利用ProteOnXPR36分析蛋白与小分子相互作用（二）
Anti-DNP抗体和DNP标记氨基酸的相互作用分析：如果作为ligand的蛋白分子非常大（超过100kD），那么这些分子在标记的时候用于空间位阻的关系，会占据基质的多个结合位点，导致标记效率下降。为此，很多人用ligand和analyte分子量之比来衡量芯片或仪器的灵敏度。GLH芯片可以达到400倍的检测灵敏度，也就是说，即使ligand分子比analyte分子的分子量高400倍，也依然可以检测到相互作用。为此，我们设计了一个小分子抗体（约150 KD）和几个抗原之间的相互作用实验。每个实验的具体信息和反应曲线见下表和下图：名称MWka (1/Ms)kd (1/s)KD (M)Rmax (RU)DNP-glycine2411.99×1060.0954.77×10-936DNP-valine2831.24×1060.0987.90×10-841DNP-tryptophan3707.14×1050.2513.52×10......阅读全文
小分子蛋白用20％分离胶可以跑出来吗
胶浓度与蛋白大小,是经过前人多次电泳的经验总结.在最佳的电泳条件下,能得到比较好的分离效果和比较好看的条带.如果胶浓度够大,蛋白条带会比较细一些,但电泳速度比较慢,大的片段可能分不开.10%能不能用得看你的情况了.如果只是一个条带,用10%是没有问题的.如果有些杂带,而且杂带与你的目标蛋白差得比较远
化学所利用分子间弱相互作用调控生物传感研究获进展
弱键相互作用分子间是自然界实现化学选择性的基础。设计和调控分子间弱相互作用将为基于生物传感的活体分析化学研究提供新的思路。 中国科学院化学研究所活体分析化学院重点实验室研究员毛兰群课题组长期致力于利用调控分子间弱相互作用，发展活体分析化学新原理和新方法的研究。利用氨基酸分子间的离子对相互作用，
生物大分子相互作用分析仪
生物大分子相互作用分析仪（双偏振极化干涉测量系统）（DPI）英国Farfield公司致力于为全球的生物学蛋白检测、表面科学及纳米科技领域提供创新的科学分析仪器，使用户在分子甚至原子的层面上理解物质之间的相互作用及作用期间的实时变化，给出相应的动力学及热力学参数，如：分子直径、厚度、密度、表面浓度及固
核酸与小分子识别理论计算研究取得进展
中国科学院长春应用化学研究所电分析化学国家重点实验室研究员汪劲和副研究员晏致强，提出了核酸—小分子识别特异性的理论计算方法并开发了一套全新的核酸—小分子相互作用能量打分函数SPA-LN。该研究成果发表在Nucleic Acids Research上。 研究表明，核酸（nucleic acids
蛋白质与水的相互作用
蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键（偶极-偶极相互作用或氢键），或氨基酸的侧链（解离的、极性甚至非极性基团）同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多：（1）pH>pI 时，蛋白质带负电荷，pH=pI 时，蛋白质不带电荷，pH 时，蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高于蛋白质的p
蛋白质与水的相互作用
水和蛋白质是构成一切生命的基础材料。对人体来说，我们需要有二十种氨基酸才能保证细胞的正常工作。其中，有八种氨基酸是人体无法自行合成，必须由食物中摄取，称作“必需氨基酸”，又称作完全蛋白。资料表明：这八种中如果缺少任何一种，其他则毫无用处。另外十二种是人体可以自行合成的，称作“非必需氨基酸”。人体
脂质大分子和小分子
脂肪到底是不是生物大分子，这是一个让很多生物老师都很纠结的问题，高中生物人教版必修一并没有生物大分子的定义（必修一33页提到“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子”），很多辅导书籍及练习题也经常添乱，搞得我们在备课时一头雾水。开卷有益，让我们翻开高校教材找找答案吧！ 一、高分子化合物 根据《有
BLT小课堂丨植物蛋白互作技术（二）
免疫共沉淀技术(CoIP)：借助抗体和抗原之间的专一性，确定两种蛋白质在完整细胞内生理性的相互作用。当用预先固化在argarose beads上的蛋白质A的抗体免疫沉淀A蛋白，那么与A蛋白在体内结合的蛋白质B也能一起沉淀下来。再通过蛋白变性分离，对B蛋白进行检测，进而证明两者间的相互作用。优
