蠕虫／胚胎流式分选系统斑马鱼体内药物自动化高通量...
蠕虫/胚胎流式分选系统-斑马鱼体内药物自动化高通量筛选仪器的发展和验证得益于基因组学、组合化学和高通量筛选技术的发展，利用小分子靶位进行药物筛选研究，取得了长足的进步。但这种药物筛选的方法，成功率只有不足3%，而且可以研究的已知靶位点十分有限。因此，寻找更好的药物模型进行药物的检测和筛选是迫切需要解决的重大问题之一。一些整体生物个体提供了很好的选择。基于生物体进行的药物筛选方法，其优势是基于完整的生物个体进行化合物的筛选，而不是在人工模拟的条件下进行。 斑马鱼的体积很小，斑马鱼胚胎是透明的，能够满足自动化高通量筛选的要求。斑马鱼为药物筛选提供了一个理想的生物体模型。本文的研究者开发了能够使用斑马鱼进行体内化合物高通量筛选的系统Union Biometrica-蠕虫/胚胎流式分选系统。 研究者利用斑马鱼验证了心脏毒性检测和血管生成抑制剂的药物筛选两种研究，能够在系统平台自动化实现。有效提高了药物筛选的成功率。 蠕虫/胚胎流式分选系......阅读全文
蠕虫/胚胎流式分选系统斑马鱼体内药物自动化高通量...
蠕虫/胚胎流式分选系统-斑马鱼体内药物自动化高通量筛选仪器的发展和验证得益于基因组学、组合化学和高通量筛选技术的发展，利用小分子靶位进行药物筛选研究，取得了长足的进步。但这种药物筛选的方法，成功率只有不足3%，而且可以研究的已知靶位点十分有限。因此，寻找更好的药物模型进行药物的检测和筛选是迫切需要解
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
模式生物高通量多维表型研究方法概述（二）
3.颅面畸形三维重建与评估：每条斑马鱼幼体，记录高达320帧的图像，通过三维重构技术，形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是：retinoic acid（视黄酸）、cyclopamine（环巴胺）和flu
苏州医工所微小模式生物流式成像研究取得进展
模式生物是生命科学研究中的理想研究材料，生命科学领域的发展依赖于模式动物资源的开发与利用，以斑马鱼、线虫、涡虫等为代表的微小模式动物，在基于生命体活体表征的疾病模型药物筛选中发挥着越来越重要的作用。然而，目前在利用微小型模式动物开展科学研究过程中主要以手工分拣筛选和利用传统显微镜进行局部成像为主
斑马鱼胚胎细胞的培养
成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系 实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化
斑马鱼胚胎DNA的制备
材料和试剂1. 蛋白酶K（罗氏03115836001）2. 1M的Tris，pH值8.33. 氯化钾4. 吐温20（10％，EMD4 biosciences，655207）5. NP40（10％，Merck，492018）设备1.
高通量研究脊椎动物多维表型的方法（一）
Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo
模式生物高通量多维表型研究方法概述（一）
摘要：动物个体内，多数由基因突变与生物活性分子所引发的复杂生理应答机制，无法使用细胞培养模型进行预测，而动物水平研究却进展缓慢。本研究中，我们利用微米分辨率的高通量光学投影层析成像系统，结合高效的大颗粒流式分选系统（Union Biometrica），实现了脊椎动物的整体多维度扫描。系统以前
方案27.6－斑马鱼胚胎细胞的培养
成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系 实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化
通过流式细胞仪研究斑马鱼胚胎中细胞周期分析
[精华提要]结合绿色荧光蛋白表达的细胞周期分析广泛的用于研究绿色荧光蛋白标记的细胞的细胞周期分布。这个方案是一种用绿色荧光蛋白标记的斑马鱼胚胎来分析细胞周期的方法。材料与试剂1. PBS（Invitrogen公司14040）2. 胎牛血清3. 乙醇4.
