二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测序技术对铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因进行鉴定和系统分析，新发现了一批的野生大豆miRNA和其作用的靶基因*。该研究成果发表在10月刊的BMC Plant Biology上。 MicroRNA（miRNA）是一类调控真核生物广泛生理过程的内源性非编码小RNA，它的调控作用是通过降解靶mRNA或是阻碍其翻译来实现。植物miRNA通常与其靶基因完全或是近乎完全匹配，引起mRNA的降解。在植物中，miRNA参与调控发育全过程以及对生物或非生物胁迫的应答。要确定miRNA的功能就必须首先鉴定它们的靶基因。降解组测序是近来兴......阅读全文
甘肃农业大学：光刺激下miRNA对土豆次级代谢的影响如何
光是影响土豆代谢途径和刺激其产生次生代谢物的一个重大的环境因素。光诱导马铃薯引发的代谢途径和生理功能的自适应改变，在一定程度上反应了基因表达的变化。土豆转录水平上的次生代谢途径一直得到广泛的研究，但microRNA（miRNA）转录后调控机制研究却少之又少。甘肃农业大学张金文课题组，运用miRNA测
华南植物园：荔枝果实衰老受miRNA调控
荔枝色泽鲜艳，营养丰富，具有较高的商业价值。然而，在采收后1-2天内荔枝就会变质，主要体现为果皮褐色。调控荔枝果实衰老的因素很复杂。MicroRNAs作为负调控因子参与了几乎所有的生理过程。在最新的一项研究中，中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室从miRNA水平探究了荔枝果实衰
二代基因测序临床应用“放闸”－达安基因将受益！
1月19日讯，卫计委公布首批可开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床应用试点的109家医疗机构，为二代基因测序“放闸”，随着试点范围公布，行业有望迎来爆发性增长。值得一提的是，上述医疗机构开展相关临床应用必须使用国家食药监总局（CFDA）已批准上市的基因测序仪及配套试剂，目前仅华大基因和达安基因（
不卑不亢看待二代测序
人们常说“事后诸葛亮”，可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力，天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种，不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面： 1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文，但是这些中国话想表
食药监局批准第二代基因测序诊断产品
近日从国家食药监总局获悉，日前，国家食品药品监督管理总局经审查，首次批准注册了第二代基因测序诊断产品，其中包括基因检测仪、检测试剂盒等。该批产品可通过对孕周12周以上的高危孕妇外周血血浆中的游离基因片段进行基因测序，对胎儿染色体非整倍体疾病进行无创产前检查和辅助诊断。 国家食品药品监督管理总
中国首部二代基因测序技术临床应用共识出台
当今，肿瘤诊治已迈入个体化及精准医学的时代，从“一刀切”向“针对每一个病人的具体病情，正确选择并精确地应用适当的治疗方法”发展，这对进一步提高治疗的有效性，降低不必要的药物副作用和节约医疗支出都有着深远的意义。肿瘤的精准医疗是一项系统工程，包括精准诊断、精准治疗、精准管理多个环节，均以精准的肿瘤
miRNA测序应用于阿尔茨海默氏症新机制的研究
阿尔茨海默氏症（Alzheimer's disease，AD）是一种神经性疾病。有研究表明，miRNA-Seq和全基因组测序鉴定到了一些非编码RNA可能参与了其中的疾病形成。竞争性内源RNA（ceRNA）是非编码RNA执行生物学功能的一种重要方式。然而，相对于其重要的生物学功能，只有部分
大豆“走失”的基因“回家”了
左上为栽培大豆种子，其余为多年生野生大豆种子。山东农大供图 多年生野生大豆植株 山东农大供图从又黑又小的野生大豆，到又黄又大的栽培大豆，3月15日《自然—植物》在线发表的论文证实，在这个过程中丢失了约70%的基因位点。现在，科学家让这些丰富的遗传资源“回家”了。论文通讯作者、山东
外泌体研究深度剖析（二）
案例2：外泌体lncRNA促进肾癌肿瘤细胞耐药性肿瘤学顶级期刊Cancer Cell（IF：27.409）发表文章，阐述了疾病相关lncRNA参与肾癌耐药性及通过外泌体传播的生理机制，将外泌体lncRNA的研究又一次带到了大众视野中。首先作者通过高通量手段检测了野生型细胞和耐药型细胞中差异表达的
冯献忠课题组等在大豆基因组解析研究中取得进展
中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员冯献忠课题组等选择1份东北野生大豆、7份我国代表性栽培种，结合平均50×的三代测序和Hi-C测序，组装了高质量大豆参考基因组。组装的8个大豆基因组大小范围为986.1-1001.3Mb，Contig N50=1.4-6.1Mb，BUSCO完整性评估为96.
