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RNAi实验原理与制备方法(二)

3.用RNase III 消化长片断双链RNA制备siRNA其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase III (or Dicer) 在体外消化,得到一种siRNAs“混合鸡尾酒”。在除掉没有被消化的dsRNA后,这个siRNA混合物就可以直接转染细胞,方法和单一的siRNA转染一样。由于siRNA混合物中有许多不同的siRNAs,通常能够保证目的基因被有效地抑制。dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因......阅读全文

RNAi 实验介绍

1. RNAi 介绍 RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导

RNAi 实验介绍

1. RNAi 介绍RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导。这个方法与常规方

Lipofectamine™2000转染Stealth™ RNA或者siRNA进入哺乳动物细胞

前言Lipofectamine™ 2000试剂是一项专利配方,用于高效转染Stealth™ RNA或者短的干扰RNA(siRNA)到哺乳动物细胞,以进行RNAi分析(1,2)。该说明书提供了一般的指导以及使用Lipofectamine™ 2000转染Stealth™ RNA或者siRNAj进入哺乳动

果蝇RNAi的实验中双链短RNA的合成(dsRNA)方法

本文来自于哈佛大学医学院果蝇RNAi筛选中心的经典实验方法,专门用于果蝇RNAi实验方法。感谢哈佛大学医学院果蝇RNAi筛选中心的支持!Primer Designed dsRNATemplate SelectionPCRIn vitro RNA TranscriptiondsRNA Pur

全球各实验室如何进行RNAi实验?

对于那些之前在研究基因功能方面受到挫折的研究人员而言,体内RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术的出现就好像是救兵一般,令人欣喜。理论上体内RNAi能进行更加细致的敲除,从而研究人员能获得时间和空间调控的基因敲除效果。 但是这并不意味着体内RNAi是一件容易完成的实验,实际上

RNAi的实验原理和操作实用技术

  几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。    此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既

RNAi的研究进展(二)

三,RNAi的应用前景RNAi 技术中的相关问题主要涉及以下几点:(1) dsRNA 序列的选择dsRNA 主要选自已知的cDNA 的开放阅读框架(ORF) 中的基因区域。为防止mRNA 调控蛋白对RISC 与靶RNA 结合的干扰,应避免选择包括:1) 起始密码子下游或终止密码的50~100 核

RNAi实验原理与方法

RNAi实验原理与方法近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(

RNAi实验原理与方法选择(二)

尽管有些公司推出了shRNA和siRNA试剂盒,但这些试剂盒大都突出操作简单,毕竟涉及RNA操作,用户自己难免会产生很多预料不到的困难,晶赛公司可以完全为您解决后顾之忧,您可以直接拿到有效的siRNA或shRNA序列。 3. Dicer酶法生产siRNA优点:可以跳过筛选与检测有效siRN

南海海洋所构建马氏珠母贝遗传图谱并发现转录调控因子

  马氏珠母贝是一种具有较大经济价值的海水养殖贝类和生产珍珠的主要母贝,也是国际上研究生物矿化机制的良好实验材料。对马氏珠母贝性状分子遗传基础和重要基因功能进行解析,将有助于推动其遗传改良技术的发展和品种创制。  近日获悉,中国科学院南海海洋研究所何毛贤研究团队利用RAD高通量SNP分型技术,构建了

RNAi实验原理与方法

实验概要进行RNAi实验实验原理通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation  and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small  interfering RN

RNAi的实验原理和操作实用技术(1)

几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既是一种了解基因功能的强大工具,又是很多生物的基因组所

RNAi的发现和起源

首次发现dsRNA能够导致基因沉默的线索来源于线虫Caenorhabditis elegans的研究。>1995年,康乃尔大学的Su Guo博士和>Kemphues在试图阻断秀丽新小杆线虫(C.  elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义

《癌症基因治疗》-李明远小组-siRNA基因治疗新方法

来自四川大学华西医学中心微生物学教研室,成都生物制品研究所(Institute of Chengdu Biological Products)的研究人员通过构建质粒pAd-hTR证明了hTR siRNA在HeLa细胞系中有效和特异的端粒酶的敲除,从而指出了这种siRNA表达重组腺病毒系统在癌症基因治

RNAi的实验原理与方法

近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。一、RNA

RNA干扰技术(RNA interference,RNAi)

1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果

基因技术专题-2

RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应

国自然基金之二——研究内容如何设计

  上回我们说到国自然基金的创新性,创新性是国自然项目评议要点的第一条。评议要点的第二条是针对研究内容、研究目标及拟解决的关键科学问题进行评议。这回,我们就来聊聊研究内容如何设计。   研究内容的设计与创新点息息相关,不能脱离创新点,研究内容就是围绕创新点进行实验设计,论证创新点的正确性。   