LSFIS助力苏州医工所在斑马鱼高通量三维成像研究获进展
斑马鱼胚胎具有通体透明特点，适于光学显微镜下的活体观测。光片显微技术（Light-sheet microscopy）是一种新型的三维成像方式，具有光毒性小、扫描速度快等特点。针对斑马鱼、线虫等毫米级模式生物，光片成像需复杂的样品准备流程，且由于视场限制，获得全胚胎的三维数据往往需要多区域成像与拼接，
斑马鱼胚胎细胞的培养——细胞系
实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTAZEM-2细胞（或等同物）试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培养液D培养液Holtfreter缓冲液实验步骤鳟鱼胚胎提取物：(a)收集胚胎（受精后 28 天的 Shasta Rainbow 或其他鳟鱼种系
斑马鱼胚胎细胞的培养——原代培养
实验方法原理收集胚胎，除去绒毛膜，用胰蛋白酶分散胚胎细胞，然后在胚胎成纤维细胞饲养层上培养从斑马鱼囊胚和原肠期胚获得的原代细胞。实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA胚胎成纤维细胞饲养层人重组白血病抑制因子试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培
斑马鱼的胚胎原位杂交试验实录
收集斑马鱼的胚胎，在Holfretor水中培养，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%多聚甲醛固定，在4℃保存，二十四小时后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗，然后换成甲醇，在-20C 保存，待用（两天和两天以上的胚胎需要用双氧水处理，去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成）原位
斑马鱼
一、概述斑马鱼是生长在印度、巴基斯坦淡水河流中的一种硬骨鱼（鲤鱼），成年鱼全身仅长4－5厘米，因全身横向分布着一道一道褐色的斑马线而得名。斑马鱼很容易在实验室饲养，一般3个月就可以达到生殖成熟期，雌鱼每次产卵200枚左右，一生可产卵数千枚，斑马鱼所产之卵经24小时即可胚胎发育成熟，仔鱼期只有1个月。
斑马鱼为何作为高内涵筛选HCS的模式动物？
有两种有效的筛选方法，广泛用于早期药物发现中的化合物分选。这些方法包括高通量筛选 （HTS） 和高内涵筛选 （HCS）。虽然前者从大量新药候选药物中快速有效地分选有用的化合物，但HCS使用基于成像的多参数分析来鉴定可能影响这些药物疗效的化合物。 在本文中，您将了解什么是HCS，使用的不同方法以及常见
以斑马鱼胚胎为模型－研究胚胎发育早期的自我保护机制
当生物体遇到药物或化学污染物入侵时，它会应激性地提高自身转化及外排能力，从而尽快将外源物降解或排出体外，从而实现自我保护，这一作用也被称作生物体的外源物抵御作用。由于该作用决定了药物或污染物在体内的停留时间，从而影响了药物药效或化学污染物毒性的发生，因而受到药物学及环境毒理学研究的广泛关注。
斑马鱼——CRISPR高通量基因功能研究新平台
近日，来自美国NIH的研究人员进行了一项研究，他们利用CRISPR-CAS9技术靶向斑马鱼特定DNA序列进行基因功能探索和人类治病基因的发现研究，相关研究成果在线发表在国际学术期刊genome research。 在这项研究中，研究人员发现利用基因编辑技术CRISPR-CAS9进行斑马鱼基因靶
－Nat－Commun：斑马鱼可用于癫痫药物筛选
化学药物Clemizole在“Dravet综合症”的一个斑马鱼模型中能有效防止癫痫类发作。在Nature Communications上发表的这一发现确认了一个新方法，后者有可能被用来识别癫痫病的另类疗法。 “Dravet综合症”是一种从婴儿时期开始的严重癫痫，以严重的、自发的和复发的
“超级再生”动物激发人类医疗灵感
在受伤后，一些涡虫几乎可以再生体内的所有细胞，墨西哥钝口螈可以重建整个四肢和部分大脑，斑马鱼可以修复断裂的脊髓，绿安乐蜥则能重新长出尾巴。鱼类、两栖动物、爬行动物和蠕虫展现的再生能力令研究人员着迷已久，而大多数哺乳动物却不具备这种能力。如今，由于基因组学、蛋白质组学和单细胞成像技术的进步，科学家能够
