凝集素芯片技术应用于肿瘤侵袭研究
肿瘤的发生、发展以及转移与糖链的表达密切相关。一些肿瘤细胞糖基化修饰的改变能够影响细胞的周期调控和细胞的增殖能力,促进肿瘤的发展,但具体分子机制尚不清晰。来自美国纽约大学医学院的科研小组借助糖基化研究新工具——凝集素芯片,发现肿瘤转移相关驱动因子,进而找到其上游调控因子以及下游靶向因子,揭开了黑色素瘤转移机制,相关结果发表在国际顶级学术期刊Cancer cell上(PMID: 28609658)。 技术背景——凝集素芯片介绍 凝集素(Lectin)是一类自然界广泛存在的蛋白质,具有特定糖结构识别的特性。利用凝集素进行特定糖结构的解析是糖生物学研究领域的常用手段。凝集素芯片是将多种经典凝集素以微阵列的形式固定在高分子三维芯片片基上,形成高通量凝集素芯片,可进行多种糖结构的同步筛选和交叉验证。 1、凝集素芯片筛选糖基化谱 首先,研究人员通过凝集素芯片对临床黑色素瘤样本进行差异糖蛋白筛选。重点分析黑色素......阅读全文
凝集素芯片技术应用于肿瘤侵袭研究
肿瘤的发生、发展以及转移与糖链的表达密切相关。一些肿瘤细胞糖基化修饰的改变能够影响细胞的周期调控和细胞的增殖能力,促进肿瘤的发展,但具体分子机制尚不清晰。来自美国纽约大学医学院的科研小组借助糖基化研究新工具——凝集素芯片,发现肿瘤转移相关驱动因子,进而找到其上游调控因子以及下游靶向因子,揭开了黑
凝集素芯片技术应用于肿瘤侵袭研究
肿瘤的发生、发展以及转移与糖链的表达密切相关。一些肿瘤细胞糖基化修饰的改变能够影响细胞的周期调控和细胞的增殖能力,促进肿瘤的发展,但具体分子机制尚不清晰。来自美国纽约大学医学院的科研小组借助糖基化研究新工具——凝集素芯片,发现肿瘤转移相关驱动因子,进而找到其上游调控因子以及下游靶向因子,揭开了
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
Arraystar-CircRNA芯片应用于肝癌研究
第二军医大学免疫所所长、中国医学科学院院长曹雪涛院士课题组主要从事天然免疫与免疫调节基础研究、免疫治疗应用研究。近期其实验室用Arraystar CircRNA芯片研究发现circMTO1可以作为microRNA的吸附海绵结合癌基因miR-9从而上调p21的表达从而抑制肝细胞癌(hepatocell
肿瘤细胞侵袭实验
Matrigel 基质膜模型 实验方法原理 Matrigel 是从小鼠EHS肉瘤中提取的基质成分,含有LN、IV型胶原、接触蛋白和肝素硫酸多糖,铺在无聚乙烯
肿瘤细胞侵袭实验
Matrigel 基质膜模型 实验方法原理 Matrigel 是从小鼠EHS肉瘤中提取的基质成分,含有LN、IV型胶原、接触蛋白和肝素硫酸多糖,铺在无聚乙烯
糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片
糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密
糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片
糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密
科学家用微芯片揭示出肿瘤细胞如何变侵袭细胞
科学家用一种微芯片作为细胞的“障碍训练场”,揭示出细胞变形如何把肿瘤从良性变成了具有侵袭性的恶性肿瘤。相关论文发表在近期《自然·材料》杂志上。 在上皮—细胞间质转化(EMT)过程中,上皮细胞会和内部组织粘在一起变成间质细胞,才能扩散和迁移。在胚胎阶段这一过程是有利的,让细胞能在整个胚胎中移动,
糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片(二)
第4步:关键糖蛋白鉴定为了进一步明确是哪个蛋白的表达量发生了上调,研究人员以凝集素SNA-I为钓饵,进行了pull down实验。血清pull down产物(P-M3)经电泳分离后,对42 kDa分子量附近的蛋白条带进行了质谱鉴定。结果显示,高同源性蛋白HP和HPR的鉴定分值Z高。随后通过w
