全球各实验室如何进行RNAi实验?

对于那些之前在研究基因功能方面受到挫折的研究人员而言,体内RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术的出现就好像是救兵一般,令人欣喜。理论上体内RNAi能进行更加细致的敲除,从而研究人员能获得时间和空间调控的基因敲除效果。 但是这并不意味着体内RNAi是一件容易完成的实验,实际上RNAi实验操作声名狼藉,即使是细胞培养这一步,都面临着许多困难。就像来自整合DNA技术(Integrated DNA Technologies)的Mark Behlke说的一样,“在体内,问题其实是一样的,不同的只是要更加困难十倍”。研究人员需要将RNA导向他们的靶器官,和靶细胞,有效的转染细胞,并且还要解决好毒性和脱靶的问题。 值得留意的是也有一些小技巧能解决一些问题,比如说,对于人工合成的小干扰RNAs,可以利用一些阳离子脂质体来中和RNA的负电荷,从而使得这些RNA更容易通过细胞膜,或者进行化学修饰,保护RNA不受到核酸酶,......阅读全文

RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)

早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由

RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)

基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育

RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)

1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果

反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)

最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(3)

SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(1)

Rnai最近由于RNA 干扰(RNA interference,RNA i)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA 干扰是

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(2)

1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA (antisenseRNA )的过程中发现的,由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA (senseRNA )和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par

RNA干扰RNAi的生物特性

RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南

RNA干扰(RNAi)实验成功要素

基因和siRNA选择RNAi实验的通量可从沉默单个感兴趣的基因,到少量相关基因或同一个通路上的基因,到全基因组高通量筛选,取决于需要解决的生物学问题。siRNA的设计至关重要。转染优化用于RNAi实验的细胞应当有效转染siRNA。转染必须经过优化确保siRNA的浓度是最低的有效浓度以避免非特异性效应

RNAi(RNA干扰)的分子机制

通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dic

Rules-of-siRNA-design-for-RNA-interference-(RNAi)

General GuidelinessiRNA targeted sequence is usually 21 nt in length.Avoid regions within 50-100 bp of the start codon and the termination codonAvoid

RNA靶向的定义

中文名称RNA靶向英文名称RNA targeting定  义(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向试剂。

使用RNAi技术治疗肿瘤病

肿瘤病的治疗肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注

细胞化学词汇RNA靶向

中文名称:RNA靶向英文名称:RNA targeting定  义:(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(1)

近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。一、R

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(3)

3.DEAE-葡聚糖和polybrene带正电的DEAE-葡聚糖或polybrene多聚体复合物和带负电的DNA分子使得DNA可以结合在细胞表面。通过使用DMSO或甘油获得的渗透休克将DNA复合体导入。两种试剂都已成功用于转染。DEAE-葡聚糖仅限于瞬时转染。4.机械法转染技术也包括使用机械的方法,

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(2)

dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因。现在多数的研究显示这种情况通常不会造成影响。最

哺乳动物RNAi技术-Mammalian-RNA-Interference

Mammalian RNA InterferenceThomas TuschlLaboratory for RNA Molecular BiologyThe Rockefeller University, New York Excerpted from RNAi: A Guide To Gene S

RNA靶向的基本概念

中文名称RNA靶向英文名称RNA targeting定  义(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向试剂。

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(2)

在构建双链RNA的表达载体时,使用RNA多聚酶Ⅲ来指导RNA的合成。这是因为RNA多聚酶Ⅲ有明确的启始和终止序列,而且合成出的RNA不会带有polyA尾。当RNA多聚酶Ⅲ遇到连续5个胸腺嘧啶时,它指导的转录就会终止,并且转录产物在第二个尿嘧啶处被切下来。U6启动子能被RNA多聚酶Ⅲ识别, 合

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

Nature:靶向饥渴的肿瘤

  来自杜克大学医学院的研究人员在4月9日的《自然》(Nature)杂志上报告称,用于治疗一种罕见遗传疾病、阻断铜摄取的药物似乎找到了其他的用途:可用来对抗某些类型的癌症。研究人员发现,携带一种BRAF基因突变的癌症需要铜来促进肿瘤生长。   黑色素瘤便是这样的一种肿瘤。根据美国国家癌症研究所的统

Cancercell:靶向“上瘾”的肿瘤

  采用他们所说的一种有前景的高度选择性的治疗策略,达纳法癌症研究所的科学家们通过靶向让癌症“上瘾”的异常蛋白安全地抑制了小鼠的乳腺癌和一种形式的白血病。   虽然研究人员利用药物遗传沉默或阻断了正常组织以及癌组织中的蛋白,动物却仍然保持健康。研究人员将这一成果报告在10月16日的《癌细胞》(Ca

简述RNA干扰技术对肿瘤病的治疗

  肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种d

RNA干扰治疗肿瘤病的方法介绍

肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种dsR

RNAi实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程

RNAi 实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程,本实验方法来自于加州大学Jim教授实验,很权威!Procedure for the Generation of dsRNA for use in RNAi1. Design polymerase chain reaction (PCR ) prim

Nature:靶向肿瘤微环境,用antimiR治疗肿瘤

  近日,著名国际期刊Nature发表了耶鲁大学研究人员的一项最新研究成果,他们建立了一个能够将antimiR靶向输送到酸性肿瘤微环境的药物输送平台,通过抑制miR-155表达,抑制淋巴癌发展。这一研究成果对靶向药物输送系统研究以及通过antimiR治疗癌症具有重要意义。  MicroRNA是是一类

抗肿瘤分子靶向药物研究重点实验室在南京建成

       位于南京徐庄软件园的江苏省抗肿瘤分子靶向药物研究重点实验室今天正式竣工,江苏省副省长何权出席了竣工典礼,称这是江苏首家设在企业的省级重点实验室。  何权说,江苏是医药大省,也是医药强省。加大科研投入,将使民族医药的自主创新成为可能。  抗肿瘤分子靶向药物研究重点实验室于2008年10月

RNA干扰用于肿瘤病的治疗

肿瘤是多个基因相互作用的基因网络调控的结果,传统技术诱发的单一癌基因的阻断不可能完全抑制或逆转肿瘤的生长,而RNAi可以利用同一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性,设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因同时剔除的表现,也可以同时注射多种dsR

生物制药技术大跃进:RNABase时代悄悄到来

  以RNA为基础(RNA-Base)的生物制药是一类相对较新的技术,包括以RNA为基础开发新疗法和疫苗,该技术主要针对一些慢性疾病和罕见疾病的治疗和预防,如癌症、糖尿病、肺结核以及某些心血管疾病等。据市场研究分析,DNA与RNA疗法预计以12%的年复合增长率增长,预计到2020年市场规模达12亿美