细胞蛋白水平与mRNA丰度间的依赖关系(一)

近20年来,高通量技术的发展支持了大规模的基因组、转录组和蛋白质组定量分析。这些数据被用来分析在不同系统和条件下转录组与蛋白质组的定量关系。这些研究有时候会导致一些冲突的结论,尤其是究竟在何种程度上mRNA的量控制了蛋白质的量。基础生命科学研究和转化生命科学研究的一个核心问题是:基因组信息是如何通过自身的表达来决定表型的。中心法则将DNA、RNA和蛋白质这三种分子紧紧联系在了一起。来源于同一基因座的转录本的量与蛋白的量之间的关系并不简单。蛋白的表达水平除了被转录本的量调控以外,还存在其他许多重要的调控途径。这些途径包括(1)翻译率:翻译率受到mRNA序列的显著影响,比如上游的开放阅读框,内部的核糖体结合位点;(2)翻译率的调控:调控的方式有蛋白结合到转录本上的调控原件,非编码RNA的结合,转录本与核糖体的结合能力;(3)蛋白质的半衰期:泛素化途径的降解或者细胞自噬不依赖于转录本的量;(4)蛋白质合成的延迟:蛋白合成需要时间,因此......阅读全文

mRNA-显示蛋白的筛选与扩增实验

实验方法原理 实验材料 纯化的 mRNA 显示蛋白试剂、试剂盒 NaOHHClNaClMgCl2 乙醇1-丁醇苯酚 氯仿 异戊醇EDTAPCR 缓冲液ATP 琼脂糖ATP-适配体筛选结合缓冲液ATP-适配体筛选洗脱缓冲液鲑精 DNABSA3'引物5'引物Taq DNA 聚合酶仪器、耗

自由度的大小与卡方检验结果的显著水平有什么关系?

自由度的大小与卡方检验结果的显著水平有以下关系:一、对临界值的影响随着自由度的增大,卡方分布的曲线逐渐变得更加平缓,峰值向右移动。这意味着在相同的显著水平下,自由度越大,对应的卡方临界值就越大。例如,在显著水平为 0.05 的情况下,当自由度为 2 时,卡方临界值可能是 5.99;而当自由度为 10

细胞的形态和功能间有什么关系

细胞的形态结构决定了细胞的功能;细胞的功能反映了细胞的形态结构。例子:红细胞扁圆形,有利于红细胞穿过毛细血管壁为组织细胞提供氧气;神经细胞细长形,“长发飘飘”,可以快速传递神经冲动信号!精细胞蝌蚪形,可以快速移动寻找卵细胞,与之结合受精!

细胞与原子的关系

  一、细胞和原子的关系:   细胞由各种物质构成,物质由分子构成,分子由原子构成。有些物质直接由原子构成,如一个氧气分子由两个氧原子构成。  二、细胞与原子的大小比较: 细胞 > 原子

蛋白质组学牛人Nature发表重要成果

  第一次结合两种新兴的大规模实验技术:多通道质谱分析法和具有高水平自然遗传多样性的小鼠种群,哈佛医学院(HMS)和Jackson实验室(JAX)的研究人员解决了生物学和医学中一个悬而未决的问题:遗传变异是如何影响蛋白质水平的?  蛋白质是构成所有细胞和生物结构与功能“零件表”的氨基酸链。因此,了解

血管生成细胞外囊泡的分泌依赖于这一蛋白!

  肿瘤缺氧是实体肿瘤的一个标志,与肿瘤进展、转移发展和治疗抵抗有关。作为对缺氧的反应,肿瘤细胞分泌促血管生成因子,诱导血管形成,恢复缺氧区域的氧气供应。细胞外小泡(EVS)是肿瘤微环境中细胞间通讯的媒介。在这里,作者证明了LC3/GABARAP蛋白家族成员GABARAPL1的表达增加是内体成熟、分

面粉粗细度与面粉白度的关系研究

面粉的品质检测项目较多,比如使用电动验粉筛测定其粗细度,面粉粗细度一般用留存或通过的筛孔来表示,所以现在多是使用电动验粉筛来进行测定,对于通用面粉来说,不同加工精度面粉,面粉的粗细度也不一样。面粉的等级越高,面粉也越细。使用白度仪测定其白度等,那么面粉粗细度与面粉白度有没有什么关系呢?借助电动验粉筛

智能白度测定仪分析面条白度与蛋白质的影响关系

  面条是人们喜爱的食物之一。面条的品质受很多因素的影响。在人们对食物的追求更为精细的时代,面条的白度也在影响着面条的价值。智能白度测定仪分析面条色泽受多种因素的影响,如面粉白度、灰分含量、出粉率、面粉颗粒大小、发芽损失率、蛋白质含量、和面加水量及酶类等。面条白度与面粉白度呈极显著正相关,粉色白的面

