差减cDNA文库的建立实验
实验方法原理 实验材料 ［＋］ 和 ［-］cDNA 文库（ATCC 或 Stratagene）试剂、试剂盒 TE 缓冲液EcoRI EDTA蔗糖溶液琼脂糖凝胶TBE 缓冲液乙醇S1 核酸酶S1 核酸酶缓冲液苯酚 氯仿 异丙醇乙酸钠AluIRsaI去离子甲醜胺SDS酵母 tRNA氯仿 异丙醇磷酸化的 λgt10 连接臂T4 DNA 连接酶E.coli C600flAλ 噬菌体包装抽提物悬浮介质仪器、耗材 离心管实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 从［+］ 和 ［-］ 的细胞或组织获得 cDNA 文库。本方案假设［＋］ 和 ［-］ 文库是 λ 噬菌体文库。如果这两种文库的载体都是质粒的话，那么它们都只需要 100 ug。插入片段需琼脂糖凝胶电泳纯化，而不仅仅是蔗糖梯度离心纯化。2. 使用大规模的 DNA 纯化柱从［＋］和 ［-］ 文库中各纯化＞1 mg 的 DNA。以 1 mg/ml 的浓度......阅读全文
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。 实验材料
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。实验材料 TY试剂、试剂盒 储存液溶菌酶干粉细菌裂解缓冲液甘油水溶液实验步骤 一、材料与设备1. 2X TY：16 g 蛋白胨，10 g 酵母提
构建cDNA文库的反转录的注意事项
这是构建cDNA文库中最贵的一步，也是核酸质变的一步，它将易降解的RNA变成了不易降解的cDNA。反转录不成功，说明一次文库方案的夭折。反转录效率不高表现在一是部分mRNA被反转录了，但还有相当一部分本该反转录的mRNA未被反转总的全长cDNA太少，这就难以构建好的全长cDNA文库。少量程度的m
cDNA文库组标准流程一:Total－RNA的提取
1.试剂配制准备工作：1、研钵、5ml/10ml/ 25ml移液管、100ml/250ml量筒、250ml/100ml容量瓶、药匙、 试剂瓶等玻璃制品均用锡纸包裹口部，置于烤箱内,180℃，烤6小时。2、50ml/1.5ml离心管、枪头等塑料制品用0.1‰DEPC水浸泡过夜后，121℃ 20mins
cDNA文库组标准流程四:载体制备
1．pBlueScriptII的提取1．取1ul商品的pBlueScriptII，转化入大肠杆菌宿主菌中，取5ul转化产物均匀涂布在含AMP的LB平板上，37℃培养过夜。2．第二天取一只无菌的50ml离心管，加入10ml AMP抗性的LB液体培养基，挑单克隆于离心管中，37℃，250rpm，培养过夜
cDNA文库组标准流程六:电转化流程
1．电转化感受态细胞的制备1. 用枪头挑取单克隆菌落，投入盛有10ml LB液体培养基的50ml离心管中。（同时做培养基和枪头的空白对照）2. 37℃，220rpm，培养14-16个小时。3. 第二天，以1：100的比例将这10ml菌液倒入1000ml LB液体培养基中
SSH抑制性消减杂交文库构建方法介绍
SSH是一项可以快速获取两个不同生物材料中差异表达基因的分子生物学技术，是快速筛选差异表达基因的有效方法，也是寻找新基因的重要手段。该技术尤其适合以genome尚不完全清晰的物种或者以特殊材料为研究对象的科研工作者。是基因芯片技术的有效补充。基本流程:通过差减文库构建，文库验证和筛选（逆向斑点杂交）
cDNA文库组标准流程七:快速鉴定、菌落PCR
1．质粒快速鉴定 试剂：Protoplasting buffer:30mM Tris-HCl, pH8.0 0.33ml/1.0M 5mM EDTA 0.1ml/0.5M 50mM
各家cDNA文库构建试剂盒优缺点比较
Invitrogen的:采用的是Gateway技术：利用λ噬菌体位点特异重组系统的BP和LR双向反应，首先将PCR产物用传统方法克隆到Gateway化的入门载体，这个目标基因就可以迅速方便而且定向地重组到任何Gateway化的表达载体上.优点:1无需限制酶切、无需连接，只要利用重组酶就可以穿梭于任何
cDNA文库的构建和筛选—在外界环境压力条件
实验步骤 一、材料 所有化学试剂均为分子生物学级纯度。所用塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头均经高压蒸气灭菌。涉及核酸的操作均需带手套。 1.总 RNA提取 （1）无 RNase 水。加 I mL 焦 炭 酸 二 乙
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品RNasin反转录缓冲液仪器、耗材PCR 管子热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheApplied
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin反转录缓冲液仪器、耗材 PCR 管子 热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheAp
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇 dNTP 随机引物 来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin 反转录缓冲液
