凋亡细胞核DNA片段检测方法进展(一)

摘 要:当今生物学领域的研究一个热点之一是细胞凋亡。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决是方法学问题。作者从凋亡细胞的特征性核DNA片段检测着手,阐述了多种凋亡细胞核DNA片段检测方法以及近年来的一些新进展。细胞凋亡(apoptosis)又称细胞凋谢或称程序性细胞死亡(Programmed cell death,PCD),是有别于细胞坏死而受基因控制的一种主动性细胞自杀过程。对细胞凋亡的研究已成为当今生物学领域的热点之一。开展对细胞凋亡的研究,首先要解决的是方法学问题。根据凋亡细胞的生化特征检测组织或培养细胞中的细胞凋亡发生状况,是一种特异而敏感的方法,特别是与其他方法(如流式细胞仪)结合后,可以对细胞凋亡进行定性和定量的研究。下面根据生化特征检测细胞凋亡的方法学及有关进展作一综述。1 琼脂糖凝胶电泳细胞凋亡最显著而具特征性的生化特征是DNA降解为大约由180~200 bp或其多聚体组成的寡核苷酸片段,琼脂糖凝胶......阅读全文

检测细胞凋亡的实验方法比较3

◆ 细胞坏死与细胞凋亡细胞凋亡与坏死是两种完全不同的细胞凋亡形式,根据死亡细胞在形态学、生物化学和分子生物学上的差别,可以将二者区别开来。细胞凋亡的检测方法有很多,下面介绍几种常用的测定方法。 一、细胞凋亡的形态学检测   根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。

细胞凋亡检测(AnnexinVFITC-单染法)2

2 荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜一般以细胞核染色质的形态学改变为指标来评判细胞凋亡的进展情况。常用的DNA 特异性染料有:HO 33342 (Hoechst 33342),HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。三种染料与 DNA 的结合是非嵌入式的,主要结合在DNA 的A

PCR扩增样本DNA的HLA基因片段

一、PCR扩增体系1. 1.0uM 引物2. 300ng待测样本基因组DNA3. 2.0U Taq多聚酶4. 200uM 各种dNTP5. 用1 X PCR缓冲液(10mM Tris-HCl,pH8.3,50mM KCl,1.5mM MgCl2,0.01%明胶)调至总体积100ul,并用50ul矿物

DNA片段的回收实验——微量柱法

实验材料DNA片段试剂、试剂盒纯化试剂盒异丙醇仪器、耗材离心机电泳仪电泳槽取液器微量真空装置抽滤装置实验步骤1.  紫外灯下从胶上切下目的片段,放入一Epphendof管中。2.  离心管在-20℃冷却5~10分钟。3.  将微量柱下套上一Epphendof管,将冷却的胶条装进微量柱中,4℃12 0

如何提高DNA片段的转化率

一、克隆分析原理克隆分析用于将DNA片段从一个载体(质粒、黏粒或噬菌体)转移到另一个载体上。它们通常用于构建表达系统,或是将DNA片段转移到特殊的载体上以制备杂交探针或是制备测序用的单链模板。典型的载体含有三个必要的元件:一个抗生素抗性标记、一个复制起点(以便选择转化了的大肠杆菌宿主)以及一个或多个

体外连接DNA片段的方式有哪些?

第一种方法是,用DNA连接酶连接具有互补粘性末端的DNA片段;第二种方法是,用T4DNA连接酶直接将平末端的DNA片段连接起来,或是用末端脱氧核苷酸转移酶给具平末端的DNA片段加上poly(dA)-poly(dT)尾巴之后,再用DNA连接酶将它们连接起来;第三种方法是,先在DNA片段末端加上化学合成

DNA片段的回收实验——树脂回收法

目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术,回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。实验方法原理本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程,PCR产物即能被有效地从含引物二聚体、非特异性扩增引物片断等混合物中分离

深圳罗湖首次截获人体组织DNA片段

  深圳市出入境检验检疫局罗湖局日前在一名旅客携带入境行李中截获人体组织DNA片段,这是罗湖口岸首次截获该类物品。  据相关工作人员介绍,当日在该旅客行李中发现一批离心管样品,共36支。经查,该批样品为人体组织DNA片段,用离心管装载并包裹于牛皮纸盒中放置于填充干冰的保温箱内,离心管及纸盒外无任何标

分子克隆化DNA片段的制备介绍

  常用以下方法获得DNA片段:  ①用限制性核酸内切酶将高分子量DNA切成一定大小的DNA片段;  ②用物理方法(如超声波)取得DNA随机片段;  ③在已知蛋白质的氨基酸顺序情况下,用人工方法合成对应的基因片段;  ④从mRNA反转录产生cDNA。