糖蛋白标志物研究工具——凝集素芯片(一)
糖基化是Z为广泛和复杂的蛋白质共翻译或翻译后修饰之一,它是通过糖基转移酶,在新生多肽或者成熟蛋白质的特定氨基酸上添加多个单糖的过程,通俗的理解就是在细胞器内“出厂”的蛋白质上添加各种糖链“标签”的过程。人体内至少50%的蛋白质都会发生糖基化修饰。这类修饰与蛋白质的正确折叠、构象稳定性及分泌等密切相关
蛋白质芯片技术应用于药物筛选
疾病的发生发展与某些蛋白质的变化有关,如果以这些蛋白质构筑芯片,对众多候选化学药物进行筛选,直接筛选出与靶蛋白作用的化学药物,将大大推进药物的开发。蛋白质芯片有助于了解药物与其效应蛋白的相互作用,并可以在对化学药物作用机制不甚了解的情况下直接研究蛋白质谱。还可以将化学药物作用与疾病联系起来,以及药物
Arraystar-lncRNA芯片应用于乳腺癌研究
德克萨斯大学安德森癌症中心的华人学者杨柳青博士主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,杨柳青博士应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌组织的长链非编码RNA(lncRNA)表达情况,并且发现部分lncRNA可以直接和脂质(磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等)发生相互
生物标记物:识别肿瘤侵袭
早期结肠癌患者将来可以从特定额基因测试中获益,并帮助他们在化疗方面做出正确的决定。其中两种生物标记物是MACC1基因,高水平促进肿瘤的生长和肿瘤的转移,以及一种有缺陷的DNA不匹配修复(dMMR)系统,它在肿瘤的形成中起着重要的作用。患有dMMR肿瘤和低MACC1基因活性的患者的预期寿命更长。
蛋白质芯片技术应用于疾病诊断
蛋白质芯片技术在医学领域中有着潜在的广阔应用前景。蛋白质芯片能够同时检测生物样品中与某种疾病或者环境因素损伤可能相关的全部蛋白质的含量情况,即表型指纹(phenomic fingerprint)。表型指纹对监测疾病的过程或预测,判断治疗的效果也具有重要意义。Ciphelxen Biosystems公
SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中研究进展
人类基因组序列草图完成后,生命科学进入了“后基因组时代”,研究的重点转向了对复杂的蛋白质功能的研究。蛋白质是基因表达的最终产物,器官组织的生理状态变化会引起血清蛋白质组的改变,因此对蛋白质和蛋白质组学进行研究可以直接获取疾病的特征性标志。由于人血清是一个蛋白质相当丰富并不断变化的系统,单一的血清肿瘤
空间组学新技术破解肿瘤细胞早期空间侵袭模式
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516182.shtm近日,上海交通大学医学院分子医学研究院杨朝勇团队和附属仁济医院泌尿科郑军华团队开发了一种空间转录组学测序新技术Decoder-seq,并运用该技术探究了早期肾细胞癌(RCC)两种亚型肿
凝集素RCAI与TNBC细胞系的结合强弱与其转移能力正相关
2015年3月,以广州博翀生物产品-凝集素芯片为核心的研究成果发表在Breast Cancer Research杂志,文章标题为“Lectin RCA-I specifically binds to metastasis-associated cell surface glycans in
凝集素RCAI与TNBC细胞系的结合强弱与其转移能力正相关
2015年3月,以广州博翀生物产品-凝集素芯片为核心的研究成果发表在Breast Cancer Research杂志,文章标题为“Lectin RCA-I specifically binds to metastasis-associated cell surface glycans in tr
肿瘤细胞侵袭实验(Tumour-Invasion-Assay)
