基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定(二)

表1 有效梯度内的采集数据分析 表2 HeLa和酵母样本全蛋白鉴定结果 2.2 HeLa和酵母蛋白质组快速鉴定结果 数据经SEQUEST HT搜库和Percolator卡值, 从1 μg和50 ng HeLa样本中分别鉴定到20860和14100条肽段(q值0.01), 分别对应3865和2877个非冗余蛋白(表2), 而同样的鉴定数量, 目前的报道至少需要2~3h[9]. 另外, 酵母样本共鉴定到15083条肽段(q值0.01), 对应2697个非冗余蛋白(表2). HeLa数据进一步使用Preview软件分析谱图质量精度(图2). 结果显示, 母离子(m/z)质量精度平均为0 ppm, 子离子质量精度(m/z)平均为0.075 Da. 轨道肼质量偏差基本保持在5 ppm以内, 具有高质量精度和长期稳定的质量轴; 离子阱质量偏差基本保持在±0.2 Da以内, 质量精度良好,......阅读全文

钱小红:基于生物质谱进行蛋白质组定性和定量的策略

军事医学科学院 钱小红研究员  2014年4月26日,首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自军事医学科学院的钱小红研究员为大家带来题为《Biological mass spectrometry based strategies for qu

基于气相色谱–高分辨-Orbitrap-质谱技术的高效大...(二)

Q Exactive GC 系统在 EI 全扫模式下运行,分辨率为 60,000(FWHM,m/z 200)。此外,还以 15K、30K 和 120K  等不同分辨率进行了其它实验。色谱数据采集确保不少于每峰 11 个点,以保证峰面积积分的准确性。 数据处理数据采集和处理使用Thermo Scien

靶向代谢组学新质生产力-—-岛津专利全谱二维液质联用技术来了!

  01 导语  在靶向代谢组学检测中,样品基质通常较为复杂,所需分析的化合物数量多、极性范围广。当各目标物极性差异过大时,往往难以通过单一方法完成所有目标化合物的分析。通常采用两种样品前处理方式、两种分析方法和两种色谱柱,分别完成强极性和弱极性物质的分析。这种方式耗时耗力,且可能产生冗余数据,不利

质谱技术在蛋白组研究中的应用(二)

6 质谱仪的最新进展 用质谱检测蛋白,首先考虑到用PMF与 MALDI-TOF联用,如果无法检测,下一步就用ESI-MS/MS创建序列标签。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分样本就足以检测,剩下的样本就可以用来创建序列标签。并且,在MALDI-TOF仪器上,用一种叫做“源后延迟”

水生所在原核生物的蛋白基因组分析研究中取得进展

  蛋白基因组学(Proteogenomics) 是基于高精度的串联质谱数据对基因组进行注释,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和模式,还能提供蛋白质组层面特有的信息,如翻译后修饰、信号肽等。目前,蛋白基因组学已成为功能基因组学研究不可或缺的重要工具。然而,对海量质谱数据实现全面和精准的解读仍是当前蛋

上海有机所发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术

  中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库(AllCCS),并开发出基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术,用于生命体内已知和未知代谢物的化学结构鉴定。  离子淌度质谱(Ion Mobility-Mass Spectrometry)

典型case分享-|-基于质谱的蛋白质O糖基化分析

生物体内的糖基化修饰越来越受到关注,糖基化修饰主要分为N糖和O糖。对于哺乳动物而言,常见的O糖以连接在丝氨酸或苏氨酸的N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)为基础,在酶的作用下进一步转移半乳糖或N-乙酰葡萄糖胺等糖基,从而形成四种核心结构。在这四种核心结构的基础上,已合成的糖苷还可以在酶的作用下进一步转移

葛峰课题组最新文章发布原核生物的蛋白基因组分析软件

  蛋白基因组学(Proteogenomics) 是基于高精度的串联质谱数据对基因组进行注释,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和模式,还能提供蛋白质组层面特有的信息,如翻译后修饰、信号肽等,目前 已成为功能基因组学研究不可或缺的重要工具。然而,对海量质谱数据实现全面和精准的解读仍是当前蛋白基因组学研

联川生物与布鲁克深入交流,共同推进蛋白质组学和代谢组学快速发展

  2025年8月14日杭州,杭州联川生物技术股份有限公司(以下简称“联川生物”)与布鲁克公司(以下简称“布鲁克”)在联川生物进行交流和洽谈深入合作。  联川生物作为多组学科研服务行的领军企业,近年来以其高质量的组学数据为发展的驱动力,在组学科研服务业务快速增长。布鲁克以持续开发领先的分析技术为使命

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术

2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享

质谱解析(二)

常用离子源详解 电子轰击电离(Electron Impact Ionization, EI) 质谱中最常用的离子源,一般为70 eV的电子束,远大于大多数有机化合物的电离电位(7~15 eV),会使相当多的分子离子进一步裂解,产生广义的碎片离子。 优点:1)结构

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

质谱鉴定微生物的原理

  在应用MALDI-TOF MS时,通常将微生物样本与一种饱和的低分子量无机化合物溶液(称为基质)进行混合加在靶板上,待干后样本与基质共结晶后形成了以基质包裹构架的样本固体沉淀。样本基质结晶体经激光辐射,基质从激光中吸收能量使样品吸附,基质与样品之间发生电荷转移使得样品分子电离,离子在加速电场下获