体外连接DNA片段的具体方式介绍

平末端DNA片段的连接常用的平末端DNA片段连接法,主要有同聚物加尾法、衔接物连接法及接头连接法。同聚物加尾法这种方法的核心部分是,利用末端脱氧核苷酸转移酶转移核苷酸的特殊功能。末端脱氧核苷酸转移酶是从动物组织中分离出来的一种异常的DNA聚合酶,它能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到DNA分子

体外连接DNA片段的具体方式介绍

平末端DNA片段的连接常用的平末端DNA片段连接法,主要有同聚物加尾法、衔接物连接法及接头连接法。同聚物加尾法这种方法的核心部分是,利用末端脱氧核苷酸转移酶转移核苷酸的特殊功能。末端脱氧核苷酸转移酶是从动物组织中分离出来的一种异常的DNA聚合酶,它能够将核苷酸(通过脱氧核苷三磷酸前体)加到DNA分子

DNA酶解及DNA片段琼脂糖凝胶电泳

【目的要求】1.掌握限制性核酸内切酶概念、特点及作用原理,DNA酶解技术的应用2.掌握琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段原理及其操作3.熟悉电泳基本原理及其影响因素【教学内容】1.限制性核酸内切酶概念、特点及作用原理,DNA酶解技术的应用2.DNA片段琼脂糖凝胶电泳3.电泳概念、分类、应用、基本原理及其影

检测凋亡和其他形式的细胞死亡

实验步骤基本方案1 用活细胞或荧光染料定量细胞活性显微镜观察是一种简单且准确的检测凋亡的方法。凋亡的标志性特征包括细胞核浓缩 、细胞膜完整但出现发泡现象,以及清晰的胞质。材 料 (带7 项 目 见 附 录 1)V 染料混合剂P B S 的 细 胞 悬 液 (附 录 1)9 6 孔圆底板显微镜用的载玻

mtDNA与细胞核DNA相比的优点

①突变率高,是核DNA的10倍左右,因此即使是在近期内趋异的物种之间也会很快地积累大量的核苷酸置换,可以进行比较分析;②因为精子的细胞质极少,子代的mtDNA基本上都是来自卵细胞,所以mtDNA是母性遗传(maternal inheritance),且不发生DNA重组,因此,具有相同mtDNA序列的

细胞凋亡形态学检测与观察

hoechst33258染色,他们认为细胞发生凋亡时,染色质会固缩。 所以Hoechst染色时,细胞核会呈致密浓染,或呈碎块状致密浓染。正常细胞核刺激后有致密浓染的凋亡细胞  AO-EB染色法:The image below shows human lymphoma cells treated wi

细胞凋亡检测实验——DNA-ladder法

实验方法原理发生细胞凋亡时,内源性核酸酶被激活,染色体DNA链在核小体之间被切割,形成180~200个碱基或其整数倍的DNA片段,将这些DNA片段抽提出来进行电泳,可得到DNA梯状条带(DNA ladder)。 实验材料凋亡细胞试剂、试剂盒蛋白酶K醋酸钾白细胞裂解液Tris-HClNaClEDTAS

免疫组化的细胞凋亡检测

  细胞凋亡原理:正常凋亡细胞通过检测凋亡细胞DNA片段进行染色,正常的、人为造成凋亡的细胞很少能够被染色。以甲基绿复染,便于从形态学上分辨评估正常细胞和凋亡细胞。  首先确定目标凋亡细胞的组织部位(如眼球组织,由于玻璃体结构内没有细胞核,因此看不到凋亡,在整个组织的最外面有单层视网膜细胞,因此只能

细胞凋亡(TUNEL,TUNEL染色)检测技术

细胞凋亡是指为维持内环境稳定,  生物体内细胞在特定的内源或外源信号诱导下,其死亡途径被激活,并在有关基因的调控下发生的程序性死亡过程。细胞凋亡是程序性死亡过程的一种主要形式,它涉及染色质凝聚和外周化、细胞质减少、核片段化、细胞质致密化、与周围细胞联系中断、内质网与细胞膜融合,最终细胞片段化形成许多

7种细胞凋亡有效的检测方法

7种细胞凋亡有效的检测方法一、细胞凋亡的形态学检测 根据凋亡细胞固有的形态特征,人们已经设计了许多不同的细胞凋亡形态学检测方法。1 光学显微镜和倒置显微镜2 荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜3 透射电子显微镜观察二、磷脂酰丝氨酸外翻分析(Annexin V法)磷脂酰丝氨酸(Phosphatidyls

Caspase活化、核染色质固缩及DNA片段化

Life Technologies提供了用于细胞功能和健康检测的各种试剂。其中许多分析以荧光或比色法为基础,具有灵敏性、便利性和安全性。这些产品已经过多种仪器平台验证,包括显微镜、流式细胞仪、酶标仪和高内涵筛选,能够实现各种细胞功能的分析:细胞活性和细胞毒性细胞增殖和细胞周期细胞凋亡自噬氧化应激内吞

