Cas9也可以用来找药靶?(一)

去年10月份季博分享了一篇文章“Cas9与耐药基因研究是啥关系”,介绍的是张锋的两篇文章,2014年的Science,2015年的Nature。讲座中,季博给大家简单分析了这两篇文章,两篇文章用的思路都一样,连细胞和药物都一样。按道理,14年Science收了,15年同档次的Nature是不会再收了,但Nature还是收了。为啥呢?因为这两篇文章的思路真的是非常棒,对于现在的精准医疗研究来说真的是雪中送炭。所以今年在“精准医疗中我们需要怎么做”系列文章中(文末有文章链接哦~),季博特别介绍了这个思路。简单回顾一下,以Science为例。黑色素瘤细胞加入药物,细胞会死掉。文章中在加入药物之前,把Cas9的敲除慢病毒库感染细胞(Nature用的是Cas9-SAM过表达库),然后再加药,看有啥细胞活下来了,把活下来的细胞测序看看是什么基因被敲除了。这些基因就是敲除后导致耐药的基因。虽然发的都是Science和Nature,这两个研究都......阅读全文

Cell子刊:组织特异性的CRISPR载体

  细菌一直在与病毒或入侵核酸(质粒)进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制。CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。在CRISPR和Cas的帮助下,细菌可以经由小RNA分子的引导,靶标和沉默入侵者遗传信息的关键部分。  现在,CRISPR与Cas9的组合已经成为了一个通用工具,被用来对真核

用CRISPR/cas9编辑精原细胞基因

  利用CRISPR/Cas9 系统对胚胎进行基因编辑,可有效地产生具有靶向基因组修饰的生物体。三月十二日在Cell子刊《Cell Reports》发表的一项研究中,来自德克萨斯大学西南医学中心、芝加哥大学和犹他大学等处的研究人员,用CRISPR / cas9技术对大鼠的精原细胞进行基因编辑,为在大

哈佛大学实验室发现CRISPR/Cas9存在严重脱靶效应

  哈佛大学David R Liu实验室利用体外筛选和高通量测序检测CRISPR/Cas9的脱靶,针对CLTA基因的四个不同靶位点共设计了八条不同序列的gRNA,即每个靶位点有两条gRNA,结果发现,四个靶位点均存在脱靶现象,脱靶效率最高可达 84%,同时CRISPR/Cas9的特异性仅与g

种植土壤检测报告满一年可以用吗

不可以。根据查询《种植土壤检测规定》得知,种植土壤检测报告满一年就不可以用了,需要重新进行检测后才可以继续使用。种植土是理化性能好,结构疏松、通气,保水、保肥能力强,适宜于园林植物生长的土壤。

Nature子刊:双功能CRISPRCas9,可同步实现基因编辑和调控

  哈佛医学院著名遗传学家George Church教授是基因编辑技术的鼻祖之一:2年前张锋使用CRISPR技术完成了多重基因组编辑,Church则使用CRISPR技术完成了RNA介导的人类基因组编辑。  自此之后,CRISPR/Cas9技术持续火爆,方便快捷的方式迅速风靡科研界,不论是医学研究,农

PNAS:利用CRISPR/Cas9开发出一种精准的基因组突变预防系统

  通用的DNA遗传编码中的单个碱基变化可导致或恶化许多危及生命的疾病。这种“点突变”能够将人体内的细胞转变为癌细胞,随后这种癌细胞继续生长而形成肿瘤,或者它们能够将将抗生素敏感性细菌转化为导致不可治愈的感染的抗生素耐药性细菌。在理想的世界中,临床医生应能够在携带着这样的有害点突变的细胞产生后立即将

PNAS:利用CRISPR/Cas9开发出一种精准的基因组突变预防系统

  通用的DNA遗传编码中的单个碱基变化可导致或恶化许多危及生命的疾病。这种“点突变”能够将人体内的细胞转变为癌细胞,随后这种癌细胞继续生长而形成肿瘤,或者它们能够将将抗生素敏感性细菌转化为导致不可治愈的感染的抗生素耐药性细菌。在理想的世界中,临床医生应能够在携带着这样的有害点突变的细胞产生后立即将

