酵母前体mRNA剪接提取物实验(二)
(12) RNA 洗脱缓冲液:20 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.6),0.5 mol/L NaCl,10 mmol/L EDTA,2% ( V/V ) 苯酚(Tris EDTA 或 NaAc-EDTA 平衡),4°C 保存。(13) 7.5 moI/L 乙酸铵(NH4Ac):用 0.2 μm 孔径的滤器除菌,4°C 保存。(14) 70% ( V/V ) 乙醇:室温储存。(15) 染色液:10% 溴酚蓝,10% 二甲苯蓝,室温保存。染料可能不完全溶解,但不影响使用,使用前用力摇晃。(16) 去离子甲酰胺,pH 大于或等于分装成 1~10 ml 每份,于 -20°C 储存。储存超过 6 个月时须检查其 pH,如果 pH 低于 6.5 需进行去离子处理。(17) 转录产物上样缓冲液:98% 甲酰胺,50 mmol/L EDTA,溴酚蓝和二甲苯蓝各 0.1%。-20℃ 储存。(18) 蛋白酶 K 溶液:2.5 mg ......阅读全文
酵母前体mRNA剪接提取物实验(二)
(12) RNA 洗脱缓冲液:20 mmol/L Tris-HCl ( pH 7.6),0.5 mol/L NaCl,10 mmol/L EDTA,2% ( V/V ) 苯酚(Tris EDTA 或 NaAc-EDTA 平衡),4°C 保存。(13) 7.5 moI/L 乙酸铵(NH4Ac):用 0
酵母前体mRNA剪接提取物实验
真核生物前体 mRNA ( pre-mRNA ) 的剪接分为两步,即先从前体切去内含子,然后将两个外显子连接在一起形成成熟的 mRNA。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使
酵母前体mRNA剪接提取物实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。
酵母前体mRNA剪接提取物实验(一)
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶试剂、试剂盒 YPTris-HCl ETDASD
酵母前体mRNA剪接提取物实验(一)
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。 实验材料 tRNAUTPRNA 聚合酶 试剂、试剂盒 YPT
酵母剪接体分析实验(二)
4. 设备(1) 液氮 (N2)。(2) 离心机,匀浆器,旋转真空浓缩仪。(3) 各种试管、离心管。(4) 玻璃板:一块为 26.5 cm 高、20.2 cm 宽、0.4 cm 厚。带凹口的玻璃板尺寸同前一块,但带一 2.2 cm 深、16.3 cm 宽的凹口。(5) 聚四氟乙烯垫片和梳子:垫片和梳
酵母剪接体分析实验
实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。
酵母剪接体分析实验
前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋
酵母剪接体分析实验(一)
实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。试剂、试剂盒 Tris HCI 溶液EDTATE乙酸钠SDSRNA 的匀浆缓冲液RNA 的溶解缓冲液T
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。
酵母提取物的制备实验
实验方法原理酵母细胞的裂解方法有很多种,包括自溶、压力破碎(如French加压罐)、研磨(玻璃珠振荡)和酶裂解(如Zymolase)等。本方案讨论的振荡玻璃珠研磨,是最简便的方法之一。这对于小体积(如<1mL的)和数升体积都很有效。经相差显微镜检测,细胞破碎率一般>95%。实验材料新鲜培养的酵母细胞
酵母提取物的制备实验
实验方法原理 酵母细胞的裂解方法有很多种,包括自溶、压力破碎(如French加压罐)、研磨(玻璃珠振荡)和酶裂解(如Zymolase)等。本方案讨论的振荡玻璃珠研磨,是最简便的方法之一。这对于小体积(如<1mL的)和数升体积都很有效。经相差显微镜检测,细胞破碎率一般>95%。实验材料 新鲜培养的酵母
酵母提取物的制备实验
基本方案 实验方法原理 酵母细胞的裂解方法有很多种,包括自溶、压力破碎(如French加压罐)、研磨(玻璃珠振荡)和酶裂解(如Zymolase)等。本方案讨论
转录产物mRNA前体的后加工
原核mRNA的原始转录产物(除个别噬菌体外)都可直接用于翻译,而真核mRNA一般都有相应的前体,前体必须经过后加工才能用于转译蛋白质。一般认为,真核mRNA的原始转录产物(也称原始转录前体), hn RNA(hetero-geneous nuclear RNA,核不均一RNA),最终被加工成成熟的m
