DNA&RNA寡聚核苷酸的准确分子质量测定(一)

1. 前言随着人们对核酸结构和功能的深入了解,特异性结合或者裂解致病基因的核酸药物也逐渐成为了药物研究的新热点, 核酸药物的作用效率高、应用范围广,可以对传统药物进行补充,并且在前期的临床诊断中也可以起到重要的指示作用。核酸药物主要是指各种具有不同功能的寡聚核糖核苷酸(RNA)或者寡聚脱氧核糖核甘酸(DNA),主要作用于基因水平,在信息流传递的上游阶段起作用,效率比较高,且通过结合或者裂解特异性的致病基因,而对其它基因没有任何影响。在信息流的传递过程中,信号逐级放大,一个基因可以转录出多个 mRNA,一个 mRNA 又可以翻译出多个蛋白质,所以与作用于信息流最终产物-蛋白质相比,核酸药物具有广泛的应用前景。目前的核酸药物可以与一些转录因子、凝血酶、人类免疫缺陷病毒、双链 DNA 的特殊部位等结合,从而抑制 DNA 的复制或者蛋白、受体等的结合,从而干扰和阻止病毒或者错误基因和蛋白的表达和放大,因此在基因药物的......阅读全文

现在有哪几种PCR的方法

Qβ复制酶反应Kacian等于1972年首次报报Qβ复制酶催化RNA模板的自我复制功能,它能在常温30min,将其天然MDV扩增至109.1986年Chu等报道用生物标记的靶序列特异性探针,可与亲和素联接的MDV杂交,经洗脱未被结合的MDV后,再加入Qβ复制酶,扩增复制MDV拷贝,然后用溴乙锭染色检

早期诊断:让微RNA发光,改变液体活检的纳米技术

  在癌症早期诊断领域,通过检测血液或尿液中与肿瘤相关的生物标记物来诊断癌症的液体活检与传统活检相比侵入性更低,更为经济省时,需要专业技能也较少。循环DNA(circulating DNA),微RNA(microRNA, miRNA),和其它非编码RNA都可以成为与疾病相关的生物标记物。日前,美国纪

单细胞测序,解密小RNA分子的未知功能

随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘,单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院( Karolinska Institute)的研究人员近日公布了一种新方法,这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列,有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结

Journal-of-Neurosci:微小RNA分子调节应激的行为反应

  慢性压力会影响我们的情绪和行为。神经精神科和行为神经遗传学的科学家们研究了大脑如何响应应激的分子机制。对于第一次,他们可以将应力相关的脑区域中微小RNA分子miR19b水平的变化,与小鼠异常行为联系起来。这些发现有助于更好地了解我们的大脑应对压力的办法。  各地阿龙Alon Chen陈导演的“马

分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍

在DNA序列未知而必须首先进行克隆以便绘制酶谱和测序时,也常应用克隆。克隆探针一般较寡核苷酸探针特异性强,复杂度也高,从统计学角度而言,较长的序列随机碰撞互补序列的机会较短序列少,克隆探针的另一优点是,可获得较强的杂交信号,因为克隆探针较寡核苷酸探针掺入的可检测标记基因更多。但是,较长的探针对于靶序

分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍

RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。这类RNA探针主要用于研究目的,而不是用于检测。例如,在筛

同聚物加尾法的概念

所谓同聚物加尾法就是利用末端转移酶在载体及外源双链DNA的3’端各加上一段寡聚核苷酸,制成人工黏性末端,外源DNA和载体DNA分子要分别加上不同的寡聚核苷酸,如dA(dG)和dT(dC),然后在DNA连接酶的作用下连接成为重组的DNA。

sanger和他的DNA测序方法

Sanger酶学法sanger是英国生物化学家,1918年8月13日生于英格兰格洛斯特夏郡,在剑桥大学圣· 约翰学院获哲学博士学位,毕业后到著名的剑桥医学研究会分子生物学实验室工作。Sanger的工作主要研究蛋白质的结构,特别是研究测定胰鸟素分子的结构,成功地测定了胰鸟素的精细结构,因而获得了195

总DNA质量检测及酶切

实验目的:了解掌握检测 DNA 质量的方法以及 DNA 定量的方法;了解影响 DNA 在琼脂糖凝胶中泳动速率的因素;训练 DNA 的琼脂糖凝胶电泳操作及 DNA 的限制性内切酶操作。实验原理:限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。

质粒DNA质量如何评估才可靠?

质粒抽提过程中有很多步骤会影响最后的产量和质量,那么如何评估质粒DNA的产量和质量呢?目前使用分光光度法定量质粒DNA和通过琼脂糖凝胶电泳进行质粒DNA产率和质量的分析是两种最常用的方法。溶液中的核酸浓度可通过260 nm的吸光度方便地进行计算。A260的数值处于0.1至1.0之间时测量结果具有良好

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA(一)

基因组DNA的提取概 述基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DN

重组质粒的筛选与鉴定

摘要: 可以在蛋白质水平和目的基因功能水平等各个层次鉴定重组子。可以在 蛋白质 水平和目的基因功能水平等各个层次鉴定重组子.基因水平的鉴定有酶切鉴定、 PCR 鉴定、核酸杂交和基因序列分析等.蛋白质水平鉴定有插入失活双 抗生素 对照筛选(例如 Te

兔肝RNA的制备及测定

实验原理: 细胞内大部份RNA均与蛋白质结合在一起,并且多以核蛋白的形式存在。因此,分离制备RNA  时,首先遇到的是必须使RNA与蛋白解离,并除去蛋白质。由于RNA的种类来源和存在形式不同,所用的制备方法各异,一般常用的方法有,盐酸胍法,去污剂法和苯酚法。其中,以苯酚法使用较为广泛。产品纯度高,适

