数据库的一个关键优势在于,它超越了基本分子重量――不同的化合物可能具有相同的分子量,串联质谱数据能以更高可信度,识别这些生物系统中的分子,这还包含了气体分子轰击的单个化合物,前者能是后者以独特的方式分离。而产生的分子碎片重量则能为......阅读全文
代谢组学新工具:METLIN
METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。 超过上万个代谢物 目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,
岛津又一合作成果——GCMS特色代谢物数据库正式发布
代谢组学(Metabonomics / Metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分,已广泛应用于食品及医药等领域。岛津一直致力于为代谢组学研究工作开发配套解决方案,数年前就推出了针对性的专业数据库,同时岛津也积极与国内客户开展合作进一步扩
我国首次发布海洋化合物数据库
3日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结
我国首次发布海洋化合物数据库
昨日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结
岛津又一合作成果——GCMS特色代谢物数据库正式发布
代谢组学(Metabonomics / Metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分,已广泛应用于食品及医药等领域。岛津一直致力于为代谢组学研究工作开发配套解决方案,数年前就推出了针对性的专业数据库,同时岛津也积极与国内客户开展合作进一步扩
加拿大建成首个人类小分子代谢物数据库
加拿大阿尔伯塔大学的研究小组日前宣布,他们建成了世界上首个人类小分子代谢物组数据库。专家认为,这将对许多传染病、遗传病或环境引发的疾病的诊断、预防和监测产生重大影响。 人类小分子代谢物组是所有人体内产生的小分子代谢物的总称,是化学意义上的“人类基因组”。科学家认为,如果说人类基因组描绘了生
布鲁克最新发布-|-4D代谢组学和4D脂质组学新突破
新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上; 数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D; 数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro; 新款代谢组学软件MetaboScape 20
沃特世发布用于离子迁移谱代谢物分析的参考数据库
分析测试百科网讯 2016年6月6日,沃特世在第ASMS2016上推出用于离子迁移质谱研究的代谢物分析参考数据库Metabolic Profiling CCS Library。该Metabolic Profiling CCS Library包括900多个碰撞截面(CCS)值,该数值主要是测量气相
岛津推出简化GCMS/-MS方法开发的智能数据库系列
2015年6月24日-马里兰州哥伦比亚市(华美)。岛津科学仪器公司发布其新的智能GCMS数据库系列。该系列产品是独立的数据库,可用于分析农药、法医毒理学物质、代谢物和环境污染物。每个数据库包括数百个相关化合物,并且具有优化的过渡和碰撞能量、CAS登记号和保留指数(RI)。该软件系列支持GC-MS
液相色谱仪的行业应用
液相色谱仪用于生物制药 液相色谱(LC)/质谱(MS)分析仪器、色谱柱化学分析、软件以及至关重要的应用技术,广泛应用于生物制药分析领域。 液相色谱仪用于精细及专用化学品 LC/ MS/GC系统能够提供化合物检定、处理复杂分析的特异性。包括液相色谱、质谱、色谱柱、样品制备化学、信
第56届ASMS安捷伦推出多款质谱新品
安捷伦推出多款质谱新品- 气相/三重串联四极杆质谱;超高灵敏度的液相/三重串联四极杆质谱仪;高灵敏度的四极杆-飞行时间串联质谱仪;全新代谢物物谱库和软件平台 2008年6月2日,在美国丹佛举办的第56届美国质谱协会年会上(ASMS)上,安捷伦科技隆重推出多款质谱产品及软件,包括全新的7000A型
基于色谱质谱联用技术检测尿液中类固醇激素及代谢物的研究进展
摘 要 类固醇激素在人体新陈代谢、免疫调节、生长发育、维持生命功能等方面具有重要作用,但其同时又作为一类新型有机污染物,干扰人体正常的内分泌机能从而对人体产生危害,因此类固醇激素的研究已逐渐成为国际上环境和健康领域的研究热点。尿液具有无创收集、前处理简单、能敏感地反映生理变化等优势,更适用于定
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
蛋白合成交流之如何从数据库找合适的化合物?
