高通量荧光定量芯片可对人类病原菌及微生物污染溯源

人类病原菌及其引发的疾病严重威胁公众健康,亟需发展高灵敏性、高特异性的诊断工具。监测人类病原菌并追溯其污染来源对人类健康具有重要意义。目前对人类病原菌的监测主要有两个挑战,一是多个病原菌丰度的同时定量,对微生物污染水平、健康风险的综合评估具有必要性;二是微生物污染来源的鉴定,对环境管理者减缓或控制环境污染的相关举措至关重要。 中国科学院城市环境研究所发展一种高灵敏度(80%)和高特异性(99%)的高通量荧光定量芯片,可同时对23种人类病原菌的68个标记基因和10种粪源宿主的23个标记基因进行定量。研究团队基于该芯片对厦门13个海滨浴场的水体进行病原菌检测和污染溯源,并结合nanopore三代长片段测序技术对水体潜在病原菌进行检测。该研究发展的针对微生物污染监测和溯源的高通量定量芯片将为病原菌相关的健康评估提供数据,为人类健康发展的环境管理措施提供科学依据。 相关研究成果以High-throughput diagnosis......阅读全文

高通量荧光定量芯片可对人类病原菌及微生物污染溯源

  人类病原菌及其引发的疾病严重威胁公众健康,亟需发展高灵敏性、高特异性的诊断工具。监测人类病原菌并追溯其污染来源对人类健康具有重要意义。目前对人类病原菌的监测主要有两个挑战,一是多个病原菌丰度的同时定量,对微生物污染水平、健康风险的综合评估具有必要性;二是微生物污染来源的鉴定,对环境管理者减缓或控

使用人类疾病模型生物斑马鱼的高通量成像实验

为什么使用斑马鱼进行筛选? 目前,基于斑马鱼的筛选由于花费,通量和伦理原因作为一种哺乳动物筛选的替代受到欢迎。斑马鱼由于其与人类的高度生物相似性,成为一种有用的药物开发模型。在个体学和器官形成研究中体现了其主要器官系统与人类极其相似,且斑马鱼和人类的相似度高达 70 - 80%。斑马鱼由于其繁殖力强

高通量测序技术实现绘制人类视网膜高精度发育细胞图谱

  人类胚胎发育从受精卵开始,经过着床前胚胎发育(胚内和胚外组织的产生),原肠胚产生(三胚层的特化)和器官发生等阶段,最终新生儿出生。人类胚胎发育从单个细胞到上万亿个细胞,历时二百八十天,整个过程的基因表达受到多种因素的精细调控,其中很多机制尚未明确。  为了解析人类胚胎发育各个阶段的基因表达调控网

病原菌的鉴别实验

实验方法原理 1.致病性葡萄球菌耐盐,在高盐培养基上能生长;2. 致病性葡萄球菌能发酵甘露醇。3. 当颗粒性抗原(如:细菌)与特异性抗体结合后,在有电解质存在的环境下,抗原抗体可凝集成肉眼可见的块状物。仪器、耗材 脓液标本增菌液高盐琼脂培养基甘露醇发酵培养基革兰氏染液NS抗金黄色葡萄球菌抗体玻片接种

病原菌的鉴别实验

实验方法原理1.致病性葡萄球菌耐盐,在高盐培养基上能生长;2. 致病性葡萄球菌能发酵甘露醇。3. 当颗粒性抗原(如:细菌)与特异性抗体结合后,在有电解质存在的环境下,抗原抗体可凝集成肉眼可见的块状物。仪器、耗材脓液标本增菌液高盐琼脂培养基甘露醇发酵培养基革兰氏染液NS抗金黄色葡萄球菌抗体玻片接种环酒

植物病原菌的分离

一、实验原理植物患病组织内的真菌菌丝体,如果给予适宜的环境条件,除个别种类外,一般都能恢复生长和繁殖。植物病原菌的分离就是指通过人工培养,从染病植物组织中将病原真菌与其它杂菌相分开,并从寄主植物中分离出来,再将分离到的病原菌于适宜环境内纯化,这个过程总称植物病菌的分离培养。植物病原真菌的分离一般都是

高通量测序

  高通量测序技术又称“下一代”测序技术,以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括:大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。  高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DN