什么是小分子RNA？
MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为22 个核苷酸的非编码单链RNA分子，它们在动植物中参与转录后基因表达调控。在动植物以及病毒中已经发现有28645个miRNA 分子(Release 21: June 2014) 。大多数miRNA 基因以单拷贝、多拷贝或基因簇(c
小分子转膜时间
小分子的话就不要过夜转,采取100V一小时应该就可以了,注意降温。知识补充蛋白的分子量 是理论的分子量 其实还可能有一些修饰的 比如乙酰化 糖基化等那么要考虑分子量的问题 其次 你买的抗体怎么样？特异性 效价 亲和力等 是否适合做WB？ 再次 你可以用预染的蛋白marker试一试 确定你的目的蛋白没
小分子RNA（miRNA）简介
一、什么是小分子RNA（ MicroRNA）? MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本（primary transcrip
小分子抗体的应用
1.肿瘤导向治疗2.放射免疫显像，协助肿瘤的诊断。3.优点：分子量小，穿透性强，抗原性低;由于不含Fc段，不会与带有Fc段受体的细胞结合，不良反应少；半衰期短，有利于及时中和及清除毒素；另外，可在原核系统表达及易于基因工程操作。
小分子RNA的简介
MicroRNA (miRNA) 是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某
小分子抗体的应用
1.肿瘤导向治疗2.放射免疫显像，协助肿瘤的诊断。3.优点：分子量小，穿透性强，抗原性低;由于不含Fc段，不会与带有Fc段受体的细胞结合，不良反应少；半衰期短，有利于及时中和及清除毒素；另外，可在原核系统表达及易于基因工程操作。
利用小分子极性光切割测定G四重折叠结构的构象
动物所利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构的构象 基因组中可以形成G-四重折叠结构的序列分布非常广泛，这些结构对诸如癌基因表达的影响使得其成为药物治疗的可能靶点。研究生理条件下基因组双链DNA中的G-四重折叠结构的结构对寻找和设计靶向药物具有非常重要的指导意
上海药物所利用单转录因子及小分子诱导肝细胞转分化
细胞间的转分化，也就是成体细胞不需要通过诱导多能干细胞（ipsC）阶段而直接转变为另一类成体细胞，并实现功能性修复，是再生医学研究的热点。以肝脏为例，肝功能衰竭每年导致许多病人死亡，而可供移植的肝脏或肝细胞来源非常有限。同时，肝细胞在新药研发领域也是研究药物代谢及毒性的重要工具。如何获得无伦理问
利用小分子荧光抑制剂实现酶高分辨成像的新方法
近日，大连化物所复杂分子体系反应动力学研究组（1101组）韩克利研究员团队基于氨基甲酸酯母核的结构与功能关系，设计并发展了小分子抑制剂型荧光探针（SMI-probe），在重要的药物代谢酶羧酸酯酶（Carboxylesterases，CEs）的实时荧光高分辨检测中取得了良好的应用效果。由于抑制剂型
实验室常用小仪器——小分子类
实验室常用小仪器——小分子类1. 色谱柱恒温箱由于色谱柱恒温箱可以精确、稳定的控制色谱柱的使用温度，对于提高色谱柱的柱效，改善色谱峰的分离度，缩短保留时间，降低反压，减少泵的磨损，保证分析样品结果的重复性，具有不可忽视的作用，使其成为高效液相色谱仪的重要配套装置。2. 柱后衍生装置柱后衍生又称柱后反
组蛋白分子伴侣DAXX和染色质重塑蛋白ATRX相互作用模式
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈勇研究组的最新研究成果，以Structural basis for DAXX interaction with ATRX为题，发表在Protein & Cell上，该成果揭示了组蛋白分子伴侣DAXX蛋白与染色质重塑蛋白ATRX相互作用
KinExA分子与完整细胞相互作用系统的原理与应用（一）