怎样去除cDNA文库构建过程中的核糖体RNA
反转录结束后，加RNase处理
差示分析法的介绍
以往研究基因表达差异的方法主要有： 蛋白质双向电泳、cDNA 减法杂交和mRNA 差示技术( 简称DD2PCR )。蛋白质双向电泳只能粗略地比较两种细胞内产生的蛋白质， 不能直接从基因水平分析鉴定， 因而很难推广； cDNA 减法杂交需建立cDNA 文库， 通过两次杂交分离去除双链分子， 再将余下的
云南建立三种野生稻基因文库
云南省农科院生物技术与种质资源研究所目前已为该省分布的三种野生稻建立了基因文库。 云南省农科院生物技术与种质资源研究所副所长程在全博士接受新华社记者专访时表示，在优异种质基因发掘研究方面，研究所首次构建了普通野生稻、疣粒野生稻和药用野生稻cDNA文库，并从中发现和分离获得一大批野生稻重要功能基因
噬菌体文库的扩增实验
文库一旦包装就应该尽快进行扩增，它可以大大增加文库的拷贝数，但在扩增时由于克隆的生长速率不同，文库的组成可能会出现某种潜在的改变。这种文库克隆组成比率的变化可以通过把文库克隆预吸附到细菌上并使用一种高密度铺平板和短期培养的方法而尽量减少。文库一旦包装就应该尽快进行扩增，它可以大大增加文库的拷贝数，但
噬菌体文库的扩增实验
实验材料 噬菌体试剂、试剂盒 MgSO4麦芽糖琼脂糖氯仿DMSOSM仪器、耗材 离心机分光光度计水浴锅实验步骤 1. 制备铺平板菌（1）2.5 ml 新鲜过夜培养的宿主菌液接种于250 ml 含0.2%麦芽糖和10 mmol/l MgSO4的LB培养液中。（2）在37℃恒温摇床剧烈摇荡2~4 h，
噬菌体文库的扩增实验
基本方案 实验材料 噬菌体 试剂、试剂盒
YAC实验——YAC文库构建
YAC带有天然染色体所有的功能元件，包括一个着丝粒，一个DNA复制起点，两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA，这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因，在染色体步移中每次允许更大的步移距离，同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验步骤1. 尽管当插入片段大于10
YAC实验——YAC文库筛选
实验步骤1. YAC中心实验室用于筛选文库的方法进展很快。2. 将一块或多块微量滴定板微孔中的YAC克隆转印到尼龙膜上，用单拷贝探针进行杂交，就可以筛选YAC文库了。3. 然而，由 于杂交实验的信噪比较低以及制备所有的转印尼龙膜所需的花费巨大，绝大多数实验室已采用PCR方法来筛选文库。4.
单链－cDNA－的合成实验
实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液
单链－cDNA－的合成实验
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶（100~200U/ul)SUPERaseIN
单链－cDNA－的合成实验
本方案利用的是总RNA，因为如果使用18SrRNA作内对照，在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA，以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X
cDNA文库的构建和筛选—在外界环境压力条件下，...（二）
8 标记探针的合成9 Northern 印迹（1）10X MOPS 缓冲液： 200 mmol/L MOPS， 50 mmol/L 乙酸納， 10 mmol/L EDT A , pH 7. 0。（2）I. 25% 甲醛变性胶：将 3.75 g 琼脂糖溶于 217 m L 双蒸水中，加 E B 至
cDNA文库的构建和筛选—在外界环境压力条件下，...（一）
cDNA文库的构建和筛选—在外界环境压力条件下，新表达基因的鉴定方法实验实验步骤 一、材料所有化学试剂均为分子生物学级纯度。所用塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头均经高压蒸气灭菌。涉及核酸的操作均需带手套。1.总 RNA提取（1）无 RNase 水。加 I mL 焦 炭 酸 二 乙 酯（DEP
cDNA－扩增和影印实验
实验材料保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1－甲基－2－吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 将密
cDNA－扩增和影印实验
实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列 试剂、试剂盒
锚定酶消化cDNA实验
试剂、试剂盒溶液与缓冲液引物仪器、耗材试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀（实验方案 A, 第 2 步
锚定酶消化cDNA实验
试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀（实验方案 A, 第