遗传发育所在植物基因组编辑突变体筛选方法研究取进展

  如何快速高效进行突变体检测和鉴定是植物基因组编辑技术迅速发展面临的重要问题之一。目前植物基因组编辑突变检测方法主要包括PCR/RE、T7EI错配切割、临界退火温度PCR (ACT-PCR)、Sanger测序和二代测序(NGS)等。以上所有的检测方法都基于PCR反应,且都有各自的不足之处。PCR/

鸡肉也含芬普尼?-台湾“食药署”下阶段抽验鸡肉

   据台湾媒体报道,台湾蛋商公会批评“食药署”拟定芬普尼容许摄入量过于严格,对此,“食药署长”吴秀梅表示,芬普尼原本就禁用于食用动物,不肖业者却用在养鸡场,最近“食药署”多次专家开会商议,未来将纳入常规检验,且标准就是参考欧盟,以仪器极限值5ppb为限。   据报道,吴秀梅指出,芬普尼属于脂溶性,

显微操作技术在基因编辑中的应用(三)

图9:ESI注入8细胞阶段的胚胎。钝端毛细管图10:EMBL转基因过程中使用的DMi8、Eppendorf TransferMan 4r显微操作器和PiezoXpert压电破膜仪。以钝端毛细管进行胚囊注射。DIC用于小鼠转基因的CRISPR/Cas 9技术用于小鼠转基因的CRISPR/Cas9技术为

来,我们介绍一种热稳定的Cas9核酸酶

  CRISPR/Cas9是一种强大的技术,适用于多个物种的基因组编辑,但不包括嗜热细菌。目前的Cas9蛋白都分离自嗜温细菌,比如,SpCas9来自化脓链球菌(Streptococcus pyogene)。这些Cas9蛋白在高温下无法很好地发挥作用,因此只能委屈嗜热细菌在较低的温度下生长。幸好,加州

用CRISPR/Cas9对CART细胞进行多重基因编辑(一)

作者:Xiaojuan Liu1, *, Yongping Zhang2, *, Chen Cheng1, 3, *, Albert W Cheng4, Xingying Zhang1, 5, Na Li1, Changqing Xia2, 6, Xiaofei Wei7, Xiang Li

进口药就一定比国产药好?

一些发达国家的药厂生产条件较好,产品的杂质含量较低,但是这不是绝对的。我国这些年来,许多药厂花了大量投资,生产条件已有很大改善,有些产品中的杂质比国外同类产品还低,质量也很好,因此不能一概而论。

进口药就一定比国产药好?

一些发达国家的药厂生产条件较好,产品的杂质含量较低,但是这不是绝对的。我国这些年来,许多药厂花了大量投资,生产条件已有很大改善,有些产品中的杂质比国外同类产品还低,质量也很好,因此不能一概而论。

全球信息化,这一“死角”也不容落下

“当前,我国网络规模全球领先,拥有全球规模最大的移动宽带和光纤网络,建成5G基站近160万个,成为全球首个基于独立组网模式建设5G网络的国家。”在5月17日举行的2022年世界电信和信息社会日大会开幕式上,工业和信息化部副部长张云明说。近年来,我国信息通信业基础设施不断完善,技术产业成熟壮大,创新应

一项有趣的实验-猴子也会做交易

据BBC报道,在距离波多黎各海岸不远的一座岛上,研究人员利用猴子开展了一项有趣的实验。这项实验涉及6只卷尾猴,研究人员以“007”系列电影中角色的名字为它们命名。研究人员训练这些猴子用小小的金属代币来交换食物,然后将它们放在临时的小型市场中,在那里研究人员将为猴子提供不同价格的不同食物。

