RNAi实验原理与方法选择(二)

尽管有些公司推出了shRNA和siRNA试剂盒,但这些试剂盒大都突出操作简单,毕竟涉及RNA操作,用户自己难免会产生很多预料不到的困难,晶赛公司可以完全为您解决后顾之忧,您可以直接拿到有效的siRNA或shRNA序列。 3. Dicer酶法生产siRNA优点:可以跳过筛选与检测有效siRNA序列的步骤,节省时间和开支。缺点:有可能引发非特异性的基因沉默,尤其是同源或者密切相关的基因。适用于:快速而经济地研究某个基因功能缺失的表型不适用于:长期研究项目,或者是需要一个特定的siRNA进行研究评价:★★★☆☆ 4.编码shRNA的载体生产siRNA优点:制备质量可控性好,带有抗生素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达,持续数星期甚至更久,可以大量扩增。缺点:转录后的shRNA的正确折叠率不能保证,有可能因此造成非特异性抑制,质粒载体转染效率不稳定,与细胞类型有关。适用于:已知一个有效的siRNA序列,需要维......阅读全文

RNAi的功能

1.高通量的研究基因功能在后基因组时代,需要大规模高通量的研究基因的功能,由于RNAi能高效特异的阻断基因的表达,因而RNAi成为研究基因功能的很好的工具。研究者将线虫三号染色体上2232个基因对应的dsRNA合成出来,并注射到线虫性腺内,然后观察子代细胞分裂时出现的异常表型,结果发现了133个基因

Alnylam-RNAi-胆固醇药物一期实验结果良好

  Alnylam公司最近公布了其最新的RNAi药物ALN-PCS早期研究成果。这种药物是一种被设计为靶向PCSK9酶基因产物的药物。 PCSK9的主要生理作用是降解LDL胆固醇,通过抑制这种酶的活性,肝脏部位LDL受体活性将会明显提高并进而降低血液中LDL胆固醇的含量从而达到治疗效果。研究人员

RNAi的生物特性

RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南

RNAi的生物特性

RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南

RNAi的分子机制

通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dicer的酶

RNAi表达载体构建

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够

RNAi原理FLASH演示

How does RNAi work? Genetic and biochemical data indicate a possible two-step mechanism for RNA interference (RNAi): an initiation step and an effecto

RNAi技术的应用

5 RNAi技术的应用5.1 功能基因组和遗传学应用随着各种模式生物和人类基因组测序的完成,基因功能的研究远远落后于大量序列所提供的信息,研究和发现基因功能成为越来越紧迫的任务。长期以来,破坏基因结构或抑制基因表达是研究基因功能的重要方法,如常用的基因敲除技术( gene knock out) 。基

RNAi原理图解

The Mechanism of RNA Interference (RNAi)Long double-stranded RNAs (dsRNAs; typically >200 nt) can be used to silence the expression of target genes in

RNAi表达载体构建

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够

RNAi具有的特征

①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;

BLOCKiT-RNAi-Designer

Allows you to design synthetic siRNA, Stealth RNA, or shRNA molecules from nucleotide target sequences, or convert an siRNA molecule sequence into a S

RNAi基因沉默方法

大约在十年前,2006年诺贝尔生理/医学奖得主CraigMello和AndrewFire发现,他们能够将短RNA 分子插入到线虫中并沉默特定基因的表达。今天,研究人员也常常使用这种强大的RNA 干扰方法来研究哺乳动物系统中的特定基因功能。为了进行这种基因沉默实验,研究人员通常需要依赖化学合成的RNA

RNAi的生物特性

RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南

RNAi的生物特性

RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南

RNAi术语表

RNAi GlossaryDicer - Dicer is a member of the RNase III family of nucleases that specifically cleave double-stranded RNAs. Dicer processes long dsRNA

RNAi放大效应机制

由于在一些生物中RNAi的影响格外显著,有人提出在RNAi 途径中可能存在某个(信号)扩增的步骤。这种扩增可能是复制外源注入的dsRNA从而产生更多的siRNA ,也可能是直接扩增siRNA本身。这种扩增可能在RNA诱导沉默复合物(RISC)形成过程进行,作为RISC形成的补充,或者独立于R

RNAi:制备siRNAs的方法

越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子,能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的mRNA,这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference p

Cell头条:内源RNAi信号

  来自加拿大麦吉尔大学的Mathieu Flamand 和Thomas F. Duchaine在7月20日《细胞》(Cell)杂志上发表了一篇题为“SnapShot: Endogenous RNAi Pathways”的文章。文章以概略图加上主题内容简介并推荐了10篇文献,简明扼要地概述了

RNAi有哪些高效性

RNAi的高效性:dsRNA在Dicer作用下形成siRNA,siRNA解链与RISC形成复合物,这些RISC可专一性地与靶向的mRNA特异性结合。siRNA也有可能不与RISC结合,而是通过解链直接靶向结合mRNA。根据RISC结合位点或单链siRNA结合位点在RdRP作用下可形成新的dsRNA,

-默沙东退出RNAi研究领域

  尽管最近罗氏公司、赛诺菲两个制药巨头宣布重返RNAi疗法研究领域,默沙东公司却做出相反的决定,宣布撤出这一研究领域。公司最近宣布将相关的 Sirna公司以1亿7千5百万美元的价格出售给Alnylam公司。这也是默沙东公司宣布进行研发部门重组后的又一个大动作。        公司于2006年以

RNAi技术的应用特点

由于使用RNAi技术可以特异性剔除或关闭特定基因的表达,(长度超过三十的dsRNA会引起干扰素毒性)所以该技术已被广泛用于探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗领域。

RNAi:制备siRNAs的方法

  越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子,能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的mRNA,这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference pat

RNAi片段siRNA设计原则

RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG).S

RNAi表达载体构建(一)

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分

RNAi的生物特性介绍

  1、RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关  ① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;  ② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。  2、R

RNAi的发现和起源

首次发现dsRNA能够导致基因沉默的线索来源于线虫Caenorhabditis elegans的研究。>1995年,康乃尔大学的Su Guo博士和>Kemphues在试图阻断秀丽新小杆线虫(C.  elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断

RNAi引起的基因敲除

RNAi引起的基因敲除:由于少量的双链RNA就能阻断基因的表达,并且这种效应可以传递到子代细胞中,所以RNAi的反应过程也可以用于基因敲除。

RNAi表达载体构建(二)

(2)、序列同源性分析: 将潜在的序列和相应的基因组数据库(人,或者小鼠,大鼠等等)进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列.例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚

RNAi及基因沉默原理

RNA 干扰(RNAinterference,RNAi)是由双链RNA (double-strandedRNA,dsRNA) 引发的转录后基因静默机制。其原理是:RNaseIII 核酶家族的Dicer,与双链RNA 结合,将其剪切成21 - 25nt 及3'端突出的小干扰RNA (small