细胞化学基础分子间​三种力的关系

极性分子与极性分子之间,取向力、诱导力、色散力都存在;极性分子与非极性分子之间,则存在诱导力和色散力;非极性分子与非极性分子之间,则只存在色散力。这三种类型的力的比例大小,决定于相互作用分子的极性和变形性。极性越大,取向力的作用越重要;变形性越大,色散力就越重要;诱导力则与这两种因素都有关。但对大多

细胞水平的代谢调节(一)

  一、细胞内酶的分隔分布  从物质代谢过程中可知,酶在细胞内是分隔着分布的。代谢上有关的酶,常常组成一个酶体系,分布在细胞的某一组分中,例如,糖酵解酶系和糖元合成、分解酶系存在于胞液中;三羧酸循环酶系和脂肪酸β-氧化酶系定位于线粒体;核酸合成的酶系则绝大部分集中在细胞核内。这样的酶的隔离分布为代谢

细胞凋亡检测方法总览(早期检测、晚期检测和mRNA水平)

细胞凋亡的检测方法,从大类上还可以分为早期检测、晚期检测和mRNA水平的检测。一、早期检测1、PS(磷脂酰丝氨酸)在细胞外膜上的检测2、细胞内氧化还原状态改变的检测3、细胞色素C的定位检测4、线粒体膜电位变化的检测二、 晚期检测1、TUNEL2、LM-PCR Ladder (连接介导的PCR检测)当

有关电平参数间的关系

  对于一般的逻辑电平,以上参数的关系如下:  Voh > Vih > Vt > Vil > Vol。  6:Ioh:逻辑门输出为高电平时的负载电流(为拉电流)。  7:Iol:逻辑门输出为低电平时的负载电流(为灌电流)。  8:Iih:逻辑门输入为高电平时的电流(为灌电流)。  9:Iil:逻辑门

新方法快速可靠地定量单细胞中的mRNA和蛋白

  在单细胞水平上分析基因表达是一项艰巨的任务,往往需要专门的设备。为此,加拿大麦吉尔大学的研究人员开发出一种快速可靠的方法,能够定量单细胞内多个基因的mRNA和蛋白水平。  通过揭示细胞之间的个体差异,单细胞分析克服了细胞异质性的问题。不过,在单细胞水平上分析基因表达是一项艰巨的任务,往往需要专门

白度仪分析面粉灰分与白度的关系

      面粉是我们常吃的主要粉类粮食,人们对面粉品质的追求,主要根据感观来的。总是觉得面粉的白度越白,面粉品质越好。但是,面粉的白度也是受很多因素影响的。一般来讲,面粉的白度和灰分是统一的,即灰分低面粉就白,面粉白灰分就低。在生产高等级面粉即灰分低于0.50%以下时是这样的。但在生产普通标准粉、

细胞间有传递致癌蛋白的“木马”

  据美国物理学家组织网报道,北卡罗莱纳大学科学家的一项最新发现显示,细胞感染人类疱疹病毒(EBV)后,会产生小泡或被称为外体的液囊,从而改变细胞中所含的蛋白质和RNA(核糖核酸)。这种变质的外体一旦进入健康细胞,就能转变细胞的良性生长方式,使之变成不可控的致癌生长。这一发现刊登于美国

新技术助力多种肿瘤内细胞丰度的精准预测

11月8日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所副研究员李雪飞团队与香港浸会大学副教授田亮团队展开合作的最新成果发表于《美国科学院院刊》。合作团队开发了一种基于深度学习与公开单细胞数据集的解卷积算法,能够较精确地估算19种实体肿瘤中16种细胞类型的丰度。肿瘤微环境是一个由多种类型细胞组成的复

转氨酶水平与肝功能状态的有关系介绍

  ①转氨酶水平正常,肝脏损害持续存在。见于某些肝炎病人,比如慢性乙型肝炎病毒携带者,乙型肝炎病毒指标一直阳性,但转氨酶从来没有升高过,有的已经发生了纤维化,甚至肝硬化和肝癌;还有不少急性和慢性丙型肝炎病人也有类似情况。  ②转氨酶水平很高,但不过是一时性的,不会给肝功能造成很大影响,后果也不很严重

胰岛素与血糖水平的关系是什么?