关于细胞凋亡检测—Y-啶橙染色法(-Acridine-Orange-,AO)的基本介绍

  AO 可将细胞或细胞核中的双链DNA 和变性DNA 染成不同颜色的荧光。AO 插入双链DNA 中时,发绿色荧光;AO也可与单链或通过变性而产生的DNA 单链发生作用,这时发出红色荧光,因此,通过FCM 检测不同的荧光,可判断凋亡的发生。在测定被标准化后,绿色和红色荧光强度的量与总DNA 含量成比

Y-啶橙染色法(-Acridine-Orange-,AO)检测细胞凋亡的介绍

  AO 可将细胞或细胞核中的双链DNA 和变性DNA 染成不同颜色的荧光。AO 插入双链DNA 中时,发绿色荧光;AO也可与单链或通过变性而产生的DNA 单链发生作用,这时发出红色荧光,因此,通过FCM 检测不同的荧光,可判断凋亡的发生。在测定被标准化后,绿色和红色荧光强度的量与总DNA 含量成比

常用的几种细胞凋亡检测方法详细步骤(二)

第三种 线粒体膜势能的检测 线粒体在细胞凋亡的过程中起着枢纽作用,多种细胞凋亡刺激因子均可诱导不同的细胞发生凋亡,而线粒体跨膜电位DYmt的下降,被认为是细胞凋亡级联反应过程中最早发生的事件,它发生在细胞核凋亡特征(染色质浓缩、DNA断裂)出现之前,一旦线粒体DYmt崩溃,则细胞凋亡不可逆转。线粒体

常用细胞凋亡检测方法(图)

一、细胞凋亡的形态学检测1、光学显微镜和倒置显微镜(1) 未染色细胞:凋亡细胞的体积变小、变形,细胞膜完整但出现发泡现象,细胞凋亡晚期可见凋亡小体。贴壁细胞出现皱缩、变圆、脱落。(2) 染色细胞:常用姬姆萨染色、瑞氏染色等。凋亡细胞的染色质浓缩、边缘化,核膜裂解、染色质分割成块状和凋亡小体等典型的凋

细胞死亡的检验方式

细胞发生凋亡时具有固有的形态特征,如细胞核表现缩小、染色质边缘化、凝集,凋亡晚期还会出现由核碎片与胞质内的部分细胞器混合在一起,且被细胞膜包裹形成的凋亡小体。DNA特异性染料(如Hoechst33342、Hoechst33258和DAPI等)可以与DNA的A-T碱基区进行非嵌入式结合,从而使细胞核着

DNA片段的回收实验——液氮冻融法

实验材料DNA片段试剂、试剂盒纯化试剂盒异丙醇仪器、耗材离心机电泳仪电泳槽取液器微量真空装置抽滤装置实验步骤1.  紫外灯下从胶上切下目的片段,放入一Epphendof管中。2.  离心1 min,加入500 ul TE,200 ul 酚/氯仿混匀。3.  离心管放入液氮中10~15 min,再室温

研究实现大片段DNA染色体整合

近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心开发了创新的、基于可重复利用靶点的大片段DNA染色体整合策略,构建了首株能够脱离质粒、稳定合成红霉素A的大肠杆菌菌株,并提升了产量。红霉素是临床重要的广谱大环内酯类抗生素。传统研究多采用多质粒系统进行表达,但质粒的不稳定性、抗生素的使用及细胞代谢负担过重,限制

“垃圾DNA”片段是如何开启或关闭基因?

  普林斯顿大学的研究人员近日捕捉到一段视频,显示曾被认为是“垃圾DNA”的片段如何开启或关闭基因。这段视频和成果于周一发表在《Nature Genetics》上。  在人类基因组中,未编码基因的DNA片段占90%以上。过去,它们被认为是“垃圾DNA”,但是后续的研究证实,这些片段包含了开启或关闭基

新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘

  美国华盛顿大学的一个研究小组称,他们使用了一种被称为“mrFAST”的新型DNA测序算法,可对基因的重复片段进行精确统计并对其作用作出初步判断。相关研究发表在8月30日出版的《自然·遗传学》杂志上。   据了解,截至2003年底,绝大部分的人类基因组已获得测定。但基因组中仍有许多的区域未获得测

DNA片段纯化与回收常见问题分析

Q:利用凝胶回收试剂盒DNA回收效率较低或者未回收到目的片段?A:可能有以下几个原因:   1. 胶块未完全溶解,可适当延长水浴时间,并增加上下颠倒次数辅助溶解;   2. 胶块体积太大,应先将其切为小块,分多次回收;   3. 电泳缓冲液pH太高,硅基质膜在高盐低pH结合DNA,如pH太高,应作适