一、KinExA的技术背景： Sapidyne Instruments Inc.于1995年在美国创立，产品基于独特的Kinetic Exclusion Assay（KinExA）ZL技术。在公司成立早期，Xavier大学、美国陆军和环境保护局等研究单位采用KinExA技术开展了大量工作；经过数
全球获批小分子药物靶点的现状分析
近期，Nature Reviews Drug Discovery（IF=47）杂志刊登的题为“A comprehensive map of molecular drug targets”的综述，对目前已获批的小分子药物及靶点进行了综合分析。研究人员收集了1591种批准药（小分子药物和生物药物），以及
利用蛋白连接酶和切割酶可控地制备聚合蛋白质分子
将多个蛋白质分子交联构建成蛋白二聚体、三聚体甚至多聚体在生物技术、材料和制药等领域有着广泛的应用。以蛋白质为基质的生物材料，具有完美的生物相容性和功能多样性等优势。而在生物制药中，将蛋白类药物分子与其他分子或蛋白交联聚合也有着广泛的应用。目前蛋白聚合主要是利用巯基交联的方式，该反应聚合过程较难调
关于蛋白与分子的结合的讨论
Docking相关A:新手想问一下，docking结果怎么判断小分子和蛋白产生了结合呀，形成了疏水键或氢键吗?B:打分越低越好，一般会设置一个已知的配体用来做参照，或者说用来检验参数是否合理。A:我是选择了有配体的蛋白，处理了蛋白和分子后进行docking，得到这个结果。B:只要比这个配体的打分低，
酶免蛋白(及酶)—小分子半抗原结合物的制备
在临床实验室中，我们常常会遇到有关小分子物质如激素、治疗药物和毒品等的测定问题，而这些小分子通常分子量小于1 000，只是半抗原，仅有反应原性，没有免疫原性，如像蛋白大分子一样，将其直接免疫动物，不能得到小分子的抗体，只有将其先与载体蛋白相连接，组成完全抗原免疫动物，才能得到特异的抗小分子抗体，
Alpha®CETSA®方案细胞水平小分子结合相应靶向蛋白的验证
我们不再是我们，我们依然是我们——当Alpha®遇上CETSA® 小分子药物研发中，筛选能有效结合目标蛋白的分子是非常耗时耗（财）力的一个环节，但又是必须进行的工作。高失败率源于结合情况的错综复杂，体外生化实验的结合效果，往往不能很好的在细胞水平进行重现。这其中可能是因为分子在穿越细胞膜时
蛋白质分子量的测定：SECMALS－与传统校正法（二）
表 1：BSA 单体、二聚体和三聚体的测得分子量三聚体二聚体单体RV 峰 - (ml)14.3115.3717.05Mn - (kDa)203.8135.266.4Mw - (kDa)204.4135.366.5Mw/Mn1.0031.0011.001Wt Fr（峰）0.0540.1650.78图
隆抗体与小分子化合物相比有何优点
1．单克隆抗体的特性 1）高特异性：由于单克隆抗体只针对一个抗原决定簇，而一个抗原决定簇又很小，一般只有4～7个氨基酸，故单克隆抗体发生交叉反应的机会很少，即其特异性高。但这种专一性也不是绝对的。在相似的抗原之间，其特异性具有浓度的依赖性，即当抗体的浓度达到一定的程度后，其特异性可有所降低。 2
沃特世ACQUITY－RDa检测器，提升小分子分析便捷度与可靠性
采用SmartMS技术，操作便捷且符合法规要求，有效助力常规分析实现精确质量测定 美国马萨诸塞州米尔福德市，即时发布–沃特世公司（纽约证券交易所代码：WAT）隆重推出采用SmartMS技术的ACQUITY RDa检测器，为沃特世飞行时间(Tof)质谱(MS)系列再添一款智能化新品。这款精确质量数检
新型分子传感器可探测蛋白质或药物小分子的详细信息
尽管科学家因为石墨烯无与伦比的属性而对其青睐有加，但迄今为止，其实际应用仍然乏善可陈。不过，瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）生物纳米系统实验室和西班牙光子科学研究所的科学家们在最新一期的《科学》杂志上宣称，他们利用石墨烯独特的光学和电子学属性，研制出了一种具有超高灵敏度的分子传感器，可以探测蛋白
利用细菌特殊蛋白充当传感器测定特定分子的尺寸
近日，来自弗莱堡大学等处的研究人员通过研究开发了一种新型方法，该方法可以精确测定单一分子的尺寸；文章中，研究人员利用嗜水气单胞菌分泌产生的气单胞菌溶素蛋白代替了金黄色葡萄球菌产生的α-溶血素，这种气单胞菌溶素蛋白可以在人工细胞膜上形成一种孔状结构。 相关研究结果发表于杂志ACS Nano上，研