实验方法原理 Matrigel 是从小鼠EHS肉瘤中提取的基质成分,含有LN、IV型胶原、接触蛋白和肝素硫酸多糖,铺在无聚乙烯吡硌烷酮的聚碳酸酯滤膜上,能在DMEM培养基中重建形成膜结构,这种膜结构与天然基质膜结构极为相似。 滤膜孔径一般为8um,而且膜孔都被Matrigel覆盖,细胞不能自由穿过,
肿瘤细胞侵袭试验(Tumour-Invasion-Assay)
一 、 原理Matrigel 是从小鼠EHS肉瘤中提取的基质成分,含有LN、IV型胶原、接触蛋白和肝素硫酸多糖,铺在无聚乙烯吡硌烷酮的聚碳酸酯滤膜上,能在DMEM培养基中重建形成膜结构,这种膜结构与天然基质膜结构极为相似。滤膜孔径一般为8um,而且膜孔都被Matrigel覆盖,细胞不能自由穿过,必须
蛋白质芯片技术应用于抗原抗体检测
在CavinM.等人的实验中,蛋白质芯片上的抗原抗体反应体现出很好的特异性,在一块蛋白质芯片上10800个点中,根据抗原抗体的特异性结合检测到唯一的1个阳性位点。Cavin M.指出,这种特异性的抗原抗体反应一旦确立,就可以利用这项技术来度量整个细胞或组织中的蛋白质的丰富程度和修饰程度。其次利用蛋白
蛋白质芯片技术应用于生化反应的检测
对酶活性的测定一直是临床生化检验中不可缺少的部分。Cohen用常规的光蚀刻技术制备芯片、酶及底物加到芯片上的小室,在电渗作用中使酸及底物经通道接触,发生酶促反应。通过电泳分离,可得到荧光标记的多肽底物及产物的变化,以此来定量酶促反应结果。动力学常数的测定表明该方法是可行的,而且,荧光物质稳定。Are
SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中研究进展(三)
SELDI蛋白芯片技术可有效筛选血清中特异性蛋白标志物,为建立卵巢癌的诊断模型提供可靠的技术平台。 2.4 乳腺癌 CA153用于乳腺癌的检测,其灵敏度23%,特异性69%,只能用于监测治疗效果和复发情况。LI等[23]对169例血清进行检测,其中乳腺
SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中研究进展(一)
作者:余家密 【摘要】 SELDI蛋白芯片技术全称为表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)是近年用来研究蛋白质组学的一项新的技术平台,具有高通量、高效率、高灵敏度等特点,可以快速地分析各种生物样品中蛋白质组的组成,在基础医学研究、临床疾病诊断以及药物研发方面
SELDI蛋白芯片技术在肿瘤早期诊断中研究进展(二)
2.1 肝 癌 肝癌是非洲、中国和东南亚国家最常见的恶性肿瘤之一,其生存率低,很大一部分是由于诊断时病程已到了进展期,失去了很好的治疗机会[6]。目前肝癌的早期诊断主要依靠血清AFP的检测,但近年来大量临床研究表明,AFP阳性率波动在60%~70%[7],约有1/
类器官芯片在肿瘤研究中的应用
在过去几十年中,干细胞生物学的进展导致在体外创造了一类新的3D细胞样细胞,称为类器官,因为它们的空间形态与原始器官相似。利用该技术从体外培养的肿瘤组织中形成的肿瘤类有机物在很大程度上保留了肿瘤细胞在体内的生物学特性,具有成本低、操作简单等优点,弥补了传统肿瘤实验模型的缺陷。1、肿瘤发生发展机制肿瘤是
凝集素RCAI与TNBC细胞系的结合强弱与其转移能力正相关
2015年3月,以广州博翀生物产品-凝集素芯片为核心的研究成果发表在Breast Cancer Research杂志,文章标题为“Lectin RCA-I specifically binds to metastasis-associated cell surface glycans in tr
微流控芯片技术在循环肿瘤细胞分离中的研究进展
循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)是指从原发肿瘤或转移灶脱落、发生上皮-间质转化进入患者外周血血液循环的恶性肿瘤细胞.CTCs在肿瘤研究和临床诊断上的作用逐渐得到认可,外周血中CTCs存在与否以及数量多少不但可以用于肿瘤的早期诊断,还可以用于评估肿瘤预后、