RNA酶污染的预防措施
RNA的的化学性质比DNA活跃得多。RNA分子上紧邻磷酸二脂键的2′羟基基团能直接被RNA酶利用来作为活性因子,从而使得RNases无需金属离子就能发挥活性。由于RNA酶在环境中广泛存在,特别是RNase A,结构极其稳定,不能通过高温高压灭菌失活,因而极难消除,对保持RNA样品的完整性构成极大的威胁。由于RNase A类酶依赖于活性位点处的组氨酸残基起催化作用,因此能被组氨酸烷化剂DEPC所抑制。为了避免RNA降解,RNA相关实验都严格应遵循下述操作规则: 1.使用RNase-free溶液; 2.佩戴清洁一次性手套并经常更换; 3.建立RNA工作专区,使用专用的移液器和RNase-free枪头; 4.使用无菌的一次性塑料器皿,尽量避免使用玻璃器皿; 5.金属工具可以用快速灼烧数秒钟的方式来快速消除污染; 6.玻璃器皿可在180℃以上温度下烘焙数小时,或用新鲜配......阅读全文
非编码RNA-Nfi调控水稻固氮酶活性
近日,生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学(Applied and Environmental Micro
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
提取的基因组DNA有RNA-污染如何解决?
得到的基因组在进行常规下游实验如,PCR、酶切、分子杂交等生物学实验时如不能顺利进行,主要因为DNA 样品不纯,含有蛋白、有机溶剂和盐类等杂质影响内切酶或DNA 聚合酶的活性。 1)实验过程中没有有效使用RNase A,应严格按照实验要求进行。 2)RNase A失活: RNase A应
用核糖核酸酶和放射性标记的RNA探针对RNA作图
核糖核酸酶保护分析用于度量特异性 mRNA 的丰度以及为它们的拓扑异构特征作图。这种方法包括测试 RNA 与互补的放射标记的 RNA 探针(核糖探针)杂交,然后未杂交的序列被一种或几种单链特异性的核糖核酸酶裂解。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理核糖核酸酶保护分析用于度量特
聚合酶链反应的污染来源
1、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。2、PCR试剂的污染:主要是由于在PCR
从-PEI-沉淀洗脱σ32-和-RNA-聚合酶实验
试剂、试剂盒缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A仪器、耗材SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶(10%)试剂缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol/LNa
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)的优缺点
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性,且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中,需要DNA模板与镁离子(Mg2+)作为辅因子。牛血清蛋白(bovine serum albumin,BSA)及精胺(spermidine)对此酶具促进效果。与细菌的RNA
用-T4-DNA连接酶连接RNA分子
实验材料 T4DNA 连接酶 T4 多聚核酸激酶 RNA 供体 受体 寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒 10X 连接缓冲液 [Y32P]ATP 无 RNase 水 l0 mmol LATP RNasin。 无 RNase 的 DNase。 5XTBE 2X 变性胶上样缓冲液 TE仪器、耗材 真空
从-PEI-沉淀洗脱σ32-和-RNA-聚合酶实验
试剂、试剂盒 缓冲液 A 含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤 材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶(10%)试剂缓冲液 A含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol
T7RNA聚合酶的基本信息
T7RNA聚合酶具有高度启动子专一性,且只会转录T7噬菌体中位于T7启动子下游的的DNA或DNA复制品。此酶在合成RNA的过程中,需要DNA模板与镁离子(Mg2+)作为辅因子。牛血清蛋白(bovine serum albumin,BSA)及精胺(spermidine)对此酶具促进效果。与细菌的RNA
3类不同的RNA聚合酶的功能介绍