关于病原菌的危害相关介绍

  病原菌为什么会使人生病呢?是因为它们能产生致病物质,造成宿主感染。如果不产生致病物质,就是非病原菌。至于正常菌群,当与宿主处于生态平衡状态,它们并不引起机体的感染,故属于非病原菌范畴。但是,在特定条件下,因为菌群失调、宿主免疫功能低下或菌群寄居部位改变造成了生态失调状态,正常菌群也能引起感染,这

口腔颌面部感染的病原菌

  口腔颌面部感染以化脓性细菌感染为主,常见的致病菌主要有金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌和大肠杆菌、绿脓杆菌等;少见厌氧性腐败坏死性细菌所引起的腐败坏死性感染;偶见特异性感染如结核杆菌、梅毒螺旋体及放线菌等感染也可见到。感染可以由一种致病菌引起,也可由多种细菌所引起,一与颌面部腔窦相通的感染常是由需氧

植物与病原菌“作战”新路径

  国际知名学术期刊《自然》(Nature)16日在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心何祖华研究团队的一篇研究论文。该研究揭示了一条全新的植物免疫的基础代谢调控网络,为水稻抗病育种提供了新思路,有助减少农药使用。  作为水稻的“癌症”,稻瘟病会造成水稻的减产甚至绝产。何祖华研究员介绍,稻瘟病

新研究阐释病原菌毒力调控机制

近日,华东理工大学生物工程学院教授王启要课题组在病原菌毒力调控方面取得新进展,相关研究发表于《核酸研究》。如果将细菌核心基因组比作细菌内部的原住民,那么细菌进化的主要驱动力就是水平转移基因元件(入侵者)不断与原住民融合,从而赋予或增强细菌致病性和环境适应性等特性。三型分泌系统(T3SS)、六型分泌系

植物病原菌的分离所需器材介绍

1.分离材料:梨黑斑病(Alternaria kikuchiana),柿树圆斑病(Pestnlotia sp)及杉木炭疽病(Glomerella cingolata)新发病的病叶;杨树烂皮病(Cytospora chrysosperma)国槐腐烂病(Dothiorella sp.)的带有新病斑的枝条

新研究阐释病原菌毒力调控机制

近日,华东理工大学生物工程学院教授王启要课题组在病原菌毒力调控方面取得新进展,相关研究发表于《核酸研究》。如果将细菌核心基因组比作细菌内部的原住民,那么细菌进化的主要驱动力就是水平转移基因元件(入侵者)不断与原住民融合,从而赋予或增强细菌致病性和环境适应性等特性。三型分泌系统(T3SS)、六型分泌系

对ICU病房病原菌的检测分析

感染是ICU病房内病人导致多器官功能衰竭和死亡的主要因素,发生率明显高于普通病房[1],而控制感染主要是对病原菌采用有效的抗菌治疗。近年来,随着第三代头孢菌素等抗生素的广泛应用和耐药菌株的增加,病原菌在构成和药物感敏性上都发生了较大的变化,而ICU病房病人病情危重,多数无法获得病原学依据后才用药,经

酵母多糖吸附病原菌作用的介绍

  酵母细胞壁多糖能吸附病原菌的主要机理是: 甘露聚糖能干扰肠道病原菌的定殖, 从而降低动物肠道病原微生物数量如沙门氏菌和大肠杆菌的数量。肠道中的病原菌(大肠杆菌、沙门氏菌、梭状芽孢杆菌等) 细胞表面或绒毛上具有一种蛋白质物质(类丁质结构) , 通过识别动物肠壁细胞上的特异性, 而与之糖类结合, 在

植物分辨病原菌和有益菌

  丹麦奥尔胡斯大学以及其他研究所的科学家发现,植物生物分子互作可帮助它们正确分辨有益菌和病原菌。   国际研究团队整合生物化学、化学选择和微生物遗传学等研究手段,发现豆科植物百脉根根瘤菌分泌的特殊修饰几丁质分子物质(Nod因子)和病原菌分泌的几丁质。植物的检测通过位于细胞表面的受体蛋白质配体发生

病原菌侵入后机体的免疫反应

一、宿主体表的防御功能(一)机械的阻挡和排除作用健康和完整的皮肤与粘膜能有效地阻挡细菌的侵入。呼吸道粘膜上皮细胞的纤毛向上颤动,可将细菌咳出或咽下;随粪便每日约排菌1012个;小便可清除尿道上皮的细菌。(二)分泌液中化学物质的局部抗菌作用汗腺分泌的乳酸,皮脂腺分泌的脂肪酸均有一定的抗菌作用。胃酸能杀