RNAseq综述(一)

摘要在过去的十年中,RNA测序(RNA-seq)已经成为在全转录组范围内分析差异基因表达和mRNAs差异剪接的重要工具。然而,随着下一代测序技术的发展,RNA-seq技术也在不断发展。现在,RNA-seq用于研究RNA生物学的许多方面,其中包括单细胞基因表达、翻译(翻译组,translatome)和

环状RNA研究方法(一)

至2015起云序生物已经完成10000+例环状RNA全转录组测序服务,涵盖了50+疾病,20+物种,帮助众多客户在环状RNA分子的研究中取得突破性进展。客户发表的环状RNA文章高达20篇以上。此外云序生物还提供环状RNA机制研究手段,rip&RNA pull down技术,帮助客户冲刺高分机制文章。

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

RNA提取过程中如何去除DNA污染

方法:1、使用DNA酶DNAse I 消化1小时,恒温37度。2、离心取上清的时候,一定要小心不要取到中间的膜和下面的液体。3、直接加NaOH溶液与提取液混合搅拌,然后离心就可以了.因为RNA可溶于NaOH溶液,而DNA不可溶,离心后的上清液就不含有DNA了。

高通量RNA干扰技术筛选DNA损伤实验

目前,将RNAi库和基于细胞水平的高通量分析技术相结合对于我们鉴定药物敏感性和抵抗性的新机制有非常广阔的前景。举例来说,已有研究者对全基因组进行RNAi筛选找出了导致非小细胞肺癌对紫杉醇敏感的基因。这项研究也证实了RNAi技术在发现影响癌症细胞细胞有丝分裂的靶点上具有很大潜力。 Molecular

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

DNA芯片技术和RNA测序有啥不同?

 日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界:日本政府秘密建立名为“白金数据”的数据库。该库搜集了全国人民的DNA数据,通过对犯罪分子留在现场的毛发、体液等证物进行比对,警方可以高效、快速、准确锁定真凶。借助“白金数据”的帮助,一个检举率100%、冤案率0%的理想法制社会构建完

探索小分子RNA-OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制

华南植物园探索小分子RNA OsmiR393调节水稻分蘖、耐旱的分子机制        小分子RNA(MicroRNA)是一类内源非编码的单链小分子RNA(21~24nt),以序列特异性的方式在转录、转录后和翻译水平上对靶基因表达进行调控,是生物体内基因表达自我调控的一种重要手段。miR3

DNA探针的种类及其特点

核酸探针按性质划分可分为基因组 DNA 探针、cDNA 探针、RNA 探针和人工合成的寡核苷酸探针等几类。作为诊断试剂,较常使用的是基因组 DNA 探针和 cDNA 探针。其中,前者的应用最为广泛,它的制备可通过酶切或聚合酶链反应(PCR)从基因组中获得特异的 DNA 后将其克隆到质粒或噬菌体载体中

Northern杂交试验指导手册(2)-RNA质量检测

二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1ml

从土壤中轻松获取高质量RNA

详细介绍:从土壤中轻松获取高质量RNA众所周知,从土壤中提取DNA已非易事,而想从中再提取RNA可说是难上加难。DNA不容易提取是因为本身土壤中富集的材料就少,提取过程相对复杂,造成操作损失;而RNA不容易提取除了以上所提到的原因外,还有一个很关键的原因——无处不在的RNA酶,对RNA的稳定存在构成

琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量

一.原理带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。其中,凝胶电泳由于其操作简便、快速、灵敏等优点,使它成为分离、鉴定和提纯核酸的首选标准方法。与蛋白质分子类似,核酸分子也是两性解离分子。在pH3.5时,碱基上的氨基基团解离,而三个磷酸基团中只有第一个磷酸解离,整个分子带正电荷,在电场中向负极泳动;在p

核酸分离与纯化的设计与原则

细胞内的核酸包括DNA与RNA两种分子,均与蛋白质结合成核蛋白(nucleoprotein)。DNA与蛋白质结合成脱氧核糖核蛋白(deoxyribonucleoprotein,DNP),RNA与蛋白质结合成核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)。其中真核生物的DNA又有染色体DNA

核酸分离与纯化的设计与原则

细胞内的核酸包括DNA与RNA两种分子,均与蛋白质结合成核蛋白(nucleoprotein)。DNA与蛋白质结合成脱氧核糖核蛋白(deoxyribonucleoprotein,DNP),RNA与蛋白质结合成核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)。其中真核生物的DNA

微RNA检测新方法:纳米技术改变液体活检

  日前,美国研究人员利用单壁碳纳米管的光谱特性研制了一种能直接检测体液中微RNA的纳米传感器。这种传感器弥补了传统微RNA检测方法的缺陷,有望帮助医疗人员对患者进行早期诊断。  在癌症早期诊断领域,通过检测血液或尿液中与肿瘤相关的生物标记物来诊断癌症的液体活检与传统活检相比侵入性更低,更为经济省时

基因芯片技术简介和应用展望(一)

基因芯片(Gene Chip)通常指DNA芯片,其基本原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然后与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛化到生物芯片(biochip)、微阵列(Microarray)、DNA芯片(DNA chip),

水分测定仪如何准确操作

水分测定仪的使用方法:   预热调零:由于天平是不等臂上皿式,工作时秤盘在干燥箱内上下运动,时间一长,干燥箱内秤架热量会传至横梁一端,使横梁一臂受热产生膨胀伸长,改变常温下平衡力矩,使天平零位改变,产生天平误差。   加热测试:天平经预热调零后,取下l0g砝码,把预先称好的试样物质均匀地倒在秤盘内(