凋亡细胞核DNA片段检测方法进展(一)
摘 要:当今生物学领域的研究一个热点之一是细胞凋亡。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决是方法学问题。作者从凋亡细胞的特征性核DNA片段检测着手,阐述了多种凋亡细胞核DNA片段检测方法以及近年来的一些新进展。细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD),是有别于细胞坏死而受基因控制的一种主动性细胞自杀过程。对细胞凋亡的研究已成为当今生物学领域的热点之一。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决的是方法学问题。根据凋亡细胞的生化特征检测组织或培养细胞中的细胞凋亡发生状况,是一种特异而敏感的方法,特别是与其他方法(如流式细胞仪)结合后,可以对细胞凋亡进行定性和定量的研究。下面根据生化特征检测细胞凋亡的方法学及有关进展作一综述。1 琼脂糖凝胶电泳细胞凋亡最显著而具特征性的生化特征是DNA降解为大约由180~200 bp或其多聚体组成的寡核苷酸片段,琼脂糖凝胶......阅读全文
DNA片段纯化与回收常见问题分析
Q:利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段?A:可能有以下几个原因: 1. 胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解; 2. 胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收; 3. 电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适
DNA片段的亚克隆实验——基本方案
所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。实验材料DNA试剂、试剂盒CIPdNTPDNA聚合酶T4聚
脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非
脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收
低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非常有效的。本实验来源「
“垃圾DNA”片段是如何开启或关闭基因?
普林斯顿大学的研究人员近日捕捉到一段视频,显示曾被认为是“垃圾DNA”的片段如何开启或关闭基因。这段视频和成果于周一发表在《Nature Genetics》上。 在人类基因组中,未编码基因的DNA片段占90%以上。过去,它们被认为是“垃圾DNA”,但是后续的研究证实,这些片段包含了开启或关闭基
研究实现大片段DNA染色体整合
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制
分子克隆化DNA片段与载体连接介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一,方法有: ①粘性末端连接,DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端,用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样,有些限制性内切酶虽然识别不同顺序,却能产生相同末端。 ②平头末端连接,用物理方法制备的DN
细胞死亡的检验方式
细胞发生凋亡时具有固有的形态特征,如细胞核表现缩小、染色质边缘化、凝集,凋亡晚期还会出现由核碎片与胞质内的部分细胞器混合在一起,且被细胞膜包裹形成的凋亡小体。DNA特异性染料(如Hoechst33342、Hoechst33258和DAPI等)可以与DNA的A-T碱基区进行非嵌入式结合,从而使细胞核着
DNA-Ladder的测定方法是怎么一回事?
不同细胞不同状态是有不同死法的,具体是细胞凋亡、坏死、还是程序性坏死,需要进一步排查分析来确定。而细胞凋亡是个复杂的过程,针对凋亡时期不同,检测的方法有所不同。那如何去确定哪条途径被触发,在哪个步骤被阻断,以及抑制剂是否能够抑制呢?下面介绍几种常用的测定方法。 一:细胞凋亡的形态学检测 发生
细胞凋亡检测实验——DNA-片断化检测
实验方法原理细胞凋亡时主要的生化特征是其染色质发生浓缩, 染色质DNA 在核小体单位之间的连接处断裂, 形成50~300 kbp 长的DNA 大片段, 或180~200 bp 整数倍的寡核苷酸片段, 在凝胶电泳上表现为梯形电泳图谱(DNA ladder)。细胞经处理后,采用常规方法分离提纯DNA,进
DNA降解断裂法检测肿瘤细胞凋亡
实验方法原理 凋亡的DNA降解选择性发生在核小体间DNA,提取细胞总DNA或者选择性提取小分子量DNA后电泳可检查独特的核小体间片段DNA。 实验材料 肿
DNA降解断裂法检测肿瘤细胞凋亡
细胞DNA提取 实验方法原理 凋亡的DNA降解选择性发生在核小体间DNA,提取细胞总DNA或者选择性提取小分子量DNA后电泳可检查独特的核小体间片段DNA。
关于细胞凋亡细胞DNA-含量的测定
细胞凋亡时,核酸内切酶激活,导致DNA 断裂,这是凋亡的特征性表现,也为FCM 鉴别凋亡细胞奠定了基础。而检测细胞凋亡DNA 断裂的方法中,最常用、最简便的就是细胞DNA 含量分析。当细胞用乙醇、TrtionX—100 处理后细胞膜上出现漏洞,小片段DNA 从细胞内释放出来,使其DNA 含量低于
怎样鉴定细胞凋亡
细胞凋亡的检测细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式,根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别,可以将二者区别开来。细胞凋亡的检测方法有很多,下面介绍几种常用的测定方法。一、细胞凋亡的形态学检测根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。1 光学显微镜和
细胞凋亡检测方法