RNA干涉(RNA Interference,RNAi)(1)

基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育

RNA干扰(RNAi)实验成功要素

基因和siRNA选择RNAi实验的通量可从沉默单个感兴趣的基因,到少量相关基因或同一个通路上的基因,到全基因组高通量筛选,取决于需要解决的生物学问题。siRNA的设计至关重要。转染优化用于RNAi实验的细胞应当有效转染siRNA。转染必须经过优化确保siRNA的浓度是最低的有效浓度以避免非特异性效应

PLoS Pathogens:揭示棉铃虫病毒抑制宿主黑化反应新机制

  棉铃虫病毒是控制棉铃虫危害的一种重要生物农药,它能够克服宿主的免疫系统,建立系统感染,最终杀死宿主昆虫。在当前研究中,对棉铃虫病毒克服宿主免疫系统机制了解的缺乏,制约着对其杀虫性能的进一步优化。  黑化反应是昆虫一种独特的天然免疫机制,由丝氨酸蛋白酶级联反应介导对酚氧化酶原的剪切,这个过程被丝氨

武汉病毒所等揭示棉铃虫病毒抑制宿主黑化反应新机制

  棉铃虫病毒是控制棉铃虫危害的一种重要生物农药,它能够克服宿主的免疫系统,建立系统感染,最终杀死宿主昆虫。在当前研究中,对棉铃虫病毒克服宿主免疫系统机制了解的缺乏,制约着对其杀虫性能的进一步优化。  黑化反应是昆虫一种独特的天然免疫机制,由丝氨酸蛋白酶级联反应介导对酚氧化酶原的剪切,这个过程被丝氨

半制备规模单链RNA纯化

引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一般大小的21基体寡核苷酸的总产率也达到67~90%,较长链的寡核苷酸的产率相应较低。研究人员通常需要使用纯度高于初步合成混合物的材料。因此,

半制备规模单链RNA纯化(二)

图2中所示被选中的馏份收集窗表示不同的质量负荷。峰值采集后,样品可以根据需要对等分和干燥,以便长期储存。TEAA的挥发性使离子对缓冲组分的去除非常容易。溶剂蒸发后被纯化的寡核苷酸实际上是不含盐的。 UPLC条件纯化RNA寡核苷酸的纯度通过ACQUITY UPLC系统来验证。如图3所示,我们

CRISPR精品操作指南:如何精确有效完成实验!

  生物学家们总是沉迷于对基因组修修补补,而其中一种近期红得发紫的技术就是 CRISPR。自2012年CRISPR/Cas 首次作为一种基因组编辑工具登台以来,关于这种技术的论文数量就大幅增加,最好的证明之一就是2015年两位科学家由于在CRISPR基因组编辑技术方面的重要贡献而获得“科学突破奖”,

产生RNA干扰RANi 的方法

4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,

【分享】siRNA转染成功的主要关键

  siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用,是对特定信使RNA(mRNA)进行降解的指导要素,细胞转染实验中经常会遇到siRNA转染,下面介绍一下siRNA转染成功的主要关键点。图片来源于网络   1.设计合成有效的siRNA   RNAi的核心需要siRNA对相应mRNA进行有效的结合和作用。si

汕头大学教授到昆明动物所进行学术交流

  5月31日,应中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏研究员的邀请,汕头大学许丽艳教授和李恩民教授到研究所进行学术交流。当天下午,许丽艳教授和李恩民教授给所内师生们分别做了题为“fascin基因在食管癌中的功能、表达调控及其细胞信号传导通路”以及“桥粒糖蛋白DSC2负性调控食管癌细胞侵袭迁移的分子机制”的

西安交大教授JACI:表观遗传调控对过敏性疾的影响

  生物通报道:来自西安交通大学医学部,瑞士巴塞尔大学的研究人员发表了题为“Constitutive high expression of protein arginine methyltransferase 1 in asthmatic airway smooth muscle cells is

Alnylam:从30%到5%,如何降低RNAi疗法的肝脏毒性?

  RNAi疗法因为能够有效靶向普通药物无法靶向的蛋白而成为医药界所关注的医疗手段。但是与其它靶向疗法一样,RNAi疗法也会产生脱靶效应,而这些脱靶效应可能造成严重的毒副作用。日前,Alnylam Pharmaceuticals公司的研究人员对N-乙酰半乳糖 (GalNAc) 缀合的RNAi 造成肝