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）
基因测序“摩尔定律”初现，“三代测序”要革“二代”的命？
在“二代测序”（NGS）尚未迎来投资热潮的情况下，技术突破捷报连连的“三代测序”（3GS）又进入到了投资人的视野中。1986年，第一台商用基因测序设备正式出现，到第二代测序设备出现，期间间隔了19年时间。而第二代设备问世，到第三代设备的诞生，仅仅用了5年，基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。
第二代高通量测序仪基因检测技术介绍
基因检测不像衣食住行，在人们的潜意识中归属于非生活必需品，因此国内大众消费群体对基因检测的认知程度很长一段时间处于低级水平。但随着测序技术的飞速发展，基因检测也逐渐被国人所知；人们意识到基因检测可以做到疾病病因与预防，并且随着科技发展人们即将迎来精准医疗大时代。基因组革命从1869年米歇尔发现核素开
CFDA首次批准注册第二代基因测序诊断产品
7月2日，国家食品药品监督管理总局（CFDA）官网发布消息，称胎儿染色体非整倍体（T21、T18、T13）检测试剂盒（半导体测序法）等一批医疗器械注册获批。 这是国家食品药品监督管理总局首次批准注册的第二代基因测序诊断产品。 据介绍，此次批准注册的第二代基因测序诊断产品有：BGISEQ－10
什么是二代测序技术
二代测序技术又称为高通过量测序技术，是对传统Sanger测序（称为一代测序技术）革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序，可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势，在生命科学领域已经被
什么是二代测序技术
二代测序技术又称为高通过量测序技术，是对传统Sanger测序（称为一代测序技术）革命性的改变。二代测序技术的核心思想是边合成边测序，可以一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，所以又被称深度测序。由于二代测序技术具有多样本、多位点同时进行测序并且具有较高的覆盖率等优势，在生命科学领域已经被
二代测序原理及应用
二代测序原理及应用如下：一、原理二代测序原理也就是文库构建，PCR产生的片段或基因组打断的片段两端需要添加接头修饰才能进行测序。1、末端修饰。打断的片段是随机断裂，其末端可能是不平的。因此，建库第一步是补齐不平的末端。2、添加接头。经过末端修饰后的DNA片段3’末端具有突出的A尾，而接头具有突出的T
二代测序分析未来如何
二代测序数据分析越来越热但是我觉得虽然在这个大环境下还是应该冷静思考一下。数据分析和数据分析员，我觉得要先弄清这两者的区别，数据分析，现在注重的算法和生物学的结合，优化现有的分析流程和对大数据背景下的深度挖掘（其实对计算机和算法的要求更高一些），如果数据分析员其实说白了就是一个重复分析流程的搬砖工。
诊断性二代测序指南
通过二代测序（next-generation sequencing，NGS）能够快速地对某个个体患者的数千个甚至数百万个DNA碱基对进行测序。这一技术快速出现并且获得成功，这预示着一个遗传学诊断的新的时代的到来。但是，新技术也带来了新的挑战，一方面是技术层面上的，即数据处理问题，另一方
碳缓解情境下的水胁迫
一项研究发现，在碳缓解情境下对食物和生物能源的需求增加可能增加水胁迫。由于全球气候变化预计将增加蒸散、干旱和其他水胁迫，碳排放缓解一直被视为缓解水胁迫的一条道路。Mohamad I. Hejazi 及其同事构建了一个具有精细的空间尺度的模型，整合了区域气候模型以及人类活动的模型，从而预测两种气候
中国农大：玉米miRNA参与应答氮缺乏
虽然最近研究表明，miRNA能调节植物对于营养缺乏的适应性应答，但对于miRNA在氮缺乏适应性应答的功能仍需进一步探索。为了阐明玉米中氮传感与信号传导的分子生物学机制，中国农业大学李文学副教授领衔团队联合应用miRNA测序和降解组测序对玉米miRNA在氮缺乏条件下的调控作用展开了系统
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
单细胞转录组揭秘玉米根系对热胁迫的响应机制
近日，中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队首次在单细胞水平解析了玉米根系细胞对热胁迫的特异性响应机制，揭示了热胁迫下植物根系的细胞异质性、根系类型的差异和分化轨迹，鉴定了单双子叶植物响应热胁迫的关键核心基因，相关研究成果发表于《自然—通讯》（Nature Communications）
芯片和降解组测序揭示掌叶半夏miRNAs新信息
掌叶半夏（Pinellia pedatisecta）是中医中最重要的中草药之一，可治肿毒，具有止呕，化痰，消肿，止痛等功能。MicroRNAs（miRNAs）是内源性非编码小RNA，在植物基因表达调控中发挥关键作用。但目前在miRBase上仍没有掌叶半夏的microRNAs信息，并且对其相关生物学功
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
版纳植物园番木瓜miRNA研究获进展
番木瓜(Carica papaya)又称木瓜，是十字花目番木瓜科水果。番木瓜不仅可以作为水果食用，还有重要的药用价值。作为一种重要的热带植物，番木瓜的产量和质量常常受到病虫害的严重影响。其中为害最普遍及最严重的首推由病毒引起的番木瓜环斑花叶病，除此之外，还有10多种真菌病害，如炭疽病、叶斑病
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花？
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期，云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点，应用云序生物提供的全转录组测序服务，仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》（影响因子5.19）
小分子RNA（miRNA）简介
一、什么是小分子RNA（ MicroRNA）? MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本（primary transcrip
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(de