斑马鱼胚胎细胞的培养——成纤维细胞饲养层
实验方法原理通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化筛选成纤维细胞，用原肠胚期斑马龟的胚胎成纤维细胞制备饲养层 [ Sun et al., 1995a ]。实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA受精后8h的胚胎FB
组织靶向性胚胎嵌合体—斑马鱼囊胚细胞移植
真核生物的基因调控比原核生物复杂得多。这是因为这两类生物在三个不同水平上存在着重大的差别：①在遗传物质的分子水平上，真核细胞基因组的DNA含量和基因的总数都远高于原核生物，而且 DNA不是染色体中的唯一成分，DNA和蛋白质以及少量的RNA构成以核小体为基本单位的染色质；②在细胞水平上，真核细胞的染色
胚胎和成年斑马鱼眼情的组织学准备
INTRODUCTIONThis protocol describes the histological preparation of embryonic and adult zebrafish eyes. The methods described here can be easily adapt
Nature：系统解析斑马鱼参考基因组
斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点，近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。 近日，英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
C13C4.5/Spinster，一种进化上保守的蛋白作用于脂肪代谢...
C13C4.5/Spinster，一种进化上保守的蛋白作用于脂肪代谢而对线虫生育能力做出调控Union BioMetrica COPAS 大颗粒流式系统应用C13C4.5/Spinster，一种进化上保守的蛋白作用于脂肪代谢而对线虫生育能力做出调控C13C4.5/Spinster, an evo
COPAS流式分选系统简介及其在药物筛选方面的应用
微型模式动物、模式植物种子、大体积细胞及微球的分选在生命科学研究中有着非常广泛的应用，但是由于这些对象体积太大，普通流式细胞仪难以对其进行分选，而手工镜下分选耗时耗力、效率低下、准确性难以保证，因此一种自动化大体积微粒分选系统应运而生，它就是本文介绍的COPASTM多参数生物微粒分析与分选系统。
应用模式动物斑马鱼开展农药环境毒理的研究（一）
在未涉及正文分析介绍及阐述之前，首先给大家分享一个关于斑马鱼研究的框架图：从框架图可以看出，该研究的目的及主要思路是：评估福美锌（ziram）对斑马鱼发育的影响，主要从形态学、行为、生理学和分子四大方面来进行探讨。毋庸置疑，这也是今天将与大家分享的一篇使用Noldus（诺达思）的DanioVisio
斑马鱼之后，CRISPR再探哺乳动物胚胎发育史
Researchers have used gene-editing to track the cell-by-cell development of a mouse embryo.Credit: Agnieszka Jedrusik and Magdalena Zernicka-Goetz
使用人类疾病模型生物斑马鱼的高通量成像实验
为什么使用斑马鱼进行筛选? 目前，基于斑马鱼的筛选由于花费，通量和伦理原因作为一种哺乳动物筛选的替代受到欢迎。斑马鱼由于其与人类的高度生物相似性，成为一种有用的药物开发模型。在个体学和器官形成研究中体现了其主要器官系统与人类极其相似，且斑马鱼和人类的相似度高达 70 - 80%。斑马鱼由于其繁殖力强
显微注射泵系统选购方案建议（二）
此系列数显气动皮升注射泵主要应用前景为：1.鱼类遗传学研究应用：●用于斑马鱼、青鳉、中华鲟、黑斑原鮡等鱼类卵细胞及鱼类幼体的核酸类物质、染料、功能蛋白、慢病毒等的注射；●用于海洋生物如珊瑚虫等的遗传学研究；2.脑科学研究的应用：●用于光遗传学研究中慢病毒等物质的动物颅内精确注射；●用于神经回路研究中