真核细胞含有3类不同的RNA聚合酶,根据其对α-鹅膏蕈碱的敏感性不同,分为RNA聚合酶Ⅰ(A)、RNA聚合酶Ⅱ(B)、RNA聚合酶Ⅲ(C),如下:酶的种类存在功能对抑制物的敏感性RNA聚合酶Ⅰ核仁合成rRNA前体不敏感RNA聚合酶Ⅱ核质合成mRNA前体及大多数snRNA敏感RNA聚合酶Ⅲ核质合成5S
从-PEI-沉淀洗脱σ32-和-RNA-聚合酶实验
试剂、试剂盒 缓冲液 A 含 0、0.3、0.5、0.7、0.9 和 1.1mol LNaCl 的缓冲液 A 仪器、耗材
T4-RNA连接酶的基本信息
T4 RNA Ligase,即T4 RNA连接酶,是一种ATP-依赖的可以催化单链RNA、单链DNA或单核苷酸分子间或分子内5'-P末端与3'-OH末端之间形成磷酸二酯键的酶。
信使RNA的反转录酶与反转录过程
定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录 1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。 2.反转录酶与反转录过程 反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合
T4-RNA连接酶的来源和用途
用途:用RNA 3'末端标记;RNA和RNA分子间连接;寡核苷酸的环化;tRNA修饰;5' RACE中寡核苷酸连接到cDNA单链;在蛋白质特定位点引入非天然氨基酸。来源:由大肠杆菌表达,表达基因的来源为T4噬菌体。活性定义:37℃30分钟内,催化1 nmol 5'-[P]-(
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
怎么样在RNA提取时避免基因组的污染
260/280的比值可以判断比较严重的基因组污染。也可以通过跑琼脂糖胶看加样孔里亮不亮作为一个参考依据。其实一般很难保证RNA没有基因组污染的,特别是加入氯仿后的剧烈震荡会促进dna溶解到水相里,后面就很难分离了。有些许的基因组污染的样品也能够满足大部分的实验要求。所以在rt-pcr等试验中才要求设
纤维素酶污染菌的控制
饲用纤维素酶普遍存在一种俗称的“白毛菌”污染。污染后轻者酶活性下降,重者发酵失败。为此,研究控制发酵污染意义很大。张苓花等(1998)研究“白毛菌”的菌落特征、来源、生长和生理特征及控制方法,找到了一种与康氏木霉Wu-932呈共生关系,而与“白毛菌”呈竞争性抑制关系的热带假丝酵母菌J-931。利
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水
RNA聚合酶复合物晶体结构获解析
中科院武汉病毒所研究员龚鹏带领研究小组解析了RNA病毒基因组复制和转录中重要物质——RdRP转位中间体的晶体结构。这将为相关抗病毒研究提供重要依据。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,也是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
实验材料 载体试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素pGP裂解缓冲液仪器、耗材 培养箱分光光度计离心机实验步骤 1. 将含有待表达基因的片段亚克隆于pT7-5、pT-6或pT7-7中,转化一种标准大肠杆菌菌株,此菌株不应带有可指导T7 RNA聚合酶合成的质粒。转化物涂布于氨苄青霉素平皿,于37℃温育培养
T4-RNA连接酶的基本信息介绍
T4 RNA Ligase主要用于RNA和RNA之间的连接,连接时需要5'磷酸基团和3'羟基的存在。不仅可以进行RNA分子间的连接,也可以进行RNA分子(最短8个碱基)的环化连接。 T4 RNA Ligase可以用于RNA和单核苷酸之间的连接,单核苷酸必须为5'和3
3.6.1-用-T4-DNA连接酶连接RNA分子
T4 DNA 连接酶可将双链复合物缺刻连接,其中包括 RNA-DNA 杂合链及 RNA-RNA 杂合链。实验材料T4DNA 连接酶T4 多聚核酸激酶RNA 供体受体寡核苷酸 cDNA 模板试剂、试剂盒10X 连接缓冲液[Y32P]ATP无 RNase 水l0 mmol LATPRNasin。无 RN
T7-RNA聚合酶/启动子表达实验
基本方案 备选方案 备选方案2 实验材料 载体 试剂、
RNA甲基化酶的基本信息和作用
中文名称RNA甲基化酶英文名称RNA methylase定 义编号:EC 2.1.1.-。催化RNA中碱基甲基化反应的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod
我国科学家发现RNA病毒聚合酶独特催化机制
RNA病毒包括SARS冠状病毒、高致病性流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒等,在过去十五年间多次造成全球性影响,对人类健康构成严重威胁,而针对RNA病毒的药物和疫苗目前严重匮乏。聚合酶作为RNA病毒所必需的复制酶,在病毒RNA基因组复制过程中发挥核心作用,深入了解其催化机制,将为有效应对RNA病毒提