细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式,根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别,可以将二者区别开来。细胞凋亡的检测方法有很多,下面介绍几种常用的测定方法。一、细胞凋亡的形态学检测 根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。 1 光学显微镜和倒
线粒体介导的凋亡过程介绍
当线粒体的膜电位下降,线粒体膜通透性增加,线粒体内促凋亡因子(例如:当线粒体的膜电位下降,线粒体膜通透性增加,线粒体内促凋亡因子(例如:Cyt C、AIF、SMAC/DIABLO、HTRA2/OMI、ENDOG)释放到胞质中。Cyt C释放到胞内以后,与Apaf-1相互作用,在ATP和dATP的协
用hoechst染细胞核测细胞凋亡,怎么样看结果
1、HE染色、光镜观察:凋亡细胞呈圆形胞核深染胞质浓缩染色质团块状细胞表面芽现象2、丫啶橙(AO)染色荧光显微镜观察:细胞核呈黄绿色荧光胞质呈红色荧光凋亡细胞核染色质呈黄绿色浓聚核膜内侧见细胞膜呈泡状膨及凋亡体3、台盼蓝染色:细胞膜完整、破裂台盼蓝染料进入细胞细胞变蓝即坏死细胞膜完整细胞台盼蓝染色则
常用的几种细胞凋亡检测方法详细步骤介绍
细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式,根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别,可以将二者区别开来。细胞凋亡的检测方法有很多,下面介绍几种常用的测定方法。 第一种 细胞凋亡的形态学检测 根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。
早期细胞凋亡的标志
细胞凋亡的检测细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式,根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别,可以将二者区别开来。细胞凋亡的检测方法有很多,下面介绍几种常用的测定方法。一、细胞凋亡的形态学检测根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。1 光学显微镜和
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。实验材料 DNA 大小标准基因组 DNA试剂、试剂盒 溴化乙锭酚:氯仿仪器、耗材 水浴实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液溴化
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验
标记DNA的3‘末端 修复突出的3’或5‘末端 随即寡核苷酸引物介导 实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ-Klenow片段实验
实验方法原理 选用本方法可产生用于放射自显影的32P末端标记分子量标志物。放射自显影带的强度与片段长度无关,标记DNA可稳定数月之久。 实验材料 DNA试剂、试剂盒 dNTP仪器、耗材 水浴锅实验步骤 1. 在20 μl 反应体积中,用可产生5’突出端的限制性内切酶消化0.1~0.4 μg DNA
DNA片段能预知寿命:端粒长度决定生物寿命
西班牙、英国研究人员最近发现,提取血液中的细胞,测试细胞中端粒的长度,可推断一个人的寿命有多长。这种检测方法将于2011年年底在英国上市,由此引来争议与关注 端粒长度 决定生物寿命 西班牙马德里国立癌症研究中心的玛莉亚・比拉斯科博士是这项商业端粒检测方法的发明者,她说这是一种非常简单、快捷
DNA片段探针的应用实验——水溶液中杂交
实验材料DNA试剂、试剂盒杂交液洗膜液仪器、耗材培养箱实验步骤1. 除了于65℃在杂交液Ⅰ中温育的条件外,预杂交按甲酰胺法进行。 2. 按甲酰胺法制备探针并用2 ml 杂交液Ⅰ稀释。3. 滤膜在65℃杂交过夜,然后移去杂交液,用低严紧性洗膜液Ⅰ洗膜2次。4. 用高严紧性洗膜液Ⅰ在65℃迅速洗
脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收
实验方法原理 低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。 实验材料
分子克隆实验DNA片段与载体连接方法介绍
DNA分子与载体分子连接是克隆过程中的重要环节之一,方法有:①粘性末端连接,DNA片段两端的互补碱基顺序称之为粘性末端,用同一种限制性内切酶消化DNA可产生相同的粘性末端。在连接酶的作用下可恢复原样,有些限制性内切酶虽然识别不同顺序,却能产生相同末端。②平头末端连接,用物理方法制备的DNA往往是平头
细胞凋亡的几种检测方法介绍
一、形态学观察方法1、HE染色、光镜观察:凋亡细胞呈圆形,胞核深染,胞质浓缩,染色质成团块状,细胞表面有“出芽”现象。2、丫啶橙(AO)染色,荧光显微镜观察:活细胞核 呈黄绿色荧光,胞质呈红色荧光。凋亡细胞核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧,可见细胞膜呈泡状膨出及凋亡小体。3、台盼蓝染色:如果细胞膜 不
细胞凋亡的几种检测方法
一、形态学观察方法 1、HE染色、光镜观察:凋亡细胞呈圆形,胞核深染,胞质浓缩,染色质成团块状,细胞表面有“出芽”现象。 2、丫啶橙(AO)染色,荧光显微镜观察:活细胞核呈黄绿色荧光,胞质呈红色荧光。凋亡细胞核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧,可见细胞膜呈泡状膨出及凋亡小体。 3、台盼蓝
细胞凋亡的几种检测方法
一、形态学观察方法1、HE染色、光镜观察:凋亡细胞呈圆形,胞核深染,胞质浓缩,染色质成团块状,细胞表面有“出芽”现象。2、丫啶橙(AO)染色,荧光显微镜观察:活细胞核呈黄绿色荧光,胞质呈红色荧光。凋亡细胞核染色质呈黄绿色浓聚在核膜内侧,可见细胞膜呈泡状膨出及凋亡小体。3、台盼蓝染色:如果细胞膜不完整