  胰岛素与血糖水平之间存在直接的调节关系。  胰岛素是由胰腺分泌的一种激素,它的主要作用是降低血糖水平。当您摄入食物后,食物中的糖分被转化为葡萄糖进入血液,这时血糖水平上升。为了维持血糖在正常范围内,胰腺会分泌胰岛素。胰岛素可以帮助身体的细胞吸收血液中的葡萄糖,将其转化为能量或储存起来,从而降低血

Klotho水平与胰岛素抵抗的关系研究概况

  Klotho基因(KL)是Kuro等于1997年发现的与衰老有关的新基因。近年来,发现KL在胰岛素和胰岛素样生长因子-1(IGF-1)信号通路中起到重要的调节作用,认为是反应IR的良好指标。近年来,KL与T2DM的相关性研究受到越来越多的关注。  兰丹凤等探讨血浆Klotho(KL)水平与IR的

​蛋白聚糖与疾病关系

动脉壁中的氨基聚糖及蛋白聚糖是引起低密度脂蛋白及钙沉积的内在因素。动脉壁中硫酸皮肤素的含量随年龄的增长而增多,而且可在生理性pH及离子强度下与低密度脂蛋白结合。有动脉粥样硬化斑块的主动脉组织中可见硫酸皮肤素含量异常增高,由病变部位增殖的平滑肌细胞产生。蛋白聚糖还与肿瘤的发生及转移有关。在一些肿瘤,如

细胞周期蛋白的表达水平异常与哪些疾病相关?

细胞周期蛋白的表达水平异常与多种疾病相关,尤其是肿瘤:癌症:许多肿瘤细胞中细胞周期蛋白的表达出现异常。例如,Cyclin D 过表达常见于乳腺癌、淋巴瘤等;Cyclin E 过表达与乳腺癌、胃癌等多种癌症有关。这些异常表达会导致细胞周期调控失衡,细胞过度增殖,促进肿瘤的发生和发展。神经退行性疾病:如

置信区间与置信水平关系分析

置信区间与置信水平关系分析美国做了一项对总统工作满意度的调查。在调查抽取的1,200人中,有60%的人赞扬了总统的工作,抽样误差为±3%,置信水平为95%;如果将抽样误差减少为±2.3%,置信水平降到为90%。则两组数字的情况比较如下:抽样误差置信水平置信区间间隔宽窄度±3%95%60%±3%=57

细胞分裂与细胞分化的关系

细胞分化不是单个细胞的变化,细胞必须经过细胞分裂,达到一定数目才能进行细胞分化,也就是说细胞分化是以细胞分裂为基础的,两者相伴相随常常是细胞一边分裂一边分化,随着细胞分化的进行细胞分裂能力逐渐下降,最后高度分化的细胞失去分裂能力。

面粉粗细度与白度之间有关系吗?

概述 小麦是世界各地广泛种植的粮食作物之一,将小麦磨成粉,可以制作各种面制食品,馒头就是其中之一。有人认为,小麦磨粉机粉碎的小麦粉越细,其白度越高,是否是这样呢?本文通过圆形验粉筛研究面粉粗细度与面粉白度之间有何关系。 实验过程           面粉的粗细度可用圆形验粉筛进行检

同位素丰度的规律

同位素丰度有以下规律:①原子序数在27号以前的元素中,往往有一种同位素的丰度占绝对优势。如N为99.64%,N为0.36%。大于27号的元素同位素的丰度趋向于平均,如锡的10种天然同位素中丰度最大的是Sn,为32.4%。②原子序数为偶数的元素中,往往是偶数中子数同位素的丰度大。如硫的天然同位素中,呥

丰度的概念和表示方式

丰度,是指一种化学元素在某个自然体中的重量占这个自然体总重量的相对份额(如百分数)。丰度表示方法主要分为重量丰度、原子丰度和相对丰度。

土壤中有机氯含量与土壤理化指标间的关系

关于TOC、含水率、粘土矿物对有机氯农药在土壤中的迁移转化规律的影响,本研究采用统计分析软件研究了土壤剖面上有机氯农药含量与3种理化参数之间的相关关系。5.5.2.1污灌区由于积差相关系数的大小并不能完全代表相关性的强弱,因此在对污灌区进行简单相关分析的基础上,进行偏相关分析,即在没有其他因子影响下

癌症与微卫星不稳定性之间的依赖关系

  合成致死性(synthetic lethality)---两个遗传事件之间的相互作用,通过这种相互作用,这两种遗传事件的共同发生导致细胞死亡,但每个事件单独发生则做不到这一点---可用于癌症治疗。DNA修复过程提供了有吸引力的合成致死靶标,这是因为许多癌症表现出DNA修复途径的破坏,这可能导致对

相对丰度计算公式

相对丰度又称同位素丰度比(isotopic abundance ratio),指气体中轻组分的丰度C与其余组分丰度之和的比值。 在生态中相对丰度:群落内物种数目的多少。不同的群落中物种丰度是不同的,从赤道到南北极,群落的物种丰度逐渐减少。物种丰度(species richness)越大,其结构就越复

白度仪分析馒头白度与加工工艺的关系

  消费者对馒头品质和感官指标要求(如馒头白度)的逐步提高,促使面粉厂家及馒头生产企业通过添加各种漂白剂及增白剂以达到提高馒头白度的目的。但是,食品安全日益被关注的今天,提高馒头白度需要靠加工工艺,而不是添加剂。馒头加工工艺中汽蒸压力和时间对馒头白度的影响,找出汽蒸压力和汽蒸时间与馒头白度的关系和最