体系相关A:http://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/这个网站的结果怎么比较啊?答:我还没用过呢,只是在网上搜索到的。你那计算完了,有什么结果啊?A:答:没有打分之类的东西?A:只给了结果,但没看到这样排序的依据。答:应该是最上面的是最合适的,那你下载下来就可以用
高沸点化合物灵敏度低、峰形差原因分析
a. 离子源温度太低、导致样品被吸附;排除方法:提高离子源温度。b. 气相色谱接口的温度太低;排除方法:提高气相色潜接口的温度, 使之与升温程序的终温一致。c. 气相色谱升温程序的终温太低;排除方法:提高气相色谱升温程序的终温。
布鲁克推出用于生命科学等领域的最新质谱技术及解决方案
2014年6月16日,巴尔的摩,马里兰州——今天,在第62届美国ASMS质谱年会上,布鲁克公司(NASDAQ: BRKR)宣布推出多款质谱产品,这些产品除了能在应用市场和工业化市场发挥作用外,还可应用于生命科学研究、蛋白质组学研究、临床研究等领域,另外,它还能为制药/生物制药/ CRO的客户提供
全谱分析——探究小分子化合物的“大工具”
样品中如此微小的小分子化合物,究竟是如何进行分析的?代谢物全谱分析,通过色谱串联质谱(HPLC-MS/MS)技术鉴定样品中小分子化合物,从而达到对其进行定性定量分析的目的。利用超高效液相色谱质谱联用技术对物质分离和鉴定,结合质谱数据库信息注释和分类,精准定性,帮助我们从整体上了解样本的性质,详细的描
Bruker在ASMS-2016上推出最新代谢组学数据库
新型MetaboBASE Personal Library提高分析人员深入进行代谢物鉴定的信心 分析测试百科网讯 2016年6月6日—在ASMS 2016会议上,Bruker推出最新质谱数据库,被称为Bruker MetaboBASE Personal Library™,该数
安捷伦推出新型中端QTOF系统-为常规分析树立新标准
分析测试百科网讯 据报道,安捷伦科技在2015年4月21日推出6545 Q-TOF质谱系统,旨在为常规分析提高分析灵敏度。 新的中端系统在硬件和软件上均有提升,使其在食品安全、环境检测、法医毒理学和药品等领域进行小分子化合物痕量分析时
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
代谢组学全流程解决方案
赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标
代谢途径延伸策略为生物标记物的鉴定提供新思路
随着精准医学等概念的提出,代谢组学技术在生物标记物的发现及相关疾病的诊断、治疗和预后等环节中的重要作用日益彰显。尽管分析仪器的发展极大推动了生物标记物的测定,目前代谢物的首要鉴定手段仍依赖于将样品中所获得的一级、二级信息与在线数据库如HMDB、METLIN中所含标准品的信息进行比对。然而,数据库
安捷伦科技推出最高灵敏度的精确质量QTOF-LC/MS系统
丹佛,ASMS,2008年6月2日 安捷伦科技今天推出6530 精确质量测定的Q-TOF液质联用系统,具有无与伦比的灵敏度。使用了真正的高精度TOF技术,该系统具有出众的数据质量,高质量准确度,高质量分辨率,宽动态范围,高灵敏度和高速度。新的6530是蛋白质组学、代谢组学、杂质检验、环境污染物筛选
什么是代谢物?
代谢物(metabolite)亦称中间代谢物,是指通过代谢过程产生或消耗的物质,生物大分子不包括在内。生物大分子的前体及降解产物是真正的代谢物。代谢过程中在酶作用下生成或转变的小分子化合物也称作代谢物。
什么是代谢物?
代谢物(metabolite)亦称中间代谢物,是指通过代谢过程产生或消耗的物质,生物大分子不包括在内。生物大分子的前体及降解产物是真正的代谢物。代谢过程中在酶作用下生成或转变的小分子化合物也称作代谢物。
代谢物的概念
代谢物(metabolite)亦称中间代谢物,是指通过代谢过程产生或消耗的物质,生物大分子不包括在内。生物大分子的前体及降解产物是真正的代谢物。代谢过程中在酶作用下生成或转变的小分子化合物也称作代谢物。
Agilent单四级杆质谱仪的主要特点与功能简介
Agilent单四级杆拥有不同性能级别的配置选择,是一款非常灵活的分析平台,可从基础配置到高级高灵敏度配置进行升级,以便在需要时提升性能,随时准备适应法规中的不断变化。单四极杆旨在满足分析需求不断发展的的常规实验室,可延长运行时间并具有的稳定性,限度地提高样品通量,同时提供易于使用的常规智能工具,
什么叫抗代谢物及抗代谢物的作用机理?
抗代谢物是指在微生物生长过程中常常需要一些生长因子才能正常生长,可以利用生长因子的结构类似物干扰机体的正常代谢,以达到抑制微生物生长的目的。一些与酶的正常底物或中间产物结构类似的物质,能与酶的正常底物或中间产物竞争酶活性部位使反应停止,从而阻断代谢途径。可用于抑制微生物生长,在治疗由病原微生物引起的
科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库!
日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。 代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围