mRNA前体的后加工过程介绍
原核mRNA的原始转录产物(除个别噬菌体外)都可直接用于翻译,而真核mRNA一般都有相应的前体,前体必须经过后加工才能用于转译蛋白质。一般认为,真核mRNA的原始转录产物(也称原始转录前体), hn RNA(hetero-geneous nuclear RNA,核不均一RNA),最终被加工成成熟的m
PNAS:U2AF的不同构象在mRNA前体剪接中起着关键性作用
2016年11月6日/生物谷BIOON/--在基因的RNA转录本能够表达蛋白之前,它们的非编码区被一种称作剪接体的复合体移除。在一项新的研究中,德国科学家们报道这种分子复合体的一种成员的不同构象在这种移除过程中发挥着至关重要的作用。 RNA充当着将储存在DNA中的遗传信息有序地转化为合成特异性
催化活化酵母剪接体的结构揭示了分枝机理
在1977年,Phillip Sharp和Richard Roberts俩个研究组独立发现了剪切这一过程,紧接着,1979年, Steitz研究组发现五种称为U1,U2,U4,U5和U6 snRNA的富含尿苷的小核RNA(snRNA)和7种12-35kDa的蛋白质(snRNPs)。之后,
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S10
剪接体
剪接体(英文:spliceosome)定义:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。实验材料 前体 mRNA 底物试剂、试剂盒 ATP CP 混合物HEPES-KOH聚乙烯醇
哺乳动物细胞体外剪接分析实验
实验方法原理 剪接反应的典型做法是使用核提取物,即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分,最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。
关于mRNA前体的后加工的介绍
原核mRNA的原始转录产物(除个别噬菌体外)都可直接用于翻译,而真核mRNA一般都有相应的前体,前体必须经过后加工才能用于转译蛋白质。一般认为,真核mRNA的原始转录产物(也称原始转录前体), hn RNA(hetero-geneous nuclear RNA,核不均一RNA),最终被加工成成熟
施一公:克服提纯问题,发布最新酵母剪接体结构
2018年5月25日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》(Science)杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer
Cell丨施一公组完成酵母剪接体结构最后拼图
真核生物pre-mRNA剪接由超分子复合物剪接体(spliceosome)完成。完整的剪接过程主要分为八种不同的状态,预催化剪接体的前体(pre-B),预催化剪接体(B),活化复合物(Bact),催化活化复合物(B*),催化步骤I复合物 (C),催化步骤II活化复合物(C*),催化后剪接体(P)
施一公团队《细胞》解析酵母ILS状态剪接体
北京时间9月15日凌晨,Cell在线发表了施一公教授课题组题为“Structure of an Intron Lariat Spliceosome from Saccharomyces cerevisiae”的论文,解析了酿酒酵母平均分辨率为3.5A的内含子套索剪接体ILS complex(In
施一公再发Science-克服提纯问题-发布最新酵母剪接体结构
2018年5月25日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》(Science)杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Structures of the Fully Assembled Saccharomyces cer
施一公等在《科学》发文报道酵母剪接体三维结构
2016年12月16日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心施一公教授研究组于(Science)杂志就剪接体的结构与机理研究再发长文(Research Article),题为《酵母剪接体处于第二步催化激活状态下的结构》(Structure of a Yeast Step II Catal
mRNA的分离和纯化实验(二)
(三) mRNA的分离1、mRNA与Oligo(dT)-纤维素结合:用移液器重新悬浮oligo(dT)-纤维素,取适量的oligo(dT)-纤维素到RNA样品中,盖上盖子,颠倒数次将oligo(dT)-纤维素与RNA混匀。于37℃水浴保温并温和摇荡15min。oligo(dT)-纤维素与RNA所需量