品茗论谱-|-第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究

2024年4月2日,SCIEX举办的“第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究”在春意盎然的西湖畔顺利落幕。来自复旦大学的特聘教授唐惠儒教授和西湖大学郭天南教授、浙江大学的徐飞教授和王保红教授等浙江省内30余位质谱专家学者莅临沙龙;来自SCIEX全球和中国区的领导也参加沙龙交流。 沙龙伊

布鲁克与景杰生物联合-推动前沿单细胞蛋白质组学研究

分析测试百科网讯 2021年10月14日,在第十一届中国蛋白质组学大会召开期间,为推动单细胞蛋白质组学的发展,拓展单细胞研究的视野,布鲁克和景杰生物联合举办了“单细胞蛋白质组学专题卫星会”,并在线上进行了直播。卫星会现场布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生布鲁克.道尔顿中国区经理何磊先生首先致欢迎辞,他

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

瑕瑜:用化学反应的灵感改造质谱-解决脂质组学的难题

  质谱在现代科学研究中正发挥着日益重要的作用。分析化学家使用质谱,研究基础科学和应用技术领域的挑战性课题,做出有影响力的工作。随着社会与经济的迅猛发展,科学仪器研发与应用研究从未像今天这样如此紧密地联系在一起。对质谱而言,仪器研发、分析方法与应用研究正成为相互推动、共同发展的有机整体。质谱仪器或关

基于高分辨质谱的组学分析方法在白酒香型鉴别...(一)

基于高分辨质谱的组学分析方法在白酒香型鉴别中的应用1.引言白酒在中国有着悠久的生产历史, 是我国优秀而宝贵的民族遗产,与白兰地、威士忌、伏特加、朗姆酒、金酒并列为世界6大蒸馏酒。我国固态发酵白酒质量的影响因素很多, 每个生产批次所产酒的酒质是不一致的。为了统一达到本品所固有的各种微量成分和它

APAF选择TripleTOF-5600系统推进蛋白质组学研究

  全球生命科学分析技术的 领导者AB SCIEX公司,今天宣布,澳大利亚的蛋白质组分析中心(APAF)选择了AB SCIEX TripleTOF 5600系统,通过显著增加蛋白质组覆盖率来帮助推进蛋白质组学研究。TripleTOF 5600 系统是生命科学产业界最快、最灵敏的高分

脂质组-LC/MS自动化鉴定及相对定量(二)

第 1 步 数据分析模块 — 峰提取 • 原始数据文件读取• 智能峰提取 整合于 LipidSearch 软件中的峰提取引擎能够处理不同 MS 实验和仪器平台采集的数据。综合独特的峰提取算法、区分不同实验和仪器类型、整合先进的谱图处理功能,最终确保精确的谱峰提取。 第 2 步 鉴定模块 — 脂质鉴定

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学驱动的精准医学(A)

  2025年10月13–14日,在第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会上,以“蛋白质组学驱动的精准医学(Proteomics-Driven Precision Medicine)”为主题的分会于梅州厅举行。会议由中国人民解

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

蛋白质组学发文章的四重境界(二)

译文:细胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能验证。遥想当初,很多老师意气风发砸钱做芯片,数据堆积如山,一脸懵逼。然而如今世风日下,基因芯片灌水发文章很难上5分,怎么将课题继续下去?其实芯片数据结合蛋白质组学可以玩出新花样,比如下面这篇:Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5

植物蛋白质组学和糖基化(二)

4. 注释( 1 ) 每个实验均使用新鲜的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化试剂。( 2 ) 要仔细识别蛋白质印迹,因为 WGA 既能识别 N-糖苷的 GlcNAc,也能识别 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纤维素印迹膜上封闭结合位点的溶液应避免糖蛋白污染。所以我们建议在这一步骤中使

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料:修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒:消化缓冲液                                                                  萃取液                                                          

利用纳升级液相色谱-串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝 G-250

利用纳升级液相色谱--串联质谱进行蛋白质鉴定实验

实验材料 修饰胰蛋白酶试剂、试剂盒 消化缓冲液萃取液清洗液脱色液仪器、耗材 多通道移液枪Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管实验步骤 3.1 胶内蛋白的水解和多肽的提取(一天的实验方案)对于从 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 电泳(经考马斯亮蓝

2025-AOHUPO-|-布鲁克质谱技术午餐会:4D多组学解决方案引领蛋白质组学研究

2025年10月12日至14日,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会在广州隆重召开。本次大会以“探索蛋白质宇宙:迈向新生物学和精准医学”为主题,汇聚了来自20多个国家和地区的近2000名科学家、临床医学专家及产业界领袖,共同

2014年度北京质谱年会大会报告

  2014年度北京质谱年会于2014年3月21~22日在北京拉斐特城堡酒店隆重开幕。本次质谱年会由北京理化分析测试技术学会北京质谱分会主办,国家大型科学仪器中心北京质谱中心协办。来自各大科研机构、院校、厂商的科研工作者们近400人参加并聆听了年会开