病原菌快速药敏检测研究取得进展

细菌感染死亡往往源于抗生素施用的延迟或不当。抗菌药物敏感性试验(AST)作为临床指导抗生素治疗的常规手段,其检测效率直接关系到患者的治疗效果。目前临床主流方法的最短周转时间(TAT)仍需16至20小时。这意味着在AST结果出来前,早期治疗阶段的抗生素处方往往难以达到最佳效果。针对这一临床需求,中国科

植物病原菌的分离的实验目的

植物病原菌的分离培养是植物病理学实验最基本的操作技术之一,它对原害鉴定,病原形态观察、植物病害接种体的培养等方面都是经常使用的研究手段。通过本实验,要求植物病原菌分离培养的一般原则和方法。

植物病原菌的分离的实验原理

植物患病组织内的真菌菌丝体,如果给予适宜的环境条件,除个别种类外,一般都能恢复生长和繁殖。植物病原菌的分离就是指通过人工培养,从染病植物组织中将病原真菌与其它杂菌相分开,并从寄主植物中分离出来,再将分离到的病原菌于适宜环境内纯化,这个过程总称植物病菌的分离培养。植物病原真菌的分离一般都是采用组织分离

酵母多糖吸附病原菌作用主要机理

酵母细胞壁多糖能吸附病原菌的主要机理是: 甘露聚糖能干扰肠道病原菌的定殖, 从而降低动物肠道病原微生物数量如沙门氏菌和大肠杆菌的数量。肠道中的病原菌(大肠杆菌、沙门氏菌、梭状芽孢杆菌等) 细胞表面或绒毛上具有一种蛋白质物质(类丁质结构) , 通过识别动物肠壁细胞上的特异性, 而与之糖类结合, 在肠壁

疑难病例病原菌的检测体会

    近几年来,经常发现临床病人反复感染,但是找不到病原菌。最近我室会诊了1例老年病人,因反复下呼吸道感染,3次住院、出院,均未治愈。原就诊医院在痰标本中,始终未发现致病菌,仪凭经验使用多种抗菌药物,效果不佳。    为此,本室参加了临床会诊,首先通知病人全部停用2d抗菌药物;床边留取脓痰、立即接

如何区别是定植菌还是病原菌?

对于痰标本培养确定分离菌是否为可能的感染菌最简单和最直接的证据就是痰标本涂片,首先感染菌会导致白细胞大量增加,其次由于感染早期(细菌/真菌)启动非特异性免疫因子中中性粒细胞是最主要的免疫细胞,吞噬和包裹现象是反映细菌与机体免疫系统的相关性的最重要的信号,观察这一现象有助于区别是感染还是定植。俞云松教

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序技术

没有测序的癌症诊断是不完整的,完整的癌症诊断应该包括一系列基于细胞遗传学技术、荧光原位杂交技术、标准分子技术以及NGS的预后与预测性分析。对于早期癌症患者来说,NGS序列分析在多种癌症的筛查技术中具有不容忽视的代表性;而对于晚期癌症患者,大量的侵入性测试往往只能筛查出少数几个药物靶点。 随

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序原理

高通量测序原理是将基因组 DNA 片断化,然后克隆到质粒载体上,再转化大肠杆菌。对于每个测序反应,挑出单克隆,并纯化质粒 DNA。高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。高通量

高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思

高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通

隐球菌脑膜炎的病原菌检查

  在各种标本中如能找到新生隐球菌,则对诊断有决定意义。  ⒈ 直接镜检:取脑脊液标本少许置玻片上,加一滴墨汁混匀后,加盖玻片。一般新生隐球菌在镜下即可见圆形或椭圆形的双层厚壁孢子,外有一层宽阔荚膜,边缘清楚完整,菌体内可见单个出芽;若为新生隐球菌上海变种,则菌体呈棒形、针形、梭形、瓢形、圆球形及出

化学发光探针检测技术速查病原菌

  吉林检验检疫局建立的金标法检测单核细胞增生性李斯特氏菌技术作为当今检测病原体和诊断疾病方面最为敏感的免疫学技术之一,不仅操作简便、快速、特异,更为重要的是适用于广大基层食品监管部门的现场检测和诊断,这些特点都是其他免疫学方法所无法比拟的。  该技术不仅具有巨大的发展潜力,而且还具