让水稻也能像大豆一样榨油

  9日,记者从中国水稻研究所水稻生物育种全国重点实验室张健研究员团队获悉,该团队利用合成生物学手段将水稻种子油脂含量从2.3%提升至11.7%,为水稻、玉米、马铃薯、木薯等高产淀粉类粮食作物转换为油料用途提供了新的技术途径和思路。相关研究近日在线发表于《植物通讯》。  “大豆、油菜等油料作物通常具

600多个新癌症基因靶点-CRISPRCas9助力靶向药开发

  在癌症治疗研究中,科学家和制药公司一直在努力探索新的靶向疗法,选择性地杀死癌细胞,使健康组织不受伤害。目前,新靶向药物研发非常困难。一个靶向药物的研发成本约为1~2亿美元,但大约90%的药物在开发过程中失败。因此,在该过程开始时选择良好的药物靶点被视为药物研发最重要的部分。  为了提高药物研发效

Nature-Methods:Cas9大有潜力

  提到目前最热门的基因组编辑工具,非CRISPR/Cas莫属。今年以来,国内外多个研究小组聚焦这一领域,在Science、Nature和Cell等杂志上发表多项重要成果,而生物公司也迅速推出相关产品。   CRISPR/Cas系统经过改造,可实现多个哺乳动物系统内高效可靠的RNA导向基因组修饰,

什么是CRISPR/Cas9技术

CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的基因敲除、敲入或点突变。

什么是CRISPR/CAS9技术

CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。CRISPR/Cas9是细菌和古细菌为应对病毒和质粒不断攻击而演化来的获得性免疫防御机制。

crispr-cas9基因敲除原理

基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR

crispr-cas9基因敲除原理

基本原理:CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR

什么是CRISPR/CAS9技术

CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出现的一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。CRISPR/Cas9是细菌和古细菌为应对病毒和质粒不断攻击而演化来的获得性免疫防御机制。

什么是CRISPR/Cas9技术

CRISPR/Cas9系统的原理是利用gRNA特异性识别靶序列,并引导Cas9核酸内切酶对靶序列的PAM上游进行切割,从而造成靶位点DNA双链断裂,随之利用细胞的非同源末端连接(NHEJ)或同源重组(HDR)的方式对切割位点进行修复,实现DNA水平的基因敲除、敲入或点突变。

美研究发现一全新乳腺癌治疗靶点

  美国斯克利普斯研究所(TSRI)科学家的一项研究表明,一生长调节因子可作为乳腺癌的全新治疗靶点,使用SR-3029实验室化合物可显著抑制肿瘤生长。  发表在最新一期《科学转化医学》杂志上的这项研究指出,一种名为“酪蛋白激酶 1δ酶”(CK1δ)的生长调节因子可作为全新的乳腺癌治疗靶点。对于包括难

广东建立道地南药广藿香遗传转化与基因编辑体系

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518425.shtm近日,广东省农业科学院作物研究所特色作物与南药研究团队成功建立道地南药广藿香遗传转化与基因编辑体系,并通过靶向敲除PatPDS基因产生白化植物验证其有效性。相关成果发表于《园艺研究》(

基于PCR评估sgRNA特异性的方法

  CRISPR/Cas9已经成为一种通用的基因组工程工具,依赖于一个单导向RNA(sgRNA)和Cas9酶进行基因组编辑。研究人员可以用简单、快速和经济的方法来产生sgRNAs,因此能够在培养细胞、小鼠、斑马鱼和其他模型系统中进行靶向诱变。为了靶向效率,预先筛选sgRNAs,对于成功诱变和减少动物

中山大学等开发RNA编辑新工具

  CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢?  为此,5月

Science:CRISPR/Cas9大革命

        DNA编辑技术CRISPR近年来风生水起,已经开始取代了其它基因组编辑工具,如锌指核酸酶和 TALENs等。不过目前科学家们对于这一技术中的RNA引导核酸内切酶:Cas9了解的还不够多,如果能更精确的掌握这种酶在CRISPR系统中如何发挥作用的,将能提高这一技术的使用效率和